About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Atp13a2
ATPase type 13A2
MGI:1922022

164 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs32841683
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140985185fAtp13a2 : Locus-Region
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
2SNP CT        C                                      C/T
rs50701309
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140985717fAtp13a2 : Locus-Region
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNP  A                                               A
rs52146278
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140985948fAtp13a2 : Locus-Region
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNP GA        G                                      A/G
rs52080998
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140985998fAtp13a2 : Locus-Region
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNP G         G                                      G
rs48718270
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140986605fAtp13a2 : Locus-Region
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNP           T                                      T
rs51470915
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140986716fAtp13a2 : Locus-Region
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNP           T                                      T
rs32185646
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140987636fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
2SNP  C        T                                      C/T
rs32559945
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140988350fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNP TA        T                                      A/T
rs31751744
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140989078fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNP AA   A    C                                      A/C
rs32235703
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140989109fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
2SNP AC   C    A                                      A/C
rs32889208
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140989373fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
2SNP A    G    A                                      A/G
rs32591108
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140989412fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
2SNP G    A    G                                      A/G
rs32501025
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140989988fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
2SNP GA   A    G                                      A/G
rs32903122
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140990225fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
2SNP GG   G    A                                      A/G
rs31913351
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140990252fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
2SNP CT   T    C                                      C/T
rs32917212
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140990295fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
2SNP TC   C    T                                      C/T
rs32029754
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140990301fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
2SNP TC   C    T                                      C/T
rs32385833
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140991089fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
2SNP AG   G    A                                      A/G
rs31878192
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140991247fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
2SNP TA        T                                      A/T
rs28260921
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140991738fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
3SNPA G   G    A GA                                 G A/G
rs47552273
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140992585fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNP CT        C                                      C/T
rs28260920
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140992619fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNP              C                                 T C/T
rs47855488
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140992722fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNP A         A                                      A
rs48715050
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140992749fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNP CC        C                                      C
rs107624365
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140993128fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNP  T                                               T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs32596317
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140993429fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
2SNPGG    A    G                                      A/G
rs32471849
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140993626fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
2SNPCC    T    C                                      C/T
rs13461262
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140993841fAtp13a2 : Coding-NonSynonymous
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
2SNP C    G    C                                      C/G
rs32875038
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140993846fAtp13a2 : Coding-Synonymous
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
2SNP CT   T    C                                      C/T
rs32628066
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140993890fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
2SNP GT   T    G                                      G/T
rs28260919
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140994712fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNPC CCCC   C CCCC        C          C      C C    T C/T
rs28260918
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140994869fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNPC CCCC   T CCTC        C          C      C C    C C/T
rs28260917
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140994991fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNPG GGGG   A GGAG        G          G      G G    G A/G
rs32707016
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140995228fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
2SNPCCT   T    C                                      C/T
rs28260916
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140995339fAtp13a2 : Coding-NonSynonymous
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
3SNPAAGGGGG  G AAGA        A          A      G A    G A/G
rs28260915
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140995356fAtp13a2 : Coding-Synonymous
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNPC CCCC   T CCTC        C          C      C C    C C/T
rs28260914
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140995389fAtp13a2 : Coding-Synonymous
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
2SNPAAGGGG   G AAGA        A          A      G A    G A/G
rs50102235
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140995418fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNP A         A                                      A
rs28260913
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140995541fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
2SNPGGAAAA   G GGGG        G          G      A G    G A/G
rs28260912
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140995579fAtp13a2 : Coding-Synonymous
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
2SNPT CCCC   T TTTT        T          T      C T    C C/T
rs51602937
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140995633fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNP           G                                      G
rs45981727
