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Genome
Coordinate Discrepancy The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details). |
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Symbol Name ID |
Strc stereocilin MGI:2153816 |
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) |  | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | Allele Summary (all strains) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs27439774 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121188312 | f | Ckmt1 : Intron Strc : Locus-Region | 2 | SNP | G | G | G | G | G | G | C | G | G | G | G | G | G | G | G | C | G | C/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29621014 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121188363 | f | Ckmt1 : Intron Strc : Locus-Region | 1 | SNP | G | G | C | C/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29504227 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121188366 | f | Ckmt1 : Intron Strc : Locus-Region | 1 | SNP | T | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27439773 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121188631 | f | Ckmt1 : Intron Strc : Locus-Region | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | T | A | A/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27439772 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121188674 | f | Ckmt1 : Intron Strc : Locus-Region | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | T | A | A/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29505504 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121189844 | f | Ckmt1 : Locus-Region Strc : Intron | 1 | SNP | C | C | C | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32830232 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121189929 | f | Ckmt1 : Locus-Region Strc : Intron | 1 | SNP | G | G | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27439771 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121190070 | f | Strc : Coding-Synonymous | 2 | SNP | G | G | G | G | G | A | G | G | G | A | G | G | G | G | A | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27439770 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121190198 | f | Strc : Intron | 2 | SNP | G | G | G | G | G | A | G | G | G | A | G | G | G | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27439769 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121190354 | f | Strc : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27439768 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121190747 | f | Strc : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27439767 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121190809 | f | Strc : Coding-NonSynonymous | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | C | G | C/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27439766 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121191024 | f | Strc : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27439765 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121191434 | f | Strc : Intron | 2 | SNP | T | T | T | T | T | C | T | T | T | C | T | T | T | T | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29563100 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121191826 | f | Strc : Intron | 1 | SNP | C | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27439764 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121191850 | f | Strc : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27439763 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121191878 | f | Strc : Intron | 2 | SNP | T | T | T | T | T | T | C | C | T | T | C | C | T | T | T | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27439762 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121192122 | f | Strc : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27439761 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121192293 | f | Strc : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33486572 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121192322 | f | Strc : Intron | 1 | SNP | C | C | C | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13476739 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121192484 | f | Strc : Coding-Synonymous | 3 | SNP | C | C | C | C | C | C | T | T | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | T | T | T | C | C | C | C | C | T | C | T | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C/T |
| rs27439760 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121192792 | f | Strc : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27439759 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121192843 | f | Strc : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32948294 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121192864 | f | Strc : Intron | 1 | SNP | T | T | G | T | G/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27439758 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121193312 | f | Strc : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) | | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | Allele Summary (all strains) |
| rs27439757 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121193535 | f | Strc : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | T | A | A | A | A | A | A | A/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33481707 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121194309 | f | Strc : Intron | 1 | SNP | G | G | A | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs3723297 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121194392 | f | Strc : Intron | 3 | SNP | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | G | A | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27439756 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121194491 | f | Strc : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | C | A | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs3664905 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121194608 | f | Strc : Intron | 2 | SNP | G | G | A | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29810001 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121195336 | f | Strc : Intron | 1 | SNP | T | T | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33060141 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121195528 | f | Strc : Intron | 1 | SNP | C | C | A | C | A/C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27439755 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121196577 | f | Strc : Intron | 1 | SNP | A | T | T | A | A/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27439754 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121197026 | f | Strc : Intron | 2 | SNP | C | C | C | C | C | C | T | T | C | C | T | T | C | C | C | T | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27439753 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121197093 | f | Strc : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27439752 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121197791 | f | Strc : Intron | 2 | SNP | C | C | C | C | C | G | C | C | C | G | C | C | C | C | G | C | C/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29539876 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121197954 | f | Strc : Intron | 1 | SNP | A | A | A | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33625843 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121197960 | f | Strc : Intron | 1 | SNP | G | G | G | T | G | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27439751 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121198231 | f | Strc : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27439750 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121198409 | f | Strc : Coding-Synonymous | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27439749 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121198590 | f | Strc : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27439748 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121198738 | f | Strc : Coding-Synonymous | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27439747 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121198920 | f | Strc : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27439746 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121199505 | f | Strc : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27439745 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121199555 | f | Strc : Intron | 1 | SNP | G | A | G | A | A | G | A | G | G | G | G | A | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27439744 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121200277 | f | Strc : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27439743 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121200465 | f | Strc : Coding-Synonymous | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | C | A | C | C | C | C | C | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs6225876 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121200852 | f | Strc : Intron | 1 | SNP | G | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27439742 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121200854 | f | Strc : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | G | C | C | C | C | G | C/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs6225889 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121200855 | f | Strc : Intron | 1 | SNP | G | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) | | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | Allele Summary (all strains) |
| rs27439741 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121200896 | f | Strc : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | A | T | T | T | T | A | T | A/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs6226001 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121200920 | f | Strc : Intron | 1 | SNP | A | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs6226548 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121201015 | f | Strc : Coding-Synonymous | 2 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27439740 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121201135 | f | Strc : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27439739 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121201172 | f | Strc : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27439738 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121201661 | f | Strc : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27439737 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121201711 | f | Strc : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27439736 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121202248 | f | Strc : Intron | 2 | SNP | G | G | G | G | G | C | G | G | G | C | G | G | G | G | C | G | C/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27439735 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121202299 | f | Strc : Intron | 2 | SNP | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32937182 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121202760 | f | Strc : Coding-NonSynonymous | 1 | SNP | A | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27439734 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121203305 | f | Strc : Coding-Synonymous | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27439733 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121204066 | f | Strc : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | G | T | T | T | T | G | T | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27439732 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121204151 | f | Strc : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27439731 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121204498 | f | Strc : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27439730 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121204515 | f | Strc : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | T | G | G | G | G | T | G | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27439729 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121204627 | f | Strc : Coding-Synonymous | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27439728 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121204815 | f | Strc : Coding-Synonymous | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | A | C | C | C | C | C | C | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27439727 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121205424 | f | Strc : Coding-Synonymous | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27439726 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121205599 | f | Strc : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | T | G | G | G | G | G | G | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29618556 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121206483 | f | Strc : Intron | 1 | SNP | A | A | C | A | A/C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33464279 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121206572 | f | Strc : Coding-Synonymous | 1 | SNP | T | T | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27439725 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121206838 | f | Strc : Locus-Region | 2 | SNP | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | T | C | C | C | C | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27439724 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121206962 | f | Strc : Locus-Region | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27439723 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr2:121207058 | f | Strc : Locus-Region | 2 | SNP | G | G | G | G | G | A | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | A/G |
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc |
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last database update 05/08/2013 MGI 5.13 |
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