About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Scgb3a2
secretoglobin, family 3A, member 2
MGI:2153470

66 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs31951518
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43762292fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : 1997 bp upstream of
1SNPG GGGG   G G  G       A          G      A G    A A/G
rs30116674
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43762518fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : Locus-Region
2SNP TC        T                                     C/T
rs49622402
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43762569fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : Locus-Region
1SNP GG        G                                     G
rs31951517
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43762736fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : Locus-Region
3SNPC CCCC     C  T    T  C          CC     C C    C C/T
rs48196763
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43763114fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : Locus-Region
2SNP GG        G       A              G              A/G
rs31951516
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43763241fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : Locus-Region
3SNPGGGGGG     G  T    T  G          GG   G G G    G G/T
rs31951515
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43763346fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : Locus-Region
1SNPG GGGG     G  G       G          T      G T    G G/T
rs31951514
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43763495fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : Locus-Region
1SNP   GGG     G  G       G          A      G A    G A/G
rs31950453
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43763760fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : Locus-Region
3SNPC CCCC   C C  A    A  C          AC     C A    C A/C
rs46084042
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43763838fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : Locus-Region
2SNP  C        C       T              C              C/T
rs47240680
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43763923fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : Locus-Region
2SNP  T        T       G              T              G/T
rs31950452
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43763931fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : Locus-Region
3SNPA AAAA     A  T    T              A       T      A/T
rs31950451
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43763945fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : Locus-Region
3SNP  AAAA     A  G    G  A          AA       A    A A/G
rs31950450
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43764019fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : Locus-Region
3SNPC CCCC     C  G    G  C          CC       C      C/G
rs31950449
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43764175fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : Locus-Region
1SNPC CCCC   C C  C       C          A      C A    C A/C
rs31950448
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43764394fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : mRNA-UTR
1SNPC CCCC   A CCAC       A          A      A A    A A/C
rs31950447
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43764651fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : Intron
1SNPG GGGG   A G AG       G          G      G G    G A/G
rs30001499
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43764656fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : Intron
4SNPAAAAAAG  G AA G    G  G          GA     G G    G A/G
rs13483330
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43764720fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : Intron
4SNPCTCCTTCCCCCTCCCCTCCCCCCCCCCTCTCCCCCCCCCCCCCCTCCCCC/T
rs31950446
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43764736fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : Intron
1SNPA AAAA   G AAGA       G          G      G G    G A/G
rs31950445
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43764770fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : Intron
1SNPA AAAA   T AATA       T          A      T A    T A/T
rs31950444
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43764804fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : Intron
1SNPC CCCC   C CCCC       T                 T C    T C/T
rs31949713
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43764898fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : Intron
1SNPA AAAA   T AATA       T          A      T A    T A/T
rs31949712
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43764957fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : Intron
1SNPT TTTT   C TTCT       C                 C T    C C/T
rs31949711
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43765013fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : Intron
1SNPA AAAA   A AAAA       G          A      G A    G A/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs31949710
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43765067fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : Intron
1SNPT TTTT   T TTTT       G          G      G T    G G/T
rs31949709
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43765194fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : Intron
1SNPG GGGG   A GGAG       G          G      G      G A/G
rs31949708
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43765275fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : Intron
3SNPGGGGGG   G  GGA    A  G           G     G G    G A/G
rs31949707
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43765301fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : Intron
1SNPA AAAA   A AAAA       C                 C A    C A/C
rs31949706
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43765343fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : Intron
1SNPC CCCC   C CCCC       T          C        C      C/T
rs31949705
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43765441fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : Intron
1SNPA AAAA   A AAAA       G                 G      G A/G
rs31949704
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43765480fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : Intron
3SNPTTTTTT   A TTAA    A              T     A      A A/T
rs31948823
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43765620fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : Intron
1SNPT TTTT   T  TTT       A                 A T    A A/T
