About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Cdt1
chromatin licensing and DNA replication factor 1
MGI:1914427

100 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs254980517
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122566117fCdt1 : Locus-Region
Gm20388 : within coordinates of
1SNP             C  T    C/T
rs220811076
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122566230fCdt1 : Locus-Region
Gm20388 : within coordinates of
1SNP             G  A    A/G
rs241087352
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122566299fCdt1 : Locus-Region
Gm20388 : within coordinates of
1SNP             T  A    A/T
rs32557013
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122566302fCdt1 : Locus-Region
Gm20388 : within coordinates of
3SNPAGG   A  A   G  A    A/G
rs50382584
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122566560fCdt1 : Locus-Region
Gm20388 : within coordinates of
2SNP AA      A   A  GG   A/G
rs50271219
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122566869fCdt1 : Locus-Region
Gm20388 : within coordinates of
2SNP  A      A   A  GG   A/G
rs33321604
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122566892fCdt1 : Locus-Region
Gm20388 : within coordinates of
3SNP  C   A  A   C  A    A/C
rs32738443
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122566923fCdt1 : Locus-Region
Gm20388 : within coordinates of
3SNP  C   T  T   C  CC   C/T
rs33070199
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122566949fCdt1 : Locus-Region
Gm20388 : within coordinates of
3SNP  A   C  C   A  CC   A/C
rs49923822
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122566956fCdt1 : Locus-Region
Gm20388 : within coordinates of
1SNP  C      C       G   C/G
rs257326959
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122567076fCdt1 : Locus-Region
Gm20388 : within coordinates of
1SNP             T  C    C/T
rs227688654
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122567509fCdt1 : Locus-Region
Gm20388 : within coordinates of
1SNP             G  A    A/G
rs244014609
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122567629fCdt1 : Locus-Region
Gm20388 : within coordinates of
1SNP             T  C    C/T
rs215449816
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122567690fCdt1 : Locus-Region
Gm20388 : within coordinates of
1SNP             C  T    C/T
rs227989796
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122567947fCdt1 : Locus-Region
Gm20388 : within coordinates of
1SNP             G  A    A/G
rs32668195
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122567966fCdt1 : Locus-Region
Gm20388 : within coordinates of
3SNP TT   C  C   T  C    C/T
rs32984709
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122567970fCdt1 : Locus-Region
Gm20388 : within coordinates of
3SNP GG   A  A   G  G    A/G
rs33010037
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122568691fCdt1 : Intron
Gm20388 : within coordinates of
3SNPG A   G  G   A  G    A/G
rs254888476
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122568861fCdt1 : Intron
Gm20388 : within coordinates of
1SNP             T  C    C/T
rs214867272
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122568891fCdt1 : Intron
Gm20388 : within coordinates of
1SNP             C  G    C/G
rs32668198
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122568907fCdt1 : Intron
Gm20388 : within coordinates of
3SNPTCC   T  T   C  T    C/T
rs256881119
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122568920fCdt1 : Intron
Gm20388 : within coordinates of
1SNP             T  C    C/T
rs222913835
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122569223fCdt1 : Coding-NonSynonymous
Gm20388 : within coordinates of
1SNP             A  G    A/G
rs240989096
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122569238fCdt1 : Coding-NonSynonymous
Gm20388 : within coordinates of
1SNP             C  G    C/G
rs261485895
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122569288fCdt1 : Intron
Gm20388 : within coordinates of
1SNP             C  T    C/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs225690260
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122569567fCdt1 : Intron
Gm20388 : within coordinates of
1SNP             T  C    C/T
rs241540603
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122569578fCdt1 : Intron
Gm20388 : within coordinates of
1SNP             C  T    C/T
rs257282976
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122569580fCdt1 : Intron
Gm20388 : within coordinates of
1SNP             T  C    C/T
rs227656546
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122569784fCdt1 : Intron
Gm20388 : within coordinates of
1SNP             A  G    A/G
rs237687808
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122569813fCdt1 : Intron
Gm20388 : within coordinates of
1SNP             G  C    C/G
rs262849803
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122569951fCdt1 : Coding-NonSynonymous
Gm20388 : within coordinates of
1SNP             C  A    A/C
rs228534146
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122569994fCdt1 : Coding-Synonymous
Gm20388 : within coordinates of
1SNP             A  G    A/G
rs250152304
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122569996fCdt1 : Coding-NonSynonymous
Gm20388 : within coordinates of
1SNP             T  C    C/T
rs218463372
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122570110fCdt1 : Intron
Gm20388 : within coordinates of
