About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Vps54
vacuolar protein sorting 54 (yeast)
MGI:2178798

258 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs256656082
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21237156fVps54 : Locus-Region1SNP             C  A    A/C
rs224058093
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21237523fVps54 : Locus-Region1SNP             A  G    A/G
rs242540260
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21237692fVps54 : Locus-Region1SNP             A  T    A/T
rs263877984
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21237697fVps54 : Locus-Region1SNP             A  C    A/C
rs52269487
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21237775fVps54 : Locus-Region1SNP  C                  C
rs47866436
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21237868fVps54 : Locus-Region1SNP CC                  C
rs47421344
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21237881fVps54 : Locus-Region1SNP TT                  T
rs48191974
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21237883fVps54 : Locus-Region1SNP  A                  A
rs47041861
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21237936fVps54 : Locus-Region1SNP  A                  A
rs50708527
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21238034fVps54 : Locus-Region1SNP  A                  A
rs49266238
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21238199fVps54 : Locus-Region1SNP  C                  C
rs232727471
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21238334fVps54 : Locus-Region1SNP             G  A    A/G
rs251926468
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21238621fVps54 : Locus-Region1SNP             T  C    C/T
rs216646425
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21239703fVps54 : Intron1SNP             A  G    A/G
rs226405934
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21239882fVps54 : Intron1SNP             C  T    C/T
rs244131998
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21239974fVps54 : Intron1SNP             A  T    A/T
rs213164799
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21241048fVps54 : Intron1SNP             T  C    C/T
rs230186242
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21242749fVps54 : Intron1SNP             T  C    C/T
rs230460578
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21243676fVps54 : Intron1SNP             G  A    A/G
rs218240790
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21243961fVps54 : Intron1SNP             C  T    C/T
rs51000217
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21243969fVps54 : Intron1SNP             C  T    C/T
rs258680627
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21244481fVps54 : Intron1SNP             T  C    C/T
rs52067508
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21245822fVps54 : Intron1SNP CA                  A/C
rs26876025
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21246445fVps54 : Intron1SNPC CCTC   CCCC CC  CCTC/T
rs26876024
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21246478fVps54 : Intron1SNPT TTCT   TTTT TT  TTCC/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs223169338
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21246928fVps54 : Intron1SNP             T  C    C/T
rs231686222
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21248010fVps54 : Intron1SNP             G  A    A/G
rs250338791
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21248625fVps54 : Intron1SNP             T  G    G/T
rs218020156
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21248646fVps54 : Intron1SNP             C  T    C/T
rs242617784
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21248714fVps54 : Intron1SNP             G  T    G/T
rs265868146
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21249026fVps54 : Intron1SNP             A  G    A/G
rs26876023
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21249043fVps54 : Intron2SNPT  GG      TGG TT TGGG/T
rs26876022
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21249122fVps54 : Intron1SNPC CCCC   CCCC CC  CTCC/T
rs6280288
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21250108fVps54 : Intron2SNP      T C    C  T    C/T
rs262613947
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21250377fVps54 : Intron1SNP             T  C    C/T
rs6294957
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21250484fVps54 : Intron1SNP      C T            C/T
rs6294975
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21250496fVps54 : Intron1SNP      C T            C/T
rs26876021
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21250554fVps54 : Intron1SNPT TTCT   TTTT TT  TCCC/T
rs226479269
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21250710fVps54 : Intron1SNP             G  A    A/G
rs244167022
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21250909fVps54 : Intron1SNP             C  G    C/G
rs26876020
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21251658fVps54 : Intron1SNPC CCTC   CCCC CC  CTTC/T
rs254898360
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21252367fVps54 : Intron1SNP             C  T    C/T
rs223747324
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21253049fVps54 : Intron1SNP             T  C    C/T
