About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Sall4
sal-like 4 (Drosophila)
MGI:2139360

94 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29769322
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168746345fSall4 : 1987 bp downstream of3SNPG G   T            G               G              G/T
rs33156137
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168746383fSall4 : 1949 bp downstream of3SNPT T   C            T               T              C/T
rs52456633
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168747593fSall4 : 739 bp downstream of1SNP G                                                G
rs52393497
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168747594fSall4 : 738 bp downstream of1SNP TC                                               C/T
rs52389777
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168747740fSall4 : 592 bp downstream of1SNP GG        G                                      G
rs52145125
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168747741fSall4 : 591 bp downstream of1SNP TT        T                                      T
rs33686234
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168747937fSall4 : Locus-Region1SNP C    T    C                                      C/T
rs13476905
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168748725rSall4 : mRNA-UTR4SNP?CGCCCA  CCCC CCCCC?CC C T  CCCCCC ?CCCCCCC TCCC CA/C/G/T
rs4223676
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168748727rSall4 : mRNA-UTR1SNP  C CCC  C C        T C                           C/T
rs4223675
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168748761rSall4 : mRNA-UTR1SNP  T TTT  T T        A T                           A/T
rs4223674
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168748891rSall4 : mRNA-UTR1SNP  G GGG  T G        G G                           G/T
rs13469512
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168749163rSall4 : mRNA-UTR3SNPC C   T            C               C              C/T
rs13469511
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168749265rSall4 : mRNA-UTR3SNPC     T            C               C              C/T
rs33341561
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168749753fSall4 : mRNA-UTR3SNP TT   C    T       T               T              C/T
rs32916595
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168749777fSall4 : mRNA-UTR3SNP AA   T    A       A               A              A/T
rs29540510
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168749964fSall4 : mRNA-UTR1SNP AA   C    A                                      A/C
rs33175525
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168750038fSall4 : Coding-Synonymous2SNP  G   A    G       G               G              A/G
rs33232114
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168750384fSall4 : Coding-NonSynonymous3SNP  A   G    A       A               A              A/G
rs33183121
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168750538fSall4 : Intron3SNP  C   T    C       C               C              C/T
rs29545424
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168750746fSall4 : Intron3SNPTTT   G    T       T               T              G/T
rs29832586
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168750931fSall4 : Intron3SNPAA    G    A       A               A              A/G
rs50621747
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168751271fSall4 : Intron2SNP AA        A       A               A              A
rs45648339
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168751289fSall4 : Intron2SNP  C        C       C               C              C
rs32860272
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168751638fSall4 : Intron3SNP TT   C    T       T               T              C/T
rs33447110
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168751811fSall4 : Intron1SNP CC   G    C                                      C/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29911427
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168751816fSall4 : Intron3SNP GG   T    G       G               G              G/T
rs33420472
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168751897fSall4 : Intron3SNP GG   A    G       G               G              A/G
rs48124377
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168752348fSall4 : Intron2SNP TT        T       T               T              T
rs33174221
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168753252fSall4 : Intron2SNPTTT   C    T                                      C/T
rs33642038
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168753254fSall4 : Intron2SNPTTT   C    T                                      C/T
rs33401542
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168753365fSall4 : Intron3SNPGGG   C    G       G               G              C/G
rs33338824
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168753887fSall4 : Intron2SNPCCC   A    C                                      A/C
rs27287907
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168754373fSall4 : Intron1SNPT TTTT   T TTTT        T          T      T C    T C/T
rs32978167
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168754522fSall4 : Coding-Synonymous
Sall4 : Intron
3SNP G    A    G       G               G              A/G
rs27287906
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168754622fSall4 : Coding-NonSynonymous
Sall4 : Intron
1SNPG GGGG   G GGGG        G          G      G C    G C/G
rs27287905
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168754839fSall4 : Coding-NonSynonymous
Sall4 : Intron
1SNPC CCCC   C CCCC        C          C      C A    C A/C
rs13476906
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168755443fSall4 : Coding-Synonymous
Sall4 : Intron
5SNPCCCCCCTTTTTCCTCCTCCCTC CTTTTCTCCTTTCCCTTCCTTTCTCTTC/T
rs27287904
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168755620fSall4 : Coding-Synonymous
Sall4 : Intron
1SNPG GGGG   G GGGG        G          G      G A    G A/G
rs27287903
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168756145fSall4 : Coding-Synonymous
Sall4 : Intron
2SNPAAAAAA   A AAAA        A          A    G A G    A A/G
rs46280898
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168756196fSall4 : Coding-Synonymous
Sall4 : Intron
1SNP CC                                    T          C/T
rs51901655
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168756229fSall4 : Coding-Synonymous
Sall4 : Intron
1SNP AA                                    G          A/G
rs51340924
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168756247fSall4 : Coding-Synonymous
Sall4 : Intron
1SNP GG                                    T          G/T
rs47468507
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168756283fSall4 : Coding-Synonymous
Sall4 : Intron
1SNP CC                                    T          C/T
rs27287902
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168756762fSall4 : Coding-NonSynonymous
Sall4 : Intron
1SNPA AAAA   C AAAA        A          A        C    A A/C
rs27287901
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168756950fSall4 : Intron4SNPTTTTTTC  C TTCT    T   T          CT     T C    C C/T
rs27287900
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168757151fSall4 : Intron1SNPG GGGG   G GGGG        G          G      G C    G C/G
rs27287899
