About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Cntnap2
contactin associated protein-like 2
MGI:1914047

1000 of 13629 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.
Include SNPs that map to multiple locations

Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs30073014
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45058118fCntnap2 : Locus-Region
Hdp1 : within coordinates of
3SNP T    C    T       T              C   C          C/T
rs30016556
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45058232fCntnap2 : Locus-Region
Hdp1 : within coordinates of
2SNP T    C    T       T              C              C/T
rs29876414
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45058442fCntnap2 : Locus-Region
Hdp1 : within coordinates of
3SNP GA   A    G       G              A   A          A/G
rs6283588
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45058741fCntnap2 : Locus-Region
Hdp1 : within coordinates of
1SNP      T   G                                      G/T
rs6284096
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45058822fCntnap2 : Locus-Region
Hdp1 : within coordinates of
1SNP      T   C                                      C/T
rs29922055
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45061683fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
4SNPTTGGGTG  G TGGG    T  T          TG     T G    G G/T
rs29982278
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45062558fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
4SNPGGAAAGA  A GAAA    G  G          GA     G A    A A/G
rs6302553
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45066449fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
5SNPGGAAAGA  GGGAGA    G  G          GA     G A    A A/G
rs6303001
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45066493fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNP      G   A                                      A/G
rs6303653
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45066633fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
5SNPTTGGGGG  TTTGTG    T  T           G     T G    G G/T
rs29974138
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45067472fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNP GC   C    G       G              C              C/G
rs29868537
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45067795fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNP AG   G            A              G              A/G
rs29871056
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45068256fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNP GA   A    G       G              A              A/G
rs29834043
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45068321fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNP CA   A    C       C              A              A/C
rs30117096
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45069416fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNP TG   G    T       T              G              G/T
rs6356926
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45069475fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNP      T   C                                      C/T
rs6369931
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45069557fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNP GA   A   GG       G              A              A/G
rs6371069
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45069810fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNP  A   A   GG       G              A              A/G
rs6371457
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45069826fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNP  T   T   CC       C              T              C/T
rs29971100
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45071160fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNP GA   A    G       G              A              A/G
rs29918681
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45071243fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNP  C   C    G       G              C              C/G
rs29874474
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45071525fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNP AC        A       A              C              A/C
rs30018176
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45071581fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNP AG        A       A              G              A/G
rs30123530
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45073694fB230112I24Rik : within coordinates of
Cntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNP  G   G    T       T              G              G/T
rs30068860
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45075923fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNPAAG   G    A       A              G              A/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29886478
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45076269fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNP AG   G    A       A              G              A/G
rs30126082
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45076392fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNP GA   A    G       G              A              A/G
rs30058766
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45076542fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNP AG   G                                          A/G
rs29874258
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45076643fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNP TA   A    T       T              A              A/T
rs30125824
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45077504fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNP  C   C    T       T              C              C/T
rs30123125
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45077708fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNP TA   A            T              A              A/T
rs30113152
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45077829fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNP TC   C            T              C              C/T
rs29933056
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45078213fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
4SNPTTCCCTC  C TCCC    T  T          TC     T C    C C/T
rs30023374
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45078608fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNPTTCCCTC  C TCCC    T  T          TC     T C    C C/T
rs30057990
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45079331fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
4SNPAAGGGAG  G AGGG    A  A          AG     A G    G A/G
rs30075359
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45079446fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
4SNPCCTTTCT  C CTCT    C  C          CT     C T    T C/T
rs30130812
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45079692fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNPAAC   C    A       A              C              A/C
rs30064775
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45084175fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
4SNPAAGGGAG  A AGAG    A  A          AG     A G    G A/G
rs30019525
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45084484fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
4SNPAAGGGAG  A AGAG    A  A          AG     A G    G A/G
rs30069315
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45087559fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
4SNPGGAAAG   A GAAA    G  G          GA   A G A    A A/G
rs30159289
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45090136fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNPGGCCCGC  C GCCC       G          G      G C    C C/G
rs30070708
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45092806fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
4SNPC TTTCT  T CT T    C             CT     C T    T C/T
rs29923212
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45093026fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNPT A   A    T       T              A              A/T
rs6319193
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45093870fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNPG AAA A  AGGAAA    G  G          GA     G A    A A/G
rs30064866
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45094420fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
4SNPG TTTGT    GTGT    G  G          GT     G G    T G/T
rs30017208
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45095424fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNPA     T    A       A              T              A/T
rs29931460
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45104102fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNP TC                T              C              C/T
rs29827778
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45104717fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNP  C   T    C                                     C/T
rs29923446
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45112350fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
4SNPAAGGG A    AGAG    A  A          AG     A A    G A/G
rs30075264