rs254939359
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21253259fVps54 : Intron1SNP             G  T    G/T
rs218336705
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21253544fVps54 : Intron1SNP             T  C    C/T
rs26876019
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21253677fVps54 : Intron1SNPT TTCT   TTTT TT  TCCC/T
rs26876018
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21254881fVps54 : Intron1SNPC CTCC   CCCT CC  CCCC/T
rs238800814
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21255152fVps54 : Intron1SNP             C  G    C/G
rs26876017
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21255738fVps54 : Intron1SNPT TTCT T TTTT TT  TTCC/T
rs48627702
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21256210fVps54 : Intron2SNP CC      C   T  C    C/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs46157258
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21256234fVps54 : Intron1SNP GG      G           G
rs214452204
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21256791fVps54 : Intron1SNP             G  T    G/T
rs231731858
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21257763fVps54 : Intron1SNP             C  T    C/T
rs250432880
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21257852fVps54 : Intron1SNP             T  A    A/T
rs218104396
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21258716fVps54 : Intron1SNP             A  G    A/G
rs236267019
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21259070fVps54 : Intron1SNP             G  A    A/G
rs29385836
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21259096fVps54 : Intron2SNP  G   G  A   G  A    A/G
rs29387590
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21259106fVps54 : Intron1SNP  C   T  C           C/T
rs224978807
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21261391fVps54 : Intron1SNP             A  T    A/T
rs244903226
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21261821fVps54 : Intron1SNP             T  A    A/T
rs265207819
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21261947fVps54 : Intron1SNP             C  T    C/T
rs219080862
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21263125fVps54 : Intron1SNP             A  G    A/G
rs26876016
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21265006fVps54 : Intron1SNPT  T T A T    TT  TA A/T
rs26876015
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21265294fGm18817 : within coordinates of
Vps54 : Intron
1SNPC CC C G CCCC CC  C  C/G
rs26876014
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21265371fGm18817 : within coordinates of
Vps54 : Intron
1SNPG GG G A GGGG GG  G  A/G
rs26876013
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21265669fGm18817 : within coordinates of
Vps54 : Intron
1SNPT TT T T TTTT TT  TATA/T
rs26876012
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21265926fGm18817 : within coordinates of
Vps54 : Intron
1SNPC CC C   CCCC CC  CT C/T
rs236327208
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21266383fGm18817 : within coordinates of
Vps54 : Intron
1SNP             T  C    C/T
rs26876011
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21266454fVps54 : Intron1SNPA AA A A AAAA AA  AC A/C
rs254983691
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21266744fVps54 : Intron1SNP             T  C    C/T
rs26876010
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21267297fVps54 : Intron1SNPT TT T C TTTT TT  TC C/T
rs26876009
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21267310fVps54 : Intron1SNPC CCGC C CCCC CC  CCGC/G
rs26876008
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21267953fVps54 : Intron1SNP    G    A  A       GA/G
rs223805153
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21268328fVps54 : Intron1SNP             T  G    G/T
rs260468370
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21268734fVps54 : Intron1SNP             A  G    A/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs26876007
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21269481fVps54 : Intron1SNPG GGGG T GGGG GG  GGGG/T
rs26876006
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21269498fVps54 : Intron1SNPT TGTT T TTTG TT  TTTG/T
rs26876005
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21270691fVps54 : Intron1SNPT TTTT G TTTT TT  TGTG/T
rs26876004
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21271030fVps54 : Intron1SNPG GGGG G GGGG GG  GAGA/G
rs26876003
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21271034fVps54 : Intron1SNPC CCTC C CCCC CC  CCTC/T
rs26876002
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21271485fVps54 : Intron1SNPC CCTC C CCCC CC  CCTC/T
rs26876001
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21271532fVps54 : Intron1SNPT TTTT G TTTT TT  TGTG/T
rs26876000
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21271566fVps54 : Intron1SNPC CCCC C CCCC CC  CTCC/T
rs264155682
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21272067fVps54 : Intron1SNP             C  T    C/T
rs26875999
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21272601fVps54 : Intron1SNPC CCCC T CCCC CC  CCCC/T
rs233357354
