About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
Genome Coordinate Discrepancy
The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details).
 Symbol
Name
ID
F12
coagulation factor XII (Hageman factor)
MGI:1891012

46 matching SNPs displayed


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs16818442
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55518549rF12 : Locus-Region2SNPC TCTTTCCCCCCCC TCTCCC T CCC CCC/T
rs16818441
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55518555rF12 : Locus-Region2SNPA GGGGGGGAGGGAGAGGGGGGAG AAAGGAA/G
rs48492846
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55518647fF12 : Locus-Region1SNPT TTT T TTTTT     T  T     T GTG/T
rs45993122
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55518672fF12 : Locus-Region1SNPA AAA A AAAAA     A  A     A GAA/G
rs51161197
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55518829fF12 : Locus-Region1SNPA AAA A AAAAA     A  A     A CAA/C
rs49896280
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55519007fF12 : Locus-Region1SNPC CCC C CCCCC     C  C     C TCC/T
rs16818443
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55519385fF12 : mRNA-UTR2SNPA AAAAAACAACAAAAAAAAAA   AAA AAA/C
rs48938912
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55519531fF12 : Coding-NonSynonymous1SNPG GGG G GGGGG     A  G     G GGA/G
rs16818445
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55519758rF12 : Coding-Synonymous1SNP  GGGGGGAG   GGGGG GG GGAGG G  A/G
rs16818444
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55519925rF12 : Intron1SNP   GGGGGAG   GGGGG GG GGAGG G  A/G
rs46267994
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55520155fF12 : Intron1SNPC CCC C CCCCC     C  C     C TCC/T
rs51875121
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55520168fF12 : Intron1SNPC CCC C CCCCC     C  C     C TCC/T
rs29227456
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55520407fF12 : Intron1SNP AA    G A                     A/G
rs16818457
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55520424rF12 : Intron1SNP  CGCCCGGC   CGCCG G  CCCCC C  C/G
rs16818456
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55520426rF12 : Intron2SNP TTGTTTGGT   TGTTG G  TT TT T  G/T
rs16818455
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55520427rF12 : Intron1SNP  T     GT    G  G G  T     T  G/T
rs16818454
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55520467rF12 : Intron1SNP   T   TT     T  T T      C    C/T
rs16818453
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55520478rF12 : Intron1SNP   CAAAC A   ACAAC     AA A A  A/C
rs16818452
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55520550rF12 : Intron1SNP  C  C G C   CCCC     CCC C C  C/G
rs16818451
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55520569rF12 : Intron1SNP  CG CGGG       CG G  CCC C    C/G
rs16818450
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55520581rF12 : Intron1SNP   C A C A   A  AC     AAAA A  A/C
rs16818449
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55520603rF12 : Intron1SNP  C CCTTT     TCCT      CCC T  C/T
rs16818448
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55520659rF12 : Intron1SNP    T   C     CT         T     C/T
rs16818447
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55520677rF12 : Intron1SNP     C TTC    TCCT     C CC    C/T
rs16818446
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55520738rF12 : Intron2SNPGGA AA G G      A      A GG A  A/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29244155
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55521070fF12 : Intron1SNPAAA    T A                     A/T
rs16818458
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55521255rF12 : Intron2SNPAAATAAATAA   ATAAT TT AAAAA A  A/T
rs29680748
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55521557fF12 : Coding-Synonymous2SNPT TAT TATTATA     T  A     T  TA/T
rs50557211
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55521628fF12 : Intron1SNPC CCC C CCCCC     C  C     C GCC/G
rs16818466
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55521649fF12 : Intron2SNP  TCTTTCCT   TCTTC CC TT TT T  C/T
rs49276429
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55522120fF12 : Coding-Synonymous1SNPC CCC C CCCCC     C  C     C TCC/T
rs16818467
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55522191rF12 : Coding-NonSynonymous2SNPA AAAAAAGAAGAAAAAAAAAAAAGAAAAAAA/G
rs47110035
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55522409fF12 : Coding-Synonymous1SNPA AAA A AAAAA     A  A     A GAA/G
rs16818468
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55522818rF12 : Intron2SNPGGGTGGGTGG   GTGGT TT GGGGG G  G/T
rs16818469
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55523975rF12 : Intron1SNP  GGGGGGGG   GGGGG GG  AGGG G  A/G
rs16818473
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55525189rF12 : Intron2SNP TCCCCCCCT   TCTCC CC TCCTT C  C/T
rs16818472
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55525321rF12 : Intron1IN-DEL  T-TTT---   ---T- -- -T--- T  -/T
rs16818470
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55525322rF12 : Intron2Mixed  ????????   ????? ?? ????? ?  -/A/G/T
rs29232237
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55525322fF12 : Intron1SNP CA    C C                     A/C
rs16818461
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55527391rF12 : Intron2SNP GGAGGGAGG   GAGGA AA GG GG G  A/G
rs16818460
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55527433rF12 : Intron1SNP  TTTTTTCT   TTTTT TT TT TT T  C/T
rs16818459
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55527554rF12 : Intron1SNP  GGGGGGGA   AGAGG GG AG AA G  A/G
rs16818462
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55528156rF12 : Locus-Region1SNP  CCCCCCCT   TCTCC CC  CCTT C  C/T
rs16818463
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55528453fF12 : Locus-Region1SNP  TTTTTTGT   TTTTT TT TT TT T  G/T
rs16818464
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55528465fF12 : Locus-Region1SNP  GGGGGGTG   GGGGG GG GG GG G  G/T
rs16818465
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr13:55528562fF12 : Locus-Region1SNP  AAAAAAGA   AAAAA AA AA AA A  A/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
06/05/2013
MGI 5.13
The Jackson Laboratory