About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
Genome Coordinate Discrepancy
The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details).
 Symbol
Name
ID
B3galt5
UDP-Gal:betaGlcNAc beta 1,3-galactosyltransferase, polypeptide 5
MGI:2136878

180 matching SNPs displayed


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs51312213
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96500975fB3galt5 : Locus-Region1SNPG GGGG  A GGGG       G          G      G G    G A/G
rs51279592
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96501028fB3galt5 : Locus-Region1SNPG GGGG  A GGGG       G          G      G G    G A/G
rs46343768
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96501177fB3galt5 : Locus-Region1SNPC CCCC  C CCCC       C          C      C T    C C/T
rs48474620
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96501427fB3galt5 : Locus-Region1SNPC CCCC  G CCGC       C          C      G G    G C/G
rs47423242
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96501685fB3galt5 : Locus-Region1SNPG GGGG  C GGGG       G          G      G G    G C/G
rs51959260
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96501896fB3galt5 : Locus-Region1SNPG GGGG  G GGGG       G          G      A G    A A/G
rs49823651
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96503122fB3galt5 : Intron1SNPT TTTT  G TTGT       T          T      G G    T G/T
rs47326229
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96503705fB3galt5 : Intron1SNPT TTTT  G TTTT       T          T      T T    T G/T
rs48786835
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96503918fB3galt5 : Intron1SNPT TTTT  C TTCT       T          T      C C    C C/T
rs49450272
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96504195fB3galt5 : Intron1SNPC CCCC  G CCCC       C          C      C C    C C/G
rs46933201
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96504519fB3galt5 : Intron1SNPG GGGG  C GGCG       G          G      G C    G C/G
rs47099887
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96504627fB3galt5 : Intron1SNPT TTTT  T TTTT       T          T      T T    C C/T
rs47844825
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96505181fB3galt5 : Intron1SNPA AAAA  A AAGA       A          A      A G    A A/G
rs52195912
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96505718fB3galt5 : Intron1SNPT TTTT  T TCTC       T          T      T T    T C/T
rs52297309
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96505732fB3galt5 : Intron1SNPT TTTT  T TTAT       T          T      T A    T A/T
rs46852402
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96506295fB3galt5 : Intron1SNPT TTTT  C TTCT       T          T      T C    T C/T
rs45674689
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96506610fB3galt5 : Intron1SNPA AAAA  G AAAA       A          A      A A    A A/G
rs51559445
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96506634fB3galt5 : Intron1SNPG GGGG  G GG G       G          G      G A    G A/G
rs48207709
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96506647fB3galt5 : Intron1SNPA AAAA  G AA A       A          A      A G    A A/G
rs47547298
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96506726fB3galt5 : Intron1SNPC CCCC  C CCTC       C          C      C T    C C/T
rs3164141
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96506843rB3galt5 : Intron1SNPT ATAA  A ATAT       A          T      T A    A A/T
rs47868677
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96506943fB3galt5 : Intron1SNPT TTTT  T TTCT       T          T      T C    T C/T
rs50686339
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96507025fB3galt5 : Intron1SNPC CCCC  C CCC        C          C      C C    T C/T
rs3166084
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96507031rB3galt5 : Intron1SNPC GCGG  G GCGC       G          C      C G    G C/G
rs46845764
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96507204fB3galt5 : Intron1SNPA AAAA  G AAAA       A          A      A A    A A/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs51944680
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96507259fB3galt5 : Intron1SNPC CCCC  C CCTC       C          C      C T    C C/T
rs51502200
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96507300fB3galt5 : Intron1SNPT TTTT  C TTTT       T          T      T T    T C/T
rs49116589
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96507326fB3galt5 : Intron1SNPA AAAA  T AATA       A          A      A T    A A/T
rs51622331
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96507387fB3galt5 : Intron1SNPG GGGG  T GGTG       G          G      G T    G G/T
rs3166083
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96507685rB3galt5 : Intron1SNPA CACC    CA A       C          A      A      C A/C
rs50779723
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96507718fB3galt5 : Intron1SNPT TTTT  C TTTT       T          T      T T    T C/T
rs45941559
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96507768fB3galt5 : Intron1SNPT TTTT  C TTTT       T          T      T T    T C/T
rs3166082
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96508244rB3galt5 : Intron2SNPCCTCTTT C TCCC       T          C      C C    T C/T
rs3164140
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96508414rB3galt5 : Intron1SNP AG   G   G                                     A/G
rs3164139
