About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Trpm5
transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 5
MGI:1861718

141 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs250418464
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143067496fCd81 : mRNA-UTR
Trpm5 : 1657 bp downstream of
Tssc4 : Locus-Region
1SNP             G  T   G/T
rs255503047
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143067499fCd81 : mRNA-UTR
Trpm5 : 1654 bp downstream of
Tssc4 : Locus-Region
1SNP             T  G   G/T
rs218421423
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143068045fCd81 : Intron
Trpm5 : 1108 bp downstream of
Tssc4 : Locus-Region
1SNP             C  T   C/T
rs238414160
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143068087fCd81 : Intron
Trpm5 : 1066 bp downstream of
Tssc4 : Locus-Region
1SNP             T  C   C/T
rs257933099
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143068188fCd81 : Intron
Trpm5 : 965 bp downstream of
Tssc4 : Locus-Region
1SNP             A  G   A/G
rs225384040
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143068194fCd81 : Intron
Trpm5 : 959 bp downstream of
Tssc4 : Locus-Region
1SNP             A  G   A/G
rs243728590
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143068702fTrpm5 : 451 bp downstream of
Tssc4 : Locus-Region
1SNP             C  T   C/T
rs265427567
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143068792fTrpm5 : 361 bp downstream of
Tssc4 : Locus-Region
1SNP             C  T   C/T
rs232158109
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143068994fTrpm5 : 159 bp downstream of
Tssc4 : Locus-Region
1SNP             C  T   C/T
rs258983212
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143069149fTrpm5 : 4 bp downstream of
Tssc4 : Locus-Region
1SNP             G  C   C/G
rs217212715
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143069157fTrpm5 : within coordinates of
Tssc4 : Locus-Region
1SNP             C  A   A/C
rs33825563
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143069199fTrpm5 : within coordinates of
Tssc4 : Locus-Region
1SNPA AAAA   AA A AA AAGA/G
rs223398082
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143069290fTrpm5 : within coordinates of
Tssc4 : Locus-Region
1SNP             A  T   A/T
rs243008321
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143069317fTrpm5 : within coordinates of
Tssc4 : Locus-Region
1SNP             T  C   C/T
rs213621119
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143069751fTrpm5 : within coordinates of
Tssc4 : Intron
1SNP             A  G   A/G
rs239006176
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143070953fTrpm5 : within coordinates of
Tssc4 : mRNA-UTR
1SNP             A  G   A/G
rs258703326
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143070973fTrpm5 : within coordinates of
Tssc4 : mRNA-UTR
1SNP             A  G   A/G
rs217294859
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143070993fTrpm5 : within coordinates of
Tssc4 : mRNA-UTR
1SNP             A  C   A/C
rs239643633
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143071096fTrpm5 : Locus-Region
Tssc4 : Locus-Region
1SNP             T  G   G/T
rs255448949
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143071327fTrpm5 : Locus-Region
Tssc4 : Locus-Region
1SNP             A  G   A/G
rs33826705
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143071422fTrpm5 : Locus-Region
Tssc4 : Locus-Region
2SNP  AAAA G AA AGAAAAGAA/G
rs230998373
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143071599fTrpm5 : mRNA-UTR1SNP             G  A   A/G
rs251507632
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143071732fTrpm5 : mRNA-UTR1SNP             G  A   A/G
rs223811342
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143072042fTrpm5 : mRNA-UTR1SNP             G  A   A/G
rs248440224
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143072419fTrpm5 : Coding-NonSynonymous1SNP             G  A   A/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs263001170
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143072588fTrpm5 : Intron1SNP             T  C   C/T
rs224810136
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143072628fTrpm5 : Intron1SNP             T  C   C/T
rs240578484
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143072848fTrpm5 : Intron1SNP             G  C   C/G
rs259643211
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143072894fTrpm5 : Intron1SNP             T  C   C/T
rs223337870
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143073143fTrpm5 : Intron1SNP             C  T   C/T
rs242950944
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143073250fTrpm5 : Intron1SNP             C  T   C/T
rs255290911
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143073345fTrpm5 : Intron1SNP             T  C   C/T
rs33826708
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143073524fTrpm5 : Intron2SNPC CCCC C C TCTCCCCTCC/T
rs33826711
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143073676fTrpm5 : Intron1SNPG GGGG G GGGG GG AGGA/G
rs257250673
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143073736fTrpm5 : Intron1SNP             C  T   C/T
rs216740621
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143073945fTrpm5 : Intron1SNP             T  C   C/T
rs242194697
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143074193fTrpm5 : Intron1SNP             A  G   A/G
rs248932958
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143074202fTrpm5 : Intron1SNP             G  A   A/G
rs212241029
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143074203fTrpm5 : Intron1SNP             T  C   C/T
rs230911238
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143074347fTrpm5 : Intron1SNP             T  C   C/T
rs251452726
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143074362fTrpm5 : Intron1SNP             C  T   C/T
rs223493119
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143074395fTrpm5 : Intron1SNP             T  G   G/T
rs33827624
