About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Cacna1f
calcium channel, voltage-dependent, alpha 1F subunit
MGI:1859639

150 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 142)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs33354441
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7605584f 1SNPA  ATAAT  AT AAA    A/T
rs33354443
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7605586f 1SNPTC TTTT CCT  TTT    C/T
rs33355336
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7606275f 1SNPAG AAAAAGGAA AAA    A/G
rs226914365
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7606407f 1SNP                 TG G/T
rs243787608
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7606492f 1SNP                 GA A/G
rs33355339
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7606979f 1SNPAG AAAAAGGAA AAA    A/G
rs33355342
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7607249f 1SNPTC TTTTTCCTT TTT    C/T
rs33356185
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7607272f 1SNPAG  A   GG   A      A/G
rs33356188
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7607496f 1SNPCG CCCCCGGCCCCCC    C/G
rs33356191
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7607558f 1SNPTC TTTTTCCTTTTTT    C/T
rs33356193
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7607666f 1SNPCT CCCCCCCCCCCCC    C/T
rs213109464
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7608056f 1SNP                 GA A/G
rs239761740
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7608082f 1SNP                 AG A/G
rs33357076
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7608325f 1SNPGA GGGGGGGGG GGG    A/G
rs259011253
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7608588f 1SNP                 AC A/C
rs33357078
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7608753f 1SNPTC TTTT CCTTTTTT    C/T
rs33357080
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7610392f 2SNPTA TTTTTAATT TTT AT A/T
rs33357082
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7610405f 1SNPCC CCCCCCTC  CC     C/T
rs33357994
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7610661f 1SNPCT CCCCCCCCC CCC    C/T
rs33357996
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7610739f 1SNPGG GAGGAGGG  GGG    A/G
rs33357999
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7611239f 1SNPTC TTTTTTTTT TTT    C/T
rs33358002
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7611273f 1SNPCC CCCCCTCCC CCC    C/T
rs33358915
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7611358f 1SNPTG TTTTTGGTTTTTT    G/T
rs33358918
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7611762f 1SNPCA CCCCCAACCCCCC    A/C
rs33358920
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7612450f 1SNPCT CCCCCCCCCCCCC    C/T
SNP ID
(dbSNP Build 142)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs239610531
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7613325f 1SNP                 AC A/C
rs33358923
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7613830f 1SNPAC AAAAAAAAA AAA    A/C
rs33359786
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7613863f 1SNPGG GGGGGAAGG GGG    A/G
rs33359788
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7614011f 1SNPGG GGGGGAAGGGGGG    A/G
rs33359791
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7614100f 1SNPGG GGGGGAAGGGGGG    A/G
rs33360524
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7614183f 1SNPGG GGGGGAAGGGGGG    A/G
rs259064482
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7614466f 1SNP                 CT C/T
rs33360527
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7614767f 1SNPGG GGGGGAAGG GGG    A/G
rs33360530
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7614806f 1SNPGA GGGGGGGGG GGG    A/G
rs219370356
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7614871f 1SNP                 TC C/T
rs33360532
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7615068f 1SNPAG AAAAAAAAA AAA    A/G
rs33361454
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7615099f 1SNPTC TTTTTCCTTTTTT    C/T
rs232067834
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7615501f 1SNP                 TG G/T
rs33361457
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7615535f 1SNPAG AAAAAAAAAAAAA    A/G
rs248074611
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7615619f 1SNP                 GT G/T
rs33354294
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7616207f 1SNPTC TTTTTCCTTTTTT    C/T
rs218585491
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7616386f 1SNP                 CT C/T
rs247293007
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7616467f 1SNP                 TC C/T
rs33354297
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7616683f 1SNPAC AAAAAAAAAAAAA    A/C
rs33354300
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7616864f 1SNPCT CCCCCCCCCCCCC    C/T
rs33354303
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7617468f 2SNPGA GGGGGAAGGGGGG AG A/G
rs33355126
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7617535f 1SNPTC TTTTTTTTTTTTT    C/T
rs33355129
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7617716f 1SNPG  GGGGGAAGGGGGG    A/G
rs33355131
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7617941f 1SNPGA GGGGGGGGGGGGG    A/G
rs47756306