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45113914fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNPC T   C    C       C              T              C/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs30117530
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45120820fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNPAAG   A    A       A              G              A/G
rs29872341
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45121195fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNPTTA   T    T       T              A              A/T
rs30113221
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45129425fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNP GA        G       G              A              A/G
rs30063906
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45139914fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNP  G        A                                     A/G
rs6362677
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45141897fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNPT TTTTT  TCTTCT       T          T      T C    T C/T
rs30068898
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45142405fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNP  G   T    T       T              G              G/T
rs6383208
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45143373fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNP      C   T                                      C/T
rs6383309
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45143424fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNP      C   G                                      C/G
rs6383358
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45143440fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNPA AAAAA  ACAAC        A          A      A C    A A/C
rs6383800
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45143469fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNP      G   T                                      G/T
rs6385034
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45143683fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNPT TTTTT  TATTA        T          T      T A    T A/T
rs6385154
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45143746fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNPC CCCCC  CTCC C       C          C      C T    C C/T
rs6398030
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45143778fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNPT TTTTT  TCTT         T          T      T C    T C/T
rs6398117
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45143828fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNPT TTTTT   AT          T          T      T A    T A/T
rs6398615
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45143859fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNPC CCCCC   TCCTC       C          C      C T    C C/T
rs6365564
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45147765fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNP      T   C                                      C/T
rs6365595
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45147777fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNP      G   A                                      A/G
rs6365699
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45147837fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNP      G   T                                      G/T
rs29869670
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45155142fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNP TC   T    T       T              C              C/T
rs30067764
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45158681fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNPTTG   T    T       T              G              G/T
rs6247790
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45162214fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNP      T   C                                      C/T
rs6248292
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45162307fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNP      C   T                                      C/T
rs6248329
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45162328fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNP      A   T                                      A/T
rs6248788
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45162379fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNP      C   T                                      C/T
rs6248791
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45162385fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNP      T   C                                      C/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs6249449
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45162541fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNP      C   A                                      A/C
rs6249504
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45162573fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNP      C   G                                      C/G
rs6249879
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45162579fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNP      T   C                                      C/T
rs29831658
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45167403fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNP CT   C    C       C              T              C/T
rs29918606
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45167543fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
4SNPA GGG A  A AGAG    A  A          AG     A G    A A/G
rs29967094
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45175279fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
4SNPAAGGGAA  A AGAG    A  A          AG     A A    A A/G
rs29968226
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45175522fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNP GT   G    G       G              T              G/T
rs29932717
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45178736fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNP  C   T    T       T              C              C/T
rs29919749
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45184457fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNP GA        G       G              A              A/G
rs30030476
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45185575fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNPCCT   C            C              T              C/T
rs30081154
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45186725fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
4SNPTTCCC T    TCCC    T  T          TC     T C    T C/T
rs30010922
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45188193fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNP  T   C    C       C              T              C/T
rs30016266
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45191072fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNPCCGGGCC  G CGGG    C  C          CG     C G    C C/G
rs29924779
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45193770fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNP GA   G                                          A/G
rs29931871
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45195715fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNP AC   A            A              C              A/C
rs30067562
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45198371fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNP GT   G    G       G              T              G/T
rs29924036
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45201754fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNP CA   C                                          A/C
rs30065738
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45205745fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
4SNPC GGGCC    CGGG    C  C          CG     C G    C C/G
rs30020610
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45207016fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
4SNPAACCCAA  C ACCC    A  A          AC     A C    A A/C
rs29869593
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45217997fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNP CC   G    C                                     C/G
rs6396041
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45222850fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNP      G   C                                      C/G
rs6396112
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45222898fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNP      A   G                                      A/G
rs6396506
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45222912fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNP      G   A                                      A/G
rs6396543
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45222926fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNP      A   G                                      A/G
rs6398127
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45223209fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
4SNP GC   G   C        G              C              C/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs30023063