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143074438fTrpm5 : Coding-Synonymous2SNPA AAAA G AAGAGAAA GAA/G
rs263575590
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143074704fTrpm5 : Intron1SNP             C  G   C/G
rs224620819
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143074794fTrpm5 : Intron1SNP             C  G   C/G
rs240514467
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143074831fTrpm5 : Intron1SNP             C  T   C/T
rs259580661
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143075138fTrpm5 : Intron1SNP             C  T   C/T
rs217754098
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143075157fTrpm5 : Intron1SNP             A  G   A/G
rs236490436
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143075701fTrpm5 : Intron1SNP             C  A   A/C
rs262292612
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143075891fTrpm5 : Intron1SNP             G  A   A/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs231048131
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143075892fTrpm5 : Intron1SNP             C  T   C/T
rs252209215
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143075985fTrpm5 : Intron1SNP             G  T   G/T
rs265708995
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143076038fTrpm5 : Intron1SNP             C  T   C/T
rs228559077
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143076062fTrpm5 : Intron1SNP             T  C   C/T
rs248871807
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143076078fTrpm5 : Intron1SNP             C  T   C/T
rs212178032
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143076098fTrpm5 : Intron1SNP             A  G   A/G
rs230828121
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143076147fTrpm5 : Intron1SNP             T  C   C/T
rs245184404
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143076372fTrpm5 : Intron1SNP             A  C   A/C
rs33827627
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143076783fTrpm5 : Intron1SNPG GGGG A G GG GG  GGA/G
rs33827630
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143077045fTrpm5 : Intron1SNPG GGGG A G GG GG  GGA/G
rs33827633
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143077120fTrpm5 : Intron1SNPA AAGA G A AA AA  AAA/G
rs215033710
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143077242fTrpm5 : Intron1SNP             T  G   G/T
rs240328988
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143078597fTrpm5 : Intron1SNP             C  T   C/T
rs33828616
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143078944fTrpm5 : Intron1SNPA AAAA G A AA AA  AAA/G
rs33828619
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143079319fTrpm5 : Intron1SNPC CCCC T CCCC CC  CCC/T
rs259787933
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143079836fTrpm5 : Intron1SNP             G  A   A/G
rs33828622
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143080073fTrpm5 : Intron1SNPC CCCC T CCCC CC  CCC/T
rs218566395
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143080304fTrpm5 : Coding-Synonymous1SNP             T  G   G/T
rs33829445
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143080839fTrpm5 : Intron2SNPG GGGG   GGAGAGGG GGA/G
rs252936264
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143081152fTrpm5 : Intron1SNP             G  A   A/G
rs217698900
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143081154fTrpm5 : Intron1SNP             G  A   A/G
rs236422895
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143081709fTrpm5 : Intron1SNP             C  T   C/T
rs33829448
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143081756fTrpm5 : Coding-Synonymous1SNPG GGGG A GGGG GG  GGA/G
rs33829451
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143082762fTrpm5 : Coding-Synonymous1SNPG GGGG A GGGG GG  GGA/G
rs33830064
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143083005fTrpm5 : Coding-Synonymous1SNPA AAAA G A AA AA AAAA/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs261892878
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143083398fTrpm5 : Intron1SNP             T  C   C/T
rs223195466
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143083402fTrpm5 : Intron1SNP             C  G   C/G
rs33830067
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143083466fTrpm5 : Coding-Synonymous1SNPG GGGG G GGGG GG GAGA/G
rs33830069
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143083729fTrpm5 : Intron1SNPC CCTC C  CCC CC CCCC/T
rs247653983
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143084509fTrpm5 : Intron1SNP             G  T   G/T
rs263528643
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143084510fTrpm5 : Intron1SNP             G  T   G/T
rs228522865
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143084596fTrpm5 : Intron1SNP             G  A   A/G
rs33821926
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143085104fTrpm5 : Intron1SNPC CC C T  CCC  C CCCC/T
rs33821928
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143085348fTrpm5 : Intron1SNP  TTTT T  TTT  T CTTC/T
rs33821931
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143085625fTrpm5 : Intron2SNPG GGGG G  GAGA GGGAGA/G
rs33822844
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143086114fTrpm5 : Intron1SNPC CCCC T  CCC  C CCCC/T
rs33822847
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143086131fTrpm5 : Intron1SNPG GGGG A  GGG GG GGGA/G
rs33822850
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143086171fTrpm5 : Intron1SNPA AAAA G  AAA AA AGAA/G
rs33822853
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143086458fTrpm5 : Intron1SNPA AAAA C  AAA  A A AA/C
rs33823795
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143086707fTrpm5 : Intron1SNPT TTTT A  TTT TT TATA/T
rs33823797
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143086920fTrpm5 : Coding-Synonymous1SNPG GGAG G  GGG  G GGGA/G
rs256072455
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143087189fTrpm5 : Intron1SNP             A  G   A/G