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21272997fVps54 : Intron1SNP             A  G    A/G
rs26875998
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21273005fVps54 : Intron1SNPC C CC C CCC  CC  CTCC/T
rs26875997
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21274162fVps54 : Intron1SNPT TTTT C TTTT TT  TTTC/T
rs26875996
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21275178fVps54 : Intron1SNPA AAAA   AAAA AA  ATAA/T
rs26875995
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21275233fVps54 : Intron1SNPA   GA G AAAA AA  AGGA/G
rs26875994
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21275760fVps54 : Intron2SNPC CTTC T CCCTTCCC CTTC/T
rs29464690
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21276133fVps54 : Intron2SNPAAC   C              A/C
rs214538026
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21276134fVps54 : Intron1SNP             C  A    A/C
rs26875993
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21276210fVps54 : Intron1SNPC CCCC C CCCC CC  CTCC/T
rs26875992
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21276794fVps54 : Intron1SNPA AAAA G AAAA AA  AAAA/G
rs26875991
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21277502fVps54 : Intron1SNPC CCCC C CCCC CC  CTCC/T
rs26875990
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21279374fVps54 : Intron1SNPT TTCT C TTTT TT  TCCC/T
rs26875989
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21279581fVps54 : Intron1SNPG GGGG A GGGG GG  G GA/G
rs26875987
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21279654fVps54 : Intron1SNPC CCCC T CCCC CC  C CC/T
rs26875982
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21280007fVps54 : Intron1SNPT TTGT T TTTT TT  TTGG/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs26875981
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21280068fGm12039 : within coordinates of
Vps54 : Intron
1SNPG GTGG G GGGT GG  GGGG/T
rs26875980
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21280085fGm12039 : within coordinates of
Vps54 : Intron
1SNPC CCCC T CCCC CC  CTCC/T
rs26875979
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21280281fVps54 : Intron1SNPT TTTT T TTTT TT  TGTG/T
rs26875978
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21280327fVps54 : Intron1SNPT TTTT T TTTT TT  TATA/T
rs225856731
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21280554fVps54 : Intron1SNP             T  C    C/T
rs6242110
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21280949fVps54 : Intron1SNP      A G            A/G
rs26875977
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21281575fVps54 : Intron1SNPT TTCT C TTTT TT  TCCC/T
rs26875976
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21281581fVps54 : Intron3SNPGGGTGG G GGGTTGGG GGGG/T
rs212043390
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21281960fVps54 : Intron1SNP             T  A    A/T
rs26875975
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21282318fVps54 : Intron1SNPT TTCT C TTTT TT  TTCC/T
rs26875974
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21282504fVps54 : Intron1SNPG GGAG   GGGG GG  GGAA/G
rs26875973
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21282555fVps54 : Intron1SNPT TTCT C TTTT TT  TTCC/T
rs26875972
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21282686fVps54 : Intron1SNPA AAGA G AAAA AA  AAGA/G
rs26875971
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21282710fVps54 : Intron1SNPC CCGC C CCCC CC  CCGC/G
rs240282910
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21283894fVps54 : Intron1SNP             C  T    C/T
rs26875970
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21285848fVps54 : Intron1SNPT   CT C TT   T     CC/T
rs263703720
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21286215fVps54 : Intron1SNP             G  A    A/G
rs26875969
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21286780fVps54 : Intron1SNPA   AA G A AA A   AAAA/G
rs216519712
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21287072fVps54 : Intron1SNP             T  C    C/T
rs239735394
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21287302fVps54 : Intron1SNP             A  T    A/T
rs26875968
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21287666fVps54 : Intron1SNPT TTCT C TTTT TT  TCCC/T
rs250289315
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21287799fVps54 : Intron1SNP             C  T    C/T
rs26862467
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21288111fVps54 : Intron1SNPT TTAT A TTTT TT  TAAA/T
rs26862466
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21288747fVps54 : Intron1SNPT TTCT   TTTT TT  T CC/T
rs219150800
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21289035fVps54 : Intron1SNP             G  A    A/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs236365887
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21289109fVps54 : Intron1SNP             A  G    A/G
rs26862465
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21289371fVps54 : Intron1SNPT TTCT C TTTT TT  TCCC/T
rs26862464
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21289852fVps54 : Intron1SNPA AAGA   AAAA AA  A GA/G
rs26862463
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21289857fVps54 : Intron1SNPG GG G T GGGG GG  GT G/T
