About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
B3gnt2
UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 2
MGI:1889505

89 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29439651
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22832845fB3gnt2 : 1902 bp downstream of3SNP T    T  G   T    G    G/T
rs26858692
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22833417fB3gnt2 : 1330 bp downstream of2SNPG  A A   AA  G    A G  A/G
rs219650267
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22833542fB3gnt2 : 1205 bp downstream of1SNP             C    C    C
rs29468873
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22833903fB3gnt2 : 844 bp downstream of3SNP GG   G  C   G    C    C/G
rs264654693
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22834300fB3gnt2 : Locus-Region1SNP             G    G    G
rs48441563
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22834661fB3gnt2 : Locus-Region1SNP                   G   G
rs48824215
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22834727fB3gnt2 : Locus-Region1SNP         G         T   G/T
rs52002441
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22834855fB3gnt2 : mRNA-UTR
Gm28048 : within coordinates of
1SNP         C         T   C/T
rs233823061
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22835311fB3gnt2 : mRNA-UTR
Gm28048 : within coordinates of
1SNP             T    C    C/T
rs29418659
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22836476fB3gnt2 : Coding-Synonymous
Gm28048 : within coordinates of
3SNPG G   G  A   G    A    A/G
rs29420650
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22836503fB3gnt2 : Coding-Synonymous
Gm28048 : within coordinates of
3SNPAAA   A  G   G    G    A/G
rs4228621
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22836820fB3gnt2 : Coding-Synonymous
Gm28048 : within coordinates of
1SNP  A AAAA A    GA       A/G
rs4228622
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22836934fB3gnt2 : Coding-NonSynonymous
Gm28048 : within coordinates of
4SNP CC CACA A   CAC  A    A/C
rs4228623
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22837021fB3gnt2 : Coding-NonSynonymous
Gm28048 : within coordinates of
1SNP  G GGGG G    AG       A/G
rs4228624
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22837035fB3gnt2 : Coding-NonSynonymous
Gm28048 : within coordinates of
1SNP  G GGGG G    AG       A/G
rs4228625
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22837150fB3gnt2 : Coding-NonSynonymous
Gm28048 : within coordinates of
2SNPT T TTTC T  T TT T  TC C/T
rs26858690
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22837172fB3gnt2 : Coding-Synonymous
Gm28048 : within coordinates of
1SNPA A A      AA   AA  AGAA/G
rs29388804
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22837448fB3gnt2 : Intron
Gm28048 : within coordinates of
3SNP TT      C   T    C    C/T
rs213419677
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22838249fB3gnt2 : Intron
Gm28048 : within coordinates of
1SNP             T    A    A/T
rs26858689
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22838334fB3gnt2 : Intron
Gm28048 : within coordinates of
1SNPT T T      TT   TT  TCTC/T
rs26858688
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22838720fB3gnt2 : Intron
Gm28048 : within coordinates of
1SNPA A A      AA   AA  AGAA/G
rs29440004
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22840047fB3gnt2 : Intron
Gm20456 : within coordinates of
Gm28048 : within coordinates of
2SNP AA      C             A/C
rs26858687
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22840237fB3gnt2 : Intron
Gm20456 : within coordinates of
Gm28048 : within coordinates of
1SNPG G G  T   GG   GG  GGGG/T
rs224013434
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22840512fB3gnt2 : Intron
Gm20456 : within coordinates of
Gm28048 : within coordinates of
1SNP             G    G    G
rs47242897
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22841085fB3gnt2 : Intron
Gm20456 : within coordinates of
Gm28048 : within coordinates of
1SNP             C    T    C/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs212785587
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22841186fB3gnt2 : Intron
Gm20456 : within coordinates of
Gm28048 : within coordinates of
1SNP             T    C    C/T
rs240697183
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22841768fB3gnt2 : Intron
Gm20456 : within coordinates of
Gm28048 : within coordinates of
1SNP             C    T    C/T
rs26858686
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22842574fB3gnt2 : Intron
Gm20456 : within coordinates of
Gm28048 : within coordinates of
1SNPG G G  G   G    GG  GAGA/G
rs26858685
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22843378fB3gnt2 : Intron
