About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
Genome Coordinate Discrepancy
The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details).
 Symbol
Name
ID
Clcn6
chloride channel 6
MGI:1347049

215 matching SNPs displayed


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27631541
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147378619fClcn6 : Locus-Region2SNPTTGTGTG  G TGGT      T        T    TT   T G/T
rs27631540
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147378770fClcn6 : Locus-Region1SNPC CCC    C CCCC      C        C    CC   T C/T
rs32922968
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147378870fClcn6 : Locus-Region1SNP CT   T                                   C/T
rs27631539
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147379273fClcn6 : Locus-Region2SNPA GAGAG  A AGGA      A        A    AA   A A/G
rs27631538
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147379530fClcn6 : Locus-Region1SNPG GGGG   A GGGG      G        G    GG   G A/G
rs27631537
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147379561fClcn6 : Locus-Region2SNPA GAGAG    AGGA      A        A    AA   A A/G
rs27631536
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147379800fClcn6 : Locus-Region2SNPC TCTCT  C CTTC      C        C    CC   C C/T
rs27631535
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147380322fClcn6 : Locus-Region2SNPG AGAGA  G GAAG      G        G    GG   G A/G
rs32035068
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147380824fClcn6 : mRNA-UTR1SNPCCT        C                              C/T
rs27631534
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147381099fClcn6 : Intron2SNPCCTCTC   C CTTC      C        C    CC   C C/T
rs27631533
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147381426fClcn6 : Intron1SNPA TATA   T ATTA      A        A    AA   T A/T
rs27631532
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147381485fClcn6 : Intron1SNPG AGAG   G GAAG      G        G    GG   G A/G
rs27631531
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147382054fClcn6 : Intron1SNPG GGGG   T GGGG      G        G    GG   G G/T
rs27631530
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147382115fClcn6 : Intron1SNPG GAGA   G AGGG      G        G    GG   G A/G
rs27631529
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147382133fClcn6 : Intron1SNPG GGGG   G GGGG      G        G    GG   A A/G
rs27631528
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147382156fClcn6 : Intron1SNPG AGAG   A GAAG               G    GG   G A/G
rs27631527
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147382292fClcn6 : Intron1SNPC TCTC   C CTTC      C        C    CC   C C/T
rs27631526
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147382329fClcn6 : Intron1SNPA GAGA   G AGGA      A        A    AA   G A/G
rs27631525
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147382483fClcn6 : Intron1SNPA  A A   T A AA               A    AA   A A/T
rs27631524
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147382514fClcn6 : Intron1SNPC TCTC   T CTTC      C        C    CC   C C/T
rs27631523
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147382555fClcn6 : Intron1SNPT GTGT   G TGGT      T        T    TT   G G/T
rs27631522
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147382808fClcn6 : Coding-Synonymous1SNPT CTCT   C TCCT      T        T    TT   T C/T
rs27631521
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147382886fClcn6 : Coding-Synonymous1SNPC TCTC   T CTTC      C        C    CC   T C/T
rs27631520
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147383138fClcn6 : Intron2SNPAAGAGAG  G AGGA      A        A    AA   G A/G
rs27631519
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147383173fClcn6 : Intron2SNPCCTCTCT    CTTC      C        C    CC   C C/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27631518
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147383254fClcn6 : Intron1SNPA GAGA   G AGGA      A        A    AA   G A/G
rs27631517
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147383547fClcn6 : Intron1SNPC CCCC   C CCCC      C        C    CC   T C/T
rs27631516
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147383881fClcn6 : Intron1SNPC CCCC   G CCCC      C        C    CC   C C/G
rs27631515
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147383920fClcn6 : Intron2SNPCCGCGCG  C CGGC      C        C    CC   C C/G
rs27631514
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147384065fClcn6 : Intron2SNPAAGAGAG  G AGGA      A        A    AA   A A/G
rs27631513
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147384110fClcn6 : Intron2SNPTTCTCTC  C TCCT      T        T    TT   T C/T
rs27631512
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147384144fClcn6 : Intron1SNPC CC C   T C CC      C        C    CC   C C/T
rs27631511
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147384372fClcn6 : Intron2SNPTTCTCTC  C TCCT      T        T    TT   C C/T
rs27631510
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147384595fClcn6 : Intron2SNPG AGAGA  G GAAG      G        G    GG   G A/G
