About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
Genome Coordinate Discrepancy
The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details).
 Symbol
Name
ID
Sdhc
succinate dehydrogenase complex, subunit C, integral membrane protein
MGI:1913302

132 matching SNPs displayed


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs32245635
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173057304f1700009P17Rik : Locus-Region
Sdhc : Locus-Region
2SNPGGGAAGA  GGAGAGGGGA/G
rs31744928
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173057416f1700009P17Rik : Locus-Region
Sdhc : Locus-Region
1SNP  A   C  A        A/C
rs32018994
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173057677fSdhc : Locus-Region1SNPC C   T  C        C/T
rs30556474
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173057684fSdhc : Locus-Region1SNPC C   A  C        A/C
rs30559203
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173057764fSdhc : Locus-Region1SNPT T   C  T        C/T
rs32552351
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173057764fSdhc : Locus-Region1SNPTTT   C  T        C/T
rs52104018
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173057861fSdhc : Locus-Region1SNPT TCCT    TCTCTTTTC/T
rs48086637
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173057872fSdhc : Locus-Region1SNPT TCCT   TTCTCTTTTC/T
rs31393387
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173058071fSdhc : Locus-Region2SNPAAACCAC  AACACAA AA/C
rs32414622
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173058160fSdhc : Locus-Region1SNPCCC   G  C        C/G
rs31566810
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173058278fSdhc : Locus-Region2SNPAAAGGAG   AGAGAA AA/G
rs30509944
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173058369fSdhc : Locus-Region1SNP TT   A           A/T
rs31656692
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173058618fSdhc : Locus-Region2SNP AAGG G  AAGAG A AA/G
rs31492761
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173058857fSdhc : Locus-Region2SNPCCCGGCG  CCGCGCCCCC/G
rs31149749
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173059027fSdhc : Locus-Region2SNPAAAGGAG  AAGAGAA AA/G
rs32279122
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173059034fSdhc : Locus-Region2SNPGGGTTGT  GGTGT GG G/T
rs32552688
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173059070fSdhc : Locus-Region1SNP GG   A  G        A/G
rs31390969
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173059168fSdhc : Locus-Region2SNPAAGGGAG  AGGAGGGGAA/G
rs31598954
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173059338fSdhc : mRNA-UTR2SNPTTTAATA  TTATATT TA/T
rs32480038
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173059463fSdhc : mRNA-UTR2SNPTTTCCTC   TCTCTT TC/T
rs32644041
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173059548fSdhc : mRNA-UTR1SNP TT   C           C/T
rs31363500
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173059550fSdhc : mRNA-UTR1SNP AA   C           A/C
rs46443148
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173059760fSdhc : mRNA-UTR1SNPG GTTG   GGTGTGGGGG/T
rs46875649
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173060189fSdhc : Intron1SNPA GA A    GAA GGGAA/G
rs49263168
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173060224fSdhc : Intron1SNPC CT C   CCTCTCCCCC/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs47642588
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173060262fSdhc : Intron1SNPT TTTT T TTTCTTTTTC/T
rs48737547
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173060333fSdhc : Intron1SNPC CGGC   CCGCGCCCCC/G
rs49870351
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173061570fSdhc : Intron1SNP  TCC     TCTCT  TC/T
rs52131579
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173061813fSdhc : Intron1SNP   AAT     ATATT TA/T
rs48633716
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173062017fSdhc : Intron1SNPC CTTC   CCTCTCCCCC/T
rs49147818
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173062068fSdhc : Intron1SNPG GCCG    GCGCGG GC/G
rs51794685
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173062352fSdhc : Intron1SNPG GTTG   GGTGTGGGGG/T
rs46629431
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173062385fSdhc : Intron1SNPT TCCT   TTCTCTTTTC/T
rs48614174
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173062461fSdhc : Intron1SNPT TCCT    TCCCTT TC/T
rs51915038
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173062802fSdhc : Intron1SNPC CCCC   CCCTCCCCCC/T
rs47950124
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173062914fSdhc : Intron1SNP  CCCC      TC    C/T
rs47245122
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173063196fSdhc : Intron1SNPC CA C   CCACACCCCA/C
rs50624869
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173063298fSdhc : Intron1SNPA AGGA   AAGAGAAAAA/G
rs51378821
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173063337fSdhc : Intron1SNPC CAA     CACACC CA/C
rs49664221
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173064290fSdhc : Intron1SNPG GGGG G GGGGGGGGCC/G
rs31554850
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173064648fSdhc : Intron1SNPC  TT  T C T TT   C/T
rs31554849
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173064766fSdhc : Intron1SNPG  TT  T   T TT T G/T
rs31554848