Gm28048 : within coordinates of
1SNPG G G  G   GG   GG  GTGG/T
rs26858684
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22843921fB3gnt2 : Intron
Gm28048 : within coordinates of
1SNPG G G  G   GG   GG  GAGA/G
rs26858683
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22844351fB3gnt2 : Intron
Gm28048 : within coordinates of
1SNPA A A      AA   AA  AGAA/G
rs263952290
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22844419fB3gnt2 : Intron
Gm28048 : within coordinates of
1SNP             G    A    A/G
rs26858682
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22844465fB3gnt2 : Intron
Gm28048 : within coordinates of
2SNPA A A  G   AGA  AAG AGAA/G
rs6316417
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22844536fB3gnt2 : Intron
Gm28048 : within coordinates of
1SNP      A C              A/C
rs6316973
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22844663fB3gnt2 : Intron
Gm28048 : within coordinates of
1SNP      T C              C/T
rs6330253
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22844783fB3gnt2 : Intron
Gm28048 : within coordinates of
1SNP      T C              C/T
rs6330793
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22844862fB3gnt2 : Intron
Gm28048 : within coordinates of
1SNP      A C              A/C
rs6331317
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22844959fB3gnt2 : Intron
Gm28048 : within coordinates of
1SNP      T A              A/T
rs52218702
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22845077fB3gnt2 : Intron
Gm28048 : within coordinates of
1SNP  T      T             T
rs52308175
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22845117fB3gnt2 : Intron
Gm28048 : within coordinates of
1SNP  A      C             A/C
rs26858681
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22845293fB3gnt2 : Intron
Gm28048 : within coordinates of
1SNPA A A      AA   AA  ACAA/C
rs26858680
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22845333fB3gnt2 : Intron
Gm28048 : within coordinates of
1SNPG G G      GG   GG  GAGA/G
rs29400213
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22845712fB3gnt2 : Intron
Gm28048 : within coordinates of
3SNP AA      T   A    T    A/T
rs26858679
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22845778fB3gnt2 : Intron
Gm28048 : within coordinates of
1SNPC C C  G   C    CC  CGCC/G
rs49480099
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22846045fB3gnt2 : Intron
Gm28048 : within coordinates of
1SNP             C    A    A/C
rs26858678
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22846299fB3gnt2 : Intron
Gm28048 : within coordinates of
1SNPA A A       A    A  AGAA/G
rs29454070
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22846309fB3gnt2 : Intron
Gm28048 : within coordinates of
3SNP CC   C  T   C    T    C/T
rs26858677
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22846454fB3gnt2 : Intron
Gm28048 : within coordinates of
1SNPA A A      AA   AA  ACAA/C
rs29445327
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22846877fB3gnt2 : Intron
Gm23772 : within coordinates of
Gm28048 : within coordinates of
3SNP C       T   C    T    C/T
rs255564551
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22847042fB3gnt2 : Intron
Gm28048 : within coordinates of
1SNP             T    A    A/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs26858676
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22847606fB3gnt2 : Intron
Gm28048 : within coordinates of
4SNPTTT T    C TCC  TTC TCCC/T
rs29394974
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22847985fB3gnt2 : Intron
Gm28048 : within coordinates of
3SNP TT   T  C   T    C    C/T
rs29422122
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22848084fB3gnt2 : Intron
Gm28048 : within coordinates of
2SNP CC   C  T   C    T    C/T
rs26858675
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22848836fB3gnt2 : Intron
Gm28048 : within coordinates of
3SNPGGG GA   AA GG  G A G  A/G
rs26858674
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22848910fB3gnt2 : Intron
Gm28048 : within coordinates of
1SNPT TTTT   TTTC   T   T TC/T
rs26858673
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22850102fB3gnt2 : Intron
Gm28048 : within coordinates of
4SNPAAA AGA  GGA G  A G A  A/G
rs26858672
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22850760fB3gnt2 : Intron
Gm28048 : within coordinates of
4SNPT TCTCT  CCTTT  T C T  C/T
rs26858671
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22851627fB3gnt2 : Intron
Gm28048 : within coordinates of
4SNPGGGCGCGG CCGGG  G CGGGGC/G
rs26858670
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22851895fB3gnt2 : Intron
Gm28048 : within coordinates of
4SNPGGG GAG  AAGGA  G AAG  A/G
rs51314815
