About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
Genome Coordinate Discrepancy
The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details).
 Symbol
Name
ID
Srd5a3
steroid 5 alpha-reductase 3
MGI:1930252

124 matching SNPs displayed


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
Insertions
rs3153754
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76567527rSrd5a3 : Locus-Region1SNP GG   A G          A/G 
rs29512648
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76571744fSrd5a3 : Intron1SNP GG     A          A/G 
rs31543934
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76573468fSrd5a3 : Intron1SNPG GGGG AG  G  G GA A/G 
rs31543935
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76573507fSrd5a3 : Intron1SNPA AAAA CA  A  AAAAAA/C 
rs31543936
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76574358fSrd5a3 : Intron1SNPA AAAA TA  A  A AAAA/T 
rs31543937
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76574391fSrd5a3 : Intron1SNPC CCCC CC  C  CCCACA/C 
rs31543938
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76574471fSrd5a3 : Intron1SNPG GGGG AG  G  GGGGGA/G 
rs31543939
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76574503fSrd5a3 : Intron1SNPC CCCC CC  C  C CTCC/T 
rs31543940
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76574601fSrd5a3 : Intron2SNPGGGGGTGGT GT  GGGGTG/T 
rs3153753
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76574923rSrd5a3 : Intron2SNPC CCTCTCC C   TCTCCC/T 
rs3153752
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76574999rSrd5a3 : Intron1SNPG GGAA AA  A  AGAGAA/G 
rs3155677
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76575016rSrd5a3 : Intron1SNPA AAGG GG  G  G GGGA/G 
rs3697530
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76575062fSrd5a3 : Intron2SNPC CCCACAA     CCCCAA/C 
rs31543941
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76575086fSrd5a3 : Intron1SNPG GGGG CG GG  GGGGGC/G 
rs31543942
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76575230fSrd5a3 : Intron1SNPG GGGG GG  G  GGGAGA/G 
rs3153751
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76575260rSrd5a3 : Intron2SNPC CCTCTCC  C  T TCCC/T 
rs3155675
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76575754rSrd5a3 : Intron1SNPT TTGG GG  G  G GGGG/T 
rs3155674
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76575814rSrd5a3 : Intron1SNPC CCAA CA     A AC A/C 
rs31543943
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76575942fSrd5a3 : Intron1SNPG G GG AG  G  GGGGGA/G 
rs31545374
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76576497fSrd5a3 : Intron1SNPC CCCT CT     CCCC C/T 
rs31545375
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76576545fSrd5a3 : Intron1SNPC C TT TT     T TTTC/T 
rs31545376
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76576576fSrd5a3 : Intron1SNP  T CT TT  T  C CTTC/T 
rs31545377
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76576683fSrd5a3 : Intron1SNPC C TT CT  T  T TTTC/T 
rs31545378
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76576781fSrd5a3 : Coding-Synonymous1SNPC CCTT TT  T  TCTCTC/T 
rs31545379
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76576814fSrd5a3 : Coding-NonSynonymous1SNPG GGAA GA  A  AGAGAA/G 
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
Insertions
rs31545380
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76576843fSrd5a3 : Coding-Synonymous1SNPG G AG GG     AGAGGA/G 
rs31545381
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76576891fSrd5a3 : Intron1SNPG GGGA GA GA  GGGGAA/G 
rs31545382
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76576938fSrd5a3 : Intron1SNPG GGGA AA G   GGGGAA/G 
rs31545383
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76577012fSrd5a3 : Intron1SNP  C TC CC  C  T TCCC/T 
rs31538314
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76577038fSrd5a3 : Intron1SNP  TTCC CC  C  CTC CC/T 
rs31538315
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76577040fSrd5a3 : Intron1SNPC   CC TC  C  C C CC/T 
rs31538316
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76577132fSrd5a3 : Intron1SNPG G AA        A A  A/G 
rs31538317
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76577147fSrd5a3 : Intron1SNPC CCCC TC  C  CCC CC/T 
rs31538318
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76577183fSrd5a3 : Intron1SNP  G AG GG     A A  A/G 
rs31538319
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76577204fSrd5a3 : Intron1SNP  C TC CC     T T  C/T 
rs31538320
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76577407fSrd5a3 : Intron1SNPA AAAA TA  A  A A AA/T 
rs31538321
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76577456fSrd5a3 : Intron1SNPC CCCC CC  C  CCCTCC/T 
rs29546680
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76577521fSrd5a3 : Intron2SNPC CCTCTCC     T TCCC/T 
rs31538322
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76577546fSrd5a3 : Intron1SNPG GGGG TG GG  GGGGGG/T 
rs31538323
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76577671fSrd5a3 : Intron1SNP  A AA GA     A    A/G 
rs31539254
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76577718fSrd5a3 : Intron2SNPC CCCAC A     C CCAA/C 
rs3155669