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173064803fSdhc : Intron1SNPA CCC  C   C CC C A/C
rs31554847
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173065280fSdhc : Intron1SNPT  CC  C T C CC C C/T
rs31554846
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173065422fSdhc : Intron1SNPC GGGC G C G GG G C/G
rs31554845
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173065907fSdhc : Intron1SNPC  AA  A C A A  A A/C
rs13470623
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173066184rSdhc : Coding-Synonymous1SNPT GGG  G T G GG G G/T
rs31554844
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173066235fSdhc : Coding-Synonymous1SNPC  TT  T C T TT   C/T
rs31554163
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173066258fSdhc : Coding-NonSynonymous1SNPC  GG  G C G GG G C/G
rs31554162
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173066427fSdhc : Intron1SNPC  TT  T C T TT T C/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs31554161
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173066463fSdhc : Intron1SNPT GGG  G   G GG G G/T
rs31554160
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173066549fSdhc : Intron1SNPA  GG  G A G G    A/G
rs31554159
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173067000fSdhc : Intron1SNPC  GG  G C C GG   C/G
rs31554158
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173067075fSdhc : Intron1SNPA  GG  G A G GG GGA/G
rs31554157
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173067200fSdhc : Intron1SNPG  AA  A   A A    A/G
rs31554156
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173067321fSdhc : Intron1SNP   CC  C AACACA AAA/C
rs31554155
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173067377fSdhc : Intron1SNPT CCC  C   C CC C C/T
rs31554154
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173067380fSdhc : Intron1SNP  TTT  T CCT TTC CC/T
rs31553233
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173067511fSdhc : Intron1SNP  CGGC G G G G  C C/G
rs31553232
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173068377fSdhc : Intron1SNPT  AA  A T A A  T A/T
rs31553231
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173068517fSdhc : Intron1SNPG GAAG   G A AG G A/G
rs31553230
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173068774fSdhc : Intron1SNP    C  C   C CT   C/T
rs31553229
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173069107fSdhc : Intron1SNP   GGG G  CG G    C/G
rs31553228
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173069190fSdhc : Intron1SNP  AGG      G GA A A/G
rs31553227
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173069660fSdhc : Intron1SNPC CGGC G CCCC CC CC/G
rs31553226
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173070837fSdhc : Intron1SNPG  CC  C     CC G C/G
rs31553225
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173071158fSdhc : Intron1SNP   AA  C     A    A/C
rs31553224
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173071224fSdhc : Intron1SNP  GAAG A   A A  G A/G
rs6214698
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173071292fSdhc : Intron1SNP      A G         A/G
rs31552623
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173071295fSdhc : Intron1SNPG G  G C GG GCGGGGC/G
rs31552622
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173071318fSdhc : Intron1SNP  GCCC C   CGCC C C/G
rs31552621
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173071761fSdhc : Intron1SNPG GAAG A   A A  G A/G
rs31552620
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173071776fSdhc : Intron1SNPA AGGA G AAG G  A A/G
rs31552619
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173072034fSdhc : Intron1SNPC CAA  A C A A  C A/C
rs6219083
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173072043fSdhc : Intron1SNP      A C         A/C
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs31552618
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173072073fSdhc : Intron1SNPC CTT  T  CT T  C C/T
rs31552617
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173072148fSdhc : Intron1SNPA AGGA G AAG G AA A/G
rs31552616
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173072565fSdhc : Intron1SNPA ATTA T AAT T  A A/T
rs31552615
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173072576fSdhc : Intron1SNPC CAAC A CCACACACCA/C
rs31552614
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173072708fSdhc : Intron1SNPG GCCG C GGCGCCG  C/G
rs31559246
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173073051fSdhc : Intron1SNPC CCCC C CCTCCCCCCC/T
rs31559245
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173073184fSdhc : Intron1SNPC CCCC C CCACCCCCCA/C
rs31559244
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173073232fSdhc : Intron1SNPA GGGA G AAGAGAAAAA/G
rs31558213
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173073594fSdhc : Intron1SNP  CAA  A     AC  CA/C
rs31919220
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173073608fSdhc : Intron1SNP GG   A  G        A/G
rs32545772
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173073939fSdhc : Intron1SNP GG   A  G        A/G
rs32757477
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173073957fSdhc : Intron1SNP CC   T  C        C/T
rs32261165
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173073958fSdhc : Intron1SNP AA   G  A        A/G
rs31558212