rs27631509
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147384826fClcn6 : Coding-Synonymous2SNPGGAGAGA  G GAAG      G        G    GG   G A/G
rs27631508
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147384991fClcn6 : Intron2SNPTTCTCTC  C TCCT      T        T    TT   C C/T
rs27631507
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147385014fClcn6 : Intron1SNPC CCCC   C CCCC      C        C    CC   T C/T
rs27631506
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147385131fClcn6 : Coding-Synonymous2SNPGGA A A  G GAA                            A/G
rs27631505
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147385140fClcn6 : Coding-Synonymous2SNPGGAGAGA  G GAAG      G        G    GG   G A/G
rs27631504
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147385684fClcn6 : Intron1SNPG TGTG   G GTTG      G        G    GG   G G/T
rs27631503
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147385891fClcn6 : Intron1SNPC TCT    T CTTC                    CC   C C/T
rs27631502
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147386164fClcn6 : Intron1SNPC T T    T  TTC      C        C    CC   T C/T
rs27631501
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147386195fClcn6 : Intron1SNPG AGAG     GAAG      G        G    GG   G A/G
rs27631500
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147386251fClcn6 : Intron1SNPG AGAG   G GAAG      G        G    GG   G A/G
rs3724091
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147386426fClcn6 : Intron1SNP     AG                                   A/G
rs3724112
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147386430fClcn6 : Intron1SNP     CT                                   C/T
rs3724210
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147386479fClcn6 : Intron2SNPG  GCGC  C GCCG      G        G    GG   G C/G
rs3724728
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147386527fClcn6 : Intron2SNPG CGCGC  C G CG      G        G    GG   C C/G
rs27631499
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147386590fClcn6 : Intron1SNPG GGGG   G GGGG      G        G    GG   A A/G
rs3725349
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147386637fClcn6 : Intron2SNPT A ACA     AAT      T        T    TT     A/C/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27631498
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147386798fClcn6 : Coding-Synonymous1SNPA GAGA   G AGGA      A        A    AA   A A/G
rs27631497
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147386950fClcn6 : Intron1SNPG AGAG   G GAAG      G        G    GG   G A/G
rs27631496
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147387090fClcn6 : Intron1SNPT CTCT   T TCCT      T        T    TT   C C/T
rs27631495
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147387546fClcn6 : Intron2SNPCCACACA  A CAAC      C        C    CC   C A/C
rs27631494
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147387593fClcn6 : Intron1SNPC CCCC   T CCCC      C        C    CC   C C/T
rs27631493
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147387683fClcn6 : Intron1SNPG AGAG   A GAGG      G        G    GG   G A/G
rs27631492
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147387761fClcn6 : Intron1SNPC CTCT   C TCCC      C        C    CC   C C/T
rs27631491
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147387764fClcn6 : Intron1SNPG A A    G GAAG      G        G    GG   G A/G
rs27631490
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147387841fClcn6 : Coding-Synonymous1SNPG AGAG   G GAAG      G        G    GG   G A/G
rs27631489
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147388559fClcn6 : Intron1SNPG C C      GCCG      G        G    GG   G C/G
rs27631488
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147388786fClcn6 : Intron1SNP  CCCC      CTC                           C/T
rs27631487
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147388787fClcn6 : Intron1SNPT AAA      TAAA               T    T      A/T
rs27631486
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147388802fClcn6 : Intron1SNP  GCGC      GGC                           C/G
rs27631485
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147388905fClcn6 : Intron1SNPG AGAG     GAAG      G        G    GG   G A/G
rs27631484
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147389039fClcn6 : Intron1SNPT GTGT     TGGT      T        T    TT   T G/T
rs27631483
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147389334fClcn6 : Intron1SNPA GAGA     AGGA      A        A    AA   A A/G
rs27631482
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147389617fClcn6 : Intron2SNPTTCTCTC    TCCT      T        T    TT   C C/T
rs27631481
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147389768fClcn6 : Intron2SNPG AGAGA    GAAG      G        G    GG   G A/G
rs27631480
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147389914fClcn6 : Intron1SNPT CTCT     TCCT      T        T    TT   T C/T
rs27631479
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147389947fClcn6 : Intron1SNPT CTCT     TCCT      T        T    TT   T C/T
rs27631478