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96508415rB3galt5 : Intron1SNP TC   C   C                                     C/T
rs52172633
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96508446fB3galt5 : Intron1SNPA AAAA  A AAGA       A          A      A G    A A/G
rs33035458
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96509442fB3galt5 : Intron2SNPT GTGGG G GTGT       G          T      T G    G G/T
rs46126820
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96509464fB3galt5 : Intron1SNPA AAAA  G AAAA       A          A      A A    A A/G
rs45652813
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96509516fB3galt5 : Intron1SNPG GGGG  T GGGG       G          G      G G    G G/T
rs50179562
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96510274fB3galt5 : Intron1SNPG GGGG  T GGTG       G          G      G T    G G/T
rs48003650
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96510333fB3galt5 : Intron1SNPT TTTT  G TTTT       T          T      T T    T G/T
rs48046226
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96510382fB3galt5 : Intron1SNPC CCCC  T CCCC       C          C      C C    C C/T
rs50673448
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96510495fB3galt5 : Intron1SNPG GGGG  A GGGG       G          G      G G    G A/G
rs45746580
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96510644fB3galt5 : Intron1SNPG GGGG  A GGGG       G          G      G G    G A/G
rs45803789
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96510897fB3galt5 : Intron1SNPC CCCC  T CCCC       C          C      C C    C C/T
rs47555389
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96510909fB3galt5 : Intron1SNPC CCCC  T CCCC       C          C      C C    C C/T
rs50538984
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96511173fB3galt5 : Intron1SNPT TTTT  C TTTT       T          T      T T    T C/T
rs47874832
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96511332fB3galt5 : Intron1SNPT TTTT  C TTTT       T          T      T T    T C/T
rs4221266
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96512382fB3galt5 : Intron2SNP AC   A   C                                     A/C
rs3166047
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96513916fB3galt5 : Intron2SNP CT       T                                     C/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs52116807
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96516011fB3galt5 : Intron1SNPA AA    G  A A       A          A      A        A/G
rs3164135
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96516630fB3galt5 : Intron2SNP AG   A   G                                     A/G
rs3164136
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96516674fB3galt5 : Intron2SNP CA   C   A                                     A/C
rs3164137
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96516916fB3galt5 : Intron1SNP AC   C                                         A/C
rs3164138
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96517088fB3galt5 : Intron2SNPAAGA  G G GA A       G          A      A        A/G
rs4221267
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96517426fB3galt5 : Intron3SNPCCTC    T TC C                  C      C        C/T
rs4221268
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96517776fB3galt5 : Intron2SNPGGA   G                                         A/G
rs4221269
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96517897fB3galt5 : Intron2SNPA C   A                                         A/C
rs47625838
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96520414fB3galt5 : Intron1SNPT  T    G  T T       G          T      T        G/T
rs3166063
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96520712rB3galt5 : Intron1SNP GA   A   A                                     A/G
rs4221270
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96522050fB3galt5 : Intron2SNP CT   T   T                                     C/T
rs48874365
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96522294fB3galt5 : Intron1SNP    T       C                            C    T C/T
rs49869427
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96522406fB3galt5 : Intron1SNP  C CC  G   GC       C                        C C/G
rs47940117
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96522448fB3galt5 : Intron1SNP  C CC  C  CTC       C          C      C T    C C/T
rs47280504
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96522534fB3galt5 : Intron1SNP  G GG  G   TG       G          G             G G/T
rs32991294
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96522743fB3galt5 : Intron1SNP TC   C   C                                     C/T
rs50646333
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96523181fB3galt5 : Intron1SNP  C CC  C  CAC       C                        C A/C
rs51301972
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96523222fB3galt5 : Intron1SNP    CC  C  GCG       C          C        C    C C/G
rs51558636
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96523701fB3galt5 : Intron1SNP    TT  T   CT       T                        T C/T
rs4221271
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96523868fB3galt5 : Intron2SNP A        G                                     A/G
rs4221272
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96523932fB3galt5 : Intron2SNP G        A                                     A/G
rs4221273
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96523991fB3galt5 : Intron2SNP C        G                                     C/G
