About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Atf4
activating transcription factor 4
MGI:88096

55 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs32406177
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:80253422fAtf4 : Locus-Region
Mief1 : Intron
2SNP  GA AG A/G
rs46605709
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:80253719fAtf4 : Locus-Region
Mief1 : Intron
2SNP GG GAG A/G
rs31744896
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:80253819fAtf4 : Locus-Region
Mief1 : Intron
3SNP TTATAT A/T
rs32034838
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:80253820fAtf4 : Locus-Region
Mief1 : Intron
3SNP TTGTGT G/T
rs32447831
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:80254104fAtf4 : Locus-Region3SNPTTTATAT A/T
rs48397011
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:80254214fAtf4 : Locus-Region2SNP GG GAG A/G
rs52050389
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:80254283fAtf4 : Locus-Region2SNP  T TGT G/T
rs49422351
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:80254517fAtf4 : Locus-Region2SNP  T  CT C/T
rs47988564
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:80254535fAtf4 : Locus-Region2SNP  C  GC C/G
rs48456443
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:80254542fAtf4 : Locus-Region2SNP  T  GT G/T
rs50272336
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:80254664fAtf4 : Locus-Region2SNP  G  AG A/G
rs47146166
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:80254703fAtf4 : Locus-Region2SNP  G  AG A/G
rs46204556
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:80254817fAtf4 : Locus-Region2SNP  G  AG A/G
rs32390553
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:80254822fAtf4 : Locus-Region3SNPC CT TC C/T
rs32047844
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:80254876fAtf4 : Locus-Region3SNPG GA AG A/G
rs32219585
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:80255001fAtf4 : Locus-Region3SNPT TC CT C/T
rs31946363
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:80255021fAtf4 : Locus-Region3SNPA AT TA A/T
rs32145224
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:80255064fAtf4 : Locus-Region3SNPA AG GA A/G
rs32207233
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:80255473fAtf4 : mRNA-UTR3SNPG GA AG A/G
rs31773570
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:80255525fAtf4 : mRNA-UTR3SNP  GA AG A/G
rs13461824
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:80255533fAtf4 : mRNA-UTR3SNP  CT TC C/T
rs50401720
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:80255874fAtf4 : Intron2SNP  C  TC C/T
rs32513687
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:80256128fAtf4 : Intron3SNPA AC CA A/C
rs13461823
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:80256276fAtf4 : mRNA-UTR3SNPG GC CG C/G
rs13461826
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:80257082fAtf4 : Coding-Synonymous2SNP  G  AG A/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs49675324
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:80257676fAtf4 : Intron2SNP TT TGT G/T
rs50549809
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:80257791fAtf4 : Intron2SNP CC CTCCC/T
rs51677483
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:80257971fAtf4 : Intron2SNP  A AGA A/G
rs51478674
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:80258086fAtf4 : 546 bp downstream of1SNP AA A  CA/C
rs46684537
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:80258149fAtf4 : 609 bp downstream of2SNP  T TGTTG/T
rs51381997
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:80258248fAtf4 : 708 bp downstream of1SNP  G G  AA/G
rs47436557
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:80258260fAtf4 : 720 bp downstream of2SNP  T TCTCC/T
rs50814348
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:80258520fAtf4 : 980 bp downstream of2SNP  G GCG C/G
rs46393166
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:80258544fAtf4 : 1004 bp downstream of2SNP  T TGT G/T
rs47636953
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:80258663fAtf4 : 1123 bp downstream of2SNP  G GTG G/T
rs49082747
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:80258672fAtf4 : 1132 bp downstream of2SNP  A ACA A/C
rs50153164
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:80258739fAtf4 : 1199 bp downstream of2SNP  T  CT C/T
rs46460628
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:80258756fAtf4 : 1216 bp downstream of2SNP  T  CT C/T
rs47264093
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:80258763fAtf4 : 1223 bp downstream of2SNP  C  TC C/T
rs50921172
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:80258828fAtf4 : 1288 bp downstream of2SNP  T  AT A/T
rs51234969
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:80258839fAtf4 : 1299 bp downstream of2SNP  A  CA A/C
rs45637445
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:80258887fAtf4 : 1347 bp downstream of1SNP  T     T
rs46231329
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:80258888fAtf4 : 1348 bp downstream of1SNP  A     A
rs49683772
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:80258913fAtf4 : 1373 bp downstream of2SNP  A  CA A/C
rs47398683
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:80258916fAtf4 : 1376 bp downstream of2SNP  C  TC C/T
rs46604518
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:80258949fAtf4 : 1409 bp downstream of2SNP  A  GA A/G
rs48230226
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:80258975fAtf4 : 1435 bp downstream of2SNP  T  CT C/T
rs240080052
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:80259058fAtf4 : 1518 bp downstream of1SNP     AC A/C
rs259008477
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:80259059fAtf4 : 1519 bp downstream of1SNP     AT A/T
rs49851521
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:80259143fAtf4 : 1603 bp downstream of2SNP  C  GC C/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs49184811
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:80259217fAtf4 : 1677 bp downstream of2SNP  T  AT A/T
rs48307584
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:80259228fAtf4 : 1688 bp downstream of2SNP  A  TA A/T
rs47487974
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:80259263fAtf4 : 1723 bp downstream of2SNP  G  AG A/G
rs46325038
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:80259290fAtf4 : 1750 bp downstream of2SNP     GA A/G
rs49714843
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:80259405fAtf4 : 1865 bp downstream of2SNP AA  GA A/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
12/09/2014
MGI 5.20
The Jackson Laboratory