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147389992fClcn6 : Intron1SNPT CTCT     TCCT      T        T    TT   T C/T
rs27631477
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147390190fClcn6 : Intron2SNPCCTCTCT    CTTC      C        C    CC   C C/T
rs3656291
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147390212fClcn6 : Intron3SNPAAGAGAG    AGGA      A        A    AA   G A/G
rs3658252
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147390556fClcn6 : Intron3SNPCCTCTCT    CTTC      C        C    CC   C C/T
rs32378906
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147390735fClcn6 : Intron1SNP  G   G    C                              C/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27631476
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147390911fClcn6 : Intron2SNPTTCTCTC    TCCC      T        T    TC   T C/T
rs27631475
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147391916fClcn6 : Intron2SNPTTCT TC    TCCT      T        T    TT   C C/T
rs13478039
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147392021fClcn6 : Coding-Synonymous3SNPGGAGAGAGGGAGAAGGGGGGGGGAAGGGAGGGGGGGGAGGGGA/G
rs27631474
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147392108fClcn6 : Coding-Synonymous2SNPAAGAGAG    AGGA      A        A    AA   A A/G
rs27631473
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147392653fClcn6 : Intron1SNPG AGAG     GAAG      G        G    GG   G A/G
rs27631472
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147392697fClcn6 : Intron1SNPG TG G     GTTG      G        G    GG   T G/T
rs27631471
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147392784fClcn6 : Intron1SNPG AGAG     GAAG      G        G    GG   G A/G
rs27631470
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147393143fClcn6 : Intron2SNPCCTCTCT    CTTC      C        C    CC   C C/T
rs27631469
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147393289fClcn6 : Intron2SNPCCTCTCT    CTTC      C        C    CC   C C/T
rs27631468
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147393336fClcn6 : Intron2SNPAAGAGAG    AGGA      A        A    AA   A A/G
rs27631467
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147393478fClcn6 : Intron2SNP GAGAGA    GAAG      G        G    GG   G A/G
rs27631466
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147393484fClcn6 : Intron1SNP  AGAG     GAAG               G     G   G A/G
rs27631465
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147393606fClcn6 : Intron1SNPG AGAG     GAAG      G        G    GG   G A/G
rs27631464
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147393802fClcn6 : Intron1SNPA GAGA     AGGA      A        A    AA   A A/G
rs27631463
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147394201fClcn6 : Intron1SNPC GGGG     GGGC      C        C    CC   G C/G
rs27631462
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147394274fClcn6 : Intron1SNPC GCGC     CGGC      C        C    CC   C C/G
rs32312116
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147394556fClcn6 : Intron1SNPTTC   C                                   C/T
rs27631461
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147395030fClcn6 : Intron1SNPC CCCC     CCCC      C        C    CC   A A/C
rs27631460
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147395232fClcn6 : Intron2SNPTTCTCT     TCCT      T        T    TT   T C/T
rs27631459
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147395261fClcn6 : Intron2SNPCCTCTC     CTTC      C        C    CC   C C/T
rs27631458
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147395293fClcn6 : Intron2SNPTTCTCT     TCCT      T        T    TT   T C/T
rs27631457
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147395542fClcn6 : Intron1SNPC CCCC     CCCC      C        C    CC   T C/T
rs32881029
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147395845fClcn6 : Intron1SNPA T        A                              A/T
rs31950558
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147395905fClcn6 : Intron1SNPT A        T                              A/T
rs32634224
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147396218fClcn6 : Intron1SNP  A   A    T                              A/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27631456
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147396594fClcn6 : Intron1SNP   G       G AG      G        G    GG   G A/G
rs32225795
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147396974fClcn6 : Intron1SNP T    C    T                              C/T
rs32750098
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147397239fClcn6 : Intron1SNP T    C    T                              C/T
rs27631455
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147397385fClcn6 : Intron1SNPG CGCG     GCCG      G        G    GG   G C/G
rs27631454
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147397414fClcn6 : Intron1SNPA GAGA     AGGA      A        A    AA   A A/G
rs27631453
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147397739fClcn6 : Intron1SNPA GAGA     AGGA      A        A    AA   A A/G
rs27631452
