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Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Pofut2
protein O-fucosyltransferase 2
MGI:1916863

53 matching SNPs displayed
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Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs108053856
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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Dp(10Prmt2-Pdxk)2Yey : within coordinates of
Gm10941 : Intron
Gn : within coordinates of
Pofut2 : Locus-Region
1SNP TC                 C/T
rs46792106
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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Dp(10Prmt2-Pdxk)2Yey : within coordinates of
Gm10941 : Intron
Gn : within coordinates of
Pofut2 : Locus-Region
1SNP       C T T   TT   C/T
rs45636560
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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Gm10941 : Noncoding-Transcript-Variant
Gn : within coordinates of
Pofut2 : Locus-Region
1SNP         T GT  TT  TG/T
rs46162069
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Gm10941 : Noncoding-Transcript-Variant
Gn : within coordinates of
Pofut2 : Locus-Region
1SNP    T    T A   TT  TA/T
rs49359398
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Gm10941 : Noncoding-Transcript-Variant
Gn : within coordinates of
Pofut2 : Locus-Region
1SNP    G  G G A   GG  GA/G
rs6355917
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Gm10941 : Locus-Region
Gn : within coordinates of
Pofut2 : Intron
1SNP      G A           A/G
rs6355988
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Gm10941 : Locus-Region
Gn : within coordinates of
Pofut2 : Intron
1SNP      A G           A/G
rs51679711
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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Gm10941 : Locus-Region
Gn : within coordinates of
Pofut2 : Intron
1SNP    C  G C C   CC  CC/G
rs49741832
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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Gm10941 : Locus-Region
Gn : within coordinates of
Pofut2 : Intron
1SNP    C  G C G   CC  CC/G
rs6356937
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Gm10941 : Locus-Region
Gn : within coordinates of
Pofut2 : Intron
1SNP      T C           C/T
rs6356941
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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Gm10941 : Locus-Region
Gn : within coordinates of
Pofut2 : Intron
1SNP      G A           A/G
rs47318044
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Gm10941 : Locus-Region
Gn : within coordinates of
Pofut2 : Intron
1SNP  G G  T G TG  GG  GG/T
rs49674572
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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Gm10941 : Locus-Region
Gn : within coordinates of
Pofut2 : Intron
1SNP    A    A G   AA  AA/G
rs49878892
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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Gm10941 : Locus-Region
Gn : within coordinates of
Pofut2 : Intron
1SNP       C T C   TT   C/T
rs50739550
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Gm10941 : Locus-Region
Gn : within coordinates of
Pofut2 : Intron
1SNP    G    G T   GG  GG/T
rs45795645
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Gn : within coordinates of
Pofut2 : Coding-Synonymous
1SNP  T T  T T C   TT  TC/T
rs46618908
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Pofut2 : Intron
1SNP       C T C   TT  TC/T
rs49895773
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Pofut2 : Intron
1SNP    C    C T   CC  CC/T
rs51601099
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Gn : within coordinates of
Pofut2 : Intron
1SNP       T C C    C   C/T
rs47374042
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Pofut2 : Intron
1SNP       G A G    A   A/G
rs49090676
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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Gn : within coordinates of
Pofut2 : Intron
1SNP         A G   AA   A/G
rs46626655
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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Gn : within coordinates of
Pofut2 : Intron
1SNP    T  T T A   TT  TA/T
rs47414375
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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Gn : within coordinates of
Pofut2 : Intron
1SNP  C C  A C C   CC  CA/C
rs51369225
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Pofut2 : Intron
1SNP    G  G G A   GG  GA/G
rs45673310
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Gn : within coordinates of
Pofut2 : Intron
1SNP    G    G A   GG  GA/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs47802969
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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Gn : within coordinates of
Pofut2 : Intron
1SNP         T C   TT  TC/T
rs47249233
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Gn : within coordinates of
Pofut2 : Intron
1SNP       G G A   GG  GA/G
rs48578251
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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Dp(10Prmt2-Pdxk)2Yey : within coordinates of
Gn : within coordinates of
Pofut2 : Intron
1SNP    T    T CT  TT   C/T
rs48868788
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Gn : within coordinates of
Pofut2 : Intron
1SNP    C  A C A   CC   A/C
rs46443618
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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Gn : within coordinates of
Pofut2 : Intron
1SNP         A G   AA   A/G
rs49297220
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Gn : within coordinates of
Pofut2 : Intron
1SNP       G A G   AA  GA/G
rs51400764
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Gn : within coordinates of
Pofut2 : Intron
1SNP  G G  A G GG  GG  GA/G
rs51292717
