About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Clec7a
C-type lectin domain family 7, member a
MGI:1861431

119 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs36276336
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129459846fClec7a : 1745 bp downstream of
Sndy1 : within coordinates of
3SNPGGTTTT G TGG GGGTGGGG/T
rs36549583
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129459867fClec7a : 1724 bp downstream of
Sndy1 : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCA  CC CACA/C
rs38750739
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129459902fClec7a : 1689 bp downstream of
Sndy1 : within coordinates of
1SNPT TTTT T TTG  TT TGTG/T
rs38485936
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129459925fClec7a : 1666 bp downstream of
Sndy1 : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCG  CC CGCC/G
rs38270072
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129459979fClec7a : 1612 bp downstream of
Sndy1 : within coordinates of
1SNPT TTTT T TTC  TT TCTC/T
rs36519132
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129459989fClec7a : 1602 bp downstream of
Sndy1 : within coordinates of
1SNPG GGGG G GGG  GG GGAA/G
rs36376773
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129460049fClec7a : 1542 bp downstream of
Sndy1 : within coordinates of
1SNPG GGGG G GGC  GG GGGC/G
rs38612892
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129460097fClec7a : 1494 bp downstream of
Sndy1 : within coordinates of
1SNPT TTTT T TTG  TT TTTG/T
rs37782839
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129460136fClec7a : 1455 bp downstream of
Sndy1 : within coordinates of
1SNPA AAAA A AAT  AA AAAA/T
rs36839343
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129460172fClec7a : 1419 bp downstream of
Sndy1 : within coordinates of
1SNPT TTTT T TTC  TT TTTC/T
rs36859733
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129460322fClec7a : 1269 bp downstream of
Sndy1 : within coordinates of
1SNPG GGGG G GGG  GA AGGA/G
rs6296589
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129460333fClec7a : 1258 bp downstream of
Sndy1 : within coordinates of
2SNPA AAAAAGGAAG  AA AGAA/G
rs6296667
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129460385fClec7a : 1206 bp downstream of
Sndy1 : within coordinates of
2SNPA AAAAACCAAC  AA ACAA/C
rs6296718
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129460417fClec7a : 1174 bp downstream of
Sndy1 : within coordinates of
2SNPT TTTTTCCTTC  TT TTTC/T
rs36647735
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129460631fClec7a : 960 bp downstream of
Sndy1 : within coordinates of
1SNPC CCCC T CCCC CC CCCC/T
rs6311861
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129460835fClec7a : 756 bp downstream of
Sndy1 : within coordinates of
1SNP      C G           C/G
rs6311889
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129460854fClec7a : 737 bp downstream of
Sndy1 : within coordinates of
2SNPA AAAAAGGAAG  AA AGAA/G
rs37062134
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129461297fClec7a : Locus-Region
Sndy1 : within coordinates of
1SNPG GGGG G GGGG GG GTGG/T
rs3689020
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129461312fClec7a : Locus-Region
Sndy1 : within coordinates of
5SNPGGTTTTGG TGGGGGGTGGGG/T
rs36818272
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129461424fClec7a : Locus-Region
Sndy1 : within coordinates of
1SNPC CCCC A CCAC CC CACA/C
rs36444878
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129461485fClec7a : Locus-Region
Sndy1 : within coordinates of
1SNPT TTTT C TTC  TT TCTC/T
rs36829705
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129461691fClec7a : mRNA-UTR
Sndy1 : within coordinates of
1SNPA AAAA T AAT  AA ATAA/T
rs37049918
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129461727fClec7a : mRNA-UTR
Sndy1 : within coordinates of
1SNPT TTTT C TTCC TT TCTC/T
rs37912722
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129461809fClec7a : mRNA-UTR
Sndy1 : within coordinates of
1SNPA AAAA G AAA  AA AAAA/G
rs36494122
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129461859fClec7a : mRNA-UTR
Sndy1 : within coordinates of
1SNPC CCCC T CCT  CC CTCC/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs36846576
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129461945fClec7a : mRNA-UTR
Sndy1 : within coordinates of
1SNPC CCCC T CCC  CC CCCC/T
rs39431859
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129462151fClec7a : mRNA-UTR
Sndy1 : within coordinates of
1SNPG GGGG G GCG  GG GGGC/G
rs36532247
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129462225fClec7a : mRNA-UTR
Sndy1 : within coordinates of
3SNPC TTTT C TCC CCCTCCCC/T
rs36637447
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129462282fClec7a : mRNA-UTR
Sndy1 : within coordinates of
1SNPG GGGG A GGAG GG GAGA/G
rs37546153
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129462301fClec7a : mRNA-UTR
Sndy1 : within coordinates of
1SNPA AAAA C AACA AA ACAA/C
rs38211074
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129462759fClec7a : mRNA-UTR
Sndy1 : within coordinates of
1SNPG GGGG T GGTG GG GTGG/T
rs36864334
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129462870fClec7a : mRNA-UTR
Sndy1 : within coordinates of
1SNPA AAAA C AACA AA ACAA/C
rs36594704
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129462904fClec7a : mRNA-UTR
Sndy1 : within coordinates of
1SNPT TTTT C TT   TT TCTC/T
rs38642502
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129462906fClec7a : mRNA-UTR
Sndy1 : within coordinates of
1SNPC CCCC   CCT  CC CTCC/T
rs36547478
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129463147fClec7a : Coding-NonSynonymous
Sndy1 : within coordinates of
3SNPG AAAA G AGG GGGAGGGA/G
rs39048356
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129463182fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
1SNPT TTTT C TTC  TT TCTC/T
rs265678074
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129463216fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
1SNP             T  G   G/T
rs38741495
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129463246fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
3SNPA CCCC A CAA AAACAAAA/C
rs36605823
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129463287fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
1SNP  GG G A GGA  GG GAGA/G
