About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Sepn1
selenoprotein N, 1
MGI:2151208

114 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs239079210
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134537022fctl : within coordinates of
Mtfr1l : Locus-Region
Sepn1 : 870 bp downstream of
1SNP            G A   A/G
rs52488332
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134537253fctl : within coordinates of
Mtfr1l : Locus-Region
Sepn1 : 639 bp downstream of
1SNP  G               G
rs28291911
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134537667fctl : within coordinates of
Sepn1 : Locus-Region
4SNPCCC   TCC T CTCCTCC/T
rs28291910
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134537682fctl : within coordinates of
Sepn1 : Locus-Region
4SNPGGAA  GGA G AGAGGAA/G
rs28291909
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134537761fctl : within coordinates of
Sepn1 : Locus-Region
1SNPC CC   TCCCC C CCCC/T
rs48130465
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134538158fctl : within coordinates of
Sepn1 : mRNA-UTR
2SNP T      T   T T   T
rs32999041
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134538307fctl : within coordinates of
Sepn1 : mRNA-UTR
3SNP AA   G A   A A   A/G
rs28291908
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134538490fctl : within coordinates of
Sepn1 : mRNA-UTR
4SNPG GG  T   T GTGGTGG/T
rs28291907
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134538596fctl : within coordinates of
Sepn1 : mRNA-UTR
4SNPC C   TT  T CTCCTCC/T
rs32373575
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134539227fctl : within coordinates of
Sepn1 : mRNA-UTR
2SNP GA   A A         A/G
rs13468444
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134539451rctl : within coordinates of
Sepn1 : mRNA-UTR
2SNP AA     A   A A   A
rs28291906
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134539481fctl : within coordinates of
Sepn1 : mRNA-UTR
1SNPT TT   CTTTT T TTTC/T
rs13468445
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134539570rctl : within coordinates of
Sepn1 : mRNA-UTR
4SNPTTTT  CCT CTTCTTCTC/T
rs32933553
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134539952fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
3SNP TT   A T   T T   A/T
rs31982097
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134540034fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
2SNP CC   T C         C/T
rs32191105
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134540069fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
3SNPGGG   A G   G G   A/G
rs46896775
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134540284fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
2SNP CT     T   T T   C/T
rs32186187
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134540568fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
3SNP GG   A G   G G   A/G
rs32388697
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134540569fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
3SNP TT   C T   T T   C/T
rs32230499
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134540607fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
2SNP TC   C C         C/T
rs13468446
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134540685rctl : within coordinates of
Sepn1 : Coding-Synonymous
3SNPAAA   G A   A A   A/G
rs13468448
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134540704rctl : within coordinates of
Sepn1 : Coding-NonSynonymous
3SNPAAA   T A   A A   A/T
rs28291905
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134541044fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
1SNPA AA   GAAAA A AAAA/G
rs32305106
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134541078fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
2SNPAAG   G G         A/G
rs32748887
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134541367fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
2SNP TG               G/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs31962876
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134541376fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
2SNP TG               G/T
rs32408527
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134541427fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
3SNP GA     A   A A   A/G
rs47001774
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134541672fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
1SNP  C     C         C
rs32623026
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134541754fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
3SNPCCT   C T   T T   C/T
rs28291904
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134541808fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
4SNPAAGG  AGG G GGGAGGA/G
rs28291903
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134541920fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
3SNPTTCC    C C  C TCCC/T
rs28291902
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134542021fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
1SNPC CC    CCCC C CTCC/T
rs28291901
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134542196fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
1SNPC CC   TC CC C CCCC/T
rs28291900
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134542231fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
1SNPC CCC  TCCCC C CCCC/T
rs28291899
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134542487fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
3SNPCCTT  TCT    C  TTC/T
rs47478034
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134542588fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
1SNP GA               A/G
rs49459104
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134542638fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
1SNP GA               A/G
rs28291898
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134542639fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
2SNP CGG     GCG C  GGC/G
rs32024563
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134542659fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
2SNPCCT   T           C/T
rs48913332
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134542678fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
1SNP TA               A/T
rs28291897
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134542702fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
1SNPC TT         C CCTC/T
rs28291896
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134542857fctl : within coordinates of
Sepn1 : Coding-Synonymous
3SNPCCTT  TCTTTT T  TTC/T
rs28291895
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134542909fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
1SNPG GG   GG  G A GGGA/G
rs28291894
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134542929fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
4SNPGGAA  GG  G AGGGAAA/G
rs28291893
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134543156fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
3SNP TCC  CTCCTC T   CC/T
rs32450257
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134543167fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
2SNP TA   A A         A/T
rs32146020
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134543267fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
3SNP CA   C A   A A   A/C
rs32287178
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134543300fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
3SNP CT   C T   T T   C/T
rs28291892
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134543562fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
1SNPT CC    CC C C T CC/T
rs28291891
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134543563fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
1SNP  GG    GGAG A  AGA/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs28291890
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134543586fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
1SNPC TT   CTT T C CCTC/T
rs32132306
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134543854fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
2SNPT C   C C         C/T
rs28291889
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134543872fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
2SNPC TT   C  C  C  CTC/T
rs28291888
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134543899fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
3SNPT CCC CCCCCC C  CCC/T
rs28291887
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134543906fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
1SNPA AA   A  AA A CAAA/C
rs32423149
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134544098fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
2SNPTTA   A A         A/T
rs28291886
