About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Vapb
vesicle-associated membrane protein, associated protein B and C
MGI:1928744

119 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.
Include SNPs that map to multiple locations

Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs52590173
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173736309fVapb : Locus-Region1SNP AC      C             A/C
rs108582071
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173746452fVapb : Intron1SNP TT      T         C   C/T
rs108387575
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173746822fVapb : Intron1SNP TT      T         C   C/T
rs47109460
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173747956fVapb : Intron1SNP TT                C   C/T
rs47471172
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173748005fVapb : Intron1SNP TT      T         A   A/T
rs33279570
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173753882fVapb : Intron1SNP GA   A  A             A/G
rs27613967
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173755229fVapb : Intron1SNPG G    A GG            A/G
rs27613966
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173756106fVapb : Intron1SNPA      G AAA           A/G
rs27613965
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173756917fVapb : Intron1SNPT TTT  C TTTT   TT  TTTC/T
rs27613964
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173757604fVapb : Intron1SNPA A    G A G          AA/G
rs27613963
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173759583fVapb : Intron1SNPC CCCC T CCCC    C  CCCC/T
rs27613962
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173759691fVapb : Intron1SNPT TTTT C TTCT   TT  TCCC/T
rs27613961
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173760208fVapb : Intron1SNPT TTTT T TTCT   TT  TCTC/T
rs27613960
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173760436fVapb : Intron1SNPA AAAA G AAGA       AGGA/G
rs27613959
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173760877fVapb : Intron1SNPC CCCC A CC C    C  CCCA/C
rs27613958
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173760883fVapb : Intron1SNPC CCCC   CCTC   CC  CTCC/T
rs27613957
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173760946fVapb : Intron1SNPT TTTT C TTTT   TT  TTTC/T
rs27613956
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173761065fVapb : Intron1SNPT TTTT G TTGT   TT  TGGG/T
rs27613955
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173761319fVapb : Intron1SNPG GGGG G GGGG   GG  GGAA/G
rs27613954
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173761477fVapb : Intron1SNPT TTTT G TTG    TT  TGGG/T
rs27613953
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173761746fVapb : Intron1SNPT TTTT C TT T   TT  TCTC/T
rs27613952
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173761956fVapb : Intron1SNPT      C CCC        TCTC/T
rs27613951
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173762009fVapb : Intron1SNPT TTTT   TTCT   TT  T TC/T
rs27613950
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173762476fVapb : Intron1SNPG GGGG A GGAG   GG  GAAA/G
rs27613949
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173762513fVapb : Intron1SNPT TTTT C TTCT   TT  TCTC/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs6246697
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173763273fVapb : Intron2SNPG GGGGG TGG G   GG  GTGG/T
rs27613948
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173763371fVapb : Intron1SNPT TTT  T TTT    TT  TCTC/T
rs6260998
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173763682fVapb : Intron2SNPC  CC CCTCC         CTCC/T
rs27613947
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173764357fVapb : Intron1SNPT TTTT C TTCT   TT  TCCC/T
rs27613946
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173764568fVapb : Intron1SNPC CCCC T CC C   CC  C CC/T
rs27613945
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173764569fVapb : Intron1SNPT TTTT   TT T   TT  TATA/T
rs27613944
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173765580fVapb : Intron1SNPT   T    T          TA A/T
rs27613943
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173766359fVapb : Intron1SNPG GGG    GG G   GG  GA A/G
rs27613942
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173766574fVapb : Intron1SNPA AAAA A AAAA   AA  AAGA/G
rs32985426
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173766660fVapb : Intron3SNP TT   C  C   C    T    C/T
rs27613941
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173766962fVapb : Intron1SNPG GGGG G GGAG   GG  GAGA/G
rs27613940
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173767105fVapb : Intron1SNPG GGG  A GG G   GG  GGGA/G
rs27613939
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173767246fVapb : Intron1SNPG GGGG G GGAG   GG  GAGA/G
rs27613938
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173767398fVapb : Intron1SNPA AAAA G AAAA   AA  AAAA/G
rs27613937