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45224744fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
4SNPG AAAGG  G GAGA    G  G          GA     G G    A A/G
rs29968451
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45224839fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
4SNPT CCCTT  C TCCC    T  T           C     T C    C C/T
rs29871621
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45224929fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
4SNPGGAA GG    G AA    G  G          GA     G        A/G
rs29921137
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45228475fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNP TC   T    T       T              C              C/T
rs30017646
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45229088fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
4SNPTTCCCTT  C TCCC    T  T          TC     T C    C C/T
rs29870104
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45230037f9630039A02Rik : within coordinates of
Cntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
4SNPGGAAAGG  A GAAA    G  G          GA     G G    A A/G
rs30067719
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45232133f9630039A02Rik : within coordinates of
Cntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
4SNPGGTTTGG  T GTTT    G  G          GT     G      T G/T
rs29923375
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45232855f9630039A02Rik : within coordinates of
Cntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
4SNPCCGGGCC    CG G    C  C          CG     C      G C/G
rs30120776
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45232956f9630039A02Rik : within coordinates of
Cntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
4SNPCCAAACC  A CAAA    C  C          CA     C      A A/C
rs29976853
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45233810fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNP  C   T    T                                     C/T
rs30031777
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45233891fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNP  C   T    T       T              C              C/T
rs30125505
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45234328fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNP TA   T    T       T              A              A/T
rs29870756
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45237058fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNPAAGGGAA    AGGG    A  A          AG     A G    G A/G
rs29969183
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45238662fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
4SNPAACCCAA  A ACAC    A  A          AC   A A A    C A/C
rs30115096
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45241503fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNP CG   C    C       C              G              C/G
rs6327227
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45246153fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNPT TTTTT  TCTT T       T          T      T C    T C/T
rs6328162
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45246281fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNPC CCCCC  CTCCTC       C          C      C T    C C/T
rs6328194
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45246303fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNPA AAAAA  AGAAAA       A          A      A G    A A/G
rs6238771
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45246665fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
4SNP AC   A   CA       A              C              A/C
rs30116140
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45252327fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNP CT   C    C       C              T              C/T
rs29869092
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45259671fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
4SNPGGAAAGG  G GAGA    G  G          GA     G G    A A/G
rs29884895
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45259968fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNPA C   A            A              C              A/C
rs30071679
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45265960fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
4SNPCCTTTCC    CTCT    C  C          CT     C      T C/T
rs29872954
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45268421fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
4SNPGGCCCGG    GC C    G  G          GC   C G      C C/G
rs6167942
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45269728fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNP      A   G                                      A/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs6168379
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45269750fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNP      G   C                                      C/G
rs6168463
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45269794fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNP      T   C                                      C/T
rs6169064
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45269910fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNP      C   T                                      C/T
rs6169651
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45270024fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNP      G   A                                      A/G
rs6170144
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45270080fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNP      T   C                                      C/T
rs6170145
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45270081fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNP      G   C                                      C/G
rs6170171
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45270097fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNP      T   G                                      G/T
rs6171251
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45270261fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNP      A   G                                      A/G
rs29831262
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45270827fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNPT GGGTT  T TGTG    T  T          TG     T T    G G/T
rs29927334
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45271970fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNP GA   G    G       G              A              A/G
rs30126327
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45273693fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNP GA        G       G              A              A/G
rs29974875
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45275775fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNP AG   A            A              G              A/G
rs30013618
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45277060fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNP  T   A    A       A              T              A/T
rs30065754
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45277203fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNPGGAAAGG  G GAGA    G  G          GA     G G    G A/G
rs30077893
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45281191fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNPAATTTAA  T ATTT    A  A          AT     A      T A/T
rs30066787
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45281267fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNPCCAAACC  A CAAA    C  C          CA     C A    A A/C
rs30074411
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45285312fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNP GA   G    G       G              A              A/G
rs29875540
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45285564fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
4SNPT CCCTT  C TCCC    T  T          TC     T C    C C/T
rs30011293
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45286119fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
4SNPAAGGGAA  A AGAG    A  A          AG     A A    G A/G
rs30066558
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45288564fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNP GC   G    G                                     C/G
rs29968335
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45288569fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNP TA   T    T                                     A/T
rs30016910
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45293002fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
4SNPTTCCCTT  C TCCC    T  T          TC     T C    C C/T
rs29935446
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45294630fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNP AG   A    A       A              G              A/G
rs29918757
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45295196fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
4SNPA GGGAA  G AGGG    A  A          AG     A      G A/G
rs30021118
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45295906fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNP  G   T                                          G/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs30021434