rs26862462
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21290248fVps54 : Intron1SNPC CCTC C CCCC CC  CCCC/T
rs26862461
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21290396fVps54 : Intron1SNPC CCAC A CCCC CC  C AA/C
rs26862460
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21290785fVps54 : Intron1SNPC CGGC G CCCG CC  CGGC/G
rs26862459
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21291090fVps54 : Coding-Synonymous1SNPA AAGA A AAAA AA  AAGA/G
rs26862458
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21291264fVps54 : Intron1SNPT TTTT G TTTT TT  TTTG/T
rs26862457
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21291393fVps54 : Intron1SNPT TTGT G TTTT TT  TGGG/T
rs26862456
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21292272fVps54 : Intron1SNPA AAAA G AAAA AA  AGAA/G
rs26862455
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21292345fVps54 : Intron1SNPC CTCC C CCCT CC  CCCC/T
rs26862454
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21293106fVps54 : Intron2SNPT T CT C TT CCT T TCCC/T
rs26862453
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21293111fVps54 : Intron1SNPC CGCC   CCC  CC  C  C/G
rs26862452
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21293137fVps54 : Intron1SNPG GGGG A GGGG GG  GAGA/G
rs218333316
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21293313fVps54 : Intron1SNP             C  T    C/T
rs248730640
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21293514fVps54 : Intron1SNP             T  G    G/T
rs266004779
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21293758fVps54 : Intron1SNP             A  G    A/G
rs29468543
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21294393fVps54 : Intron2SNP CC   C  A           A/C
rs26862451
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21294560fVps54 : Intron1SNPG GGGG G GGGG GG  GAGA/G
rs26862450
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21295624fGm12042 : within coordinates of
Vps54 : Intron
1SNPG GGGG A GGGG GG  GGGA/G
rs26862449
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21295771fGm12042 : within coordinates of
Vps54 : Intron
1SNPC CCTC C CCCC CC  CCTC/T
rs26862448
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21295783fGm12042 : within coordinates of
Vps54 : Intron
1SNPT TTTT T TTTT TT  TGTG/T
rs26862447
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21295808fGm12042 : within coordinates of
Vps54 : Intron
1SNPC CCCC T CCCC CC  CCCC/T
rs26862446
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21296080fVps54 : Intron1SNPA AAAA G AAAA AA  AAAA/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs26862445
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21296576fVps54 : Intron1SNPT TTTT C TTTT TT  TTTC/T
rs26862444
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21296641fVps54 : Intron1SNPT TTTT G TTTT TT  TTTG/T
rs26862443
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21297373fVps54 : Intron1SNPC CCCC A CCCC CC  CACA/C
rs26862442
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21297422fVps54 : Intron2SNPT TCCT T TTTCCTTT TCCC/T
rs26862441
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21297444fVps54 : Intron1SNPC CCCC T CCCC CC  CCCC/T
rs248183525
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21297511fVps54 : Intron1SNP             A  G    A/G
rs26862440
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21298358fVps54 : Intron1SNPT T TT C TTT  TT  TTTC/T
rs26862439
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21298551fVps54 : Intron2SNPG GTGG   GGG TGGG GTGG/T
rs26862438
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21298870fVps54 : Intron1SNPG GGGG A GGGG GG  GGGA/G
rs26862437
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21299029fVps54 : Intron1SNPT TTTT T TTTT TT  TCTC/T
rs225902647
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21299112fVps54 : Intron1SNP             T  C    C/T
rs29386066
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21299195fVps54 : Intron3SNP      A  G   G  G    A/G
rs26862436
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21299243fVps54 : Intron1SNPT T TT G TTT  TT  T TG/T
rs26862435
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21299299fVps54 : Intron2SNPC CGGC C CCCGGCCC CGGC/G
rs26862434
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21299419fVps54 : Intron1SNPC CCCC G CCCC CC  CCCC/G
rs26862433
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21299992fVps54 : Coding-Synonymous1SNPT TCTT T TTTC TT  TTTC/T
rs26862432
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21300136fVps54 : Coding-Synonymous1SNPT TTTT C TTTT TT  T TC/T
rs26862431
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21300198fVps54 : Coding-NonSynonymous1SNPC CCCC T CCCC CC  CTCC/T
rs26862430
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21300337fVps54 : Intron1SNPT TTCT T TTTT TT  TTCC/T
rs26862429
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21300459fVps54 : Intron1SNPG GGAG   GGGG GG  GAAA/G
rs235001477
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21300469fVps54 : Intron1SNP             T  G    G/T
rs253872503
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21300470fVps54 : Intron1SNP             T  A    A/T
rs26862428
