About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
Genome Coordinate Discrepancy
The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details).
 Symbol
Name
ID
Ccrl1
chemokine (C-C motif) receptor-like 1
MGI:2181676

102 matching SNPs displayed


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs36394116
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:103999443fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Locus-Region
1SNPC CCCC   C CCTC        C         C    C C   C C/T
rs29793892
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:103999481fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Locus-Region
1SNPCCC   T    C                                  C/T
rs33772113
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:103999799fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Locus-Region
1SNP GG   A    G                                  A/G
rs33757030
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:103999827fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Locus-Region
1SNP TT   C    T                                  C/T
rs36464594
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104001816fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Coding-Synonymous
1SNPG GGGG   A GGGG        G         G    G G   G A/G
rs37976208
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104001960fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Coding-Synonymous
1SNPG GGGG   G GGAG        G         G    G G   G A/G
rs36536695
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104002050fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Coding-Synonymous
1SNPC CCCC   T CCCC        C         C    C C   C C/T
rs37129137
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104002063fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Coding-NonSynonymous
1SNPA AAAA   T AATA        A         A    A     A A/T
rs37456787
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104002848fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNPC CCCC   T CCTC        C         C    C C   C C/T
rs36325719
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104003228fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNPT TTTT   C TTCT        T         T    T T   T C/T
rs37981886
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104003324fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNPG GGGG   G GGAG        G         G    G G   G A/G
rs38502266
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104003623fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNPT TTTT   C TTTT        T         T    T T   T C/T
rs30427357
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104003710fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
2SNPTTTT TC  C TTCT        T         T    T     C C/T
rs36602985
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104004093fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNPA  AAA   A AACA        A         A    A A   A A/C
rs37498261
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104004278fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNPG GGGG   A GGGG        G         G    G G   G A/G
rs36553094
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104004486fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNPT TTTT   T TTTT        T         T    T T   A A/T
rs30327799
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104004854fAcad11 : Intron
Ccrl1 : mRNA-UTR
2SNPAAAAAAG  G AAGA        A         A    A A   G A/G
rs37900072
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104004859fAcad11 : Intron
Ccrl1 : mRNA-UTR
1SNPA AAAA   G AAA         A         A    A A   A A/G
rs36392788
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104005599fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNPG GGGG   A GGAG        G         G    G G   G A/G
rs36967970
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104006860fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNPA AAAA   G AAGA        A         A    A A   A A/G
rs38470957
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104007064fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNPA AAAA   G AAAA        A         A    A A   A A/G
rs36525845
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104007072fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNPT TTTT   T TTAT        T         T    T T   T A/T
rs36923879
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104007106fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNPT TTTT     TTAT        T         T    T A   T A/T
rs36364856
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104007152fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNPT TTTT   C TTTT        T         T    T T   T C/T
rs37343755
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104007551fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNPA AAAA     AACA        A         A    A A   A A/C
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs36788241
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104007557fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNPG GGGG   G GGGG        G         G    G G   C C/G
rs37844400
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104007611fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNPC CCCC   C CCCC        C         C    C C   A A/C
rs36437923
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104007927fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNPT TTTT   T TTCT        T         T    T T   T C/T
rs36436674
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104008153fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNPT TTTT   T TTCT        T         T    T T   T C/T
rs36633879
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104008330fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNPT TTTT   T TTCT        T         T    T T   T C/T
rs37436637
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104008581fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNPA AAAA   A  AGA                  A    A G   A A/G
rs36383847
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104008698fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNPC CCCC   C CCTC        C         C    C C   C C/T
rs37106052
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104009197fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNPC CCCC   T CCCC        C         C    C C   C C/T
rs37867113
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104009261fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNPA AAAA   A AATA        A         A    A A   A A/T
rs36783370
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104009457fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNPC CCCC   T CCCC        C         C    C C   C C/T
rs39223413
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104009736fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNPA AAAA   C AAAA        A         A    A A   A A/C
rs38028428
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104010004fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNPA AAAA   A AAGA        A         A    A A   A A/G
rs29736757
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104010110fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
2SNPAAAAAAG  G AAGA        A         A    A A   G A/G
rs37103344
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104010142fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNPT TTTT   T TTCT        T         T    T T   T C/T
rs36408431
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104010214fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNPT TT     T TTC                   T    T     T C/T
rs37012279
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104010259fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNPG GGGG   G GGAG        G         G    G G   G A/G
rs37362484
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104010718fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNPG GGGG   G GGTG        G         G    G G   G G/T
rs37932433
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104010955fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNPC CCCC   C CCCC        C         C    C C   T C/T
rs37646232
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104011120fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNPT TTTT   T TTCT        T         T    T T   T C/T
rs36335879
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104011290fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNPA AAAA   A AAGA        A         A    A A   A A/G
rs36503041
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104011415fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNPC CCCC   C CCTC        C         C    C T   C C/T
rs36761583
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104011653fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNPG GGGG   G GGAG        G         G    G G   G A/G
rs36466158
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104012125fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNP         T   G                          G   T G/T
rs38456615
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104012742fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNP         T   C                              T C/T
rs29786245
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104012836fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNP GG   A    G                                  A/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs37397726