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45297398fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
4SNPAAGGGAA  G AGGG    A  A          AG     A G    G A/G
rs30024447
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45298413fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNP TC   T    T       T              C              C/T
rs29924328
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45299874fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNP  G   A    A       A              G              A/G
rs30024020
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45300011fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNP  A   T    T       T              A              A/T
rs29873495
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45300489fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNPA G   A            A              G              A/G
rs29923966
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45302003fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
4SNPAAGGGAA  A AGAG    A  A          AG     A A    G A/G
rs29872332
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45302165fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNPC TTTCC  T CTTT    C  C          CT     C T    T C/T
rs29873506
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45302987fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNPA CCCAA  C ACCC    A  A          AC     A C    C A/C
rs30119317
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45304394fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
4SNPA GGGAA  G AGGG    A  A          AG     A G    G A/G
rs30021064
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45306742f6330419E04Rik : within coordinates of
Cntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
4SNPTTCCCTT    TC C    T  T          TC     T      C C/T
rs29871764
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45314798fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNPA TTTAA    AT T    A  A          AT     A      T A/T
rs29868942
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45319845fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNP  A   G    G       G              A              A/G
rs29970397
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45320426fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNPTTC   T    T       T              C              C/T
rs30077319
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45323084fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNP AG   A            A              G              A/G
rs29828814
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45324229fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNP CT   C            C              T              C/T
rs30020562
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45324319fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNP TA   T            T              A              A/T
rs30067806
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45328467fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNP  C   G    G       G              C              C/G
rs30116692
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45331213fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNP GA   G    G       G              A              A/G
rs30119707
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45334076fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNPCCT   C    C       C              T              C/T
rs30123895
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45338014fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNPG T        G       G              T              G/T
rs29869039
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45339025fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNPGGA   G            G              A              A/G
rs30107010
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45344239fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNPT C   T    T       T              C              C/T
rs29881942
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45344623fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
4SNPAAGGGAA  G AGGG    A  A          AG     A G    G A/G
rs30012134
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45345636fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
4SNPT GG TT  G TGGG    T  T          TG     T G    G G/T
rs30114396
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45346125fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
4SNPG TTTGG  G GTGT    G  G          GT     G G    T G/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29834707
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45347449fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNP  C   T    T       T              C              C/T
rs29926049
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45347542fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNP  A   C    C       C              A              A/C
rs30071057
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45347731fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNPT C   T    T       T              C              C/T
rs30123742
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45358073fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
4SNPAAG AAA    A       A  A          AG     A        A/G
rs6299931
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45401150fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNPA AAAAA  ATAAAA       A          A      A T    A A/T
rs6299965
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45401174fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNP      G   T                                      G/T
rs6299994
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45401199fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNP      A   G                                      A/G
rs6299995
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45401200fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNP      T   A                                      A/T
rs6300497
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45401259fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNP      C   T                                      C/T
rs6300531
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45401276fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNP      G   A                                      A/G
rs6300574
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45401309fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNP  A   A   CA                          C          A/C
rs6300992
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45401316fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNP      A   T                                      A/T
rs6301588
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45401421fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNP CC   C   AC                          A          A/C
rs6302148
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45401542fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNP CC   C   GC                          G          C/G
rs29967292
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45406114fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNPCCT   C    C                                     C/T
rs29968228
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45408572fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNP  A   G    G                                     A/G
rs6348907
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45409873fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNPA A  AA  GGA G        A          A      A G    A A/G
rs6348930
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45409887fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNP      A   G                                      A/G
rs6348943
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45409889fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNP      A   C                                      A/C
rs6349355
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45409903fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNP      T   C                                      C/T
rs6349946
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45410056fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNP      C   T                                      C/T
rs6349975
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45410075fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNP      G   A                                      A/G
rs6350351
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45410100fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNP      C   T                                      C/T
rs6350376
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45410116fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNP      C   A                                      A/C
rs6350962
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45410250fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNPA A  AA  CCA C        A          A      A C    A A/C
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs30067770
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45415027fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNP CA   C    C                                     A/C