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134544212fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
3SNPCCTT TTCTTCT C CCTC/T
rs32784665
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134544481fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
3SNP T    C T   T T   C/T
rs241513407
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134544510fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
1SNP            C C   C
rs28291885
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134544599fctl : within coordinates of
Sepn1 : Coding-NonSynonymous
1SNPA AA   GAAGA G AGAA/G
rs28291884
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134545806fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
1SNPC CC   CCCCC C CCTC/T
rs28291883
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134546121fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
1SNPC CC   T  T  T CTTC/T
rs28291882
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134546181fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
1SNPG GG   GGGGG A GAGA/G
rs28291881
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134546472fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
1SNPC CC   C     T CTCC/T
rs28291880
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134546560fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
1SNPG GG   GGGAG A GAGA/G
rs28291879
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134546613fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
1SNPG GGG   GG G C GCGC/G
rs28291878
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134547645fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
1SNPT TT   C TC  C TCTC/T
rs28291877
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134547720fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
1SNPC  C   G  G  G CGGC/G
rs32116111
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134548382fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
2SNP  G   A G   G G   A/G
rs32729511
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134548493fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
3SNP CC   T C   C C   C/T
rs31891057
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134548502fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
3SNP TT   C T   T T   C/T
rs32609597
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134549024fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
2SNP CC   T C   C C   C/T
rs32491203
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134549155fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
3SNP AA   G A   A A   A/G
rs32938316
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134549278fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
3SNP  T   A T   T T   A/T
rs47504028
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134549681fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
2SNP  T         T C   C/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs51228832
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134549861fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
2SNP  G     G   G T   G/T
rs50620685
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134549863fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
2SNP  A     A   A C   A/C
rs51868607
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134549936fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
2SNP  T     T   T T   T
rs50358446
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134550113fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
2SNP  G         G G   G
rs45959229
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134550996fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
2SNP  A     A   A A   A
rs46668743
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134551193fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
2SNP TT     T   T T   T
rs46889794
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134551310fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
2SNP CC     C   C C   C
rs50891971
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134551551fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
2SNP GG         G G   G
rs51256975
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134551567fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
2SNP G      G   G G   G
rs50428693
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134551608fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
2SNP CC     C   C G   C/G
rs50221297
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134551610fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
2SNP TT     T   T G   G/T
rs223779528
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134551627fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
1SNP            C T   C/T
rs236675683
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134551640fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
1SNP            C C   C
rs256683370
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134551754fctl : within coordinates of
Sepn1 : Intron
1SNP            T T   T
rs218340247
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134552155fctl : within coordinates of
Sepn1 : mRNA-UTR
1SNP            C A   A/C
rs240514376
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134552229fctl : within coordinates of
Sepn1 : Locus-Region
1SNP            A A   A
rs259580560
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134552251fctl : within coordinates of
Sepn1 : Locus-Region
1SNP            G G   G
rs220542629
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134552295fctl : within coordinates of
Sepn1 : Locus-Region
1SNP            C C   C
rs246138767
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134552360fctl : within coordinates of
Sepn1 : Locus-Region
1SNP            G G   G
rs265032796
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134552531fctl : within coordinates of
Sepn1 : Locus-Region
1SNP            T A   A/T
rs230796998
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134552703fctl : within coordinates of
Sepn1 : Locus-Region
1SNP            A A   A
rs252469121
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134552820fctl : within coordinates of
Sepn1 : Locus-Region
1SNP            A A   A
rs261931852
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134553079fctl : within coordinates of
Sepn1 : Locus-Region
1SNP            T A   A/T
rs228558332
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134553168fctl : within coordinates of
Sepn1 : Locus-Region
1SNP            T C   C/T
rs248875405
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134553229fctl : within coordinates of
Sepn1 : Locus-Region
1SNP            C T   C/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs215291628
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134553365fctl : within coordinates of
Sepn1 : Locus-Region
1SNP            T T   T
rs234936597
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134553529fctl : within coordinates of
Sepn1 : Locus-Region
1SNP            C T   C/T
rs52377784
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134553600fctl : within coordinates of
Sepn1 : Locus-Region
1SNP            A T   A/T
rs45966771
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134553654fctl : within coordinates of
Sepn1 : Locus-Region
2SNP        G   G A   A/G
rs50512058
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134553671fctl : within coordinates of
Sepn1 : Locus-Region
2SNP            G A   A/G
rs48289035
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134553789fctl : within coordinates of
Sepn1 : Locus-Region
2SNP  G     G   G G   G
rs50666127
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134553805fctl : within coordinates of
Sepn1 : Locus-Region
2SNP  G     G   G G   G
rs48564936
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134553956fctl : within coordinates of
Sepn1 : Locus-Region
2SNP  G         G G   G
rs48514188
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134553975fctl : within coordinates of
Sepn1 : Locus-Region
2SNP  C     C   C C   C
rs48688456
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134554008fctl : within coordinates of
Sepn1 : Locus-Region
2SNP  A     A   A A   A
rs48282679
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134554059fctl : within coordinates of
Sepn1 : Locus-Region
2SNP  T     T   T T   T
rs49727463
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134554079fctl : within coordinates of
Sepn1 : Locus-Region
2SNP  C     C   C C   C
rs45943004
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134554097fctl : within coordinates of
Sepn1 : Locus-Region
2SNP  C     C   C C   C
rs51867865
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134554150fctl : within coordinates of
Sepn1 : Locus-Region
2SNP  T     T   T T   T

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
12/16/2014
MGI 5.20
The Jackson Laboratory