About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
Genome Coordinate Discrepancy
The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details).
 Symbol
Name
ID
Prok2
prokineticin 2
MGI:1354178

80 matching SNPs displayed


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs31222681
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99659319fProk2 : Locus-Region1SNPA AAAA   G AAGA       A          A      A G    A A/G
rs31222683
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99659350fProk2 : Locus-Region1SNPG GGGG   A GGAG       G          G      G A    G A/G
rs31223515
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99659861fProk2 : Locus-Region1SNPA AAAA   G AAGA       A          A      A G    A A/G
rs31223517
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99660010fProk2 : Locus-Region1SNPG GGGG   G GGAG       G          G      G G    G A/G
rs31223519
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99660062fProk2 : Locus-Region1SNPC CCCC   C CCAC       C          C      C C    C A/C
rs31223521
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99660162fProk2 : Locus-Region1SNP   CC      C TC                         C      C C/T
rs31223523
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99660190fProk2 : Locus-Region1SNPT TTTT   T TTTT       T          T      T C    T C/T
rs31224395
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99660199fProk2 : Locus-Region1SNPC CCCC   C CCTC       C          C      C C    C C/T
rs31224397
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99660451fProk2 : Locus-Region1SNPC CCCC   C CCCC       C          C      C T    C C/T
rs31224399
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99660457fProk2 : Locus-Region1SNPT TTTT   T TTCT       T          T      T      T C/T
rs31224401
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99660505fProk2 : Locus-Region1SNPT TTTT   T TTGT       T          T      T G    T G/T
rs31224403
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99660536fProk2 : Locus-Region1SNPA AAAA   A AAAA       A          A      A G    A A/G
rs31225225
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99660613fProk2 : Locus-Region1SNPC CCCC   C CCAC       C          C      C C    C A/C
rs31225227
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99660633fProk2 : Locus-Region1SNPG GGGG   G GGAG       G          G      G A    G A/G
rs31225229
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99660662fProk2 : Locus-Region1SNPT TTTT   T TTCT       T          T      T C    T C/T
rs31225231
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99660737fProk2 : Locus-Region1SNPA AAAA   A AAGA       A          A      A G    A A/G
rs31225233
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99660989fProk2 : Locus-Region1SNPA AAAA   A AAGA       A          A      A      A A/G
rs31226125
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99661053fProk2 : Locus-Region1SNPG GGGG   G GGAG       G          G      G G    G A/G
rs31226127
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99661269fProk2 : Locus-Region1SNPC CCCC   C CCAC       C          C      C A    C A/C
rs31226129
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99661292fProk2 : Locus-Region1SNPG GGGG   G GGAG       G          G      G G    G A/G
rs31226131
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99661434fProk2 : mRNA-UTR1SNPT TTTT   T TTGT       T          T      T G    T G/T
rs31226133
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99661487fProk2 : mRNA-UTR1SNPT TTTT   T TTAT       T          T      T A    T A/T
rs31226955
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99661503fProk2 : mRNA-UTR1SNPG GGGG   G GGAG       G          G      G G    G A/G
rs31226957
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99661627fProk2 : mRNA-UTR1SNPA AAAA   A AACA       A          A      A C    A A/C
rs31226958
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99662034fProk2 : mRNA-UTR1SNPT TTTT   T TTCT       T          T      T C    T C/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs31226959
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99662055fProk2 : mRNA-UTR1SNPT TTTT   T TTGT       T          T      T T    T G/T
rs31226961
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99662133fProk2 : mRNA-UTR1SNP  TTTT   T TTGT       T          T      T T    T G/T
rs31226963
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99662259fProk2 : mRNA-UTR1SNPA AAAA   C AACA       A          A      A C    C A/C
rs31228035
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99662498fProk2 : Intron1SNPC CCCC   C CCCC       C          C      C G    C C/G
rs31228037
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99662528fProk2 : Intron1SNPT TTTT   T TTTT       T          T      T A    T A/T
rs31228039
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99662564fProk2 : Intron1SNPC CCCC   C CCTC       C          C      C C    C C/T
rs31228041
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99662571fProk2 : Intron1SNPC  CCC   C CCCC       C          C      C T    C C/T
rs31220565
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99662853fProk2 : Intron1SNPC CCCC   C CCCC       C          C      C T    C C/T
rs31220567
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99662893fProk2 : Intron1SNPC CCCC   C CCTC       C          C      C C    C C/T
rs31220569
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99663632fProk2 : Intron1SNPC CCCC   T CCCC       C          C      C C    C C/T
rs31220571
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99663735fProk2 : Intron1SNPT TTTT   C TTCT       T          T      T C    T C/T
rs31220573
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99663754fProk2 : Intron1SNPG GGGG   A GGGG       G          G      G G    G A/G
rs31221395
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99663778fProk2 : Intron1SNPG GGGG   C GGCG       G          G      G C    G C/G
rs31221397
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99663853fProk2 : Intron1SNPG GGGG   A GGGG       G          G      G G    G A/G
rs31221399