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173767825fVapb : Intron1SNPC CCCC   CC C   CC  CTCC/T
rs27613936
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173768390fVapb : Intron1SNPG GGGG G GGGG   GG  GCGC/G
rs27613935
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173768500fVapb : Intron1SNPG GGG  T GGGG   GG  GGGG/T
rs27613934
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173768911fVapb : Intron1SNPT TTTT C TT     TT  TCCC/T
rs27613933
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173768968fVapb : Intron1SNPT TTTT C TTTT   TT  TTTC/T
rs27613932
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173769064fVapb : Intron1SNPT TTTT C TTCT   TT  TCCC/T
rs27613931
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173769585fVapb : Intron1SNPC CCCC C CCGC   CC  CCCC/G
rs215578141
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173769874fVapb : Intron1SNP             T    C    C/T
rs27613930
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173770846fVapb : Intron1SNPG GGGG G GGGG   GG  GAGA/G
rs27613929
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173770875fVapb : Intron1SNPA AAAA A AACA   AA  ACAA/C
rs27613928
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173771151fVapb : Intron1SNPC CCCC   CC     C   CTTC/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27613927
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173771152fVapb : Intron1SNPC CCCC T CC C   C   CC C/T
rs27613926
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173771309fVapb : Intron1SNPG   G  C GGG    GG  GGGC/G
rs27613925
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173771990fVapb : Intron1SNPT  TTT C TT T   TT  TCTC/T
rs27613924
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173772291fVapb : Intron1SNPC   CC G CCCC   CC  CCCC/G
rs27613923
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173772308fVapb : Intron1SNPA   AA G AAA    AA   AAA/G
rs27613922
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173772418fVapb : Intron1SNPG  GGG A GGGG   GG  GGGA/G
rs27613921
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173772550fVapb : Intron1SNPA   A  G AAAA   AA  AAAA/G
rs27613920
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173772767fVapb : Intron1SNPA   AA A AAAA   AA  AAGA/G
rs27613919
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173772797fVapb : Intron1SNPT   T  C TTTT   TT   TTC/T
rs27613918
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173772827fVapb : Intron1SNPA   AA C AAAA   AA  AAAA/C
rs27613917
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173773165fVapb : Intron1SNPC CCCC A CCCC   CC  CC A/C
rs27613916
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173773217fVapb : Intron1SNPC   C    CC     C   CTTC/T
rs27613915
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173773383fVapb : Intron1SNPA  AAA C AAAA   AA  AAAA/C
rs27613914
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173773733fVapb : Intron1SNPG   GG A GGAG   GG  GAAA/G
rs27613913
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173773917fVapb : Intron1SNPA   A  G AAA    AA  AAAA/G
rs27613912
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173774566fVapb : Intron1SNPT   TT C TTTT       TTTC/T
rs27613911
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173775562fVapb : Intron1SNPG   G  A GGG    GG  GGGA/G
rs27613910
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173775703fVapb : Intron1SNPA  GA  G AAGA   AA  AGAA/G
rs27613909
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173775936fVapb : Intron1SNPG   GG C GG G   GG  GCGC/G
rs27613908
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173776010fVapb : Intron1SNPA   A  G AAG    GG  AGAA/G
rs27613907
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173776081fVapb : Intron1SNPA   AA A AAGA   AA  AGAA/G
rs27613906
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173776093fVapb : Intron1SNPT   TT T TT T   TT  TCTC/T
rs27613905
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173777053fVapb : Intron1SNPG      A GGG        GGGA/G
rs27613904
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173777154fVapb : Intron1SNPT   T  C TTT    TT  TTTC/T
rs27613903
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173777240fVapb : Intron1SNPC  CCC T CCTC   CC  CTCC/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27613902
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173777289fVapb : Intron1SNPG   GG G GGGG   GG  GGAA/G
rs27613901
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173777603fVapb : Intron1SNPA   A  C AACA   AA  ACAA/C
rs27613900
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173777663fVapb : Intron4SNPAAA GGGG GG GG  GGA GGGA/G
rs27613899
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173777753fVapb : Intron1SNPA   AA C AAAA   AA  AAAA/C
rs27613898
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173777793fVapb : Intron1SNPC   CC G CCGC   CC  CG C/G
rs27613897
