About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
Genome Coordinate Discrepancy
The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details).
 Symbol
Name
ID
Creld1
cysteine-rich with EGF-like domains 1
MGI:2152539

60 matching SNPs displayed


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs36666799
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:113431644fCreld1 : Locus-Region
Il17rc : Intron
1SNPGGGGG A GGAGGGGGGA/G
rs38785873
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:113431699fCreld1 : Locus-Region
Il17rc : Intron
1SNPGGGGG A GGAGGGGGGA/G
rs36392730
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:113431764fCreld1 : Locus-Region
Il17rc : Intron
1SNPGGGGG A GGAGGGGAGA/G
rs37434049
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:113431875fCreld1 : Locus-Region
Il17rc : Intron
1SNPGGGGG C GGCGGGGGGC/G
rs38917173
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:113431975fCreld1 : Locus-Region
Il17rc : Intron
1SNPGGGGG G GGGGGGGAGA/G
rs37046854
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:113432006fCreld1 : Locus-Region
Il17rc : Intron
1SNPAAAAA G AAGAAAAAAA/G
rs36949156
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:113432077fCreld1 : Locus-Region
Il17rc : Intron
1SNPCCCCC C CCCCCCCTCC/T
rs37088637
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:113432086fCreld1 : Locus-Region
Il17rc : Intron
1SNPAAAAA C AACAAAAAAA/C
rs38834431
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:113432170fCreld1 : Locus-Region
Il17rc : Intron
1SNPGGGGG A GGAGGGGGGA/G
rs36832231
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:113432227fCreld1 : Locus-Region
Il17rc : Intron
1SNPAAAAA G AAGAAAAAAA/G
rs37178391
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:113432244fCreld1 : Locus-Region
Il17rc : Intron
1SNPTTTTT A TTATTTTTTA/T
rs36450406
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:113432333fCreld1 : Locus-Region
Il17rc : Coding-NonSynonymous
1SNPCCCCC T CCTCCCCCCC/T
rs36758543
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:113432484fCreld1 : Locus-Region
Il17rc : Intron
1SNPCCCCC C CCCCCCCTCC/T
rs37348522
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:113432491fCreld1 : Locus-Region
Il17rc : Coding-NonSynonymous
1SNPCCCCC C CCCCCCCCTC/T
rs36279153
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:113432558fCreld1 : Locus-Region
Il17rc : Coding-Synonymous
1SNPGGGGG G GGGGGGGAGA/G
rs37485165
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:113432689fCreld1 : Locus-Region
Il17rc : Coding-NonSynonymous
1SNPGGGGG A GGAGGGGAGA/G
rs36931950
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:113432745fCreld1 : Locus-Region
Il17rc : Coding-Synonymous
1SNPCCCC  T  CTCC C CC/T
rs36441240
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:113432771fCreld1 : Locus-Region
Il17rc : Coding-Synonymous
1SNPGGGGG G GGGGGGGTGG/T
rs36354736
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:113432942fCreld1 : Locus-Region
Il17rc : Coding-Synonymous
1SNPTTTTT C TTCTTTTCTC/T
rs37324408
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:113433012fCreld1 : Locus-Region
Il17rc : Coding-NonSynonymous
1SNPAAAAA G AAGAAAA AA/G
rs36274505
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:113433025fCreld1 : Locus-Region
Il17rc : Coding-NonSynonymous
1SNPGGGGG A GGAGGGGAGA/G
rs38099898
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:113433166fCreld1 : Locus-Region
Il17rc : Locus-Region
1SNPCCCCC T CCTCCCCTCC/T
rs36698647
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:113433250fCreld1 : Locus-Region
Il17rc : Locus-Region
1SNPGGGGG C GGCGGGGCGC/G
rs38159067
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:113433351fCreld1 : Locus-Region
Il17rc : Locus-Region
1SNPTTTTT A TTATTTTATA/T
rs36425613
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:113433479fCreld1 : Locus-Region
Il17rc : Locus-Region
1SNPCCCCC T CCTCCCCTCC/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs39526823
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:113433596fCreld1 : mRNA-UTR
Il17rc : Locus-Region
1SNPTTTTT C TTCTTTTCTC/T
rs39203547
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:113433647fCreld1 : mRNA-UTR1SNPCCCCC A CCACCCCACA/C