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21300522fVps54 : Intron1SNPT TGTT T TTTG TT  TTTG/T
rs26862427
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21301048fVps54 : Intron1SNPA A A  C  AAA AA  A  A/C
rs3712519
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21301446fVps54 : Intron1SNP    T C              C/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs4139821
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21301447fVps54 : Intron2SNP    G A      G  A    A/G
rs237768779
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21301511fVps54 : Intron1SNP             A  T    A/T
rs250325164
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21301584fVps54 : Intron1SNP             G  A    A/G
rs3713866
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21301647fVps54 : Intron1SNP    G T              G/T
rs213449423
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21302278fVps54 : Intron1SNP             A  G    A/G
rs26862426
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21302661fVps54 : Intron1SNPC CCC  T  CC  CC  C  C/T
rs230511744
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21302738fVps54 : Intron1SNP             G  A    A/G
rs247898915
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21303220fVps54 : Intron1SNP             T  C    C/T
rs26862425
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21303484fVps54 : Intron1SNPA AAAA G AAAA AA  A AA/G
rs26862424
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21303920fVps54 : Intron1SNPC CCCC T  CCC CC  C  C/T
rs26862423
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21304656fVps54 : Intron1SNPT TTTT C TTTT TT  T  C/T
rs51164849
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21305322fVps54 : Intron1SNP CC      C       T   C/T
rs26862422
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21305345fVps54 : Intron2SNPTTTTTT A TTT  T  AT  A/T
rs51925021
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21305441fVps54 : Intron1SNP CC      C       G   C/G
rs26862421
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21305469fVps54 : Intron1SNPC   C  G   CC C   C  C/G
rs50368389
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21305533fVps54 : Intron1SNP AA      A       G   A/G
rs26862420
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21305603fVps54 : Intron1SNPA      G          A  A/G
rs26862419
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21306446fVps54 : Coding-Synonymous1SNPA A A  G  A   A   A  A/G
rs26862418
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21306482fVps54 : Coding-Synonymous1SNPG G    C   G      G  C/G
rs26862417
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21306552fVps54 : Intron1SNPC CCC  T  CCC C   C  C/T
rs26862416
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21306599fVps54 : Intron1SNPT A    T      A   T  A/T
rs3689754
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21306611fVps54 : Intron1SNP    T C              C/T
rs226274417
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21307212fVps54 : Intron1SNP             T  C    C/T
rs249714379
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21307338fVps54 : Intron1SNP             T  A    A/T
rs6399901
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21307966fVps54 : Intron1SNP      G A            A/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs6400425
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21308054fVps54 : Intron1SNP      A G            A/G
rs6400474
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21308086fVps54 : Intron3SNPA AC  ACC AA CA A A  A/C
rs225605239
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21308087fVps54 : Intron1SNP             T  C    C/T
rs6400528
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21308121fVps54 : Intron1SNP      C T            C/T
rs26862415
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21308658fVps54 : Intron1SNPA A AA C   AA AA  A  A/C
rs26862414
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21308764fVps54 : Coding-Synonymous1SNPT TTT  C TTTT T   T  C/T
rs245644145
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21308936fVps54 : Intron1SNP             T  C    C/T
rs26862413
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21309143fVps54 : Intron1SNPC CCC  T  CC  C   C  C/T
rs258592788
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21309177fVps54 : Intron1SNP             G  T    G/T
rs225992733
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21309681fVps54 : Intron1SNP             C  A    A/C
rs26862412
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21309880fVps54 : Intron1SNPT  TT  C  TTT TT  T  C/T
rs26862411
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21310207fVps54 : Intron1SNPA A A  G  AA  AG  A  A/G
rs26862410
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21310986fVps54 : Intron1SNPT  TT  C T TT     T  C/T
rs238227136
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21311017fVps54 : Intron1SNP             C  A    A/C
rs26862409
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21311522fVps54 : Intron1SNPA A    G   A      A  A/G
rs256129982
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21312215fVps54 : Intron1SNP             T  A    A/T
rs26862408