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7618251f 2SNP                AGA A/G
SNP ID
(dbSNP Build 142)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs33355984
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7618529f 1SNPTT TTTTTGGTTTTTT    G/T
rs33355987
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7618565f 1SNPGA GGGGGGGGGGGGG    A/G
rs33355990
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7618660f 1SNPGA GGGGGAAGGGGGG    A/G
rs33355993
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7618695f 1SNPGT GGGGGTTGGGGGG    G/T
rs33356766
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7619268f 1SNPTT TTTTTCCTTTTTT    C/T
rs249223714
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7619277f 1SNP                 AG A/G
rs33356769
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7619345f 2SNPTC TCTTCCCTCTTTC CT C/T
rs33356772
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7619382f 2SNPTA TATTAAATATTTA AT A/T
rs33357525
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7619432f 1SNPAA AAAAAGGAAAAAA    A/G
rs33357528
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7619454f 1SNPGG GGGGGAAGGGGGG    A/G
rs33357531
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7619658f 1SNPAA AAAAACCAAAAAA    A/C
rs33358304
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7619664f 1SNPAC AAAAAC AAAAAA    A/C
rs33358307
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7619982f 1SNPCC CCCCCTTCCCCCC    C/T
rs33358310
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7620414f 1SNPAT AAAAAAAAAAAAA    A/T
rs33358313
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7620727f 1SNPTC TTTTTCCTTTTTT    C/T
rs33359056
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7621107f 1SNPCA CCCCCCCCCCCCC    A/C
rs33359059
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7621139f 1SNPGA GGGGGGGGGGGGG    A/G
rs33359062
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7621224f 1SNPGG GGGGGAAGGGGGG    A/G
rs33359964
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7621299f 1SNPTC TTTTTCCTTTTTT    C/T
rs33359967
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7621579f 1SNPCC CCCCCAACCCCC     A/C
rs33359970
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7621733f 1SNPTC TTTTTCCTTTTTT    C/T
rs33359972
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7621794f 1SNPCC CCCCCCTCCCCCC    C/T
rs33360984
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7622065f 1SNPGG GGGGGAAGG GGG    A/G
rs33360986
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7622252f 1SNPTT TTTT GGTT TTT    G/T
rs33360988
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7622568f 1SNPA   A    GA  A      A/G
SNP ID
(dbSNP Build 142)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs243916313
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7622694f 1SNP                 CT C/T
rs257131515
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7622750f 1SNP                 GA A/G
rs33360991
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7622888f 1SNPA  AAAAA GAA AAA    A/G
rs33360993
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7623475f 1SNPCC CC CCTTCC CCC    C/T
rs33361905
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7623616f 1SNPG  GGGGG AGG GGG    A/G
rs33354376
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7623633f 1SNPCC CCCC  TCC CCC    C/T
rs33354379
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7623646f 1SNPGA GGGG  AG  GGG    A/G
rs33354381
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7624029f 1SNPTC TTTTTCCTT TTT    C/T
rs234418570
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7624140f 1SNP                 TG G/T
rs254957986
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7624433f 1SNP                 TC C/T
rs33354383
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7624681f 1SNPGG GGGGGAAGG GGG    A/G
rs33355285
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7624703f 1SNPCT CCCCCCCCC CCC    C/T
rs33355288
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7625644f 1SNPCT CCCCC TCC CCC    C/T
rs33355291
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7625854f 1SNPAC AA A CCA  AAA    A/C
rs218832633
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7625985f 1SNP                 AC A/C
rs33356124
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7626101f 1SNPGG GGGGGCCGG GGG    C/G
rs33356126
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7626246f 1SNPCC CC CCGGCC CCC    C/G
rs33356128
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7626334f 1SNPGG GGGGGTTGG GGG    G/T
rs33356130
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7626546f 1SNPCC CCCCCTTCC CCC    C/T
rs33356133
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7626787f 1SNPCC CCCCC ACC CCC    A/C
rs33357046
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7626811f 1SNPTT TTTT GGTT TTT    G/T
rs33357049
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7626841f 1SNPAG AAAAAGGAA AAA    A/G
rs33357052
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7627318f 1SNPCC CCCCCTTCC CCC    C/T
rs33357825
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7627420f 1SNPTT TT TTCCTT TTT    C/T
rs237622332
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7627520f 1SNP                 TC C/T
SNP ID