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173074104fSdhc : Intron2SNPAAAGGAGG AAG G AAAA/G
rs30565860
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173074147fSdhc : Intron2SNPG GTTGTT GGT TGGGGG/T
rs32756588
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173074247fSdhc : Intron1SNPT A   A  T        A/T
rs31558211
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173074302fSdhc : Intron1SNPT  TTT T   TAT    A/T
rs31474655
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173074552fSdhc : Intron2SNPCCCTTCTT CCTCTC C C/T
rs31558210
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173074566fSdhc : Intron1SNPG GGGG G GGAGGGGAGA/G
rs32480372
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173074649fSdhc : Intron1SNP AA   G  A        A/G
rs32731858
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173074716fSdhc : Intron1SNP TA      T        A/T
rs31558209
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173074848fSdhc : Intron1SNPT TCC  C TTC CT  TC/T
rs31558208
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173075043fSdhc : Intron1SNPT TCC  C TTC C    C/T
rs31558207
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173075095fSdhc : Intron1SNP   GG  G   T GG T G/T
rs31558206
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173075118fSdhc : Intron1SNPC CTTC T C T T  CCC/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs31558205
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173075245fSdhc : Intron1SNPG GCCG   GGCGCGGGGC/G
rs31558204
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173075367fSdhc : Intron1SNPC AAA  A CCA AA AAA/C
rs31557013
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173075392fSdhc : Intron1SNPC  TT  T   T T    C/T
rs31996477
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173075778fSdhc : Intron1SNPTT    G  T        G/T
rs32635363
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173075804fSdhc : Intron1SNPCC    T  C        C/T
rs31557012
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173075936fSdhc : Coding-NonSynonymous2SNPCCCTTCTT CCTCTT C C/T
rs31557011
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173075975fSdhc : Intron1SNPT TTTT T TTTGTTTTGG/T
rs31557010
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173075998fSdhc : Intron1SNPG GGGG G GGAGGGG GA/G
rs31461449
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173076247fSdhc : Intron2SNPTTTCC CC TTCTC T  C/T
rs31477870
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173076368fSdhc : Intron2SNPCCCTTCTT CCCCTCCCCC/T
rs31557009
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173076428fSdhc : Intron2SNPCCCTTCTT CCCCTCCCCC/T
rs31557008
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173076705fSdhc : Intron1SNPG GGGG G GGGAGGGGGA/G
rs31911880
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173076800fSdhc : Intron1SNP GG   A  G        A/G
rs30855119
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173076858fSdhc : Intron1SNP CC   T  C        C/T
rs31557006
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173077099fSdhc : Intron1SNPC CTTC T CCTCTCCCCC/T
rs30560896
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173077766fSdhc : Intron2SNPTTTGG GG TTGTG  T G/T
rs31557005
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173077810fSdhc : Intron2SNPTTTGGTGG TTGTGTTTTG/T
rs32363901
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173078326fSdhc : Intron1SNP TT   A  T        A/T
rs31811097
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173078327fSdhc : Intron1SNP TT   A  T        A/T
rs30809707
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173078329fSdhc : Intron2SNP TTAA AA ?   A    A/C/T
rs31557004
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173078443fSdhc : Intron2SNPAAACCA C AACACAAAAA/C
rs31555973
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173078488fSdhc : Intron2SNPGGGAAG A GG GAGGGGA/G
rs31095486
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173078798fSdhc : Intron2SNPGGGAAG A GGGGAGGGGA/G
rs32484558
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173079778fMpz : Locus-Region
Sdhc : Intron
1SNP TT   A  T        A/T
rs30804997
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173080213fMpz : Locus-Region
Sdhc : Intron
2SNPGGGAAGAA GGAGAAAGAA/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs31555972
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173080291fMpz : Locus-Region
Sdhc : Intron
1SNPA AAAA A AAAAAAAATA/T
rs31555971
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173080457fMpz : Locus-Region
Sdhc : Intron
1SNPC CCCC T CCCCCCCCCC/T
rs31116911
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173080700fMpz : Locus-Region
Sdhc : Coding-NonSynonymous
2SNPG GAAGAG GGGGAGGGGA/G
rs31555970
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173080957fMpz : Intron
Sdhc : Locus-Region
2SNPG GCCGCC GGCGCGGGGC/G
rs31555969
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173081069fMpz : Intron
Sdhc : Locus-Region
1SNP  GGGG     C G  C C/G
rs31555968
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173081075fMpz : Intron
Sdhc : Locus-Region
1SNPG GAAG G GG GAGGGGA/G
rs30909739
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr1:173081143fMpz : Intron
Sdhc : Locus-Region
2SNPCCCTTCTT CCCCTCCCCC/T

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
06/05/2013
MGI 5.13
The Jackson Laboratory