About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Chrng
cholinergic receptor, nicotinic, gamma polypeptide
MGI:87895

72 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs31841882
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87202733fChrng : 1924 bp upstream of
Splchl2 : within coordinates of
3SNPG G    A  G    G            A       A/G
rs8259865
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87203304fChrng : 1353 bp upstream of
Splchl2 : within coordinates of
1SNP  C C CCC C   C TCCC          CC    C/T
rs8259866
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87203377fChrng : 1280 bp upstream of
Splchl2 : within coordinates of
1SNP  GGGGGGG G   G AGGG          GG    A/G
rs8259867
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87203397fChrng : 1260 bp upstream of
Splchl2 : within coordinates of
1SNP  GGGGGGG G   G AGGG          GG    A/G
rs8259868
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87203412fChrng : 1245 bp upstream of
Splchl2 : within coordinates of
12Mixed  ??????? ?   ? -???          ??    -/A/C/G/T
rs8259880
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87203441fChrng : 1216 bp upstream of
Splchl2 : within coordinates of
1SNP  CCCCCCC C   C TCCC          CC    C/T
rs8259881
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87203481fChrng : 1176 bp upstream of
Splchl2 : within coordinates of
1SNP  CCCCCCC C   C TCCC          CC    C/T
rs8259882
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87203513fChrng : 1144 bp upstream of
Splchl2 : within coordinates of
1SNP  AAAAAAA A   A TAAA          AA    A/T
rs8259883
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87203709fChrng : 948 bp upstream of
Splchl2 : within coordinates of
1SNP   AA AAG A   A GAAA          AA    A/G
rs8259884
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87203711fChrng : 946 bp upstream of
Splchl2 : within coordinates of
1SNP   GG GGA G   G AGGG          GG    A/G
rs33059926
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87203739fChrng : 918 bp upstream of
Splchl2 : within coordinates of
1SNPA AAA A G AAGA      A      A    AG AA/G
rs8237640
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87203879fChrng : Locus-Region
Splchl2 : within coordinates of
2SNPA AAAA? G AAGA      A      A  A AG AA/G
rs33059023
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87203955fChrng : Locus-Region
Splchl2 : within coordinates of
1SNPA AAA A G AAGA      A      A    AG AA/G
rs3022824
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87204114fChrng : Locus-Region
Splchl2 : within coordinates of
2SNPTTTCC T C TTCC      T      T    TC CC/T
rs3022825
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87204137fChrng : Locus-Region
Splchl2 : within coordinates of
4SNPCCCTT CTC CCCT C    CCTTTCC?TT  CCTCC/T
rs33059019
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87204198fChrng : Locus-Region
Splchl2 : within coordinates of
1SNPC CCC C G CCCC      C      C    CC CC/G
rs33059017
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87204297fChrng : Locus-Region
Splchl2 : within coordinates of
1SNPT TTT T C TTCT      T      T    TC TC/T
rs33059015
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87204330fChrng : Locus-Region
Splchl2 : within coordinates of
1SNPG GGG G C GGCG      G      G    GC GC/G
rs33058263
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87204473fChrng : Locus-Region
Splchl2 : within coordinates of
1SNPC CCC C G CCGC      C      C    CG CC/G
rs33058261
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87204525fChrng : Locus-Region
Splchl2 : within coordinates of
1SNPA AAA A A AAGA      A      A    AG AA/G
rs33058259
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87204551fChrng : Locus-Region
Splchl2 : within coordinates of
2SNPG GGG G G GGGG A    G      GG   GG AA/G
rs258292021
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87204690fChrng : Locus-Region
Splchl2 : within coordinates of
1SNP               A            T       A/T
rs33058257
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87204884fChrng : Locus-Region
D1Mit51 : within coordinates of
D1Mit51.1 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
1SNPG GGG G G GGGG      G      G    GA GA/G
rs33058255
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87204962fChrng : Locus-Region
D1Mit51 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
1SNPC CCC C G CCCC      C      C    CC CC/G
rs32224158
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87205013fChrng : Locus-Region
D1Mit51 : within coordinates of
Splchl2 : within coordinates of
1SNP       A  C                         A/C
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs33057403
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87205125fChrng : Locus-Region
Splchl2 : within coordinates of
2SNPC CCC C T CCTC T    C      CC   CT TC/T
rs232751430
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87205130fChrng : Locus-Region
Splchl2 : within coordinates of
1SNP               A            G       A/G
rs33057401
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87205427fChrng : Locus-Region
Splchl2 : within coordinates of
2SNPC CCC C C CCTC T    C      CT   CT TC/T
rs33057399
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87205797fChrng : Locus-Region
Splchl2 : within coordinates of
2SNPG GGG G A GGAG A    G      GG   GA AA/G
rs3022826
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87205848fChrng : Coding-NonSynonymous
Splchl2 : within coordinates of
3SNPTTTGG TGG TTGG      T      T    TG GG/T
rs33057396
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87205900fChrng : Intron
Splchl2 : within coordinates of
1SNPG GGG G G GGGG      G      G    GG AA/G
rs236056724
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87205953fChrng : Intron
Splchl2 : within coordinates of
1SNP               A            G       A/G
rs260825930
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87205954fChrng : Intron
Splchl2 : within coordinates of
1SNP               T            A       A/T
rs33057394
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87206291fChrng : Intron
Splchl2 : within coordinates of
1SNPG GGG G G G AG      G      G    GG GA/G
rs31919778
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87206308fChrng : Intron
Splchl2 : within coordinates of
3SNPG GCC GCC GGCC      G      G    GC CC/G
rs33056571
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87206336fChrng : Intron
Splchl2 : within coordinates of