rs4221274
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96524024fB3galt5 : Intron2SNP T        C                                     C/T
rs49005239
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96524082fB3galt5 : Intron1SNP  TTTT  A TTAT       T          T      T A    T A/T
rs51290673
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96524192fB3galt5 : Intron1SNP  C CC  C  CTC       C          C      C      C C/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs50681158
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96524260fB3galt5 : Intron1SNP  C CC  C  CC        C                   C    T C/T
rs51876283
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96524442fB3galt5 : Intron1SNP  C CC  A  CA        C          C               A/C
rs49301488
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96524501fB3galt5 : Intron1SNP    TT  C  TTT       T          T      T T    T C/T
rs48964472
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96524716fB3galt5 : Intron1SNPG GGGG  A  GGG       G          G      G G    G A/G
rs47403947
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96525080fB3galt5 : Intron1SNP  T TT  C   C        T          T             T C/T
rs48162099
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96525225fB3galt5 : Intron1SNP    TT  C  TT        T                   T    T C/T
rs47895550
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96525307fB3galt5 : Intron1SNP    AA  A  ATA       A          A             A A/T
rs49864754
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96526598fB3galt5 : Intron1SNP  A AA  C   C        A                        A A/C
rs47296285
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96526702fB3galt5 : Intron1SNP  C CC  T   T        C                        C C/T
rs47009587
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96527463fB3galt5 : Intron1SNP    CC  C  CT        C                        C C/T
rs51742429
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96527550fB3galt5 : Intron1SNP  C CC  T  CCC       C          C        C    C C/T
rs49943222
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96527751fB3galt5 : Intron1SNP  G GG  A   A        G                        A A/G
rs49584320
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96527788fB3galt5 : Intron1SNP  C CC  T  CTC       C          C      C      C C/T
rs47340192
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96527834fB3galt5 : Intron1SNP  G GG  T  GGG       G          G        G    G G/T
rs51488641
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96528105fB3galt5 : Intron1SNP    T   T   C        T                 T      T C/T
rs46572660
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96528460fB3galt5 : Intron1SNPC   TT  T  CT        T                 C T    T C/T
rs51714740
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96528505fB3galt5 : Intron1SNP  A AA  G  AG        A          A             A A/G
rs48467449
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96528552fB3galt5 : Intron1SNP    CC  G  CCC       C          C        C    C C/G
rs3166076
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96529968fB3galt5 : Intron2SNP G    G   C                                     C/G
rs3166096
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96532139fB3galt5 : Intron2SNP GA AAA G AGGG       G          G      G G    A A/G
rs3164154
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96532170fB3galt5 : Intron1SNP TC   C   C                                     C/T
rs3164155
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96532174fB3galt5 : Intron1SNP CT   T   T                                     C/T
rs46765557
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96532198fB3galt5 : Intron1SNP  C CC  T  CC        C          C        C    T C/T
rs4221276
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96532331fB3galt5 : Intron3SNPCCT TTT C TC C       C          C      C      C C/T
rs4221277
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96532351fB3galt5 : Intron2SNP TC   C   C                                     C/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs4221278
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96532370fB3galt5 : Intron2SNP TC   C   C                                     C/T
rs32842965
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96532518fB3galt5 : Intron2SNPTTCTCCC C CT T       T          T      T      C C/T
rs49632607
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96532681fB3galt5 : Intron1SNPG GGGG  C GGGG       G          G      G G    G C/G
rs46612289
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96532718fB3galt5 : Intron1SNPT TTTT  T TTT        T          T      T T    C C/T
rs49057129
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96532722fB3galt5 : Intron1SNPC TCTT  T TCTC       C          C      C T    T C/T
rs3166024
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96534507fB3galt5 : Intron2SNP CT   T   T                                     C/T
rs3166025
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96534667fB3galt5 : Intron2SNP CT   T   T                                     C/T
rs3164082
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96534783fB3galt5 : Intron2SNP G    A   A                                     A/G
rs3164083