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140995640fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNP           A                                      A
rs48572515
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140995645fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNP           C                                      C
rs47117657
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140995660fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNP           G                                      G
rs28260911
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140995716fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
2SNP  CCCC   T   T                           C      C C/T
rs28260910
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140995849fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
3SNPG AAAAA  G GGGG        G          G      A G    A A/G
rs28260909
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140995966fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
3SNPT GGGGG  G TTGT        T          T      G T    G G/T
rs28260908
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140996029fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
2SNPAAGGGG   G AAGA        A          A      G A    G A/G
rs51107243
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140996472fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNP AG        A                                      A/G
rs48633362
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140996480fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNP GA                                               A/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs28260907
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140996499fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNPC CCCC     CC C        C          C      C C    T C/T
rs28260906
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140996536fAtp13a2 : Coding-Synonymous
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
2SNPCCTTTT     CCCC        C          C      T C    T C/T
rs50482732
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140996600fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNP GA        G                                      A/G
rs51042638
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140996628fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNP CT        C                                      C/T
rs48508054
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140996629fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNP GA        G                                      A/G
rs49087973
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140996636fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNP AG        A                                      A/G
rs28260905
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140996702fAtp13a2 : Coding-Synonymous
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNPC CTCC   C CCCC        C          C      C C    C C/T
rs50478935
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140996712fAtp13a2 : Coding-Synonymous
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNP CT        C                                      C/T
rs28260904
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140996874fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
2SNPAAGGGG   A AAAA        A          A      G A    G A/G
rs49133047
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140996913fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNP TC        T                                      C/T
rs51232066
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140996915fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNP GC        G                                      C/G
rs28260903
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140996940fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
2SNPA GGGG   A AA          A          A      G      G A/G
rs28260902
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140997006fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
2SNPGGCCCC   C GGCG        G          G      C G    C C/G
rs28260901
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140997084fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
2SNPAAGGGG   G AAGA        A          A      G A    G A/G
rs28260900
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140997136fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
2SNPTTCCCC   C TTCT        T          T      C T    C C/T
rs48603080
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140997268fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNP TG        T                                      G/T
rs28260899
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140997367fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
2SNPCCTTTT   C CCCC        C          C      T C    T C/T
rs28260898
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140997445fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
2SNPAAGGGG   G AAGA        A          A      G A    G A/G
rs49984958
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140997509fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNP TC        T                                      C/T
rs48679228
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140997615fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNP  T        G                                      G/T
rs47492195
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140997633fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNP GT        G                                      G/T
rs51861153
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140998105fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNP GA        G                                      A/G
rs48860900
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140998264fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNP AC        A                                      A/C
rs48071251
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140998266fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNP TA        T                                      A/T
rs50033384
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140998690fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNP  A        G                                      A/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs28260897
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140998873fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
2SNPGGAAAA   G GGGG        G          G      A G    A A/G
rs32230955
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140998894fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
2SNP CA   A    C                                      A/C
rs33020239
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140999329fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
2SNP GT   T    G                                      G/T
rs28260896
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140999344fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNPG GGGG   A GGAG        G          G      G G    G A/G
rs28260895
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140999413fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
2SNPCCTTTT   T CCTC        C          C      T C    T C/T
rs31874374
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140999540fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
2SNP GA        G                                      A/G
rs47990174
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:140999576fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNP GA                                               A/G
rs28260894
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141000104fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
3SNPG AAAAA  A GGAG        G          G      A G    G A/G
rs31832580
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141000118fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
2SNPA G   G    A                                      A/G
rs47811633