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21312729fVps54 : Intron1SNPG GGGG   GGGG GG  GCGC/G
rs26862407
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21312995fVps54 : Intron1SNPG GGTG G GGGG GG  GGGG/T
rs26862406
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21313220fVps54 : Intron1SNPT TTTT C TTTT TT  TCTC/T
rs26862405
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21313792fVps54 : Intron1SNPT TTTT T TTTT TT  TCTC/T
rs26862404
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21313880fVps54 : Intron1SNPA AAAA A AAAA AA  ACAA/C
rs26862403
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21314015fVps54 : Intron1SNPG GGGG A GGGG GG  GAGA/G
rs26862402
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21314045fVps54 : Intron1SNPA AAAA G AAAA AA  AGAA/G
rs26862401
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21314068fVps54 : Intron1SNPC CCCC G CCCC CC  CGCC/G
rs26862400
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21314140fVps54 : Intron1SNPG GGGG A GGGG GG  GAGA/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs26862399
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21314153fVps54 : Intron1SNPC CCCC   CCCC CC  CGCC/G
rs26862398
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21314813fVps54 : Intron1SNPA AAAA G AAAA AA  AAAA/G
rs26862397
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21314871fVps54 : Intron1SNPG GGGG T GGGG GG  GTGG/T
rs26862396
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21315160fVps54 : Intron1SNPT   TT T TTTT T   TCTC/T
rs233963760
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21315504fVps54 : Intron1SNP             A  G    A/G
rs26862395
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21315605fVps54 : Intron1SNPT TTTT T TTTT TT  TCTC/T
rs26862394
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21315770fVps54 : Intron2SNPT TTCT C TTTTCTTT TCCC/T
rs263565257
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21315794fVps54 : Intron1SNP             T  C    C/T
rs232040448
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21315874fVps54 : Intron1SNP             G  A    A/G
rs6173533
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21316290fVps54 : Intron2SNPC CCCCCCTCCCC CC  CTCC/T
rs6188664
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21316739fVps54 : Intron2SNPG GGGGGGAGGGG GG  GAGA/G
rs26862393
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21316922fVps54 : Intron1SNPA AAAA C AAAA AA  ACAA/C
rs26862392
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21317097fVps54 : Intron1SNPG GGGG G GGGG GG  GGAA/G
rs26862391
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21317339fVps54 : Intron1SNPA AAAA A AAAA AA  AACA/C
rs244498434
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21317545fVps54 : Intron1SNP             G  A    A/G
rs26862390
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21318036fVps54 : Intron1SNPA AAAA A AAAA AA  ATAA/T
rs26862389
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21318421fVps54 : Intron2SNPC CCAC   CCCCACCC CACA/C
rs26862388
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21318435fVps54 : Intron1SNPA AAGA A AAAA AA  AAAA/G
rs26862387
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21318464fVps54 : Intron1SNPA AAAA   AAAA AA  ATAA/T
rs26862386
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21318597fVps54 : Intron1SNPA AAAA C AAAA AA  AAAA/C
rs26862385
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21319211fVps54 : Intron1SNPT TTGT   TTTT TT  TTGG/T
rs26862384
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21319389fVps54 : Intron1SNPG GGGG A GGGG GG  GGGA/G
rs26862383
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21319408fVps54 : Intron1SNPC CCCC C CCCC CC  CGCC/G
rs26862382
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21319454fVps54 : Intron1SNPT    T T      T   TC C/T
rs26862381
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21319876fVps54 : mRNA-UTR1SNPA AAAA   AAAA AA  AGAA/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs13471384
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21320326fVps54 : mRNA-UTR2SNP  G          G  AA   A/G
rs46206763
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21320720fUgp2 : Intron
Vps54 : mRNA-UTR
1SNP C               T   C/T
rs13471385
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21320962fUgp2 : Intron
Vps54 : mRNA-UTR
2SNPT TCCT C TTTCCTTT TCCC/T
rs218776395
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21321685fUgp2 : mRNA-UTR
Vps54 : 549 bp downstream of
1SNP             C  T    C/T
rs26862380
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21321875fUgp2 : mRNA-UTR
Vps54 : 739 bp downstream of
1SNPT TTTT   TTTT TT  TCTC/T
rs26862379
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21322343fUgp2 : Intron
Vps54 : 1207 bp downstream of
1SNPA AAAA C AAAA AA  AAAA/C
rs239169432
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21322894fUgp2 : Intron
Vps54 : 1758 bp downstream of
1SNP             G  A    A/G
rs26862378
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:21322923fUgp2 : Intron
Vps54 : 1787 bp downstream of
1SNPA AAAA C AAAA AA  ACAA/C

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
08/19/2014
MGI 5.19
The Jackson Laboratory