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96534857fB3galt5 : Intron2SNP G    A   A                                     A/G
rs3166026
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96534883fB3galt5 : Intron2SNP A    C   C                                     A/C
rs3166027
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96535173fB3galt5 : Intron1SNPT CTCC  T CTCT       T          T      T C    C C/T
rs47624889
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96535232fB3galt5 : mRNA-UTR1SNPT TTTT  T TTCT       T          T      T C    T C/T
rs51991375
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96535236fB3galt5 : mRNA-UTR1SNPC CCCC  T CC C       C          C      C      C C/T
rs3164084
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96535281fB3galt5 : mRNA-UTR2SNPGGAGAAA G AGGG       G          G      G G    G A/G
rs3166028
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96535336fB3galt5 : mRNA-UTR2SNP CTTTTT C TCCC       C                   C    C C/T
rs3166029
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96535343fB3galt5 : mRNA-UTR1SNPT CCCC  C CTCT       T          T      T C    C C/T
rs3166030
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96535395fB3galt5 : Intron2SNPTTCTCCC T CTCT       T          T      T C    C C/T
rs46348533
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96535442fB3galt5 : Intron1SNPG GGGG  G GGGG       G          G      G G    A A/G
rs4221283
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96535474fB3galt5 : Intron3SNPAACACCA C CACA       A          A      A C    C A/C
rs50692521
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96535508fB3galt5 : Intron1SNPG TGTT  G TGTG       G          G      G T    T G/T
rs47181496
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96535921fB3galt5 : Intron1SNPT TTTT  A TTTT       T          T      T T    T A/T
rs3164087
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96536173fB3galt5 : Intron3SNPCCTCTT  C TCCC       C          C      C C    C C/T
rs49502182
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96536738fB3galt5 : Intron1SNPC CCCC  C CCTC       C          C      C T    C C/T
rs49366744
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96536883fB3galt5 : Coding-Synonymous1SNPG GGGG  G GGGG       G          G      G G    A A/G
rs48389093
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96536982fB3galt5 : Coding-Synonymous1SNPC CCCC  C CCCC       C          C      C C    T C/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs3166032
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96537171fB3galt5 : Coding-Synonymous3SNPGGAGAAA G AGGG       G          G      G G    G A/G
rs48624005
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96537193fB3galt5 : Coding-NonSynonymous1SNPG GGGG  G GGGG       G          G      G A    G A/G
rs47693887
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96537240fB3galt5 : Coding-Synonymous1SNPT TTTT  T TTCT       T          T      T C    T C/T
rs3166033
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96537414fB3galt5 : Coding-Synonymous1SNPC TCTT  C TCCC       C          C      C C    C C/T
rs51089886
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96537534fB3galt5 : Coding-Synonymous1SNPC CCCC  C CCCC       C          C      C C    T C/T
rs3164088
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96537690fB3galt5 : Coding-Synonymous4SNPTTCTCCCTTTCTTTTTTTCTTTTCTTTCCCTTTTTTTTTTT TTTTTTC/T
rs3166034
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96537718fB3galt5 : mRNA-UTR3SNPAAGAGGG A GA A       A          A      A      A A/G
rs3164089
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96537757fB3galt5 : mRNA-UTR3SNPTTGTGGG T GTGT       T          T      T      T G/T
rs51725182
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96537758fB3galt5 : mRNA-UTR1SNPG GGGG  G GGAG       G          G      G A    G A/G
rs3164090
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96537828fB3galt5 : mRNA-UTR3SNPGGCGCCC G CGGG       G          G      G G    C C/G
rs50203487
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96537830fB3galt5 : mRNA-UTR1SNPG GGGG  A GGGG       G          G      G G    A A/G
rs48250083
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96537869fB3galt5 : mRNA-UTR1SNPC CCCC  A CCCC       C          C      C      C A/C
rs50469378
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96537918fB3galt5 : mRNA-UTR1SNPG GGGG  G GG G       G          G      G A    G A/G
rs46456629
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96537923fB3galt5 : mRNA-UTR1SNPG GGGG  G GGAG       G          G      G G    G A/G
rs49013726
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96538013fB3galt5 : mRNA-UTR1SNPG GGGG  G GGAG       G          G      G A    G A/G
rs49163135
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96538039fB3galt5 : mRNA-UTR1SNPC CCCC  C CCAC       C          C      C A    C A/C
rs3164091
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96538056fB3galt5 : mRNA-UTR2SNPAAGAGGG A GAGA       A          A      A G    A A/G
rs49380066
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96538252fB3galt5 : mRNA-UTR1SNPG GGGG  G GGAG       G          G      G A    G A/G
rs3166035
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96538279fB3galt5 : mRNA-UTR2SNPGGAGAAA G AGAG       G          G      G A    G A/G
rs49515421
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96538291fB3galt5 : mRNA-UTR1SNPG GGGG  G GGA        G                 G A    G A/G