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147397963fClcn6 : Intron1SNPA GAGA   G AGGA      A        A    AA   A A/G
rs27631451
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147398342fClcn6 : Intron1SNPG AGAG      AAG      G        G    GG   G A/G
rs27631450
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147398363fClcn6 : Intron1SNPG TGTG     GTTG      G        G    GG   G G/T
rs32129603
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147399200fClcn6 : Intron1SNP TC        T                              C/T
rs27631449
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147399374fClcn6 : Intron1SNP  TCTC   C  TTC                           C/T
rs27631448
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147399446fClcn6 : Intron1SNPA GAGA   G AGGA      A        A    AA   A A/G
rs27631447
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147400076fClcn6 : Intron1SNPT TTTT   C TTTT      T        T    TT   T C/T
rs27631446
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147400088fClcn6 : Intron1SNPA AAAA   G AAAA      A        A    AA   A A/G
rs27631445
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147400123fClcn6 : Intron1SNPG C CG   G GCC       G        G    GG   G C/G
rs27631444
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147400175fClcn6 : Intron1SNPT TTTT   A TTTT      T        T    TT   T A/T
rs27631443
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147400279fClcn6 : Intron1SNPC CCCC   T CCCC      C        C    CC   C C/T
rs27631442
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147400685fClcn6 : Coding-Synonymous1SNPG GGGG   A GGGG      G        G    GG   G A/G
rs27631441
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147400714fClcn6 : Intron2SNPAAGAGAG  G AGGA      A        A    AA   A A/G
rs27631440
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147400769fClcn6 : Intron2SNPCCTCTCT  C CTTC      C        C    CC   C C/T
rs27631439
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147400784fClcn6 : Intron2SNPCCTCTCT  T CTTC      C        C    CC   C C/T
rs27631438
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147400831fClcn6 : Intron2SNPGGAGAGA    GAAG      G        G    GG   G A/G
rs32048049
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147400891fClcn6 : Intron1SNPTTA   A    T                              A/T
rs32325482
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147401043fClcn6 : Intron1SNPAAC   C    A                              A/C
rs27631437
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147401138fClcn6 : Intron1SNPC CCCC   C CCCC      C        C    CC   A A/C
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27631436
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147401159fClcn6 : Intron1SNPT TTTT   C TTTT      T        T    TT   T C/T
rs27631435
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147401199fClcn6 : Intron1SNPT TTTT   C TTTT      T        T    TT   T C/T
rs27631434
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147401386fClcn6 : Intron1SNPC CCCC   G CCCC      C        C    CC   C C/G
rs27631433
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147401402fClcn6 : Intron1SNPC GCGC   G CGGC      C        C    CC   C C/G
rs27631432
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147401458fClcn6 : Intron1SNPT CTC      TCCT      T             TT   T C/T
rs27631431
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147401507fClcn6 : Intron1SNPG GGGG   C GGGG      G        G    GG   G C/G
rs27631430
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147401566fClcn6 : Intron1SNPC CCCC   T CCCC      C        C    CC   C C/T
rs27631429
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147401610fClcn6 : Intron1SNPG GGGG   A GGGG      G        G    GG   G A/G
rs27631428
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147401643fClcn6 : Intron1SNPA TATA   T ATTA      A        A    AA   T A/T
rs27631427
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147401694fClcn6 : Intron1SNPG GGGG   A GGGG      G        G    GG   G A/G
rs27631426
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147401713fClcn6 : Intron1SNPG GGGG   A GGGG      G        G    GG   G A/G
rs27631425
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147401862fClcn6 : Intron1SNPA AAAA   C AAAA      A        A    AA   A A/C
rs27631424
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147401897fClcn6 : Intron1SNPT TTTT   A TTTT      T        T    TT   T A/T
rs27631423
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147402082fClcn6 : Intron2SNPAAGGGGG  G GGGA      A        A    AA   G A/G
rs27631422
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147402167fClcn6 : Intron1SNPA AAAA   T AAAA      A        A    AA   A A/T
rs27631421
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147402186fClcn6 : Intron2SNPAA  TAT  T ATTA      A        A    AA   A A/T
rs27631420
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147402269fClcn6 : Intron1SNPC TCTC   C CTTC      C        C    CC   C C/T
rs27631419
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147402297fClcn6 : Intron1SNPT CTCT   T TCCT      T        T    TT   T C/T