rs37770239
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129463459fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
1SNPG GGGG A GGGG GG GGGA/G
rs36635506
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129463546fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
1SNPG GGGG A GGA  GG GAGA/G
rs37057001
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129463565fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
1SNPG GGGG A GGA  GG GAGA/G
rs40502775
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129463602fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
1SNPC CCCC   CCT  CC C CC/T
rs36382870
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129463622fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
1SNPT TTTT C TTC  TT T TC/T
rs37753313
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129463668fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
1SNPC CCC  C C T  CC CCCC/T
rs38773815
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129463700fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
1SNPA AAAA G AAG  AA AGAA/G
rs40296011
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129463730fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
3SNPTTGGGG G GTG TTGGGGTG/T
rs38088352
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129463768fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
1SNPA AAAA G AAGA AA AGAA/G
rs39822625
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129463778fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
1SNPA AAAA A AAA  AT TAAA/T
rs37560818
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129463847fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
1SNPA AAAA G AAG  AA AGAA/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs47559368
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129463883fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
2SNP GA          G  A   A/G
rs36525456
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129463922fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
3SNPGGAAAA G AGGGGGGAGGGA/G
rs38878263
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129463995fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
1SNPT TTTT G TTGT TT TGTG/T
rs243880281
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129464474fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
1SNP             G  C   C/G
rs30707419
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129465359fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
3SNP GA   G      G  A   A/G
rs235838017
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129465634fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
1SNP             T  C   C/T
rs259770804
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129465641fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
1SNP             C  T   C/T
rs216486777
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129465673fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
1SNP             A  G   A/G
rs237690466
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129465746fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
1SNP             T  C   C/T
rs262301761
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129465800fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
1SNP             A  G   A/G
rs219100174
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129465832fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
1SNP             C  T   C/T
rs236327504
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129465845fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
1SNP             C  G   C/G
rs248162283
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129465877fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
1SNP             T  C   C/T
rs222702088
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129465891fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
1SNP             A  G   A/G
rs240793233
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129465905fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
1SNP             C  T   C/T
rs263532581
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129465947fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
1SNP             G  A   A/G
rs231964438
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129466082fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
1SNP             A  T   A/T
rs47287816
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129466174fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
2SNP         C   T  C   C/T
rs49576491
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129466189fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
2SNP         T   A  T   A/T
rs45931511
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129466192fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
2SNP         T   C  T   C/T
rs49546836
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129466343fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
2SNP         C   T  C   C/T
rs49418658
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129466397fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
2SNP         G   A  G   A/G
rs48439187
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129466556fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
2SNP A       G   A  G   A/G
rs48281061
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129466698fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
2SNP AG      G   A  G   A/G
rs49573533
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129466724fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
2SNP GA      A   G  A   A/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs48930274
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129466781fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
2SNP GC      C   G  C   C/G
rs52508634
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129466883fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
2SNP  A      A   G  A   A/G
rs52512222
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129466890fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
2SNP CT      T   C  T   C/T
rs52449356
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129466902fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
2SNP AG      G   A  G   A/G
rs108456013
