About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Tsen54
tRNA splicing endonuclease 54 homolog (S. cerevisiae)
MGI:1923515

60 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27015858
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:115812898fCaskin2 : Intron
cub : within coordinates of
Tsen54 : Locus-Region
4SNPA AGG GG G AG GAGA/G
rs27015857
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:115812943fCaskin2 : Intron
cub : within coordinates of
Tsen54 : Locus-Region
4SNPCCCGG GG G CGCGCGC/G
rs27015856
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:115812987fCaskin2 : Intron
cub : within coordinates of
Tsen54 : Locus-Region
1SNPA  AA  AAT  AA ATA/T
rs27015855
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:115812993fCaskin2 : Intron
cub : within coordinates of
Tsen54 : Locus-Region
4SNPGGAGG GGAG AGGGGGA/G
rs29384226
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:115813034fCaskin2 : Intron
cub : within coordinates of
Tsen54 : Locus-Region
3SNP GG   CC   G  C  C/G
rs29385266
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:115813039fCaskin2 : Intron
cub : within coordinates of
Tsen54 : Locus-Region
3SNP CC   TT   C  T  C/T
rs27015854
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:115813361fCaskin2 : Intron
cub : within coordinates of
Tsen54 : Locus-Region
3SNPAAACCACCAA ACACAAA/C
rs27015853
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:115813430fCaskin2 : Intron
cub : within coordinates of
Tsen54 : Locus-Region
4SNPAAAGGAGGAAAAGAGAAA/G
rs29438159
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:115813601fCaskin2 : Locus-Region
cub : within coordinates of
Tsen54 : Locus-Region
1SNP GC   CC         C/G
rs29441098
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:115813684fCaskin2 : Locus-Region
cub : within coordinates of
Tsen54 : Locus-Region
2SNP TT   CC         C/T
rs29480450
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:115813696fCaskin2 : Locus-Region
cub : within coordinates of
Tsen54 : Locus-Region
2SNP GG   TT         G/T
rs29464134
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:115813732fCaskin2 : Locus-Region
cub : within coordinates of
Tsen54 : Locus-Region
2SNP TT   CC   T  C  C/T
rs29388110
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:115813914fCaskin2 : Locus-Region
cub : within coordinates of
Tsen54 : Locus-Region
3SNP AA   GG   A  G  A/G
rs27015852
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:115814141fCaskin2 : Locus-Region
cub : within coordinates of
Tsen54 : Locus-Region
2SNPA  CC  C   AC CAAA/C
rs27015851
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:115814208fCaskin2 : Locus-Region
cub : within coordinates of
Tsen54 : Locus-Region
2SNPT  CC  C   TCTCTTC/T
rs232703110
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:115814265fCaskin2 : Locus-Region
cub : within coordinates of
Tsen54 : Locus-Region
1SNP           G  A  A/G
rs107725020
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:115814360fCaskin2 : Locus-Region
cub : within coordinates of
Tsen54 : Locus-Region
2SNP  C        C  G  C/G
rs27015850
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:115814590fCaskin2 : Locus-Region
cub : within coordinates of
Tsen54 : Locus-Region
4SNPAAAGG GG   AG GAAA/G
rs27015849
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:115814604fCaskin2 : Locus-Region
cub : within coordinates of
Tsen54 : Locus-Region
4SNPAAACC CC   AC CAAA/C
rs29401797
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:115814628fCaskin2 : Locus-Region
cub : within coordinates of
Tsen54 : Locus-Region
3SNP AA   G    A  G  A/G
rs27015848
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:115814657fCaskin2 : Locus-Region
cub : within coordinates of
Tsen54 : Locus-Region
3SNPCCCTT TTCC CTCTCCC/T
rs27015847
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:115814671fCaskin2 : Locus-Region
cub : within coordinates of
Tsen54 : Locus-Region
2SNPG  CC  CGGGGCGCGGC/G
rs27015846
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:115815523fCaskin2 : Locus-Region
cub : within coordinates of
Tsen54 : Intron
4SNPCCCTT TTCC CTCTCCC/T
rs27015845
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:115815748fcub : within coordinates of
Tsen54 : Coding-Synonymous
4SNPCCCAACAACC CACACCA/C
rs27015844
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:115815754fcub : within coordinates of
Tsen54 : Coding-NonSynonymous
1SNP   GGC  CC  GC   C/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29392980
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:115816221fcub : within coordinates of
Tsen54 : Intron
3SNP GG   AA   G  A  A/G
rs29449943
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:115816522fcub : within coordinates of
Tsen54 : Intron
3SNP AA    G   A  G  A/G
rs29402939
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:115816527fcub : within coordinates of
Tsen54 : Intron
3SNP AA    C   A  C  A/C
rs46638342
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:115816970fcub : within coordinates of
Tsen54 : Intron
2SNP AA        A  G  A/G
rs29399965
