About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
Genome Coordinate Discrepancy
The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details).
 Symbol
Name
ID
Psenen
presenilin enhancer 2 homolog (C. elegans)
MGI:1913590

23 matching SNPs displayed


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs31469242
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:31344964fLin37 : Locus-Region
Psenen : Locus-Region
1SNP TT   T G        G/T
rs32174460
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:31344966fLin37 : Locus-Region
Psenen : Locus-Region
1SNP TT   T C        C/T
rs51158969
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:31345060fLin37 : Locus-Region
Psenen : Locus-Region
1SNPA AAAA G AAAGAGAAA/G
rs46709258
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:31345215fPsenen : Locus-Region1SNPG GGGG A GAGAGAGGA/G
rs48513780
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:31345584fPsenen : Locus-Region1SNPT TTTT C TCTCTCTTC/T
rs46851912
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:31345598fPsenen : Locus-Region1SNPT TTTT   TCT TCCTC/T
rs32433494
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:31345611fPsenen : Locus-Region1SNP GA              A/G
rs49209007
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:31346432fPsenen : Locus-Region
U2af1l4 : Locus-Region
1SNPA AAAA   AGA A GAA/G
rs47012828
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:31346702fPsenen : Locus-Region
U2af1l4 : Locus-Region
1SNPC CCCC CCCCCCCCTCC/T
rs46564588
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:31346857fPsenen : Locus-Region
U2af1l4 : Locus-Region
1SNPG GGGG CCGCGCGCGGC/G
rs50673669
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:31347265fPsenen : Intron
U2af1l4 : Locus-Region
1SNPC CCCC TTCTCTCTTCC/T
rs49329710
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:31347416fPsenen : Coding-Synonymous
U2af1l4 : Locus-Region
1SNPT TTTT TTTTTTTTCTC/T
rs31524173
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:31347451fPsenen : Intron
U2af1l4 : Locus-Region
2SNP GGGGGGGAGGGAGAGGA/G
rs31981699
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:31347569fPsenen : Intron
U2af1l4 : Locus-Region
1SNP AC   A C        A/C
rs3142450
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:31347581fPsenen : Intron
U2af1l4 : Locus-Region
1SNP GG   A G        A/G
rs31151012
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:31347640fPsenen : Intron
U2af1l4 : Locus-Region
2SNPTTTTTTT CT TCT  TC/T
rs3147797
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:31347651fPsenen : Intron
U2af1l4 : Locus-Region
2SNPCCCCCTTCCTCCCTCCCC/T
rs31624995
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:31347772fPsenen : Intron
U2af1l4 : Locus-Region
1SNP TT   T G        G/T
rs32225492
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:31347932fPsenen : mRNA-UTR
U2af1l4 : Locus-Region
1SNP AA   A G        A/G
rs46340924
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:31347967fPsenen : Intron
U2af1l4 : Locus-Region
1SNPT TTTT TTTTTTTTCTC/T
rs48930525
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:31348015fPsenen : Intron
U2af1l4 : Locus-Region
1SNPG GGGG GGGGGGGGAGA/G
rs31610670
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:31348246fPsenen : Locus-Region
U2af1l4 : Locus-Region
1SNP G    G T        G/T
rs48888482
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:31348289fPsenen : Locus-Region
U2af1l4 : Locus-Region
1SNPT CCCT TTTTTTTTCTC/T

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
05/08/2013
MGI 5.13
The Jackson Laboratory