About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
Genome Coordinate Discrepancy
The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details).
 Symbol
Name
ID
Bmp4
bone morphogenetic protein 4
MGI:88180

60 matching SNPs displayed


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs3667224
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:47001380fBmp4 : Locus-Region
Gm15217 : Intron
2SNPT TAT  AA A      AA     TAA/T
rs30841584
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:47001782fBmp4 : Locus-Region
Gm15217 : Intron
1SNPG GG  G A A      GG     GGA/G
rs30840373
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:47001812fBmp4 : Locus-Region
Gm15217 : Intron
1SNPC CT    T T      TT     CCC/T
rs30840372
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:47002308fBmp4 : Locus-Region
Gm15217 : Intron
1SNPC CC  C C C      CC     CTC/T
rs30774048
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:47002334fBmp4 : Locus-Region
Gm15217 : Intron
2SNPCCCT  CTC T      TT     CCC/T
rs30840371
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:47002434fBmp4 : Locus-Region
Gm15217 : Intron
1SNPG GG  G A G      GG     GGA/G
rs30702844
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:47002508fBmp4 : Locus-Region
Gm15217 : Intron
1SNP CC    T C                C/T
rs30840370
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:47002722fBmp4 : Locus-Region
Gm15217 : Intron
1SNPC CC    T        CC    CCCC/T
rs30840369
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:47002842fBmp4 : Locus-Region
Gm15217 : Coding-NonSynonymous
1SNPG GG    C        GG     GGC/G
rs30840368
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:47002953fBmp4 : Locus-Region
Gm15217 : Intron
2SNPT TC   CCTC      CC     TCC/T
rs30840367
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:47003052fBmp4 : Locus-Region
Gm15217 : mRNA-UTR
1SNPC CC    C C      CC     CGC/G
rs16784242
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:47003227fBmp4 : mRNA-UTR
Gm15217 : mRNA-UTR
1SNP      T CT  C       C     C/T
rs8236887
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:47003747fBmp4 : Coding-Synonymous
Gm15217 : Locus-Region
2SNP  A AAAGGA A         A    A/G
rs8244065
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:47003834fBmp4 : Coding-Synonymous1SNP      A GA                A/G
rs8244095
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:47003897rBmp4 : Coding-Synonymous2SNP GG GGGAGG G         G    A/G
rs8244094
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:47003978rBmp4 : Coding-NonSynonymous
Gm15222 : Locus-Region
1IN-DEL  A -  A                  -/A
rs30116106
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:47004005fBmp4 : Coding-Synonymous
Gm15222 : Locus-Region
1SNP AA    G A                A/G
rs8244064
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:47004311fBmp4 : Coding-Synonymous
Gm15222 : Locus-Region
2SNP TT TTTC T C  T           C/T
rs31332956
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:47004577fBmp4 : Intron
Gm15222 : Locus-Region
1SNP  C    T C                C/T
rs8236394
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:47004903fBmp4 : Intron
Gm15222 : Locus-Region
5SNP  AGAAAGAA AAAAAG  AGAG   A/G
rs8244093
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:47005043rBmp4 : Intron
Gm15222 : Locus-Region
1IN-DEL  A  AAA      A      -    -/A
rs8244063
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:47005045fBmp4 : Intron
Gm15222 : Locus-Region
1IN-DEL  -  -T TT T              -/T
rs31432401
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:47005087fBmp4 : Intron
Gm15222 : Locus-Region
1SNP AA    C A                A/C
rs31341581
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:47005118fBmp4 : Intron
Gm15222 : Locus-Region
1SNP GG    C G                C/G
rs31131261
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:47005139fBmp4 : Intron
Gm15222 : Locus-Region
1SNP AA    C A                A/C
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs8236888
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:47005381rBmp4 : Intron
Gm15222 : Locus-Region
3SNP CC CCCGCC C  C      C    C/G
rs8244061
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:47006485rBmp4 : Intron
Gm15222 : Intron
1SNP  T  TTAT  T  T      T    A/T
rs8244060
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:47006666rBmp4 : Intron
Gm15222 : Intron
1SNP  C CCCTTC C  C      C    C/T
rs8244059