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:115817049fcub : within coordinates of
Tsen54 : Intron
2SNPAAT    T         A/T
rs27015843
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:115817296fcub : within coordinates of
Tsen54 : Intron
1SNPG  GGG GGCG GG GGC/G
rs27015842
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:115817323fcub : within coordinates of
Tsen54 : Intron
1SNPT  TTT TTC  TT TTC/T
rs29388932
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:115817727fcub : within coordinates of
Tsen54 : Intron
3SNP GG   AA   G  A  A/G
rs29461120
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:115817959fcub : within coordinates of
Tsen54 : Intron
2SNP GG   CC         C/G
rs29442463
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:115817999fcub : within coordinates of
Tsen54 : Intron
2SNP CC   TT         C/T
rs49050178
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:115818570fcub : within coordinates of
Tsen54 : Intron
2SNP  A        A  G  A/G
rs246637052
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:115819216fcub : within coordinates of
Tsen54 : Intron
1SNP           G  A  A/G
rs262266682
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:115819224fcub : within coordinates of
Tsen54 : Intron
1SNP           G  A  A/G
rs29486756
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:115820057fcub : within coordinates of
Tsen54 : Intron
3SNP  C   T    C  T  C/T
rs13466121
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:115820484fcub : within coordinates of
Tsen54 : Coding-Synonymous
2SNP  A    G   A  G  A/G
rs13466122
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:115820488fcub : within coordinates of
Tsen54 : Coding-NonSynonymous
3SNP  C   TT   C  T  C/T
rs29421239
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:115821460fcub : within coordinates of
Tsen54 : Intron
3SNPCCT   CC   T  C  C/T
rs47295561
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:115822272fcub : within coordinates of
Llgl2 : Locus-Region
Tsen54 : Intron
2SNP TT        T  C  C/T
rs49209607
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:115822755fcub : within coordinates of
Llgl2 : Locus-Region
Tsen54 : mRNA-UTR
2SNP TT    G   T  G  G/T
rs46136657
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:115822787fcub : within coordinates of
Llgl2 : Locus-Region
Tsen54 : mRNA-UTR
2SNP  T    C   T  C  C/T
rs50722275
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:115822807fcub : within coordinates of
Llgl2 : Locus-Region
Tsen54 : mRNA-UTR
2SNP  C    T   C  T  C/T
rs49159109
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:115822851fcub : within coordinates of
Llgl2 : Locus-Region
Tsen54 : mRNA-UTR
2SNP  G    A   G  A  A/G
rs50422700
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:115822958fcub : within coordinates of
Llgl2 : Locus-Region
Tsen54 : mRNA-UTR
2SNP GG    C   G  C  C/G
rs48385240
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:115822987fcub : within coordinates of
Llgl2 : Locus-Region
Tsen54 : mRNA-UTR
2SNP TT    C   T  C  C/T
rs50222919
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:115823077fcub : within coordinates of
Llgl2 : Locus-Region
Tsen54 : mRNA-UTR
2SNP TT    A   T  A  A/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs48648953
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:115823264fcub : within coordinates of
Llgl2 : Locus-Region
Tsen54 : Locus-Region
2SNP AA    G   A  G  A/G
rs50104470
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:115823445fcub : within coordinates of
Llgl2 : Locus-Region
Tsen54 : Locus-Region
1SNP CC    A         A/C
rs29468230
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:115823925fcub : within coordinates of
Llgl2 : Locus-Region
Tsen54 : 831 bp downstream of
3SNP CC   GG   C  G  C/G
rs29411116
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:115824026fcub : within coordinates of
Llgl2 : Locus-Region
Tsen54 : 932 bp downstream of
3SNP CC   AA   C  A  A/C
rs29486611
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:115824214fcub : within coordinates of
Llgl2 : Intron
Tsen54 : 1120 bp downstream of
3SNP GG   CC   G  C  C/G
rs29463594
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:115824732fcub : within coordinates of
Llgl2 : Intron
Tsen54 : 1638 bp downstream of
3SNP CC   TT   C  T  C/T
rs29393209
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:115824763fcub : within coordinates of
Llgl2 : Intron
Tsen54 : 1669 bp downstream of
3SNP CC   GG   C  G  C/G
rs29430098
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:115824790fcub : within coordinates of
Llgl2 : Intron
Tsen54 : 1696 bp downstream of
3SNP GG   AA   G  A  A/G
rs29401535
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:115824843fcub : within coordinates of
Llgl2 : Intron
Tsen54 : 1749 bp downstream of
3SNP GG   AA   G  A  A/G
rs29444962
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:115825055fcub : within coordinates of
Llgl2 : Intron
Tsen54 : 1961 bp downstream of
3SNP CC   TT   C  T  C/T

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
04/08/2014
MGI 5.17
The Jackson Laboratory