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129466929fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
2SNP TA      A   T  A   A/T
rs51127060
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129467071fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
2SNP TC      C   T  C   C/T
rs52442089
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129467116fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
2SNP CT      T   C  T   C/T
rs49712188
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129467242fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
2SNP  G      G   A  G   A/G
rs50636573
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129467319fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
2SNP CA      A   C  A   A/C
rs51973096
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129467384fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
2SNP AT      T   A  T   A/T
rs48328065
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129467402fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
2SNP AC      C   A  C   A/C
rs46386811
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129467426fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
2SNP TC          T  C   C/T
rs48834153
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129467474fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
2SNP AG          A  G   A/G
rs261364304
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129467654fClec7a : Coding-NonSynonymous
Sndy1 : within coordinates of
1SNP             G  A   A/G
rs50248521
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129467689fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
2SNP AG          A  G   A/G
rs48781012
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129467790fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
2SNP AT          A  T   A/T
rs51861797
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129467942fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
2SNP GA      A   G  A   A/G
rs30516423
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129468593fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
3SNP  A   G      G  A   A/G
rs29971827
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129468764fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
3SNP AG   A      A  G   A/G
rs30117984
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129468995fClec7a : Coding-NonSynonymous
Sndy1 : within coordinates of
3SNP AG   A  G   A  G   A/G
rs30607922
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129469169fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
3SNP CG   C  G   C  G   C/G
rs30369179
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129469309fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
3SNP AT   A  T   A  T   A/T
rs29926528
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129469831fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
2SNP GA   G  A          A/G
rs49839338
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129470921fClec7a : Coding-Synonymous
Sndy1 : within coordinates of
1SNP   C C A            A/C
rs30165339
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129470991fClec7a : Coding-NonSynonymous
Sndy1 : within coordinates of
3SNP  C   T      T  C   C/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs30315115
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129471448fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
2SNPTTC   T             C/T
rs45976474
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129471567fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
1SNP             T  G   G/T
rs48371985
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129471776fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
2SNP GA          G  A   A/G
rs46649264
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129472079fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
2SNP CT          C  T   C/T
rs46526967
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129472175fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
2SNP CT          C  T   C/T
rs49940505
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129472208fClec7a : Intron
Sndy1 : within coordinates of
2SNP CT          C  T   C/T
rs46997137
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129472764fClec7a : mRNA-UTR
Sndy1 : within coordinates of
2SNP CG          C  G   C/G
rs50593280
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129472786fClec7a : Locus-Region
Sndy1 : within coordinates of
2SNP TC          T  C   C/T
rs30226460
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129473251fClec7a : Locus-Region
Sndy1 : within coordinates of
3SNPCCT          C  T   C/T
rs49382164
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129473436fClec7a : Locus-Region
Sndy1 : within coordinates of
1SNPG GGGG G GGAG GG G GA/G
rs50649236
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129473796fClec7a : Locus-Region
Sndy1 : within coordinates of
1SNPT TTTT   TTAT T  A TA/T
rs48898455
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129473905fClec7a : Locus-Region
Sndy1 : within coordinates of
1SNPC CCCC T CCTC CC C CC/T
rs30705612
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129473998fClec7a : Locus-Region
Sndy1 : within coordinates of
4SNPTTAAAATA ATATTTAAAA A/T
rs50316159
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129474009fClec7a : Locus-Region
Sndy1 : within coordinates of
1SNPC CCCC T CCTC CC C CC/T
rs30325420
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129474093fClec7a : Locus-Region
Sndy1 : within coordinates of
4SNPCCGGGGCC GCCCCCCGCCCC/G
rs46289463
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129474286fClec7a : Locus-Region
Sndy1 : within coordinates of
1SNPC CCCC T CCCC CT TCCC/T
rs49933184
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129474348fClec7a : Locus-Region
Sndy1 : within coordinates of
1SNPT TTTT C TTTT TT TTTC/T
rs50228564
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129474456fClec7a : Locus-Region
Sndy1 : within coordinates of
1SNPA AAAA G AAAA AA AAAA/G
rs49834108
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:129474629fClec7a : Locus-Region
Sndy1 : within coordinates of
1SNPC CCCC T CCCC CC CCCC/T

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
07/15/2014
MGI 5.18
The Jackson Laboratory