rs3164092
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96538292fB3galt5 : mRNA-UTR2SNPAAGAGGG A GAGA       A          A      A G    A A/G
rs47016385
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96538351fB3galt5 : mRNA-UTR1SNPG GGGG  A GGGG       G          G      G G    G A/G
rs51359244
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96538404fB3galt5 : mRNA-UTR1SNPC CCCC  C CCCC       C          C      C C    T C/T
rs3166036
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96538484fB3galt5 : mRNA-UTR3SNPGGAGAAA G AGGG       G          G      G G    G A/G
rs3166037
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96538515fB3galt5 : mRNA-UTR3SNPGGAGAAA G AGGG       G          G      G G    G A/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs47397590
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96538721fB3galt5 : mRNA-UTR1SNPG GGGG  A GGAG       G          G      G G    G A/G
rs50145660
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96538843fB3galt5 : mRNA-UTR1SNPG GGGG  A GGGG       G          G      G G    A A/G
rs49619362
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96538859fB3galt5 : mRNA-UTR1SNPT TTTT  T TTCT       T          T      T C    T C/T
rs51083003
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96539005fB3galt5 : mRNA-UTR1SNPC CCCC  C CCCC       C          C      C T    C C/T
rs50442337
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96539205fB3galt5 : mRNA-UTR1SNPA AAAA  C AACA       A          A      A C    C A/C
rs3164093
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96539257fB3galt5 : mRNA-UTR2SNPAAC   C   C                                     A/C
rs3164094
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96539288fB3galt5 : mRNA-UTR2SNPAAG   G   G                                     A/G
rs3164095
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96539297fB3galt5 : mRNA-UTR3SNPTTA AAA A ATAT       T          T      T A    A A/T
rs3164096
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96539310fB3galt5 : mRNA-UTR3SNPTTCTCCC T C T                            T    T C/T
rs3164097
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96539424fB3galt5 : mRNA-UTR3SNPA GAGGG G GAGA       A          A      A G    A A/G
rs50991082
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96539768fB3galt5 : mRNA-UTR1SNPC CCCC  T TCCC       C          C      C C    C C/T
rs3164098
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96539817fB3galt5 : mRNA-UTR3SNPAATATTT T TATA       A          A      A T    T A/T
rs45658577
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96540202fB3galt5 : mRNA-UTR1SNPG AGAA    AGGG       G          G      G G    A A/G
rs49884631
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96540276fB3galt5 : mRNA-UTR1SNPT TTTT  T T C        T          T      T T    T C/T
rs49540362
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96540302fB3galt5 : mRNA-UTR1SNPG GGGG  A G G        G          G      G G    G A/G
rs3166070
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96540357rB3galt5 : mRNA-UTR1SNPA GAGG  A GAAA       A          A      A A    G A/G
rs3164125
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96540399rB3galt5 : mRNA-UTR1SNPG AGAA  G AGGG       G          G      G G    G A/G
rs3164124
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96540701rB3galt5 : mRNA-UTR1SNP TC   C   C                                     C/T
rs3164123
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96540858rB3galt5 : mRNA-UTR2SNP GA   G   A                                     A/G
rs3164122
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96541089rB3galt5 : mRNA-UTR1SNPG CGCC  C CGCG       G          G      G C    C C/G
rs48719522
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96541091fB3galt5 : mRNA-UTR1SNP  GGGG  A GGG                            G    G A/G
rs50055449
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96541227fB3galt5 : mRNA-UTR1SNPC CCCC  C CCCC       C          C      C T    C C/T
rs3164120
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96541352rB3galt5 : mRNA-UTR1SNPG AGAA  G AGGG       G          G      G G    A A/G
rs46467780
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96541511fB3galt5 : Locus-Region1SNPC TCTT  C TCCC       C          C      C C    T C/T
rs48734266
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96541579fB3galt5 : Locus-Region1SNPA   GG  G G G        A          A      A G    G A/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs51159570
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96541653fB3galt5 : Locus-Region1SNPT CTCC  T CTCT       T          T      T C    C C/T
rs49653603
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96541666fB3galt5 : Locus-Region1SNPG AGAA  G AGGG       G          G      G G    A A/G
rs49105983
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96541719fB3galt5 : Locus-Region1SNPA AAAA  A AACA       A          A      A C    A A/C
rs3166069
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96541802rB3galt5 : Locus-Region1SNPG AGAA  G AGAG       G          G      G A    A A/G
rs3166068
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr16:96541839rB3galt5 : Locus-Region1SNPA GAGG  A GAGA       A          A      A G    G A/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
05/08/2013
MGI 5.13
The Jackson Laboratory