2SNPT TTT T   TTCT C    T      TT   TC  C/T
rs33056569
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87206343fChrng : Intron
Splchl2 : within coordinates of
2SNPG GGG G A GGGG A    G      GG   GG AA/G
rs33056567
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87206417fChrng : Intron
Splchl2 : within coordinates of
2SNPG GGG G A GGGG A    G      GG   GG AA/G
rs33056565
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87206491fChrng : Coding-Synonymous
Splchl2 : within coordinates of
2SNPA AAA A G AAGA G    A      AA   AG GA/G
rs33063486
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87206583fChrng : Intron
Splchl2 : within coordinates of
1SNPC CCC C C CCTC      C      C    CT CC/T
rs33063484
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87206596fChrng : Intron
Splchl2 : within coordinates of
2SNPT TTT T C TTCT C    T      TT   TC CC/T
rs31501065
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87206617fChrng : Intron
Splchl2 : within coordinates of
4SNPT TAA TAT TTTA T    T      TA   TT TA/T
rs33062591
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87206658fChrng : Coding-Synonymous
Splchl2 : within coordinates of
1SNPC CCC C T CCTC      C      C    CT CC/T
rs33062589
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87206997fChrng : Intron
Splchl2 : within coordinates of
1SNPT TTT T C TTTT      T      T    TT TC/T
rs33062587
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87207084fChrng : Intron
Splchl2 : within coordinates of
1SNPT TTT T C TTTT      T      T    TT TC/T
rs33062585
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87207095fChrng : Intron
Splchl2 : within coordinates of
1SNPT TTT T G TTTT      T      T    TT TG/T
rs33061973
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87207306fChrng : Intron
Splchl2 : within coordinates of
1SNPA AAA A G AAGA      A      A    AG AA/G
rs33061971
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87207377fChrng : Intron
Splchl2 : within coordinates of
1SNPA AAA A A AAGA      A      A    AA AA/G
rs33061969
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87207393fChrng : Coding-Synonymous
Splchl2 : within coordinates of
1SNPC CCC C T CCCC      C      C    CC CC/T
rs33061967
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87207411fChrng : Coding-Synonymous
Splchl2 : within coordinates of
1SNPT TTT T C TTTT      T      T    TT TC/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs33061965
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87207528fChrng : Coding-Synonymous
Splchl2 : within coordinates of
1SNPT TTT T C TTCT      T      T    TC TC/T
rs33061203
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87207535fChrng : Coding-NonSynonymous
Splchl2 : within coordinates of
2SNPAAAGG A G AAGG      A      A    AG GA/G
rs33061201
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87207653fChrng : Intron
Splchl2 : within coordinates of
1SNPG GGG G G GGGG      G      G    GG AA/G
rs33061199
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87207777fChrng : Intron
Splchl2 : within coordinates of
1SNPG GGG G A GGAG      G      G    GA GA/G
rs6392242
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87208407fChrng : Intron
Splchl2 : within coordinates of
1SNP       A T                          A/T
rs6392902
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87208546fChrng : Intron
Splchl2 : within coordinates of
1SNP       C A                          A/C
rs6393355
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87208575fChrng : Intron
Splchl2 : within coordinates of
3SNPC C    T CC                         C/T
rs49243514
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87208997fChrng : Intron
Splchl2 : within coordinates of
1SNP AA       A                         A
rs47182523
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87209270fChrng : Intron
Splchl2 : within coordinates of
1SNP CC       C                         C
rs49184246
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87209278fChrng : Intron
Splchl2 : within coordinates of
1SNP CC       C                         C
rs30912494
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87210220fChrng : Intron
Splchl2 : within coordinates of
2SNPGGG    A  G                         A/G
rs32552134
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87210422fChrng : Intron
Splchl2 : within coordinates of
2SNPAAA    T  A                         A/T
rs224863637
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87211811fChrng : mRNA-UTR
Splchl2 : within coordinates of
1SNP               C            T       C/T
rs30666997
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87212055fChrng : Locus-Region
Eif4e2 : Locus-Region
Splchl2 : within coordinates of
2SNPAAA    G  A                         A/G
rs32133116
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87212142fChrng : Locus-Region
Eif4e2 : Locus-Region
Splchl2 : within coordinates of
2SNPTTT    G  T                         G/T
rs31053371
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87212263fChrng : Locus-Region
Eif4e2 : Locus-Region
Splchl2 : within coordinates of
2SNPT T    C  T                         C/T
rs253077960
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87212421fChrng : within coordinates of
Eif4e2 : Locus-Region
Splchl2 : within coordinates of
1SNP               A            T       A/T
rs264563506
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87212714fChrng : 20 bp downstream of
Eif4e2 : Locus-Region
Splchl2 : within coordinates of
1SNP               T            A       A/T
rs31444648
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87213291fChrng : 597 bp downstream of
Eif4e2 : Locus-Region
Splchl2 : within coordinates of
2SNP CC    T                            C/T
rs31991499
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87213809fChrng : 1115 bp downstream of
Eif4e2 : Locus-Region
Splchl2 : within coordinates of
2SNP CC    G                            C/G
rs234242094
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87213824fChrng : 1130 bp downstream of
Eif4e2 : Locus-Region
Splchl2 : within coordinates of
1SNP               G            A       A/G
rs32319303
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:87214065fChrng : 1371 bp downstream of
Eif4e2 : mRNA-UTR
Eif4e2 : Intron
Splchl2 : within coordinates of
1SNP  T    C                            C/T

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
09/23/2014
MGI 5.19
The Jackson Laboratory