rs27631418
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147402426fClcn6 : Intron2SNPGGTGTG   G GTTG      G        G    GG   G G/T
rs27631417
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147402579fClcn6 : Intron1SNPA AAAA   A AAAA      A        A    AA   C A/C
rs27631416
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147402835fClcn6 : Intron1SNPA AAAA   A AAAA      A        A    AA   G A/G
rs27631415
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147402877fClcn6 : Intron1SNPG GGGG   A GGGG      G        G    GG   G A/G
rs32242379
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147402944fClcn6 : Intron1SNP CT   T    C                              C/T
rs27631414
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147403695fClcn6 : Intron1SNPC TCTC   C CTTC      C        C    CC   C C/T
rs27631413
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147403829fClcn6 : Intron1SNPG GGGG   G GGGG      G        G    GG   C C/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27631412
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147403898fClcn6 : Intron1SNPA AAAA   G AAAA      A        A    AA   A A/G
rs27631411
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147403903fClcn6 : Intron1SNPT ATAT   A TAAT      T        T    TT   T A/T
rs27631410
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147404040fClcn6 : Intron2SNPCCTCTCT  T CTTC      C        C    CC   C C/T
rs27631409
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147404374fClcn6 : Intron1SNP  A AT      AAT               T    T      A/T
rs27631408
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147404577fClcn6 : Intron1SNPC TCTC   C CTTC      C        C    CC   C C/T
rs27631407
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147404637fClcn6 : Intron1SNPC CCCC   T CCCC      C        C    CC   C C/T
rs27631406
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147404663fClcn6 : Intron1SNP  A A    G  AAA               A    A      A/G
rs27631405
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147404667fClcn6 : Intron1SNPA GAGA     AGGA      A        A    AA   A A/G
rs27631404
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147404737fClcn6 : Intron1SNPT TTTT   A TTTT      T        T    TT   T A/T
rs27631403
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147404764fClcn6 : Intron1SNPG GGGG   A GGGG      G        G    GG   G A/G
rs27631402
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147404920fClcn6 : Intron1SNPC CTCT   C TCCT      C        T    TT   T C/T
rs27631401
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147405015fClcn6 : Intron1SNPT C CT   T TCC       T        T    T    T C/T
rs27631400
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147405051fClcn6 : Intron1SNPG GGGG   A GGGG      G        G    GG   G A/G
rs27631399
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147405290fClcn6 : Intron1SNPA AAAA   G AAAA      A        A    AA   A A/G
rs27631398
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147405585fClcn6 : Intron1SNPG GGGG   A GGGG      G        G    GG   G A/G
rs27631397
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147405637fClcn6 : Intron1SNPA GAGA     AG A               A    A    A A/G
rs27631396
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147405817fClcn6 : Intron1SNPT GTGT   G TGGT      T        T    TT   T G/T
rs27631395
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147405906fClcn6 : Intron1SNPC T TT   C  TTC      C        C    CC   C C/T
rs27631394
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147405907fClcn6 : Intron1SNPG GGGG     CGG                     GG   G C/G
rs27631393
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147405997fClcn6 : Intron1SNPA AAAA   A AAAG      A        A    A      A/G
rs27631392
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147406114fClcn6 : Intron1SNPC A AC     CAAA      C        C    C      A/C
rs27631391
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147406139fClcn6 : Intron1SNPT CTCT   T TCCT      T        T    TT   T C/T
rs27631390
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147406188fClcn6 : Intron1SNPT CTCT   C TCCT      T        T    TT   T C/T
rs27631389
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147406295fClcn6 : Intron2SNPG TGT      GTTG               G    GG   G G/T
rs27631388
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147406296fClcn6 : Intron1SNPG GGGG   A  GGG                    GG   G A/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27631387
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147406321fClcn6 : Intron2SNPC GCGC   G CGG       C        C    CC   C C/G
rs27631386
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147406419fClcn6 : Intron1SNPC CCCC   C CCCC      C        T    TC   C C/T
rs27631385
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147406952fClcn6 : Intron1SNPT ATAT   A TAAT      T        T    TT   T A/T
rs27631384
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147407046fClcn6 : Intron1SNPT CTCT   C TCCT      T        T    TT   T C/T
rs27631383