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104013356fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNP         A   G                          G   A A/G
rs37532220
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104013628fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNP         C   G                          G   C C/G
rs30481177
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104014089fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNP  A   C    A                                  A/C
rs36446716
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104014131fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNP         C   T                              C C/T
rs38692586
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104014331fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNP         G   C                          C   G C/G
rs37457263
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104014429fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNP         A   G                          G   A A/G
rs30037441
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104014832fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNP CC   A    C                                  A/C
rs37952504
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104014890fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNP         C   C                              T C/T
rs37791269
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104015067fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNP         C   T                          T   C C/T
rs30515809
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104015729fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNP AA   T    A                                  A/T
rs13480388
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104015837fAcad11 : Coding-NonSynonymous
Ccrl1 : Intron
2SNPTTTTTTCCCC TT TTCTCT C TTCCCCTTTTTTTCTTT TCCCTC/T
rs36600570
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104015845fAcad11 : Coding-NonSynonymous
Ccrl1 : Intron
1SNP         C   T                          T   C C/T
rs38941733
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104016524fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNP         G   A                              G A/G
rs37542301
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104016614fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNP         C   G                              C C/G
rs36260805
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104016779fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNP         T   C                              T C/T
rs36616046
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104016993fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNP         G   C                          C   C C/G
rs29979375
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104017171fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNPAAA   G    A                                  A/G
rs39873179
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104017221fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNP         A   G                              A A/G
rs37807390
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104017352fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNP         T   G                              G G/T
rs37840030
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104017545fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNP         T   C                          C   C C/T
rs37633992
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104017657fAcad11 : Coding-Synonymous
Ccrl1 : Intron
1SNP         T   C                              T C/T
rs29642782
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104017744fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNP GG   A    G                                  A/G
rs36784410
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104017824fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNP         T   T                          T   C C/T
rs6410453
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104017907fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNP      A   G                                   A/G
rs36458458
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104018051fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNP         C   T                              T C/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs6411155
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104018074fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNP      T   A                                   A/T
rs6411631
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104018096fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNP      A   G                                   A/G
rs6412819
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104018336fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNP      C   G                                   C/G
rs38056637
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104018669fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNP         T   C                              T C/T
rs36537144
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104018689fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNP         C   T                          T   C C/T
rs37236703
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104018792fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNP         A   G                              A A/G
rs37127251
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104018924fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNP         T   G                          G   T G/T
rs36377576
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104019758fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNP         G   A                              G A/G
rs36622658
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104020825fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNP         G   C                          C   C C/G
rs37796813
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104020838fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNP             C                              T C/T
rs37276925
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104020859fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNP         C   C                              T C/T
rs3718278
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104020910fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
2SNPG G   A                                       A/G
rs36842032
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104020956fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNP         G                                  A A/G
rs33624634
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104021167fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNP  G   A                                       A/G
rs37301165
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104021311fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNP         T                                  C C/T
rs36807994
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104022200fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNP         G   A                          A   A A/G
rs37467658
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104022401fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNP  G      G   G                   A      G   A A/G
rs37399864
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104022516fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNP         G   G                   A    A     A A/G
rs6411723
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104024842fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
2SNPAAA   T    A                                  A/T
rs29644778
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104027223fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNP  G   A    G                                  A/G
rs33654734
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104027529fAcad11 : Intron
Ccrl1 : Intron
1SNP  T   C                                       C/T
rs30233239
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104029244fAcad11 : mRNA-UTR
Ccrl1 : mRNA-UTR
1SNP GG   A    G                                  A/G
rs29881346
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104029255fAcad11 : mRNA-UTR
Ccrl1 : mRNA-UTR
1SNP GG   A    G                                  A/G
rs4227901
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104029693rAcad11 : mRNA-UTR
Ccrl1 : Locus-Region
1SNP  G GGG  G G        A G                       A/G
rs4227900
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104029705rAcad11 : mRNA-UTR
Ccrl1 : Locus-Region
1SNP  C CCC  C C        A C                       A/C
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs4227899
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104029724rAcad11 : mRNA-UTR
Ccrl1 : Locus-Region
1SNP  C CCC  C C        T C                       C/T
rs4227898
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:104029747rAcad11 : mRNA-UTR
Ccrl1 : Locus-Region
1SNP  C CCC  C C        A C                       A/C

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
06/05/2013
MGI 5.13
The Jackson Laboratory