rs33823800
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143087490fTrpm5 : Intron1SNPT TTTT C  TTT TT TCTC/T
rs33823803
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143087528fTrpm5 : Intron2SNPT TTTT C  TCTCTTTTCTC/T
rs250840517
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143087850fTrpm5 : Coding-NonSynonymous1SNP             A  G   A/G
rs33824546
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143088213fTrpm5 : Intron2SNPT TTTT T  TCTCTTTTTTC/T
rs231850735
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143088626fTrpm5 : Intron1SNP             C  T   C/T
rs258591655
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143088812fTrpm5 : Intron1SNP             C  G   C/G
rs218471913
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143088820fTrpm5 : Intron1SNP             T  G   G/T
rs235488710
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143088842fTrpm5 : Intron1SNP             C  T   C/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs248544303
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143088897fTrpm5 : Intron1SNP             A  G   A/G
rs33824548
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143088963fTrpm5 : Coding-Synonymous2SNPC CCCC C  CGCG CCCCCC/G
rs33824551
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143089473fTrpm5 : Intron1SNPA AAGA A   AA  A AAAA/G
rs33825434
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143089828fTrpm5 : Intron1SNPG GGAG G  GGG GG GGGA/G
rs6374947
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143090192fTrpm5 : Intron2SNP      T C    C  T   C/T
rs256814975
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143090202fTrpm5 : Intron1SNP             A  G   A/G
rs33825436
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143090244fTrpm5 : Intron2SNPG GGTG T  GTGTGGGGGGG/T
rs244951033
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143090295fTrpm5 : Intron1SNP             G  A   A/G
rs6388503
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143090384fTrpm5 : Intron1SNP      C T           C/T
rs263261409
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143090423fTrpm5 : Intron1SNP             C  T   C/T
rs33825438
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143090534fTrpm5 : Intron1SNPC CCTC T  CCC CC CCCC/T
rs222559301
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143090554fTrpm5 : Intron1SNP             T  C   C/T
rs33825441
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143090580fTrpm5 : Intron1SNPT TTGT G   TT TT TTTG/T
rs33825443
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143090636fTrpm5 : Intron1SNPC CCTC T  CCC CC CCCC/T
rs33826745
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143090750fTrpm5 : Intron2SNPA AAAA G  AGAGAAAAGAA/G
rs256010147
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143090778fTrpm5 : Intron1SNP             T  C   C/T
rs51334413
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143090958fTrpm5 : Intron2SNP CC          C  C   C
rs33826748
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143091514fTrpm5 : Intron1SNP  CCCC G   CC    CCCC/G
rs246037552
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143091592fTrpm5 : Intron1SNP             G  T   G/T
rs262832299
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143091749fTrpm5 : Intron1SNP             G  A   A/G
rs33826751
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143092025fTrpm5 : Intron1SNPC CCCC T  CCC  C CCCC/T
rs33826753
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143092114fTrpm5 : Intron1SNPC CCCC T  CCC CC CCCC/T
rs232326984
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143092735fTrpm5 : Intron1SNP             T  C   C/T
rs33827925
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143093099fTrpm5 : Intron1SNPG GGTG G GGGG GG GGGG/T
rs33827927
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143093813fTrpm5 : Intron2SNPC CCCC C CCTCTCCCC CC/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs33827929
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143094023fTrpm5 : Intron2SNPG GGGG G GGAGAGGGGGGA/G
rs229484652
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143094223fTrpm5 : Intron1SNP             A  G   A/G
rs33827931
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143094315fTrpm5 : Intron2SNPA AAAA A AAGAGAAAAAAA/G
rs33828984
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143094384fTrpm5 : Intron2SNPA AAAA A AAGAGAAAAAAA/G
rs33828987
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143094474fTrpm5 : Intron1SNP  CCCC C CCCC  C CCTC/T
rs6352107
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143094822fTrpm5 : Locus-Region1SNP      A G           A/G
rs33828990
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143095545fTrpm5 : Locus-Region1SNPT TTTT C TTTT TT TTTC/T
rs33828993
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143095861fTrpm5 : Locus-Region1SNPT TTTT C TTTT TT TTTC/T
rs33829776
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143096003fTrpm5 : Locus-Region2SNPA AAAA A AAGAGAAAAAAA/G
rs33829779
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143096108fTrpm5 : Locus-Region1SNPT TTTT C TTTT TT  TTC/T
rs33823045
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143096302fTrpm5 : Locus-Region2SNPC CCCC C CCACACCCCACA/C
rs33823048
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143096314fTrpm5 : Locus-Region1SNPA AAAA T AAAA  A AAAA/T
rs33823051
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143096342fTrpm5 : Locus-Region1SNPT TTTT C TTTT TT TTTC/T
rs33823814
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143096380fTrpm5 : Locus-Region1SNPC CCCC T CCCC CC CCCC/T
rs214419850
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143096466fTrpm5 : Locus-Region1SNP             G  C   C/G
rs239652325
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr7:143096543fTrpm5 : Locus-Region1SNP             C  T   C/T

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
04/08/2014
MGI 5.17
The Jackson Laboratory