(dbSNP Build 142)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs33357828
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7627857f 1SNPCC CCCCC TCC CCC    C/T
rs33357831
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7628071f 1SNPCT CCCC TTCC CCC    C/T
rs33357833
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7628116f 2SNPT  TT T CCTT TTT CT C/T
rs33358566
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7628207f 1SNPG  GGGGGAAGG GGG    A/G
rs213316811
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7628213f 1SNP                 CT C/T
rs33358569
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7628736f 1SNPCT CCCCCCCCC CCC    C/T
rs33358572
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7628770f 1SNPGG GGGGGAAGG GGG    A/G
rs33359554
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7628835f 1SNPTG TTTTTTTTT TTT    G/T
rs33359557
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7629008f 1SNPTT TTTTTCCT  TTT    C/T
rs231834916
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7629180f 1SNP                 GA A/G
rs248186235
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7629257f 1SNP                 AG A/G
rs33869984
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7629386r 1SNPC T   C         C   C/T
rs33359560
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7629499f 1SNPAA AAAAATTAA AAA    A/T
rs33359562
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7629544f 1SNPCT CCCCC TCC CCC    C/T
rs221444141
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7630066f 1SNP                 CT C/T
rs33360474
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7630107f 1SNPGG GG G CCGG GGG    C/G
rs241975614
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7630553f 1SNP                 GC C/G
rs33360477
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7630605f 1SNPCC CCCCC TCC CCC    C/T
rs33360480
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7630606f 1SNPGA GGGGG GGG GGG    A/G
rs260764630
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7630625f 1SNP                 TC C/T
rs33360483
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7630953f 1SNPGG GGGGGAAGG GGG    A/G
rs33361236
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7631317f 1SNP         A   G      A/G
rs33361239
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7631344f 2SNPAG AAAAA GAA AAA GA A/G
rs33361241
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7631565f 2SNPAA AAAAAGGAA AAA   GA/G
rs33356075
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7631765f 1SNPCC CC CCCACC CCC    A/C
SNP ID
(dbSNP Build 142)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs51044829
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7631872f 1SNP      A            GA/G
rs33356078
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7631886f 3SNPAG AAAAAGGAA AAG GAGA/G
rs33356081
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7631909f 2SNPGA GGGG AAG  GGG   AA/G
rs257704194
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7631946f 1SNP                 AG A/G
rs220393231
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7631949f 1SNP                 GA A/G
rs33356954
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7632327f 1SNPAG AAAAAAAAA AAA    A/G
rs33356957
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7632357f 1SNPCT CCCCCCCCC CCC    C/T
rs237244380
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7632654f 1SNP                 CT C/T
rs33356960
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7632813f 1SNPGG GGGGG AG  GGG    A/G
rs33356963
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7633187f 1SNPAG AAAAAAAAA AA     A/G
rs257164901
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7633243f 1SNP                 TC C/T
rs33357706
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7633283f 1SNPAC AAAAAAAAA AA     A/C
rs233433472
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7633472f 1SNP                 CT C/T
rs33357709
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7634548f 1SNPCC CCCCCTTCC CCC    C/T
rs33357712
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7634715f 1SNPTC TTTTTCCTT TT     C/T
rs33358385
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7635031f 1SNPCC CTCCT CC  CC     C/T
rs33358388
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7635047f 1SNPTC TTTTTCCTT TT     C/T
rs33358391
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7635211f 1SNPTC TTTTTTTTT TT     C/T
rs260484337
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7635493f 1SNP                 GA A/G
rs33359224
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7635502f 1SNPCC CCCCCTTCC CC     C/T
rs33359226
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7635542f 1SNPGG GGGGGAAGG GG     A/G
rs263291656
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7635783f 1SNP                 TG G/T
rs33359229
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7635923f 2SNPGG GAGGAGGGA GG  AG A/G
rs33359232
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7636815f 1SNPGG GGGGGAAGG GGG    A/G
rs245816793
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7636941f 1SNP                 AG A/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
05/17/2016
MGI 6.03
The Jackson Laboratory