rs29974936
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45417023fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNPAAC   A    A                                     A/C
rs30115592
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45430211fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
4SNPTTCCCTT  C TCCC    T  T          TC   T T T      C/T
rs13478732
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45433401fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
5SNPTTCCCTTTCC TCCCTTTCT CTCTTTTCTTC TCTC  CT CCT CCCC/T
rs29925196
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45437849fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNP AG   A    A                                     A/G
rs30024650
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45437890fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNPTTATTTT  A T AT       T          T      T A      A/T
rs30011831
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45439699fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNP TC   T    T                                     C/T
rs29981681
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45439765fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNP AG   A    A                                     A/G
rs30132674
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45439778fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNP GA   G    G                                     A/G
rs29832325
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45439980fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNP GT   G    G                                     G/T
rs30023727
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45440029fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNP GT   G    G                                     G/T
rs29876118
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45440131fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNP  T   C                                          C/T
rs29869509
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45442785fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNPTTCTTTT  T TTTT       T          T      T T    C C/T
rs29977894
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45442969fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNPAAGAAAA  G AAGA       A          A      A G    G A/G
rs29872105
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45445918fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNPAACAAAA  A AAAA       A          A      A A    C A/C
rs30063957
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45451167fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNPCCT   C    C                                     C/T
rs30026896
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45451734fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNP AG        A                                     A/G
rs29876941
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45461092fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNPCCT                                              C/T
rs29972030
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45461581fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNP TC   T    T                                     C/T
rs29830454
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45461801fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNPGGTGGGG  G GGGG       G          G      G G    T G/T
rs30115139
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45462154fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNPCCGCCCC    CC C       C          C      C C    G C/G
rs29919669
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45466283fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNP AG                                              A/G
rs29870355
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45466454fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNP AG   A                                          A/G
rs29964018
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45466778fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNPGGCGGGG  G GGGG       G          G      G C    C C/G
rs6242547
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45470785fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNP      C   T                                      C/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs6242647
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45470860fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNP      A   G                                      A/G
rs30018039
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45472667fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNP TA   T    T                                     A/T
rs30012151
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45476827fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNPG A   G    G                                     A/G
rs30124638
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45478485fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNP TC        T                                     C/T
rs30120637
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45479235fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNPAATAAAA    AAAA       A          A      A A    T A/T
rs29871191
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45486781fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
4SNPAAGG A   G AGGG    A  A          AG     A G    G A/G
rs30018582
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45486914fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
4SNPTTAAAT   A TAAA    T  T          TA     T A    A A/T
rs30058483
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45489283fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNP  C        A                                     A/C
rs30072572
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45489475fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNP  G   A    A       A              G              A/G
rs29968882
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45490157fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNPTTGTTTT  T TTTT       T          T      T T    G G/T
rs6310719
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45492799fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
4SNP T    ?   TT                                     A/C/T
rs6310739
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45492807fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNP T    G   TT                                     G/T
rs6310780
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45492835fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNP A    C   AA                                     A/C
rs30113526
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45494485fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNPGGT   G    G                                     G/T
rs30018692
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45499180fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
5SNPTTCCCTT    TCCC    T  T          TC     T C    C C/T
rs29875200
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45499593fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNPAAGAAAA  G AAGA       A          A      A G    G A/G
rs29874412
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45500107fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNPGGAGGGG  G GGGG       G          G      G G    A A/G
rs30121169
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45506226fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNPAATAAA     AATA       A          A      A T    T A/T
rs30056892
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45506395fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNPCCACCCC  C CCCC       C          C      C C    A A/C
rs30077288
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45506650fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNPGGTGGGG  G GGGG       G          G      G G      G/T
rs29874680
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45506674fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNPTTCTTTT  C TTCT       T          T      T C    C C/T
rs29921142
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45512819fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNPCCT   C    C                                     C/T
rs29969893
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45513227fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNPTTC   T                                          C/T
rs30129561
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45513745fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNPC T   C    C                                     C/T
rs29968292
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45514643fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNPAAGAAAA  G AAGA       A          A      A G    G A/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29936260
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45514873fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
4SNPTTGGGTT  G TGGG    T  T          TG     T G    G G/T
rs30017974
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45515017fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNPA T   A    A                                     A/T
