About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Slc52a3
solute carrier protein family 52, member 3
MGI:1916948

112 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs45925069
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:151994570fSlc52a3 : Locus-Region1SNP GG      G       A   A/G
rs33157494
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:151994572fSlc52a3 : Locus-Region3SNP AG   G  G   G  AG   A/G
rs27346443
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:151994594fSlc52a3 : Locus-Region2SNPAAGGGG G GG   GG A  GA/G
rs47778946
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:151994595fSlc52a3 : Locus-Region1SNP  C      C       A   A/C
rs27346442
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:151994641fSlc52a3 : Locus-Region2SNPGGGGGG G GG   GG A AGA/G
rs27346441
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:151994646fSlc52a3 : Locus-Region4SNPAAGGGGGG GG  GGGAG GGA/G
rs32940125
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:151994673fSlc52a3 : Locus-Region3SNP AG   G  G   G  AA   A/G
rs46302142
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:151994748fSlc52a3 : Locus-Region1SNP TT      T       A   A/T
rs49425086
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:151994907fSlc52a3 : Locus-Region2SNP  T      T   T  CC   C/T
rs27346440
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:151994933fSlc52a3 : Locus-Region2SNPC GGGG G GG  GGGC  GGC/G
rs27346439
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:151994941fSlc52a3 : Locus-Region1SNPT TTTT T TT   TT   GTG/T
rs27346438
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:151995020fSlc52a3 : Locus-Region1SNPG GGGG G GGG  GG  GAGA/G
rs33106607
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:151995225fSlc52a3 : Locus-Region2SNP TC   C  C   C  T    C/T
rs33420401
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:151995295fSlc52a3 : Locus-Region3SNPCCT   T  T   T  C    C/T
rs33699626
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:151995426fSlc52a3 : Locus-Region2SNPGGA          A  G    A/G
rs29507255
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:151995434fSlc52a3 : Locus-Region3SNPGGA          A  G    A/G
rs234854656
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:151995813fSlc52a3 : Locus-Region1SNP             C  T    C/T
rs252981252
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:151995826fSlc52a3 : Locus-Region1SNP             C  T    C/T
rs223665173
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:151996081fSlc52a3 : Locus-Region1SNP             A  G    A/G
rs245785711
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:151996087fSlc52a3 : Locus-Region1SNP             G  T    G/T
rs27346437
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:151996334fSlc52a3 : Locus-Region1SNPC CCCC C CC   CC  CACA/C
rs29574550
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:151996377fSlc52a3 : Locus-Region3SNPA T      T   T  A    A/T
rs33115949
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:151996402fSlc52a3 : Locus-Region3SNPC T      T   T  C    C/T
rs27346436
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:151997029fSlc52a3 : Intron4SNPTTCCCCCC CC  CCCT CCCC/T
rs258608971
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:151997437fSlc52a3 : Intron1SNP             T  C    C/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs221133276
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:151997583fSlc52a3 : Intron1SNP             C  T    C/T
rs29539480
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:151997735fSlc52a3 : Intron2SNP GT   T  T   T  G    G/T
rs32881040
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:151998104fSlc52a3 : Intron
Slc52a3 : Locus-Region
2SNPG T      T   T  G    G/T
rs32987391
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:151998111fSlc52a3 : Intron
Slc52a3 : Locus-Region
2SNPG A      A   A  G    A/G
rs29864701
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:151998116fSlc52a3 : Intron
Slc52a3 : Locus-Region
2SNPC T      T   T  C    C/T
rs32913466
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:151998279fSlc52a3 : Intron
Slc52a3 : Locus-Region
2SNPGGA   A      A  G    A/G
rs27346435
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:151998781fSlc52a3 : Intron
Slc52a3 : Locus-Region
4SNPTTCCCCCC CC  CCCT  CCC/T
rs27346434
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:151998853fSlc52a3 : Intron
Slc52a3 : Locus-Region
3SNPTTCCCCCC CC   CC   CCC/T
rs27346433
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:151999056fSlc52a3 : Intron
Slc52a3 : Locus-Region
1SNP  AAAA A AA   AA  GGAA/G
rs249101587
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:151999431fSlc52a3 : Intron
Slc52a3 : Locus-Region
1SNP             C  A    A/C
rs217021202
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:151999785fSlc52a3 : Intron