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173777920fVapb : Intron1SNPG  GG  G GG     GG  GTGG/T
rs27613896
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173778120fVapb : Coding-NonSynonymous1SNP       C  C          A A/C
rs27613895
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173778722fVapb : mRNA-UTR1SNPA   AA C AAC     A  ACAA/C
rs27613894
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173778800fVapb : mRNA-UTR1SNPT   TT G TTTT   TT  TTTG/T
rs27613893
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173779590fVapb : mRNA-UTR1SNP    CC C CCTC   CC  CTCC/T
rs27613892
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173779805fVapb : mRNA-UTR1SNPC   CC C CCCC   CC  CTCC/T
rs27613891
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173780113fVapb : mRNA-UTR1SNPT   T  A TTT    TT  TTTA/T
rs27613890
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173780331fVapb : mRNA-UTR1SNPC  CC  C CCTC   CC  CTCC/T
rs27613889
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173781400fVapb : mRNA-UTR1SNPT   T  T TTC    TT  TCTC/T
rs27613888
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173781431fVapb : mRNA-UTR1SNPG   GG G GGAG   GG  GAGA/G
rs27613887
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173781477fVapb : mRNA-UTR1SNPC  CCC T CC C   CC  C CC/T
rs27613886
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173781567fVapb : mRNA-UTR1SNPT   T  C TTCT   TT  TCTC/T
rs27613885
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173781674fVapb : mRNA-UTR1SNPG G GG G GGCG   GG  GCGC/G
rs27613884
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173781781fVapb : mRNA-UTR1SNPC   C  T CCCC   CC  CCCC/T
rs27613883
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173781841fVapb : mRNA-UTR1SNPC   CC C CCCC   CC  CCTC/T
rs27613882
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173781927fVapb : mRNA-UTR1SNPG   G  G GGTG   GG  GTGG/T
rs27613881
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173782250fVapb : mRNA-UTR1SNPC   CC T CCCC   CC  CCCC/T
rs4223695
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173782907rVapb : mRNA-UTR2SNPT TTTTTC TTCT TTTT  TCTC/T
rs27613880
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173782965fVapb : mRNA-UTR1SNPG GGGG G GGGG   GG  GAGA/G
rs27613879
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173782985fVapb : mRNA-UTR1SNPC CCCC C CCTC   CC  CTCC/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27613878
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173783495fVapb : mRNA-UTR1SNPG GGGG A GG     G   G  A/G
rs27613877
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173783536fVapb : mRNA-UTR1SNPA AAAA A AAGA   AA  AGAA/G
rs27613876
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173783976fVapb : mRNA-UTR1SNPT TTTT C TTCT       TCTC/T
rs27613875
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173784129fVapb : mRNA-UTR1SNPT TTTT C TT T   TT  TCTC/T
rs27613874
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173784185fVapb : mRNA-UTR1SNPC CCC    CC C   C   CTCC/T
rs27613873
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173784776fVapb : Locus-Region4SNPTTTCCCCC CCCCC  CCT CCCC/T
rs27613872
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173785064fVapb : 728 bp downstream of1SNPG GGGG G GGAG   GG  GAGA/G
rs27613871
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173785106fVapb : 770 bp downstream of1SNPT TTT  C TTC    T   TC C/T
rs27613870
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173785228fVapb : 892 bp downstream of1SNPT TTTT C TTCT   TT  TCCC/T
rs27613869
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173785256fVapb : 920 bp downstream of1SNPT TTTT C TTCT   TT  TCCC/T
rs27613868
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173785355fVapb : 1019 bp downstream of1SNPG  GG  G GG G   GG  GTGG/T
rs27613867
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173785434fVapb : 1098 bp downstream of1SNPG GGGG G GGGG   GG  GAGA/G
rs27613866
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173785443fVapb : 1107 bp downstream of1SNPG GGGG A GGGG   GG  GGGA/G
rs27613865
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173785466fVapb : 1130 bp downstream of1SNPG GGGG G GGAG   GG  GAAA/G
rs27613864
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173785516fVapb : 1180 bp downstream of1SNPA AAAA   AA A   AA  AGGA/G
rs27613863
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173785660fVapb : 1324 bp downstream of1SNPT TTTT G TTGT   TT  TGTG/T
rs27613862
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173785704fVapb : 1368 bp downstream of1SNPT TTTT G TTTT    T  TTTG/T
rs27613861
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173785765fVapb : 1429 bp downstream of1SNPC CCCC A CCAC       CAAA/C
rs27613860
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:173785915fVapb : 1579 bp downstream of1SNPA AAAA G AAAA   AA  AAAA/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
08/26/2014
MGI 5.19
The Jackson Laboratory