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Genome
Coordinate Discrepancy The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details). |
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Symbol Name ID |
Rpl38 ribosomal protein L38 MGI:1914921 |
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) |  | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | Allele Summary (all strains) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs29473199 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:114518561 | f | Rpl38 : Locus-Region | 1 | SNP | C | C | T | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29395744 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:114519045 | f | Rpl38 : Locus-Region | 1 | SNP | C | A | A | A/C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29449924 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:114524229 | f | Rpl38 : Intron | 1 | SNP | T | T | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29455536 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:114524460 | f | Rpl38 : Intron | 1 | SNP | C | A | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29411718 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:114524615 | f | Rpl38 : Intron | 1 | SNP | A | C | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29450505 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:114524658 | f | Rpl38 : Intron | 1 | SNP | C | C | G | C/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29474863 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:114525117 | f | Rpl38 : Intron | 1 | SNP | C | T | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29386200 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:114525176 | f | Rpl38 : Intron | 1 | SNP | C | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29433207 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:114525176 | f | Rpl38 : Intron | 1 | SNP | C | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29442642 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:114525201 | f | Rpl38 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29396336 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:114525706 | f | Rpl38 : Intron | 1 | SNP | G | A | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29429993 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:114525787 | f | Rpl38 : Intron | 1 | SNP | A | C | A | A/C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29481308 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:114525836 | f | Rpl38 : Intron | 1 | SNP | T | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29460097 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:114525869 | f | Rpl38 : Intron | 1 | SNP | T | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29409325 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:114525921 | f | Rpl38 : Intron | 1 | SNP | G | A | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27029740 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:114528750 | f | Rpl38 : Intron Rpl38 : Locus-Region | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | T | G | G | G | G | T | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27029739 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:114528763 | f | Rpl38 : Intron Rpl38 : Locus-Region | 1 | SNP | G | C | G | C | C | C | G | C | C | C | G | C | C/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27029738 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:114528789 | f | Rpl38 : Locus-Region Rpl38 : Intron | 1 | SNP | C | A | C | A | A | C | C | C | C | C | C | C | A | A/C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29427177 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:114529394 | f | Rpl38 : Intron Rpl38 : Locus-Region | 1 | SNP | C | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29405638 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:114529533 | f | Rpl38 : Intron Rpl38 : Locus-Region | 1 | SNP | G | A | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29422251 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:114529623 | f | Rpl38 : Intron Rpl38 : Locus-Region | 1 | SNP | A | A | C | A/C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27029737 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:114529824 | f | Rpl38 : Locus-Region Rpl38 : Intron | 1 | SNP | C | C | T | C | C | C | T | C | T | T | T | T | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27029736 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:114530283 | f | Rpl38 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | A | G | A | A | A | A | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27029735 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:114530400 | f | Rpl38 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | T | C | T | T | T | T | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27029734 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:114530588 | f | Rpl38 : Intron | 1 | SNP | A | A | G | A | G | A | G | G | G | G | A | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) | | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | Allele Summary (all strains) |
| rs27029733 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:114530641 | f | Rpl38 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | T | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27029732 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:114530755 | f | Rpl38 : Intron | 1 | SNP | G | G | A | A | A | A | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29428641 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:114531446 | f | Rpl38 : Intron | 1 | SNP | C | T | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27029731 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:114531476 | f | Rpl38 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | C | G | C/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27029730 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:114531768 | f | Rpl38 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | G | G | G | G | G | G | G | C | C/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27029729 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:114532266 | f | Rpl38 : Intron | 1 | SNP | G | G | A | A | A | A | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27029728 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:114532577 | f | Rpl38 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | G | T | T | T | T | G | T | G/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13481243 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:114532623 | f | Rpl38 : Intron | 3 | SNP | G | G | A | A | G | A | G | G | G | A | G | A | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | A | G | G | G | G | G | A | A | G | G | G | G | G | G | G | G | A | A | A | G | A/G |
| rs27029727 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:114532907 | f | Rpl38 : Intron | 1 | SNP | T | C | C | C | C | C | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29482544 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:114532908 | f | Rpl38 : Intron | 1 | SNP | G | A | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27029726 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:114532979 | f | Rpl38 : Intron | 2 | SNP | A | G | G | G | A | G | G | A | G | A | A | A | A | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27029725 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:114533015 | f | Rpl38 : Intron | 2 | SNP | A | G | G | G | A | G | G | A | G | A | A | A | A | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29422091 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:114533139 | f | Rpl38 : Coding-Synonymous | 1 | SNP | G | A | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29410228 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:114533401 | f | Rpl38 : Intron | 1 | SNP | C | G | C | C/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29464207 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:114533431 | f | Rpl38 : Intron | 1 | SNP | A | T | A | A/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29413604 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:114533891 | f | Rpl38 : Locus-Region | 1 | SNP | A | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27029724 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:114533907 | f | Rpl38 : Locus-Region | 2 | SNP | A | G | G | A | G | G | A | G | A | A | A | A | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27029723 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr11:114534096 | f | Rpl38 : Locus-Region | 1 | SNP | T | T | T | T | T | C | C | C | C | C | C | C | T | C/T |
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc |
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last database update 05/08/2013 MGI 5.13 |
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