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76577863rSrd5a3 : Intron1SNPA AAGG GG  G  GAG GA/G 
rs31539255
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76578086fSrd5a3 : Intron1SNPG GGGG GG  G  GGGAGA/G 
rs31539256
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76578149fSrd5a3 : Intron1SNPA AAAA GA  A  AAA AA/G 
rs31539257
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76578157fSrd5a3 : Intron1SNPT TTTT TT  T  T TGTG/T 
rs3153746
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76578485rSrd5a3 : Intron1SNP     GA            A/G 
rs31539258
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76578504fSrd5a3 : Intron1SNPG GGGG GG  G  GGGAGA/G 
rs3153745
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76578614rSrd5a3 : Intron2SNPG G AGAAG  G  AGAGGA/G 
rs3155667
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76578649rSrd5a3 : Intron2SNPT T ATAAT  T  ATATTA/T 
rs3155666
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76578738rSrd5a3 : Intron1SNP     TC            C/T 
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
Insertions
rs3155665
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76578749rSrd5a3 : Intron2SNP    TCTCC     T TCCC/T 
rs31539259
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76578778fSrd5a3 : Coding-NonSynonymous1SNPC CCCC CC  C  C CTCC/T 
rs31539260
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76578866fSrd5a3 : Coding-Synonymous1SNPC CCTC CC  C  TCTCCC/T 
rs31539261
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76578893fSrd5a3 : Coding-Synonymous1SNPC CCTC CC  C  T TCCC/T 
rs31539262
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76578968fSrd5a3 : Coding-Synonymous1SNPC CCTC CC  C  TCTTCC/T 
rs31539263
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76579023fSrd5a3 : Intron1SNPC   GG CG  G  G G GC/G 
rs31540404
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76579060fSrd5a3 : Intron1SNPT TTAA AA  A  A ATAA/T 
rs31540405
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76579102fSrd5a3 : Intron1SNP    GC        G G  C/G 
rs31540406
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76579187fSrd5a3 : Intron1SNP    TA TA     T TAAA/T 
rs31540407
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76579227fSrd5a3 : Intron1SNPC CCCT CT  T  CCCC C/T 
rs31540408
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76579301fSrd5a3 : Intron1SNP    C  AC     C  C A/C 
rs31540409
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76579369fSrd5a3 : Intron1SNPC CCTT TT  T  T TCTC/T 
rs31540410
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76579399fSrd5a3 : Intron1SNPT TTTA TA  A  TTTAAA/T 
rs31540411
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76579401fSrd5a3 : Intron1SNPG GGGG TG  G  GGGGGG/T 
rs31540412
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76579560fSrd5a3 : Intron1SNPC CCCT CT CT  CCCTTC/T 
rs31540413
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76579572fSrd5a3 : Intron1SNPC CCCC AC CC  CCCCCA/C 
rs3155664
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76579733rSrd5a3 : Intron1SNPA A TA  A     T TAAA/T 
rs3155661
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76579839rSrd5a3 : Intron1SNPC C AC  C  C  ACACCA/C 
rs31541204
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76579840fSrd5a3 : Intron1SNP    A  C      A A AA/C 
rs3153744
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76579871rSrd5a3 : Intron1SNPA AAGA AA     GAGGAA/G 
rs31541205
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76579917fSrd5a3 : Intron1SNPC CCCC TC CC  CCCCCC/T 
rs31541206
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76579940fSrd5a3 : Intron1SNPT TTTT CT  T  TTTTTC/T 
rs3155660
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76580114rSrd5a3 : Intron1SNP TT   C C          C/T 
rs3153743
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76580285rSrd5a3 : Intron1SNP GG   A G          A/G 
rs31541207
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76580380fSrd5a3 : Intron1SNPG G GG TG     G GGGG/T 
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
Insertions
rs31541208
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76580515fSrd5a3 : Intron1SNPG GGGG AG  G  G GG A/G 
rs33078080
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76580580fSrd5a3 : Intron1SNP GG   A A          A/G 
rs29680013
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76580597fSrd5a3 : Intron1SNP TT   C C          C/T 
rs31541209
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76581020fSrd5a3 : Intron1SNP  G AA AA  A  A AGAA/G 
rs31541210
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76581070fSrd5a3 : Intron1SNPT C TT CT  T  T T TC/T 
rs3155659
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76581125rSrd5a3 : Intron2SNPA AAGGGAG  G  G GAGA/G 
rs31541211
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76581390fSrd5a3 : Intron1SNPG GGGG AG  G  G GAGA/G 
rs3153742
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76581494rSrd5a3 : Intron2SNPAAAAGG GG  G  G GGGA/G 
rs3155658
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76581512rSrd5a3 : Intron2SNPAAAAGG GG  G  G GAGA/G 
rs31541212