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141000165fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNP  C                                               C
rs28260893
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141000192fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
3SNPT CCCCC    TT T                   T      C      C C/T
rs28260892
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141000193fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNPG GGGG   A GGAG        G          G      G G    G A/G
rs28260891
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141000214fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
3SNPA CCCCC  C AACA        A          A      C A    C A/C
rs28260890
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141000383fAtp13a2 : Coding-Synonymous
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
3SNPA GGGG   G AAGA        A          A      G A    G A/G
rs28260889
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141000447fAtp13a2 : Coding-NonSynonymous
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNPG GGGG   G GGGG        G          G      G G    A A/G
rs32594356
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141000470fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
2SNPC T        C                                      C/T
rs32613131
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141000502fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
2SNPA G        A                                      A/G
rs50369393
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141000550fAtp13a2 : Coding-Synonymous
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNP           C                                      C
rs28260888
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141000569fAtp13a2 : Coding-NonSynonymous
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
2SNPG AAAA   G G GG        G          G      A      G A/G
rs45982302
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141000583fAtp13a2 : Coding-Synonymous
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNP           A                                      A
rs28260887
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141000603fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
2SNP  TTTT   T GGTG                   G      T G    T G/T
rs28260886
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141000765fAtp13a2 : Coding-Synonymous
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNPG CCCC   C GGCG        G          G      C G    C C/G
rs28260885
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141000799fAtp13a2 : Coding-NonSynonymous
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNPG AAAA   A GGAG        G          G      A G    A A/G
rs28260884
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141000937fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNPC AAAA   C CCCC        C          C      A C    C A/C
rs28260883
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141001497fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNPA AAAA   G AAGA        A          A      A A    G A/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs28260882
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141001527fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNPG GGGG   G GGGG        G          G      G G    T G/T
rs13461260
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141001898fAtp13a2 : Coding-Synonymous
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNPA GGGG   A AAAA        A          A      G A    G A/G
rs13461261
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141001925fAtp13a2 : Coding-Synonymous
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
2SNP AG                                               A/G
rs28260880
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141002109fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
3SNP CAAAAA  C C C         C          C      A C    A A/C
rs28260879
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141002115fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNPC CCCC   A  CA         C          C      C C    C A/C
rs28260878
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141002128fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNPG  GGG   G GGGA                   A      G G    G A/G
rs28260877
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141002204fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNPG GGGG   A GGAG        G          G      G G    G A/G
rs32601055
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141002272fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
2SNP GT   T                                           G/T
rs28260876
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141002368fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
3SNPTTCCCCC  C TTCT        T          T      C T    C C/T
rs32831961
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141002572fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
2SNP  T   T    G                                      G/T
rs33009497
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141002620fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
2SNP  G   G    A                                      A/G
rs32366617
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141002813fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
2SNP  G   G    T                                      G/T
rs28260875
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141002998fAtp13a2 : Coding-NonSynonymous
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNPA CCCC   A AAAA                   A      C A    C A/C
rs28260874
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141003114fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNPC CCCC   C CCCC        C          C      C C    G C/G
rs28260873
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141003154fAtp13a2 : Coding-Synonymous
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNP  TTTT                            C      T      C C/T
rs28260872
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141003465fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
3SNPGGTTTT     GGGG        G          G      T G    G G/T
rs48143382
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141003724fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNP  T        C                                      C/T
rs49233325
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141003838fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNP           A                                      A
rs28260871
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141003872fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
2SNPC TTTT   C CCCC        C          C      T C    T C/T
rs51009138
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141003877fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNP           T                                      T
rs28260870
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141004001fAtp13a2 : Coding-Synonymous
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
2SNP  CCCC     T  T                   T      C T    C C/T
rs48752881
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141004008fAtp13a2 : Coding-Synonymous
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNP           T                                      T
rs28260869
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141004037fAtp13a2 : Coding-Synonymous
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
2SNPT CCCC   C TTCT        T          T      C T    C C/T
rs28260868
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141004054fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNPG AAAA     GGGG        G          G      A G    A A/G
rs28260867
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141004397fAtp13a2 : Coding-Synonymous
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNPC AAAA   A CCAC        C          C      A C    C A/C
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs28260866