1SNP             T  C    C/T
rs229523780
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122570155fCdt1 : Intron
Gm20388 : within coordinates of
1SNP             G  A    A/G
rs33460056
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122570241fCdt1 : Coding-NonSynonymous
Gm20388 : within coordinates of
2SNPTCC   C  C           C/T
rs33190640
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122570278fCdt1 : Coding-Synonymous
Gm20388 : within coordinates of
2SNPTCC   C  C           C/T
rs33236114
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122570302fCdt1 : Coding-Synonymous
Gm20388 : within coordinates of
2SNPCTT   T  T           C/T
rs246884007
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122570503fCdt1 : Coding-NonSynonymous
Gm20388 : within coordinates of
1SNP             C  A    A/C
rs33010384
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122570703fCdt1 : Intron
Gm20388 : within coordinates of
3SNPAGG   G  G   G  A    A/G
rs234433989
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122570729fCdt1 : Intron
Gm20388 : within coordinates of
1SNP             G  A    A/G
rs254876455
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122570756fCdt1 : Intron
Gm20388 : within coordinates of
1SNP             G  T    G/T
rs214500464
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122570795fCdt1 : Intron
Gm20388 : within coordinates of
1SNP             G  A    A/G
rs235993325
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122570820fCdt1 : Intron
Gm20388 : within coordinates of
1SNP             A  G    A/G
rs32985486
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122570944fCdt1 : Intron
Gm20388 : within coordinates of
2SNPTCC   C  C           C/T
rs256097356
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122570999fCdt1 : Intron
Gm20388 : within coordinates of
1SNP             A  G    A/G
rs221887268
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122571026fCdt1 : Intron
Gm20388 : within coordinates of
1SNP             G  A    A/G
rs33526931
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122571096fCdt1 : Intron
Gm20388 : within coordinates of
2SNPAGG   G  G           A/G
rs235132374
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122571121fCdt1 : Intron
Gm20388 : within coordinates of
1SNP             C  T    C/T
rs251185352
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122571163fCdt1 : Intron
Gm20388 : within coordinates of
1SNP             G  A    A/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs221433814
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122571282fCdt1 : Coding-Synonymous
Gm20388 : within coordinates of
1SNP             C  T    C/T
rs33592005
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122571333fCdt1 : Coding-Synonymous
Gm20388 : within coordinates of
2SNPTCC   C  C           C/T
rs237651432
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122571620fCdt1 : Intron
Gm20388 : within coordinates of
1SNP             T  C    C/T
rs33401181
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122571621fCdt1 : Intron
Gm20388 : within coordinates of
3SNPGGG   A  A   G  G    A/G
rs220585029
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122571666fCdt1 : Intron
Gm20388 : within coordinates of
1SNP             T  C    C/T
rs245235871
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122571782fCdt1 : Coding-Synonymous
Gm20388 : within coordinates of
1SNP             G  A    A/G
rs264148307
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122571842fCdt1 : Coding-Synonymous
Gm20388 : within coordinates of
1SNP             A  G    A/G
rs229488703
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122571873fCdt1 : Intron
Gm20388 : within coordinates of
1SNP             T  G    G/T
rs246803800
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122572049fCdt1 : Coding-NonSynonymous
Gm20388 : within coordinates of
1SNP             A  G    A/G
rs260270115
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122572074fCdt1 : Coding-Synonymous
Gm20388 : within coordinates of
1SNP             G  T    G/T
rs226195345
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122572154fCdt1 : Intron
Gm20388 : within coordinates of
1SNP             A  G    A/G
rs250366226
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122572158fCdt1 : Intron
Gm20388 : within coordinates of
1SNP             A  G    A/G
rs31783792
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122572286fCdt1 : Intron
Gm20388 : within coordinates of
2SNPA AAAA A AAGAAAAG AGAA/G
rs234387635
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122572305fCdt1 : Intron
Gm20388 : within coordinates of
1SNP             T  C    C/T
rs31784575
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122572351fCdt1 : Intron
Gm20388 : within coordinates of
1SNPG GGGG A GGGG GG  GGGA/G
rs31784578
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122572444fCdt1 : Intron
Gm20388 : within coordinates of
2SNPG GGGG C GGCGGGGC GCGC/G
rs31784581
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122572472fCdt1 : Intron
Gm20388 : within coordinates of
2SNPC CCCC A CCACCCCA CACA/C
rs235039712
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122572537fCdt1 : Coding-Synonymous
Gm20388 : within coordinates of
1SNP             G  A    A/G
rs31785354
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122572552fCdt1 : Coding-Synonymous
Gm20388 : within coordinates of
1SNPG GGGG A GGGG GG  GGGA/G
rs31785357