rs31948822
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43765635fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : Intron
1SNPT TTTT   T TTTT       C          T      C T    C C/T
rs31948821
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43765666fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : Intron
1SNPG GGGG   G GGGG       C          G      C G    C C/G
rs31948820
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43765748fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : Intron
1SNPT TTTT   A TTAT       T          T      T      T A/T
rs31948819
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43765806fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : Intron
1SNPG GGGG   G GGGG       A          G      A G    A A/G
rs31948818
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43765947fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : Intron
1SNPA AAAA   G AAGA       G                        G A/G
rs30068067
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43765978fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : Intron
4SNPAAA AAC  C AACC    C  C          CA       C    C A/C
rs31948817
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43765986fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : Intron
1SNP  CCCC   C  CCC       T          C        C    T C/T
rs31948816
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43766004fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : Intron
1SNPA AAAA   C AACA       A          C      A C    A A/C
rs31948815
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43766034fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : Intron
1SNPC CCCC   C CCCC       A          C      A C    A A/C
rs31948814
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43766107fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : Intron
1SNPC CCCC   A CCAC       C          C      C A    C A/C
rs31947913
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43766143fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : Intron
1SNPC CCCC   T CCTC       C          C      C C    C C/T
rs31947912
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43766153fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : Intron
1SNPT TTTT   T TTTT       C          T      C T    C C/T
rs31947911
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43766256fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : Intron
1SNPC CCCC   C CCCC       T                 T C    T C/T
rs30178877
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43766602fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : Intron
3SNP GG   A    G       G              G              A/G
rs31947910
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43766701fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : Intron
1SNPC CCCC   C CCCC       T          T      T C    T C/T
rs31947909
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43766808fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : Coding-Synonymous
1SNPC CCCC   C CCCC       T                 T C    T C/T
rs31947908
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43766835fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : Coding-NonSynonymous
1SNPA AAAA   A AAAA       G          G      G A    G A/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs31947907
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43766927fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : Coding-Synonymous
1SNPT TTTT   T TTTT       G          T      G T      G/T
rs30026047
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43767047fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : within coordinates of
4SNPAAAAAAG  G AAGG    G  A          GA     A G    A A/G
rs30061683
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43767100fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : within coordinates of
4SNPCCCCCCG  G CCGG    G  G          GC     G G    G C/G
rs31947906
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43767145fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : mRNA-UTR
1SNPG GGGG   G GGGG       A          G      A G    A A/G
rs31947905
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43767157fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : mRNA-UTR
1SNPG GGGG   G GGGG       A          G      A G    A A/G
rs31947904
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43767206fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : mRNA-UTR
1SNPG GGGG   G GGGG       A          G        G    A A/G
rs31947123
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43767260fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : mRNA-UTR
1SNP  TTTT   T  T T       G                 G      G G/T
rs31947122
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43767279fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : mRNA-UTR
1SNPA AAAA   T AATA                                  A/T
rs31947121
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43767290fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : mRNA-UTR
1SNPA AAAA   A AAAA       G                 G A    G A/G
rs31947120
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43767411fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : Intron
3SNPAAAAAA   A AAAG    G              A       A      A/G
rs30004923
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43767522fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : Intron
3SNP GA        G       G              A              A/G
rs30157109
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43767814fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : Intron
3SNP TT   G    T       G              T              G/T
rs31947119
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43768335fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : 936 bp downstream of
1SNPG GGGG   G GGGG       A                 A G    A A/G
rs31947118
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43768392fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : 993 bp downstream of
1SNPT TTTT   C TTCT       C                 C C    C C/T
rs29682713
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43768609fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : 1210 bp downstream of
3SNP AA   G    A       G              A              A/G
rs29575090
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr18:43768843fbaw : within coordinates of
Scgb3a2 : 1444 bp downstream of
3SNP AA   C    A       C              A              A/C

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
10/08/2014
MGI 5.20
The Jackson Laboratory