Slc52a3 : Locus-Region
1SNP             A  G    A/G
rs234814874
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:151999952fSlc52a3 : Intron1SNP             G  A    A/G
rs33218627
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152000239fSlc52a3 : Intron3SNPTTG   G  G   G  T    G/T
rs27346432
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152000300fSlc52a3 : Intron4SNPCCTTTTTT TT  TTTC  CCC/T
rs236403720
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152000394fSlc52a3 : Intron1SNP             A  G    A/G
rs261442257
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152000621fSlc52a3 : Intron1SNP             T  G    G/T
rs220301738
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152000753fSlc52a3 : Intron1SNP             C  T    C/T
rs27346431
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152001149fSlc52a3 : Intron2SNPC TTTT T TT  TTTC  CTC/T
rs33469456
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152001184fSlc52a3 : Intron3SNP AG   G  G   G  A    A/G
rs29636776
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152001219fSlc52a3 : Intron3SNP AG   G  G   G  A    A/G
rs238843341
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152001435fSlc52a3 : Intron1SNP             T  C    C/T
rs262632286
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152001694fSlc52a3 : Intron1SNP             G  A    A/G
rs221809582
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152001754fSlc52a3 : Intron1SNP             C  T    C/T
rs27346430
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152001890fSlc52a3 : Intron2SNPT CCCC C CCCCCCCT CCCC/T
rs264547326
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152002024fSlc52a3 : Intron1SNP             T  C    C/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27346429
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152002056fSlc52a3 : Intron2SNPA GGGG G GGAAGGGA AAGA/G
rs27346428
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152002128fSlc52a3 : Intron3SNPGGAAAA A AAGGAAAG GGAA/G
rs29576052
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152002289fSlc52a3 : Intron3SNP AG   G  G   G  A    A/G
rs29816868
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152002298fSlc52a3 : Intron3SNP AG   G  G   G  A    A/G
rs27346427
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152002827fSlc52a3 : Intron4SNPTTCCCCCC CCCCCCCT CCCC/T
rs27346426
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152003084fSlc52a3 : Intron4SNPA GGGGGG GGAAGGGA AAGA/G
rs6192598
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152003358fSlc52a3 : Intron1SNP      C T            C/T
rs6192638
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152003378fSlc52a3 : Intron5SNPAAGGGGGGAGG  GGGA  AGA/G
rs6193150
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152003461fSlc52a3 : Intron4SNPGGA   A GA   A  G    A/G
rs6193230
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152003505fSlc52a3 : Intron5SNPTTCCCCCCTCCT CCCT TTCC/T
rs6193249
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152003516fSlc52a3 : Intron1SNP      C G            C/G
rs6193682
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152003584fSlc52a3 : Intron4SNPTTC   C TC   C  T    C/T
rs27346425
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152004381fSlc52a3 : Coding-Synonymous3SNPCCTTTT T TTCCTTTC CCTC/T
rs27346424
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152004453fSlc52a3 : Coding-Synonymous1SNPC CCCC C CCCC CC  CTCC/T
rs29570021
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152004744fSlc52a3 : Intron3SNPTTG   G  G   G  T    G/T
rs33515991
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152004745fSlc52a3 : Intron3SNPTTG   G  G   G  T    G/T
rs33071584
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152004936fSlc52a3 : Intron3SNPCCT   T  T   T  C    C/T
rs29716688
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152005148fSlc52a3 : Intron2SNP TC   C  C           C/T
rs27346423
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152005197fSlc52a3 : Intron4SNPTTCCCCCC CCCCCCCT CCCC/T
rs27346422
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152005222fSlc52a3 : Intron1SNPC CCCC C CCTT CC  TCCC/T
rs27346421
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152005358fSlc52a3 : Intron1SNPT TTTT T TTGG TT  GTTG/T
rs27346420
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152005381fSlc52a3 : Intron4SNPCCTTTTTT TTCCTTTC CCTC/T
rs32870896
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152005382fSlc52a3 : Intron3SNP GA   A  A   A  G    A/G
rs27346419
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152005450fSlc52a3 : Intron1SNPT TTTT T TTGG TT  GGTG/T
rs27346418
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152005487fSlc52a3 : Intron1SNPG GGGG A GGGG GG  GGAA/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27346417