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168757182fSall4 : Intron1SNPC CCCC   G CCCC        C          C      C C    C C/G
rs33675280
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168757308fSall4 : Intron3SNP TT   C            T               T              C/T
rs27287898
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168757383fSall4 : Intron1SNPC CCCC   C CCCC        C          C      C T    C C/T
rs47839458
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168757664fSall4 : Intron1SNP TC                                               C/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27287897
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168757803fSall4 : Intron3SNPTTTTTT   C TTCT    T   T          CT     T C    T C/T
rs27287896
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168757910fSall4 : Intron1SNPC CCCC   A  CAC        C          A      C      C A/C
rs27287895
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168758043fSall4 : Intron3SNPGGGGGG   A GGAG    G   G          AG     G G    G A/G
rs48812543
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168758061fSall4 : Intron2SNP C         C       C               C              C
rs27287894
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168758075fSall4 : Intron3SNPGGGGG    C G CG    G   G          CC     G G      C/G
rs45648983
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168758076fSall4 : Intron2SNP GG        G       G               A              A/G
rs48277897
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168758100fSall4 : Intron1SNP GG        G                                      G
rs46386927
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168758105fSall4 : Intron1SNP GG        G                                      G
rs48140290
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168758111fSall4 : Intron1SNP GG        G                                      G
rs27287893
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168758159fSall4 : Intron3SNPGGGGGG   A GGAG    G   G          AG     G G    G A/G
rs27287892
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168758316fSall4 : Intron3SNPGGGGGG   A GGAG    G   G          AG     G G    G A/G
rs27287891
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168758372fSall4 : Intron1SNPC CCCC   T CCCC        C          C      C      C C/T
rs27287890
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168758444fSall4 : Intron1SNPC CCCC   A CCCC        C          C      C C    C A/C
rs46710805
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168758737fSall4 : Intron2SNP  G                G               G              G
rs51558196
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168758738fSall4 : Intron2SNP  A                A               A              A
rs51386991
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168759090fSall4 : Intron2SNP  G                G               A              A/G
rs27287889
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168759382fSall4 : Intron3SNPGGGGGG   A GGAG    G   G          AG     G A    A A/G
rs27287888
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168759415fSall4 : Intron1SNPC CCCC   G CCCC        C          C      C      C C/G
rs27287887
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168759440fSall4 : Intron1SNPA AAAA   A AAAA        A          A      A G    A A/G
rs27287886
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168759648fSall4 : Intron1SNPT TTTT   C TTTT        T          T      T C    T C/T
rs27287885
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168760018fSall4 : Intron1SNPC CCCC   C CCCC        C          C      C G    C C/G
rs216795586
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168760870fSall4 : Intron1SNP                   G               C              C/G
rs27287884
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168761155fSall4 : Intron1SNP    GG   G   AG                   A      G        A/G
rs27287883
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168761527fSall4 : Intron1SNPC CCCC   C CCCC        C          C      C T    C C/T
rs27287882
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168762567fSall4 : Intron1SNPC CCCC   A CCCC        C          C      C C    C A/C
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27287881
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168762579fSall4 : Intron3SNPTTTTTT   G TTGT    T   T          GT     T G    G G/T
rs48958335
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168762890fSall4 : Intron2SNP GG        G       G               A              A/G
rs48805975
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168763187fSall4 : Intron2SNP GG        G       G               G              G
rs27287880
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168763759fSall4 : Intron1SNPG GGGG   A GGGG        G          G      G G    G A/G
rs27287879
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168764037fSall4 : Intron1SNPA AAAA   A AAAA        A          A      A C    A A/C
rs27287878
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168764091fSall4 : Intron1SNPT TTTT   T TTTT        T          T      T G    T G/T
rs27287877
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168764616fSall4 : Intron1SNPG GGGG   G GGGG        G          G      G A    G A/G
rs27287876
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168765073fSall4 : Intron1SNPG GGGG   A GGGG        G          G      G G    G A/G
rs27287875
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168765576fSall4 : Intron1SNPC CCCC   C CCCC        C          C      C G    C C/G
rs27287874
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168767410fGm14261 : within coordinates of
Sall4 : Locus-Region
1SNPA AAAA   A AAAA        A          A      A G    A A/G
rs27287873
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168767889fGm14261 : within coordinates of
Sall4 : Locus-Region
1SNPA AAAA   A AAAA        A          A      A G    A A/G
rs27287872
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168768030fGm14261 : within coordinates of
Sall4 : Locus-Region
1SNPA AAAA   A AAAA        A          A      A G    A A/G
rs27287871
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168768439fSall4 : Locus-Region1SNPG GGGG   G GGGG        G          G      G T    G G/T
rs27287870
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168768902fSall4 : Locus-Region1SNPC CCCC   G CCCC        C          C      C C    C C/G
rs27287869
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168769329fSall4 : 1386 bp upstream of1SNPG GGGG   T GGGG        G          G      G G    G G/T
rs27287868
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168769418fSall4 : 1475 bp upstream of1SNPA AAAA   A AAAA        A          A      A G    A A/G
rs27271667
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168769649fSall4 : 1706 bp upstream of1SNPT TTTT   T TTTT        T          T      T C    T C/T
rs27271666
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168769813fSall4 : 1870 bp upstream of1SNPT TTTT   T TTTT        T          T      T G    T G/T
rs27271665
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:168769879fSall4 : 1936 bp upstream of1SNPA AAAA   G AAAA        A          A      A A    A A/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
12/16/2014
MGI 5.20
The Jackson Laboratory