rs37699236
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:113433728fCreld1 : mRNA-UTR1SNPCCCCC T CCTCCCC CC/T
rs36697956
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:113433754fCreld1 : mRNA-UTR1SNPCCCCC G CC CCCCGCC/G
rs38022788
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:113434756fCreld1 : Intron1SNPAAAAA G AAGAAAAGAA/G
rs36484933
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:113434880fCreld1 : Intron1SNPGGGGG G GGGGGGGAGA/G
rs36957293
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:113435231fCreld1 : Intron1SNPCCCCC C CCCCCCCTCC/T
rs38873894
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:113437509fCreld1 : Intron1SNPGGGGG A GGAGGGGGGA/G
rs36946090
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:113437612fCreld1 : Intron1SNPAAAAA C AACAAAACAA/C
rs36270500
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:113437660fCreld1 : Intron1SNPCCCCC C CCCCCCCTCC/T
rs36294265
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:113437935fCreld1 : Intron1SNPTTTTT A TTATTTTATA/T
rs38027645
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:113438052fCreld1 : Intron1SNPCCCCC G CCGCCCCCCC/G
rs38351052
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:113438080fCreld1 : Coding-Synonymous1SNPGGGGG T GGTGGGGGGG/T
rs37193919
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:113438227fCreld1 : Intron1SNPGGGGG A GGAGGGGGGA/G
rs38337315
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:113438578fCreld1 : Intron1SNPGGGGG G GGGGGGGTGG/T
rs37514003
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:113438756fCreld1 : Intron1SNPTT T  C  TC    CTC/T
rs37291789
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:113438852fCreld1 : Intron1SNPAAAAA G AAGAAAAAAA/G
rs38227468
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:113439210fCreld1 : Intron1SNPAAAAA C AACAAAAAAA/C
rs36572824
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:113439868fCreld1 : Intron1SNPTTTTT C TTCTTTTTTC/T
rs36889190
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:113439935fCreld1 : Intron1SNPTTTTT C TTCTTTTCTC/T
rs6284535
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:113440143fCreld1 : Intron1SNP     A G         A/G
rs6284537
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:113440144fCreld1 : Intron1SNP     T C         C/T
rs6298370
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:113440316fCreld1 : Intron1SNP     T C         C/T
rs6299000
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:113440440fCreld1 : Intron1SNP     A G         A/G
rs38306003
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:113441564fCreld1 : Intron1SNPCCCCC A CCACCCCACA/C
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs37400133
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:113441882fCreld1 : Intron1SNPTTTTT C TTCTTTTCTC/T
rs38475559
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:113442137fCreld1 : Coding-Synonymous
Prrt3 : Locus-Region
1SNPTTTTT C TTCTTTTCTC/T
rs37276104
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:113442162fCreld1 : Coding-NonSynonymous
Prrt3 : Locus-Region
1SNPAAAAA C AACAAAACAA/C
rs37306757
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:113442382fCreld1 : Intron
Prrt3 : Locus-Region
1SNPCCCCC T CCTCCCCTCC/T
rs39280991
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:113442447fCreld1 : Intron
Prrt3 : Locus-Region
1SNPCCCCC A CCACCCC CA/C
rs36288895
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:113442520fCreld1 : Intron
Prrt3 : Locus-Region
1SNPAAAAA T AATAAAATAA/T
rs36829923
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:113442546fCreld1 : Intron
Prrt3 : Locus-Region
1SNPCCCCC C CCCCCCCTCC/T
rs37870676
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:113442553fCreld1 : Intron
Prrt3 : Locus-Region
1SNPAAAAA G AAGAAAAAAA/G
rs36304662
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:113442572fCreld1 : Intron
Prrt3 : Locus-Region
1SNPGGGGG A GGAGGGGGGA/G
rs37376838
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:113442588fCreld1 : Intron
Prrt3 : Locus-Region
1SNPGGGGG A GGAGGGGGGA/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
05/22/2013
MGI 5.13
The Jackson Laboratory