rs30024344
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45515088fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNPC GCCCC  C CCCC       C          C      C C    G C/G
rs29924697
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45520922fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNPAAGAAAA  A AAAA       A          A      A A    G A/G
rs30119216
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45521205fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNPA T   A    A       A              T              A/T
rs30020186
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45523575fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNP TG   T                                          G/T
rs29926645
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45524159fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNPGGAGGGG    GGGG       G          G    G G G    A A/G
rs30069663
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45525465fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNPGGAGGGG    GGGG       G          G      G G    A A/G
rs29974078
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45532332fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNP GC   G    G                                     C/G
rs29974847
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45532338fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNP GC   G    G                                     C/G
rs29984265
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45535710fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNP  A   G    G                                     A/G
rs30068779
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45540552fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNPG A   G                                          A/G
rs29977544
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45543949fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNP TG   T    T                                     G/T
rs6221705
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45544042fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNP      T   A                                      A/T
rs6221707
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45544048fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNP      C   T                                      C/T
rs30067715
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45544870fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNPAAGAAAA  G AAGA       A          A      A G    G A/G
rs30115896
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45548314fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNPCCTCCCC  C CCCC       C          C      C C    T C/T
rs29832356
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45548661fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNPAAGAAAA  A AAAA       A          A      A A    G A/G
rs29868722
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45551430fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNPT CTTTT  T TTTT       T          T      T T    C C/T
rs30068867
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45551526fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNPC TCCCC  C CCCC       C          C      C C    T C/T
rs30123133
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45551859fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNP  G   A    A                                     A/G
rs30066399
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45560841fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNPGGA   G                                          A/G
rs29874921
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45561966fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNPTTCTTTT  T TTTT       T          T      T T    C C/T
rs30057450
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45564062fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNPG AGGGG  G GGGG       G          G      G G    A A/G
rs30028284
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45565518fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNPAAT   A    A                                     A/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs30122162
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45572037fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNPTTG   T                                          G/T
rs29875197
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45572581fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNP AC   A    A                                     A/C
rs30075280
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45572703fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNP AG   A    A                                     A/G
rs30118243
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45572867fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNP GT   G    G                                     G/T
rs30119634
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45573409fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNP AG   A                                          A/G
rs6187548
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45574418fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNP      C   G                                      C/G
rs6188473
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45574576fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNP G    G   A                           A          A/G
rs29872686
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45583898fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNPGGAGGGG  G GGGG       G          G      G A    G A/G
rs29938158
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45583927fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNPGGTGGGG  G GGGG       G          G      G T      G/T
rs30063093
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45590646fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNPGGA        G                                     A/G
rs30017157
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45596328fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNP  T        A                                     A/T
rs30120625
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45596439fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNP  C        A                                     A/C
rs30020885
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45608751fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNP  T   G                                          G/T
rs29828428
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45609231fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNP TA   T    T                                     A/T
rs6374040
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45609978fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNP      A   T                                      A/T
rs6374142
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45610025fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
1SNP      G   T                                      G/T
rs30118610
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45613814fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNP  G   A    A                                     A/G
rs29870518
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45620313fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNPAAG   A                                          A/G
rs30125758
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45621506fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNPAAGAAA   G AAGA       A          A      A G    G A/G
rs29875294
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45625058fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNP AG        A                                     A/G
rs30064038
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45625288fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNPGGCGGGG  G GGGG       G          G      G C    C C/G
rs13478733
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45626021fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
4SNPCCTCCCCCTCCCCCCCCCCCCCCTCCCCC CCCC CTCCTC CCCCTTCC/T
rs29922197
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45626291fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNP AG   A    A                                     A/G
rs6321491
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45627381fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNPG GGGGG  AAGGAG       G          G      G A    G A/G
rs29922471
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45627386fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
3SNPCCTCCCC    CCCC       C          C      C C    T C/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs6321975
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45627445fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNPC CCCCC  CTCCCC       C          C      C T    C C/T
rs6322048
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45627495fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNPC CCCCC  TTCCTC                  C      C T    C C/T
rs6322508
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:45627522fCntnap2 : Intron
Hdp1 : within coordinates of
2SNPC