About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
Genome Coordinate Discrepancy
The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details).
 Symbol
Name
ID
Ldlrap1
low density lipoprotein receptor adaptor protein 1
MGI:2140175

125 matching SNPs displayed


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs32491403
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134299659fLdlrap1 : Locus-Region1SNP  A   C C        A/C
rs32628070
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134299671fLdlrap1 : Locus-Region1SNP  T   C C        C/T
rs32937137
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134299692fLdlrap1 : Locus-Region1SNP  T   A A        A/T
rs27591514
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134299943fLdlrap1 : Locus-Region1SNPC CCCC TCCCCCCCCCC/T
rs27591513
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134300057fLdlrap1 : Locus-Region1SNPC CCCC TCCCCCCCCCC/T
rs32090699
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134300107fLdlrap1 : Locus-Region1SNP AA   G G        A/G
rs27591512
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134300322fLdlrap1 : Locus-Region1SNPC CCCC CCCGCCGCGCC/G
rs27591511
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134300673fLdlrap1 : Locus-Region2SNPCCGGCGCCCCCCCCGCCC/G
rs32940365
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134300837fLdlrap1 : Locus-Region1SNP CC   T T        C/T
rs27591510
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134301088fLdlrap1 : Locus-Region2SNPAAGGAGA AAGAAGGGAA/G
rs27591509
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134301254fLdlrap1 : Locus-Region1SNPG GGGG  GGCGG GCGC/G
rs32946245
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134301282fLdlrap1 : Locus-Region1SNP TC   T T        C/T
rs27591508
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134301292fLdlrap1 : Locus-Region2SNPCCTTCTCCCTCCCCTCTC/T
rs27591507
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134301324fLdlrap1 : Locus-Region1SNPA AAAA GAAAAAAAAAA/G
rs27591506
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134301325fLdlrap1 : Locus-Region1SNPG GGGG  GGAGGAGAGA/G
rs27591505
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134301428fLdlrap1 : mRNA-UTR1SNPC CCCC CCCTCCTCCCC/T
rs27591504
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134301466fLdlrap1 : mRNA-UTR1SNPT TTTT GTTGTTGTGTG/T
rs27591503
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134301836fLdlrap1 : mRNA-UTR1SNPA AAAA GAAAAAAAAAA/G
rs13469286
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134302488rLdlrap1 : mRNA-UTR1SNPC CCCC CCTCCCCTCTC/T
rs27591502
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134302510fLdlrap1 : mRNA-UTR1SNPG GGG  GGGGG GGAGA/G
rs27591501
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134302599fLdlrap1 : mRNA-UTR1SNPT TTTT TTTCTTCTTTC/T
rs13469282
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134302928rLdlrap1 : mRNA-UTR1SNPG GGGG GGTGGGGTTTG/T
rs27591500
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134302965fLdlrap1 : mRNA-UTR1SNPC CCCC CCCCCCCCGCC/G
rs27591499
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134303189fLdlrap1 : Intron1SNPA AA T  T AATAAAAA/T
rs27591498
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134303409fLdlrap1 : Intron1SNPG GGGG GGGAG AGGGA/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27591497
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134303462fLdlrap1 : Intron1SNPG GGGG GGAGGGGGGAA/G
rs27591496
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134303492fLdlrap1 : Intron1SNPG GG G GGGGGGGGAGA/G
rs27591495
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134303552fLdlrap1 : Intron1SNPA AAAA GA GAAG G A/G
rs27591494
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134303739fLdlrap1 : Intron1SNPA AAAA GA GAAGGGGA/G
rs27591493
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134303755fLdlrap1 : Intron1SNPC CCCC CC CCCCTCTC/T
rs27591492
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134303809fLdlrap1 : Intron1SNPG GGGG AGAGGGGAGAA/G
rs27591491
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134303984fLdlrap1 : Intron1SNPG GGGG GGGAGGAGGGA/G
rs27591490
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134304013fLdlrap1 : Intron1SNPG GGGG GGGGGGGAGGA/G
rs27591489
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134304039fLdlrap1 : Intron1SNPC CCCC TCCCCCCCCCC/T
rs27591488
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134304060fLdlrap1 : Intron1SNPT TTTT TTTTTTATTTA/T
rs27591487
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134304069fLdlrap1 : Intron1SNPT TTTT TTTATT TTTA/T
rs27591486
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134304168fLdlrap1 : Intron1SNPC CCCC TCCCCCCCCCC/T
rs27591485
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134304638fLdlrap1 : Intron1SNPA AAAA GAAGAAGAAAA/G
rs27591484
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134304671fLdlrap1 : Intron1SNPG GGGG GGAGGGGAGAA/G
rs27591483
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134304683fLdlrap1 : Intron1SNPC CCCC TCCCCCCCCCC/T