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76581538fSrd5a3 : Intron1SNPT T TT TA     T TTTA/T 
rs31541213
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76581575fSrd5a3 : Intron1SNPA AAAA GA  A  AAA AA/G 
rs31542024
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76581606fSrd5a3 : Intron1SNPT TTTT CT     T T TC/T 
rs31542025
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76581648fSrd5a3 : Intron1SNP    AA CA  A  A AAAA/C 
rs31542026
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76581704fSrd5a3 : Intron1SNP  T C  CC     C C  C/T 
rs31542027
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76581713fSrd5a3 : Intron1SNP  G AG GG     A AGGA/G 
rs31542028
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76581758fSrd5a3 : Intron1SNPA AACC CC  C  C CCCA/C 
rs31542029
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76581914fSrd5a3 : Intron1SNP  AAGG GG  G  G GGGA/G 
rs31542030
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76581948fSrd5a3 : Intron1SNPT TTTT CT TT  TTTTTC/T 
rs3692242
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76582174fSrd5a3 : Intron1SNP     TC            C/T 
rs3692244
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76582175fSrd5a3 : Intron1SNP     GA            A/G 
rs3692808
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76582241fSrd5a3 : Intron2SNP    GAGAA     G GGAA/G 
rs31542031
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76582302fSrd5a3 : Intron1SNPA A GG GG  G  GAGGGA/G 
rs31542032
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76582403fSrd5a3 : Intron1SNPG GGGG GG     G GAGA/G 
rs31542033
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76582483fSrd5a3 : Intron1SNP    T  C      T TC C/T 
rs31542814
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76582643fSrd5a3 : Coding-Synonymous1SNPA AAAA GA  A  AAAAAA/G 
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
Insertions
rs31542815
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76582670fSrd5a3 : Coding-Synonymous1SNPG GGGG GG GG  GGGAGA/G 
rs31542816
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76582730fSrd5a3 : Intron1SNPG GGGC CC  C  GGGGCC/G 
rs31542817
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76582952fSrd5a3 : Intron1SNPC CCCC TC  C  CCCCCC/T 
rs3155656
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76582956rSrd5a3 : Intron1SNP  TTGG GG GG  GGGGGG/T 
rs3153739
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76582995rSrd5a3 : Intron1SNP  GGAG GG     A AAGA/G 
rs3153738
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76583041rSrd5a3 : Intron1SNPT T A  TT  T  A ATTA/T 
rs31542819
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76583052fSrd5a3 : Intron1SNPC CCCC TC  C  C CCCC/T 
rs31542820
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76583100fSrd5a3 : Intron1SNPG   GG AG  G  G GGGA/G 
rs3153737
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76583424rSrd5a3 : Intron1SNP  G   A            A/G 
rs3153736
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76583528rSrd5a3 : Intron1SNP  G   A            A/G 
rs6151961
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76583926fSrd5a3 : mRNA-UTR1IN-DEL  - i-i--   --     -/AGCCi-AGCC
rs3155654
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76583947rSrd5a3 : mRNA-UTR1SNP  A GGGGG   GA     A/G 
rs4225289
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76583951fSrd5a3 : mRNA-UTR1SNP  C GGGGG   GC     C/G 
rs4225290
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76583956fSrd5a3 : mRNA-UTR1SNP  G AAAAA   GG     A/G 
rs4225291
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76584030fSrd5a3 : mRNA-UTR1SNP  A AAAAA   TA     A/T 
rs4225292
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76584038fSrd5a3 : mRNA-UTR1SNP  T TTTTT   CT     C/T 
rs3153733
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76584120rSrd5a3 : mRNA-UTR1SNP  G TGTGG   GG     G/T 
rs4225293
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76584120fSrd5a3 : mRNA-UTR1SNP  C CTCCT   CC     C/T 
rs6151962
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76584120fSrd5a3 : mRNA-UTR1Mixed    ijikj   -l     -/CTCTCTCTCTCT/CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT/CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT/CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTi-CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT, j-CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT, k-CTCTCTCTCTCT, l-CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT
rs4225295
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76584194fSrd5a3 : mRNA-UTR1SNP    GGGGG   AG     A/G 
rs4225296
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76584314fSrd5a3 : mRNA-UTR1SNP    TTTTT   AT     A/T 
rs4225297
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76584316fSrd5a3 : mRNA-UTR1SNP    AATTA   CT     A/C/T 
rs4225298
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76584369fSrd5a3 : mRNA-UTR1SNP    TT  T   GT     G/T 
rs31542821
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr5:76584652fSrd5a3 : Locus-Region1SNP  G  A  AG       AAA/G 

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
05/08/2013
MGI 5.13
The Jackson Laboratory