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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Del(10Prmt2-Pdxk)4Yey : within coordinates of
Dp(10Prmt2-Pdxk)2Yey : within coordinates of
Gn : within coordinates of
Pofut2 : Coding-Synonymous
1SNP         T C   TT   C/T
rs4228282
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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Dp(10Prmt2-Pdxk)2Yey : within coordinates of
Gn : within coordinates of
Pofut2 : mRNA-UTR
1SNP  A AAAA A   GA     A/G
rs4228281
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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Del(10Prmt2-Pdxk)4Yey : within coordinates of
Dp(10Prmt2-Pdxk)2Yey : within coordinates of
Gn : within coordinates of
Pofut2 : mRNA-UTR
1SNP  G GGGG G   CG     C/G
rs4228280
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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Dp(10Prmt2-Pdxk)2Yey : within coordinates of
Gn : within coordinates of
Pofut2 : mRNA-UTR
1SNP  G GGGA G   GG     A/G
rs4228279
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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Del(10Prmt2-Pdxk)4Yey : within coordinates of
Dp(10Prmt2-Pdxk)2Yey : within coordinates of
Gn : within coordinates of
Pofut2 : mRNA-UTR
1SNP  A AAAG A   GA     A/G
rs4228278
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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Dp(10Prmt2-Pdxk)2Yey : within coordinates of
Gn : within coordinates of
Pofut2 : mRNA-UTR
1SNP  T TTTC T   TT     C/T
rs4228277
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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Del(10Prmt2-Pdxk)4Yey : within coordinates of
Dp(10Prmt2-Pdxk)2Yey : within coordinates of
Gn : within coordinates of
Pofut2 : mRNA-UTR
1SNP  G GGGG G   AG     A/G
rs4228276
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:77269638rDel(10Prmt2-Cstb)4Yah : within coordinates of
Del(10Prmt2-Pdxk)4Yey : within coordinates of
Dp(10Prmt2-Pdxk)2Yey : within coordinates of
Gn : within coordinates of
Pofut2 : Locus-Region
1SNP  G GGGG G   AG     A/G
rs4228275
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:77269639rDel(10Prmt2-Cstb)4Yah : within coordinates of
Del(10Prmt2-Pdxk)4Yey : within coordinates of
Dp(10Prmt2-Pdxk)2Yey : within coordinates of
Gn : within coordinates of
Pofut2 : Locus-Region
1SNP  G GGGG G   AG     A/G
rs4228274
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:77269660rDel(10Prmt2-Cstb)4Yah : within coordinates of
Del(10Prmt2-Pdxk)4Yey : within coordinates of
Dp(10Prmt2-Pdxk)2Yey : within coordinates of
Gn : within coordinates of
Pofut2 : Locus-Region
1SNP  A AAAA A   GA     A/G
rs4228273
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:77269715rDel(10Prmt2-Cstb)4Yah : within coordinates of
Del(10Prmt2-Pdxk)4Yey : within coordinates of
Dp(10Prmt2-Pdxk)2Yey : within coordinates of
Gn : within coordinates of
Pofut2 : Locus-Region
2SNP  A AAAG AAGA A   GGA/G
rs4228272
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:77269719rDel(10Prmt2-Cstb)4Yah : within coordinates of
Del(10Prmt2-Pdxk)4Yey : within coordinates of
Dp(10Prmt2-Pdxk)2Yey : within coordinates of
Gn : within coordinates of
Pofut2 : Locus-Region
1SNP  C CCCA C          A/C
rs46228659
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:77269867fDel(10Prmt2-Cstb)4Yah : within coordinates of
Del(10Prmt2-Pdxk)4Yey : within coordinates of
Dp(10Prmt2-Pdxk)2Yey : within coordinates of
Gn : within coordinates of
Pofut2 : Locus-Region
1SNPC CCCC C CCCC  CCCCTC/T
rs51159237
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:77269972fDel(10Prmt2-Cstb)4Yah : within coordinates of
Del(10Prmt2-Pdxk)4Yey : within coordinates of
Dp(10Prmt2-Pdxk)2Yey : within coordinates of
Gn : within coordinates of
Pofut2 : Locus-Region
1SNPC CCCC   CCTC  CCCTCC/T
rs49121042
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:77270035fDel(10Prmt2-Cstb)4Yah : within coordinates of
Del(10Prmt2-Pdxk)4Yey : within coordinates of
Dp(10Prmt2-Pdxk)2Yey : within coordinates of
Gn : within coordinates of
Pofut2 : Locus-Region
1SNP  TTTT   TTAT  TTTATA/T
rs46183864
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:77270209fDel(10Prmt2-Cstb)4Yah : within coordinates of
Del(10Prmt2-Pdxk)4Yey : within coordinates of
Dp(10Prmt2-Pdxk)2Yey : within coordinates of
Gn : within coordinates of
Pofut2 : 623 bp downstream of
1SNPG GGGG   GGAG  GGGAGA/G
rs47382958
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:77270454fDel(10Prmt2-Cstb)4Yah : within coordinates of
Del(10Prmt2-Pdxk)4Yey : within coordinates of
Dp(10Prmt2-Pdxk)2Yey : within coordinates of
Gn : within coordinates of
Pofut2 : 868 bp downstream of
1SNPG GGGG   GGGG  GGGGAA/G
rs47322297
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:77271073fDel(10Prmt2-Cstb)4Yah : within coordinates of
Del(10Prmt2-Pdxk)4Yey : within coordinates of
Dp(10Prmt2-Pdxk)2Yey : within coordinates of
Gn : within coordinates of
Pofut2 : 1487 bp downstream of
1SNPC CCCC   CCTC  CCCCCC/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs52065316
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:77271173fDel(10Prmt2-Cstb)4Yah : within coordinates of
Del(10Prmt2-Pdxk)4Yey : within coordinates of
Dp(10Prmt2-Pdxk)2Yey : within coordinates of
Gn : within coordinates of
Pofut2 : 1587 bp downstream of
1SNPC CCCC   CCCC  CCCCTC/T
rs48139147
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:77271277fDel(10Prmt2-Cstb)4Yah : within coordinates of
Del(10Prmt2-Pdxk)4Yey : within coordinates of
Dp(10Prmt2-Pdxk)2Yey : within coordinates of
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MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
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Gn : within coordinates of
Pofut2 : 1882 bp downstream of
1SNPA AAAA   AAGA  AAAG A/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
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12/16/2014
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