About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
Genome Coordinate Discrepancy
The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details).
 Symbol
Name
ID
Aspscr1
alveolar soft part sarcoma chromosome region, candidate 1 (human)
MGI:1916188

52 matching SNPs displayed


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs26966725
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:120540218fAspscr1 : Intron1SNP  CC C   C CCGC      C          C      C G   C C/G
rs26966724
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:120540486fAspscr1 : Intron1SNP  TT T   T TTCT      T          T      T C   T C/T
rs26979005
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:120541338fAspscr1 : Intron1SNPC CCCC   C CCTC      C          C      C T   C C/T
rs26979004
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:120541410fAspscr1 : Intron1SNPA AAAA   A  AG       A          A      A A   A A/G
rs26979003
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:120541603fAspscr1 : Intron1SNPT TTTT   T TTCT      T          T      T C   T C/T
rs26979002
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:120542919fAspscr1 : Intron1SNPG GGGG   G GGAG      G          G      G A   G A/G
rs26966723
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:120543742fAspscr1 : Intron1SNPC CCCC   C CCTC      C          C      C T   C C/T
rs26966722
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:120543968fAspscr1 : Intron1SNPC CCCC   C CCTC      C          C      C T   C C/T
rs26966721
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:120544492fAspscr1 : Intron1SNPC CCCC     CCTC      C          C      C T   C C/T
rs26966720
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:120544543fAspscr1 : Intron1SNPC CCCC   C CCTC      C          C      C T   C C/T
rs26966719
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:120544678fAspscr1 : Intron1SNPC CC C   T CCTC      C          C      C T   C C/T
rs26966718
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:120544947fAspscr1 : Intron1SNPA AAAA   A  ACA      A          A      A C   A A/C
rs26966717
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:120544976fAspscr1 : Intron1SNPC CCCC   C CCCC      C          C      C T   C C/T
rs26966716
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:120546681fAspscr1 : Intron1SNPT TTTT   T TT T      T          T      T C   T C/T
rs26966715
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:120547387fAspscr1 : Intron1SNP  AAAA   G AAGA      A                 A G   A A/G
rs26966714
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:120547907fAspscr1 : Intron1SNPC C  C   G  CCC      C          C      C C     C/G
rs26966713
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:120548084fAspscr1 : Intron1SNPG GGGG     GGCG      G          G      G C   G C/G
rs26966712
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:120551757fAspscr1 : Intron1SNPG GGGG   G GGAG      G          G      G A   G A/G
rs26966711
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:120552756fAspscr1 : Intron1SNPT T TT   C  T        T          T      T     T C/T
rs26966710
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:120552861fAspscr1 : Intron1SNPA AAAA   G AAAA      A          A      A A   A A/G
rs26966709
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:120553231fAspscr1 : Intron1SNPA AAAA   A AATA                        A T   A A/T
rs26966708
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:120553256fAspscr1 : Intron1SNPG GGGG   A GGGG      G          G      G G   G A/G
rs26966707
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:120553492fAspscr1 : Intron1SNPA A  A   G AAGA      A          A      A G     A/G
rs26966706
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:120554172fAspscr1 : Intron1SNPG GGGG     GGTG      G          G      G T   G G/T
rs26966705
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:120554241fAspscr1 : Intron1SNPG GGGG   G GGGG      G          G      G G   A A/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs26966704
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:120554369fAspscr1 : Intron1SNPC CCCC   T CCCC      C          C      C C   C C/T
rs26966703
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:120554435fAspscr1 : Intron1SNPT TTTT   C TTTT      T          T      T T   T C/T
rs26966702
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:120554482fAspscr1 : Intron1SNPG GGGG   G GGAG      G          G      G A   G A/G
rs26966701
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:120554808fAspscr1 : Intron1SNPT TTTT   G TTTT      T          T      T T   T G/T
rs26966700
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:120555912fAspscr1 : Intron1SNPC CCCC   C CCCC      C          C      C C   T C/T
rs26966699
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:120555964fAspscr1 : Intron1SNPT TTTT   C TTCT      T          T      T C   T C/T
rs26966698
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:120556670fAspscr1 : Intron1SNPG GGGG   G GGGG      G          G      G A   G A/G
rs26966697
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:120557354fAspscr1 : Intron1SNPA AAAA   C AA A      A          A      A C   C A/C
rs26966696
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:120557558fAspscr1 : Intron1SNPT TTTT   T TTGT      T          T      T G   T G/T
rs26966695
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:120557714fAspscr1 : Intron1SNPA AAAA     AATA      A          A      A T   A A/T
rs26966694
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:120557715fAspscr1 : Intron1SNPT TTTT   A TTTT      T          T      T T   T A/T
rs26966693
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:120558613fAspscr1 : Intron1SNPG GGGG   G GGTG      G          G      G T   G G/T
rs26966692
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:120558803fAspscr1 : Intron1SNPC CCCC   T CCTC      C          C      C T   C C/T
rs13481265
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:120559337fAspscr1 : Intron2SNPTTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC CCCCCC/T
rs26966691
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:120559360fAspscr1 : Intron1SNPG GGGG   A GGGG      G          G      G G   G A/G
rs26966690
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:120560010fAspscr1 : Intron1SNPT TTTT   C TTCT      T          T      T C   T C/T
rs26966689
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:120560528fAspscr1 : Intron2SNPTTCCCCC  C CCCC      C          C      C C   C C/T
rs6266350
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:120560622fAspscr1 : Intron1SNP      T   G                                    G/T
rs26966688
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:120560993fAspscr1 : Intron1SNPT TTTT   C TTCT      T          T      T C   C C/T
rs6270107
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:120561330fAspscr1 : Intron2SNPT T  TT   CTT        T          T        C     C/T
rs6283102
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:120561461fAspscr1 : Intron2SNPG GGGGG  AAGGAG      G          G      G A   G A/G
rs6283608
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:120561518fAspscr1 : Intron1SNP      A   G                                    A/G
rs6283714
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:120561581fAspscr1 : Intron2SNPG GGGGG  GAGGAG      G          G      G A   G A/G
rs26966687
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:120562171fAspscr1 : Intron1SNPA AAAA   A AAGA      A          A      A G   A A/G
rs26966686
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:120562194fAspscr1 : Intron1SNPC CCCC   C CCTC      C          C      C T   C C/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs26966685
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:120562319fAspscr1 : Intron1SNPT TTTT   C TTCT      T          T      T C   T C/T
rs29421716
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:120562737fAspscr1 : Intron1SNPAAG   G    G                                   A/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
05/08/2013
MGI 5.13
The Jackson Laboratory