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22851919fB3gnt2 : Intron
Gm28048 : within coordinates of
1SNP CC                G   C/G
rs51511794
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22851941fB3gnt2 : Intron
Gm28048 : within coordinates of
1SNP GG      G         C   C/G
rs49891272
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22851955fB3gnt2 : Intron
Gm28048 : within coordinates of
1SNP CC      C         T   C/T
rs48186431
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22851962fB3gnt2 : Intron
Gm28048 : within coordinates of
1SNP GG      G         A   A/G
rs46908895
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22851994fB3gnt2 : Intron
Gm28048 : within coordinates of
1SNP TT      T         C   C/T
rs51336165
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22852016fB3gnt2 : Intron
Gm28048 : within coordinates of
1SNP TT                    T
rs29440053
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22852317fB3gnt2 : Intron
Gm28048 : within coordinates of
2SNP GG   G  C             C/G
rs218735755
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22852348fB3gnt2 : Intron
Gm28048 : within coordinates of
1SNP             T    A    A/T
rs233622558
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22852350fB3gnt2 : Intron
Gm28048 : within coordinates of
1SNP             T    A    A/T
rs26858669
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22853725fB3gnt2 : Intron
Gm28048 : within coordinates of
3SNPAAAGAG   GGAAA  A G A  A/G
rs26858668
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22854768fB3gnt2 : Intron
Gm28048 : within coordinates of
1SNPG GGGG G GGGG   G   G AA/G
rs6398470
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22854769fB3gnt2 : Intron
Gm28048 : within coordinates of
1SNP      A C              A/C
rs6398976
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22854837fB3gnt2 : Intron
Gm28048 : within coordinates of
1SNP      T C              C/T
rs26858667
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22854876fB3gnt2 : Intron
Gm28048 : within coordinates of
4SNPA ACACA  CCAAA  A C A  A/C
rs6399137
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22854923fB3gnt2 : Intron
Gm28048 : within coordinates of
1SNP      T C              C/T
rs6399140
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22854925fB3gnt2 : Intron
Gm28048 : within coordinates of
1SNP      C A              A/C
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs6399536
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22854940fB3gnt2 : Intron
Gm28048 : within coordinates of
1SNP      A T              A/T
rs6400128
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22855077fB3gnt2 : Intron
Gm28048 : within coordinates of
1SNP      T C              C/T
rs6400130
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22855080fB3gnt2 : Intron
Gm28048 : within coordinates of
4SNP TT   T CC   T    C    C/T
rs29424632
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22855287fB3gnt2 : Intron
Gm28048 : within coordinates of
3SNP CC   C  T   C    T    C/T
rs26858666
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22855685fB3gnt2 : Intron
Gm28048 : within coordinates of
4SNPGGG GTGG TTGGG  G T GGGG/T
rs50799944
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22856307fB3gnt2 : Intron
Gm28048 : within coordinates of
2SNP         T   T    T    T
rs29403899
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22856562fB3gnt2 : Intron
Gm28048 : within coordinates of
2SNP AA      C             A/C
rs26858665
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22858192fB3gnt2 : Intron
Gm28048 : within coordinates of
3SNPCCCTCTCC TTCCC  C T CCCC/T
rs226792709
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22858809fB3gnt2 : Intron
Gm28048 : within coordinates of
1SNP             A    C    A/C
rs250220546
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22861077f9130230N09Rik : within coordinates of
B3gnt2 : Locus-Region
Gm28048 : within coordinates of
1SNP             T    A    A/T
rs29405071
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22862187fB3gnt2 : Locus-Region
Gm28048 : within coordinates of
3SNPAAA   A  T   A    T    A/T
rs220710722
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22862727fB3gnt2 : 1766 bp upstream of
Gm28048 : within coordinates of
1SNP             C    T    C/T
rs29398504
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22862817fB3gnt2 : 1856 bp upstream of
Gm28048 : within coordinates of
2SNP TT   T  C   C    C    C/T
rs47524550
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr11:22862840fB3gnt2 : 1879 bp upstream of
Gm28048 : within coordinates of
2SNP AA      G   A    G    A/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
09/09/2014
MGI 5.19
The Jackson Laboratory