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122572596fCdt1 : Coding-NonSynonymous
Gm20388 : within coordinates of
1SNPT TTTT C TT T TT  TCTC/T
rs251158422
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122572618fCdt1 : Coding-Synonymous
Gm20388 : within coordinates of
1SNP             G  A    A/G
rs31785359
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122572701fCdt1 : mRNA-UTR
Gm20388 : within coordinates of
2SNPC CCCC C CCGCCCCG CGCC/G
rs31785361
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122572790fCdt1 : mRNA-UTR
Gm20388 : within coordinates of
2SNPC CCCC T CCTCCCCT CTCC/T
rs31785363
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122572876fCdt1 : mRNA-UTR
Gm20388 : within coordinates of
2SNPA AAAA C AACAAAAC ACAA/C
rs31786496
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122572907fCdt1 : mRNA-UTR
Gm20388 : within coordinates of
2SNPG GGGG G GGAGGGGA G GA/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs31786499
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122572932fCdt1 : mRNA-UTR
Gm20388 : within coordinates of
2SNPT TTTT C TTCTTTTC T TC/T
rs31786502
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122573146fCdt1 : Intron
Gm20388 : within coordinates of
2SNPG GGGG A GGAGGGGA GAGA/G
rs223653387
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122573250fCdt1 : Intron
Gm20388 : within coordinates of
1SNP             G  C    C/G
rs240786007
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122573732fCdt1 : 604 bp downstream of
Gm20388 : within coordinates of
1SNP             C  T    C/T
rs32560758
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122573864fCdt1 : 736 bp downstream of
Gm20388 : within coordinates of
2SNPTCC      C           C/T
rs33034502
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122573893fCdt1 : 765 bp downstream of
Gm20388 : within coordinates of
2SNPTCC   C  C           C/T
rs260232858
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122573909fCdt1 : 781 bp downstream of
Gm20388 : within coordinates of
1SNP             C  A    A/C
rs226103651
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122574214fAprt : Locus-Region
Cdt1 : 1086 bp downstream of
Gm20388 : within coordinates of
1SNP             G  C    C/G
rs31787345
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122574409fAprt : Locus-Region
Cdt1 : 1281 bp downstream of
Gm20388 : within coordinates of
1SNPA CCCC C CCCC AC  CCCA/C
rs31787348
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122574416fAprt : Locus-Region
Cdt1 : 1288 bp downstream of
Gm20388 : within coordinates of
2SNPA AAAA   AAGAAAAG AGAA/G
rs31787351
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122574422fAprt : Locus-Region
Cdt1 : 1294 bp downstream of
Gm20388 : within coordinates of
1SNPA AAAA G AAAA AA  A AA/G
rs31779664
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122574456fAprt : Locus-Region
Cdt1 : 1328 bp downstream of
Gm20388 : within coordinates of
2SNPC CCCC C CCGCCCCG CGCC/G
rs31779667
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122574504fAprt : Locus-Region
Cdt1 : 1376 bp downstream of
Gm20388 : within coordinates of
2SNPC CCCC T CCTCCCCT CTCC/T
rs31779670
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122574512fAprt : Locus-Region
Cdt1 : 1384 bp downstream of
Gm20388 : within coordinates of
1SNPG GGGG   GGGG GG  G CC/G
rs31779673
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122574639fAprt : mRNA-UTR
Cdt1 : 1511 bp downstream of
Gm20388 : within coordinates of
2SNPA AAAA   AACAAAAC ACAA/C
rs31780616
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122574684fAprt : mRNA-UTR
Cdt1 : 1556 bp downstream of
Gm20388 : within coordinates of
1SNPC CCCC T CCCC CC  CCCC/T
rs31780619
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122574714fAprt : mRNA-UTR
Cdt1 : 1586 bp downstream of
Gm20388 : within coordinates of
1SNPC CCCC T CCCC CC  C CC/T
rs31780622
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122574725fAprt : mRNA-UTR
Cdt1 : 1597 bp downstream of
Gm20388 : within coordinates of
2SNPG GGGG C GGCGGGGC GCGC/G
rs13469228
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122574757rAprt : mRNA-UTR
Cdt1 : 1629 bp downstream of
Gm20388 : within coordinates of
2SNPG TTTT G TTGTTGTG TGGG/T
rs31781547
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122574790fAprt : mRNA-UTR
Cdt1 : 1662 bp downstream of
Gm20388 : within coordinates of
1SNPC CCCC T CCCC CC  CCCC/T
rs31781550
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122574805fAprt : mRNA-UTR
Cdt1 : 1677 bp downstream of
Gm20388 : within coordinates of
2SNPG GGGG G GGAGGGGA GAGA/G
rs6231433
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122574912fAprt : Coding-Synonymous
Cdt1 : 1784 bp downstream of
Gm20388 : within coordinates of
3SNPT TTTTTCCTTCTTTTC T TC/T
rs31782535
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122575005fAprt : Coding-NonSynonymous
Aprt : Coding-Synonymous
Cdt1 : 1877 bp downstream of
Gm20388 : within coordinates of
1SNPG GGGG G GGGG GG  GGCC/G
rs48589986
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122575035fAprt : Intron
Cdt1 : 1907 bp downstream of
Gm20388 : within coordinates of
1SNP  G                  G
rs6232463
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr8:122575095fAprt : Intron
Cdt1 : 1967 bp downstream of
Gm20388 : within coordinates of
2SNP      T C    T  C    C/T

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
08/12/2014
MGI 5.19
The Jackson Laboratory