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152005556fSlc52a3 : Coding-NonSynonymous
Slc52a3 : Intron
1SNPT TTTT T TTCC TT  CCTC/T
rs223281521
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152005688fSlc52a3 : Coding-Synonymous
Slc52a3 : Intron
1SNP             C  A    A/C
rs243009312
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152005828fSlc52a3 : Coding-Synonymous
Slc52a3 : Intron
1SNP             G  T    G/T
rs27346416
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152005829fSlc52a3 : Coding-NonSynonymous
Slc52a3 : Intron
1SNPC CCCC C CCAA CC  AACA/C
rs27346415
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152006138fSlc52a3 : Intron1SNPA AAAA A AAGG AA  GGAA/G
rs260883384
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152006177fSlc52a3 : Intron1SNP             G  A    A/G
rs27346414
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152006378fSlc52a3 : Intron1SNPG GGGG G GGAA GG  AGGA/G
rs27346413
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152006478fSlc52a3 : Intron2SNPA GGGG G GGGGGGGA GGGA/G
rs245890684
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152006723fSlc52a3 : Intron1SNP             T  A    A/T
rs27346412
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152006836fSlc52a3 : Intron3SNPAAGGGG G GGGGGGGA GGGA/G
rs27346411
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152006959fSlc52a3 : Intron4SNPAAGGGGGG GGGGGGGA GGGA/G
rs27346410
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152006960fSlc52a3 : Intron1SNPG GGGG G GGGG GG  GAGA/G
rs27346409
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152007133fSlc52a3 : Intron1SNPC CCCC C CCCC CC  CGCC/G
rs27346408
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152007659fSlc52a3 : Intron1SNPC CCCC C CCAA CC  AACA/C
rs27346407
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152007961fSlc52a3 : Coding-NonSynonymous
Slc52a3 : Coding-Synonymous
4SNPT CCCCCC CCCCCCCT CCCC/T
rs27346406
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152008155fSlc52a3 : Coding-Synonymous
Slc52a3 : mRNA-UTR
4SNPC GGGGGG GGCCGGGC CCGC/G
rs27346405
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152008176fSlc52a3 : mRNA-UTR4SNPC AAAAAA AAAAAAAC AAAA/C
rs13469509
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152008437fSlc52a3 : mRNA-UTR2SNPC TTTT T TTCCTTTC CCTC/T
rs13469506
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152008601fSlc52a3 : mRNA-UTR1SNP             A  G    A/G
rs27346404
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152008618fSlc52a3 : mRNA-UTR1SNPG GGGG G GGAA GG  AGGA/G
rs27346403
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152008667fSlc52a3 : mRNA-UTR1SNPG GGGG A GGGG GG   GGA/G
rs27346402
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152008676fSlc52a3 : mRNA-UTR1SNPT TTTT T TTCC TT  CCTC/T
rs27346401
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152008834fSlc52a3 : mRNA-UTR1SNPC CCCC C CCTT CC  TTCC/T
rs13469505
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152008866fSlc52a3 : mRNA-UTR4SNPGGAAAAAA AA  AAAG  GAA/G
rs13469508
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152008989fSlc52a3 : mRNA-UTR4SNPCCTTTTTT TTCCTTTC CCTC/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs13469507
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152009016fSlc52a3 : mRNA-UTR1SNPT TTTT T TTCC TT  CCTC/T
rs27346400
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152009209fSlc52a3 : mRNA-UTR4SNPGGAAAAAA AATTAAAG TAAA/G/T
rs27346399
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152009267fSlc52a3 : Locus-Region4SNPG TTTTTT TTG TTTG GGTG/T
rs27346398
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152009764fSlc52a3 : 506 bp downstream of4SNPTTCCCCCC CCCCCCCT CCCC/T
rs27346397
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152009948fSlc52a3 : 690 bp downstream of4SNPGGCCCCCC CCCCCCCG CCCC/G
rs241827228
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152010316fSlc52a3 : 1058 bp downstream of1SNP             C  T    C/T
rs27346396
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152010318fSlc52a3 : 1060 bp downstream of2SNPT CCCC C CCTTCCCT T CC/T
rs29767395
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152010524fSlc52a3 : 1266 bp downstream of3SNP CT   T  T   T  C    C/T
rs27346395
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152010952fSlc52a3 : 1694 bp downstream of1SNPG GGGG G GGAA GG  AAGA/G
rs27346394
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152011123fSlc52a3 : 1865 bp downstream of1SNPG GGGG G GGAA GG  AAGA/G
rs248279052
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152011173fSlc52a3 : 1915 bp downstream of1SNP             C  T    C/T
rs27346393
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:152011236fSlc52a3 : 1978 bp downstream of1SNPA GGGG G GGGG GG  GGGA/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
08/12/2014
MGI 5.19
The Jackson Laboratory