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:47006685rBmp4 : Intron
Gm15222 : Intron
1SNP  C CCCCGC C  C      C    C/G
rs16784241
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:47006813fBmp4 : Intron
Gm15222 : Intron
1SNP  G GGGG G    G     AG    A/G
rs8243611
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:47007378rBmp4 : Intron
Gm15222 : Intron
1SNP  T  T  C                 C/T
rs8244092
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:47007468rBmp4 : Intron
Gm15222 : Intron
1SNP  G GG GGT G         G    G/T
rs8236889
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:47007570rBmp4 : Intron
Gm15222 : Intron
2SNP  G GGGGAG G  G      G    A/G
rs8244091
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:47007570rBmp4 : Intron
Gm15222 : Intron
1IN-DEL  - - A-AA A         A    -/A
rs8243610
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:47007624rBmp4 : Intron
Gm15222 : Intron
1SNP  A  A AC                 A/C
rs8244090
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:47007644rBmp4 : Intron
Gm15222 : Intron
1SNP  G G GG G C  G           C/G
rs8244058
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:47008287rBmp4 : Intron
Gm15222 : Intron
1SNP  G    A G                A/G
rs8244057
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:47008338rBmp4 : Intron
Gm15222 : Intron
1SNP       T             C    C/T
rs8244056
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:47008358rBmp4 : Intron
Gm15222 : Intron
1SNP  G GGAA                  A/G
rs8244055
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:47008411rBmp4 : Intron
Gm15222 : Intron
1SNP  C CCCCGC C  C      C    C/G
rs8244054
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:47008627rBmp4 : Intron
Gm15222 : Intron
1SNP  A AAAAGA A  A      A    A/G
rs8244087
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:47009192rBmp4 : Intron
Gm15222 : Locus-Region
1IN-DEL  -  -C-CC -         -    -/C
rs8244086
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:47009195rBmp4 : Intron
Gm15222 : Locus-Region
1IN-DEL  C  C-CC- C         C    -/C
rs8244085
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:47009217rBmp4 : Intron
Gm15222 : Locus-Region
1SNP  C CCCCTC C  C           C/T
rs8244084
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:47009228rBmp4 : Intron
Gm15222 : Locus-Region
1SNP  A AAAAGA A  A           A/G
rs8244083
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:47009255rBmp4 : Intron
Gm15222 : Locus-Region
1SNP  A AAAACA A  A           A/C
rs8244082
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:47009260rBmp4 : Intron
Gm15222 : Locus-Region
1SNP  A AAATTA T  A           A/T
rs8244081
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:47009275rBmp4 : Intron
Gm15222 : Locus-Region
1SNP  A AAATAA A  A      A    A/T
rs8244080
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:47009296rBmp4 : Intron
Gm15222 : Locus-Region
1SNP  T TTTCCT T  T           C/T
rs8244079
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:47009368rBmp4 : Intron
Gm15222 : Locus-Region
1IN-DEL  - T-- --    -           -/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs8244078
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:47009385rBmp4 : Intron
Gm15222 : Locus-Region
1IN-DEL  -  ----- -  -      T    -/T
rs8236890
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:47009869rBmp4 : Intron2SNP  T TTTCCC C  T      T    C/T
rs8236891
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:47009925rBmp4 : Intron2SNP  A AAAGGA G  A      A    A/G
rs8236892
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:47010033rBmp4 : mRNA-UTR2SNP  G GGGTGG G  G      G    G/T
rs8236893
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:47010098rBmp4 : mRNA-UTR2SNP  T TTTCCT C  T      T    C/T
rs8244053
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:47010139rBmp4 : mRNA-UTR1IN-DEL  -    AAA    A      A    -/A
rs8244052
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:47010145rBmp4 : mRNA-UTR1IN-DEL  A    -AA    A      -    -/A
rs8236894
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:47010423rBmp4 : Locus-Region2IN-DEL  - - -T-T -  -      -    -/T
rs8244077
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:47010424rBmp4 : Locus-Region1IN-DEL    T TT - T  T      T    -/T
rs8236895
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr14:47010510rBmp4 : Locus-Region2SNP  G GGGCCG G  G      G    C/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
05/08/2013
MGI 5.13
The Jackson Laboratory