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147407338fClcn6 : Intron1SNPA GAGA   G AGGA      A        A    AA   A A/G
rs27631382
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147407378fClcn6 : Intron1SNPC ACAC   A CAAC      C        C    C    C A/C
rs27631381
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147407387fClcn6 : Intron1SNP  CCC    C  CC                     G      C/G
rs27631380
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147407432fClcn6 : Intron1SNPA TATA   A ATTA      A        A    AA   A A/T
rs27631379
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147407825fClcn6 : Intron1SNPT CTCT   C TCCT      T        T    TT   T C/T
rs27631378
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147408026fClcn6 : Intron1SNPT CTCT   C TCCT      T        T    TT   T C/T
rs27631377
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147408086fClcn6 : Intron1SNPT TTTT   G TTTT      T        T    TT   T G/T
rs27631376
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147408153fClcn6 : Intron1SNP  C CG   C  CCG                           C/G
rs27631375
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147408163fClcn6 : Intron1SNP  AAAA   G  AAA                           A/G
rs27631374
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147408477fClcn6 : Intron1SNPT CTCT   C TCCT      T        T    TT   T C/T
rs27631373
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147409281fClcn6 : Intron1SNP  GAGA   A  GGA                           A/G
rs27631372
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147409295fClcn6 : Intron1SNP  TCTC   C  TTC                           C/T
rs27631371
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147409381fClcn6 : Intron1SNPT CTCT   C TCCT      T        T    TT   T C/T
rs27631370
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147409443fClcn6 : Intron1SNP  ATAT   A TAAT      T        T    TT     A/T
rs27631369
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147409458fClcn6 : Intron1SNPA GAGA   G AGGA      A        A    AA   A A/G
rs27631368
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147409543fClcn6 : Intron1SNPC ACAC   C CAAC      C        C    CC   C A/C
rs27617567
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147409857fClcn6 : Intron1SNPT CTCT   C TCCT               T     T     C/T
rs27617566
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147410753fClcn6 : Intron1SNPT C CT   C  CCT               T     T     C/T
rs27617565
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147410764fClcn6 : Intron1SNPT AAAT   A TAA                T     T     A/T
rs27617564
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147410765fClcn6 : Intron1SNPC CCCC   A CCCC               C     C     A/C
rs27617563
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147410825fClcn6 : Intron1SNP  TTTT   C  TTT               C           C/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27617562
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147411062fClcn6 : Intron1SNPA T T    T ATTA               A    A      A/T
rs27617561
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147411621fClcn6 : Intron1SNPT A A    A TAAT               T     T     A/T
rs27617560
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147411646fClcn6 : Intron1SNP  A AG   G  AAG               G           A/G
rs27617559
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147411813fClcn6 : Intron1SNPT C CT   T TCCT               T     T     C/T
rs27617558
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147411910fClcn6 : Intron1SNPT C CT   T TCCT               T     T     C/T
rs27617557
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147411953fClcn6 : Intron1SNPC GCG    G CGGC               C    CC     C/G
rs27617556
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147411982fClcn6 : Intron1SNPT CTCT   T TCCT               T    TT     C/T
rs27617555
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147412010fClcn6 : Intron1SNPC T T    C CTT                C     C     C/T
rs27617554
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147412113fClcn6 : Intron1SNP  T TA   T ATTA               A     A     A/T
rs27617553
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147412192fClcn6 : Intron1SNPA GAGA   A AGGA               A    AA     A/G
rs27617552
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147412387fClcn6 : Intron1SNPG C CG   G GCCG               G    GG     C/G
rs27617551
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147412414fClcn6 : Intron1SNPT CTC    C TCCT               T     T     C/T
rs27617550
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147412474fClcn6 : Intron1SNPT CTCT   C TCCT               T    TT     C/T
rs27617549
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147412985fClcn6 : Locus-Region2SNPCCT T T  C CTTC               C     C     C/T
rs32924436
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:147413338fClcn6 : Locus-Region
Mthfr : Locus-Region
1SNP CG        C                              C/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
05/08/2013
MGI 5.13
The Jackson Laboratory