rs27591482
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134304734fLdlrap1 : Intron1SNPT TTTT ATTTTTTTTTA/T
rs27591481
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134304864fLdlrap1 : Intron1SNPC CCC  ACA CC ACAA/C
rs27591480
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134304865fLdlrap1 : Intron1SNPG GG A  G AGGAGG A/G
rs27591479
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134304926fLdlrap1 : Intron1SNPG GGGG GGGTGGTGGGG/T
rs27591478
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134305061fLdlrap1 : Intron1SNPG GGGG GGGAGGAGGGA/G
rs27591477
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134305303fLdlrap1 : Coding-Synonymous1SNPG GGGG  GG GGGGAGA/G
rs13469287
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134305318rLdlrap1 : Coding-Synonymous1SNPC CCCC CCCTCCTCTCC/T
rs27591476
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134305444fLdlrap1 : Intron1SNPA AAAA CACCAACCCCA/C
rs27591475
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134305487fLdlrap1 : Intron1SNPC CCCC TCCCCCCCCCC/T
rs27591474
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134305585fLdlrap1 : Intron1SNPG GGGG GGTGGGGTGTG/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27591473
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134305635fLdlrap1 : Intron1SNPA AAAA GAAAAAAAAAA/G
rs27591472
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134305747fLdlrap1 : Intron1SNPG GGGG AGGGGGGGGGA/G
rs27591471
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134306021fLdlrap1 : Intron1SNPC CCCC CCCACCACACA/C
rs27591470
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134306739fLdlrap1 : Intron1SNPG GGGG GGGGGGGGGAA/G
rs27591469
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134306875fLdlrap1 : Intron1SNPG GGGG AGGAGGAGAGA/G
rs27591468
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134307049fLdlrap1 : Intron1SNPT TTTT CTTTTTTTTTC/T
rs27572867
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134307113fLdlrap1 : Intron1SNPA AAAA GAAAAAAAAAA/G
rs27572866
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134307179fLdlrap1 : Intron1SNPG GGGG GGGAGGAGAGA/G
rs27572865
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134307625fLdlrap1 : Intron1SNPC CCCC CCCCCCCTCCC/T
rs27572864
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134307729fLdlrap1 : Intron1SNPA AAAA GAAGAAGA AA/G
rs27572863
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134307765fLdlrap1 : Intron1SNPA AAAA AAAGAAGA AA/G
rs27572862
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134307892fLdlrap1 : Intron1SNPT TTTT ATTATTAT TA/T
rs27572861
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134307937fLdlrap1 : Intron1SNPA AAAA AAATAATA AA/T
rs27572860
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134307984fLdlrap1 : Intron1SNPA AAAA GAAGAAGA AA/G
rs27572859
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134308094fLdlrap1 : Intron1SNPT TTTT CTTCTTCT TC/T
rs27572858
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134308158fLdlrap1 : Intron1SNPT TTTT CTTCTTCT TC/T
rs27572857
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134308253fLdlrap1 : Intron1SNPA AAAA AAA AAGAGAA/G
rs27572856
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134308361fLdlrap1 : Intron1SNPC CCCC  CC CC C TC/T
rs27572855
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134308556fLdlrap1 : Intron1SNPC CCCC ACCCCCCC CA/C
rs27572854
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134308707fLdlrap1 : Intron1SNPC CCCC CCCCCCCC TC/T
rs27572853
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134308727fLdlrap1 : Intron1SNPA AAAA GAAGAAGA GA/G
rs27572852
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134308846fLdlrap1 : Intron1SNPC CCCC GCCGCCGC CC/G
rs27572851
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134308916fLdlrap1 : Intron1SNPG GGGG GGGTGGTGGGG/T
rs27572850
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134309013fLdlrap1 : Intron1SNPC CCCC CCCTCCTC CC/T
rs27572849
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134309056fLdlrap1 : Intron1SNPG GGGG AGGAGGAG GA/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27572848
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134309214fLdlrap1 : Intron2SNPCCTTCTC CC CC C CC/T
rs27572847
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134309398fLdlrap1 : Intron1SNPC CCCC CCCTCCTC CC/T
rs27572846
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134309410fLdlrap1 : Intron1SNPA AAAA TAAAAAAAAAA/T
rs27572845
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134309570fLdlrap1 : Intron1SNPG GGGG AGGAGGAGGGA/G
rs27572844
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134309684fLdlrap1 : Intron1SNPG GGGG AGGGGGGG GA/G
rs27572843
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134310419fLdlrap1 : Intron1SNPG GGGG GGGAGGAG GA/G
rs27572842
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134310706fLdlrap1 : Intron1SNPT TTTT  TTCTTCT TC/T
rs27572841