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141004509fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNPC AAAA   C CCCC        C          C      A C    C A/C
rs31870436
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141004583fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
2SNP CT   T                                           C/T
rs28260865
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141004906fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
3SNPCCTTTT   T CCTC        C          C      T C    T C/T
rs28260864
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141005101fAtp13a2 : Coding-Synonymous
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNPC CCCC   T CCTC        C          C      C C    T C/T
rs28260863
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141005243fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNPG GGGG     GG G        G          G      G G    A A/G
rs28260862
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141005281fAtp13a2 : Coding-Synonymous
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNPC CCCC     CC C        C          C      C C    T C/T
rs28260861
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141005287fAtp13a2 : Coding-Synonymous
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNPT TTTT   C TTCT        T          T      T T      C/T
rs28260860
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141005362fAtp13a2 : Coding-Synonymous
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNPA AAAA   G AAGA        A          A      A A    G A/G
rs28260859
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141005510fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNPG GGGG   A GGAG        G          G      G G    A A/G
rs28260858
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141005825fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNPG GGGG   T GGTG        G          G      G      G G/T
rs28260857
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141005826fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNPC TTTT     CC C        C          C      T C    C C/T
rs28260856
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141005832fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNP  GGGG     T T                    T      G T    G G/T
rs28260855
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141005925fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNP  AAAA   G   G                           A      A A/G
rs28260854
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141006081fAtp13a2 : Coding-Synonymous
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNPT TTTT   C TTCT        T          T      T T    C C/T
rs28260853
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141006126fAtp13a2 : Coding-Synonymous
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNPA AAAA   G AAGA        A          A      A A    G A/G
rs28260852
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141006159fAtp13a2 : Coding-Synonymous
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNPA GG G   G AAGA        A          A      G A    G A/G
rs28260851
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141006382fAtp13a2 : Coding-Synonymous
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNPT TTTT   A TTAT        T          T      T T    A A/T
rs28260850
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141006449fAtp13a2 : Coding-Synonymous
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNPC CCCC   T CCTC        C          C      C C    C C/T
rs28260849
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141006490fAtp13a2 : Coding-Synonymous
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNPA AAAA   G AAGA        A          A      A A    G A/G
rs28260848
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141006574fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNPG GGGG   A GGAG        G          G      G G    A A/G
rs52315481
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141006577fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNP  T        C                                      C/T
rs28260847
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141006649fAtp13a2 : Intron
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
2SNP  GGGG   G AAGA        A          A      G A    G A/G
rs28260846
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141006795fAtp13a2 : Coding-Synonymous
Atp13a2 : Coding-NonSynonymous
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNPC CCCC   T CCTC        C          C      C C    T C/T
rs28260845
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141006807fAtp13a2 : Coding-NonSynonymous
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNPG GGGG   G GGGG        G          G      G G    A A/G
rs4232382
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141007060rAtp13a2 : mRNA-UTR
Atp13a2 : Coding-Synonymous
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
2SNPCC?C???CC?C?CCCCCCCC?CGCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC CCTCCCA/C/G/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs4232381
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141007069rAtp13a2 : Coding-Synonymous
Atp13a2 : mRNA-UTR
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNP  G GGG  G G        A G                           A/G
rs4232380
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141007216rAtp13a2 : mRNA-UTR
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
2SNPA AAAAA  C AACA     C AA          A      A A    C A/C
rs31974384
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141007383fAtp13a2 : mRNA-UTR
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
2SNP      T    C                                      C/T
rs32130974
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141007408fAtp13a2 : mRNA-UTR
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
2SNP      T    C                                      C/T
rs32959746
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141007551fAtp13a2 : mRNA-UTR
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNP      T    C                                      C/T
rs32674573
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141007630fAtp13a2 : mRNA-UTR
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNP      A    G                                      A/G
rs28260844
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141007836fAtp13a2 : Locus-Region
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNPA AAAA   G AAGA        A          A      A A    G A/G
rs28260843
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141007859fAtp13a2 : Locus-Region
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
2SNPC TTTT   C CCCC        C          C      T C    C C/T
rs28260842
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141007932fAtp13a2 : Locus-Region
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
3SNPA CCCC   C AACA        A          A      C A    C A/C
rs49509428
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141007955fAtp13a2 : Locus-Region
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNP           A                                      A
rs28260841
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141008176fAtp13a2 : Locus-Region
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNPT TTTT   C TTCT        T          T      T T    C C/T
rs28260840
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141008295fAtp13a2 : 965 bp downstream of
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNPT TTTT     TT T        T          T      T T    G G/T
rs28260839
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141009086fAtp13a2 : 1756 bp downstream of
Mfap2 : Locus-Region
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNPG GGGG   G GGGG        G          G      G G    A A/G
rs28260838
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:141009137fAtp13a2 : 1807 bp downstream of
Mfap2 : Locus-Region
Panc1 : within coordinates of
Pphc2 : within coordinates of
1SNPA AAAA   G AAGA        A          A      A A    G A/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
12/16/2014
MGI 5.20
The Jackson Laboratory