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99663901fProk2 : Intron1SNPC CCCC   C CCTC       C          C      C C    C C/T
rs31221401
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99663953fProk2 : Intron1SNPT TTTT   T TTCT       T          T      T C    T C/T
rs31221403
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99664192fProk2 : Intron1SNPG GGGG   G GGAG       G          G      G G    G A/G
rs31222334
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99664246fProk2 : Intron1SNPT  T        TCT                  T      T      T C/T
rs31222335
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99664327fProk2 : Intron1SNPC CCCC   C CCGC       C          C      C C    C C/G
rs31222337
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99664377fProk2 : Intron1SNP  GG G   G GGAG                  G      G G    G A/G
rs31222339
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99664696fProk2 : Intron1SNPC CCCC   T CCTC       C          C      C T    C C/T
rs31222341
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99665053fProk2 : Intron1SNPT TTTT   T TTTT       T          T      T C    T C/T
rs31222343
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99665095fProk2 : Intron1SNPC CCCC   C CCTC       C          C      C C    C C/T
rs31223285
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99665198fProk2 : Intron1SNPC CCCC   T CCCC       C          C      C T    C C/T
rs31223287
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99665241fProk2 : Intron1SNPA AAAA   G AAGA       A          A      A G    A A/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs31223289
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99665471fProk2 : Intron1SNPC CCCC   T CCTC       C          C      C T    C C/T
rs31223291
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99665503fProk2 : Intron1SNPA AAAA   G AAGA       A          A      A G    A A/G
rs31223293
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99665673fProk2 : Intron1SNPG GGGG   C GGCG       G          G      G C    G C/G
rs31224075
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99666143fProk2 : Intron1SNPG GGGG   T GGTG       G          G      G T    G G/T
rs29871306
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99666519fProk2 : Intron1SNP GG   A    G                                     A/G
rs31224077
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99666964fProk2 : Intron1SNPA AAAA   C AACA       A          A      A C    A A/C
rs31224079
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99667605fProk2 : Intron1SNPA AAAA   T AATA       A          A      A T    A A/T
rs31224081
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99667643fProk2 : Intron1SNPA AAAA   G AAGA       A          A      A G    A A/G
rs31224083
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99667689fProk2 : Intron1SNPT TTTT   T TTCT       T          T      T T    T C/T
rs31225015
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99667694fProk2 : Intron1SNPG GGGG   G GG G       G          G      G A    G A/G
rs31225017
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99667925fProk2 : Intron1SNPT TTTT   T TTAT       T          T      T T    T A/T
rs31225019
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99667961fProk2 : Intron1SNPC CCCC   C CCTC       C          C      C C    C C/T
rs31225021
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99668068fProk2 : Intron1SNPG GGGG   G GGAG       G          G      G G    G A/G
rs31225022
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99668176fProk2 : Intron1SNPG GGGG   A GGGG       G          G      G      G A/G
rs31225884
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99668180fProk2 : Intron1SNPA AAAA   A AATA       A          A      A A    A A/T
rs31225886
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99668229fProk2 : Intron1SNPC CCCC     CCCC       C          C      C T    C C/T
rs31225888
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99668241fProk2 : Intron1SNPG GGGG   T GGGG       G          G      G T    G G/T
rs31225890
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99668279fProk2 : Intron1SNPG GGGG   G GGTG       G          G      G G    G G/T
rs31225892
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99668290fProk2 : Intron1SNPG GGGG   G GGGG       G          G      G A    G A/G
rs31226744
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99668301fProk2 : Intron1SNPG GGGG   G GGAG       G          G      G G    G A/G
rs31226746
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99668312fProk2 : Intron1SNPC CCCC   C CCTC       C          C      C C    C C/T
rs31226748
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99668416fProk2 : Intron1SNPC CCCC   C CCTC       C          C      C C    C C/T
rs31226750
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99668496fProk2 : Intron1SNPA AAAA   A AAGA       A          A      A A    A A/G
rs31226752
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99668508fProk2 : Intron1SNPC CCCC   T CCCC       C          C      C C    C C/T
rs13478926
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99670496fProk2 : Intron2SNPCCTCCCCCCCCCCCCCCCCCTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC CCCCCCC/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs6248135
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99675699fProk2 : Intron1SNP      A   G                                      A/G
rs6248683
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99675811fProk2 : Intron1SNP      C   T                                      C/T
rs6248715
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99675830fProk2 : Intron1SNP      T   G                                      G/T
rs6248782
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99675868fProk2 : Intron1SNP      A   G                                      A/G
rs6249340
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr6:99675964fProk2 : Intron1SNP      G   C                                      C/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
05/08/2013
MGI 5.13
The Jackson Laboratory