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134310730fLdlrap1 : Intron1SNPC CCCC TCCTCCTC CC/T
rs27572840
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134310734fLdlrap1 : Intron1SNPA AAAA  AA AAAA GA/G
rs27572839
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134310872fLdlrap1 : Intron1SNPC CCCC GCCGCCGC CC/G
rs27572838
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134311025fLdlrap1 : Intron1SNPG GGGG AG A GAG GA/G
rs27572837
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134311092fLdlrap1 : Intron1SNPC CCCC TCCCCCCC CC/T
rs27572836
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134311259fLdlrap1 : Intron1SNPG GGGG GGGAGGAG GA/G
rs27572835
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134311293fLdlrap1 : Intron1SNPC CCCC  CCCCCCC TC/T
rs27572834
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134311414fLdlrap1 : Intron1SNPA AAAA GAAGAAGA AA/G
rs27572833
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134311485fLdlrap1 : Intron1SNPT TTTT TTTATTAT TA/T
rs27572832
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134311506fLdlrap1 : Intron1SNPC CCCC CCCTCCTC CC/T
rs27572831
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134312013fLdlrap1 : Intron1SNPC CCCC TCC CCCC CC/T
rs27572830
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134312254fLdlrap1 : Intron1SNPA AAAA AAAGAAGA AA/G
rs27572829
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134312310fLdlrap1 : Intron1SNPT TTTT TTTATTAT TA/T
rs27572828
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134312428fLdlrap1 : Intron1SNPC CCCC TCCCCCCC CC/T
rs27572827
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134312480fLdlrap1 : Intron1SNPG GGGG AGGGGGGG GA/G
rs27572826
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134312510fLdlrap1 : Intron1SNPT TTTT CTTCTTCT TC/T
rs27572825
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134312548fLdlrap1 : Intron1SNPA AAAA GAAGAAGA AA/G
rs27572824
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134312575fLdlrap1 : Intron1SNPT TTTT CTTCTTCT TC/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27572823
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134312821fLdlrap1 : Intron1SNPT  T T CTTCTTCT TC/T
rs27572822
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134312963fLdlrap1 : Intron1SNPG GGGG GGGGGGGG AA/G
rs27572821
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134312964fLdlrap1 : Intron1SNPG GGGG CGG GGCG GC/G
rs27572820
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134313003fLdlrap1 : Intron1SNPC CC C CCCTCCTC CC/T
rs27572819
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134313075fLdlrap1 : Intron1SNPC CCCC CCCTCCTC CC/T
rs27572818
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134313157fLdlrap1 : Intron1SNPT TTTT GTTGTTGT TG/T
rs27572817
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134313178fLdlrap1 : Intron1SNPT TTTT ATTATTAT TA/T
rs27572816
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134314410fLdlrap1 : Intron1SNPC CCCC CCCTCCTC CC/T
rs27572815
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134314509fLdlrap1 : Intron1SNPG GGGG GGG GGCG GC/G
rs27572814
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134314698fLdlrap1 : Intron1SNPC CCCC TCCTCCTT TC/T
rs27572813
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134314721fLdlrap1 : Intron1SNPT TTTT TTTCTTCT TC/T
rs27572812
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134314769fLdlrap1 : Intron1SNPA AAAA AAAGAAGA AA/G
rs13469283
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134314909rLdlrap1 : Coding-Synonymous1SNPC CCCC CCCTCCTC CC/T
rs27572811
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134315177fLdlrap1 : Intron1SNPG GGGG GGG GGAG GA/G
rs27572810
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134315564fLdlrap1 : Intron1SNPC CCCC CCCCCCCC TC/T
rs27572809
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134315621fLdlrap1 : Intron1SNPG GGGG GGGGGGGG AA/G
rs27572808
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134315659fLdlrap1 : Intron1SNPG GGGG GGGTGGTG GG/T
rs27572807
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134315726fLdlrap1 : Intron1SNPG GGGG GGGGGGGG AA/G
rs27572806
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134315861fLdlrap1 : Intron1SNPT TTTT TTTGTTGT GG/T
rs27572805
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134315970fLdlrap1 : Intron1SNPT TTTT TTTTTTTT CC/T
rs27572804
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134316221fLdlrap1 : Intron1SNPC CCCC CCCCCCCCCTC/T
rs27572803
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134316240fLdlrap1 : Intron1SNPA AAAA GAAGAAGA GA/G
rs27572802
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134316426fLdlrap1 : Intron1SNPA AAAA AAAAAAAA GA/G
rs27572801
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134316475fLdlrap1 : Intron1SNPT TTTT TTTTTTTT CC/T
rs27572800
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:134316543fLdlrap1 : Intron1SNPC CCCC CCCCCCCC AA/C

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
06/05/2013
MGI 5.13
The Jackson Laboratory