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Genome
Coordinate Discrepancy The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details). |
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Symbol Name ID |
Def6 differentially expressed in FDCP 6 MGI:1346328 |
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) |  | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | Allele Summary (all strains) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs33787089 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28342974 | f | Def6 : Locus-Region Zfp523 : Locus-Region | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33787088 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28343021 | f | Def6 : Locus-Region Zfp523 : Locus-Region | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33787087 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28343091 | f | Def6 : Locus-Region Zfp523 : Locus-Region | 1 | SNP | C | C | C | C | C | G | C | C | C | C | G | C | C | C/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33787086 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28343179 | f | Def6 : Locus-Region Zfp523 : Locus-Region | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33787085 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28343264 | f | Def6 : Locus-Region Zfp523 : Locus-Region | 1 | SNP | C | C | C | C | C | T | C | C | T | C | C | T | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33787084 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28343936 | f | Def6 : Locus-Region | 1 | SNP | C | C | C | C | C | A | C | C | A | C | C | C | C | C | C | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33786273 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28344214 | f | Def6 : Locus-Region | 1 | SNP | G | G | G | G | G | A | G | G | A | G | G | G | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33786272 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28344989 | f | Def6 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33786271 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28345057 | f | Def6 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33786270 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28345250 | f | Def6 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33786269 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28345617 | f | Def6 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | T | G | G | G/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33786268 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28345644 | f | Def6 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33786267 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28345752 | f | Def6 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | T | G | G | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33786266 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28345766 | f | Def6 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | C | T | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33786265 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28345897 | f | Def6 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | G | C | C | G | C | C | G | C | C | C/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33786264 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28345995 | f | Def6 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | T | C | C | T | C | C | T | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33785433 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28346142 | f | Def6 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33785432 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28346752 | f | Def6 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | C | T | T | C | T | T | C | T | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33785431 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28346987 | f | Def6 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | A | G | G | A | G | G | A | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33785430 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28348939 | f | Def6 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33785429 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28349147 | f | Def6 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | T | G | G | G/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33785428 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28349385 | f | Def6 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | A | G | G | A | G | G | A | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33785427 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28349667 | f | Def6 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | C | T | T | C | T | T | C | T | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33785426 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28350153 | f | Def6 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | T | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33785425 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28350202 | f | Def6 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) | | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | Allele Summary (all strains) |
| rs33785424 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28351420 | f | Def6 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | C | T | T | C | T | T | C | T | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33784653 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28351513 | f | Def6 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | C | T | T | C | T | T | C | T | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33784652 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28352250 | f | Def6 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | T | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33784651 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28353226 | f | Def6 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | G | T | T | G | T | T | T | T | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33784650 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28353491 | f | Def6 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | T | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33784649 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28353578 | f | Def6 : Intron | 1 | SNP | C | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33784648 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28353688 | f | Def6 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | C | T | T | C | T | T | C | T | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33784647 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28354291 | f | Def6 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | C | A | A | C | A | A | C | A | A | A/C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33784646 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28354366 | f | Def6 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | A | T | T | T | A | T | A/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33784645 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28354499 | f | Def6 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | A | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33784644 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28354569 | f | Def6 : Coding-Synonymous | 1 | SNP | G | G | G | G | G | A | G | G | A | G | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33783883 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28354575 | f | Def6 : Coding-Synonymous | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | T | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33783882 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28354778 | f | Def6 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33783881 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28354820 | f | Def6 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | G | T | T | G | T | T | T | T | T | T | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33783880 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28354908 | f | Def6 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | G | T | T | T | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33783879 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28354985 | f | Def6 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | C | T | T | C | T | T | T | T | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33783878 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28355049 | f | Def6 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | G | A | A | G | A | A | A | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33783877 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28355389 | f | Def6 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | C | T | T | C | T | T | C | T | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33056798 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28355616 | f | Def6 : Intron | 1 | SNP | A | C | C | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33783876 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28356040 | f | Def6 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | G | T | T | G | T | T | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13482936 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28356747 | f | Def6 : Coding-NonSynonymous | 2 | SNP | G | G | G | G | G | G | A | A | A | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | A | A | A | A | G | A | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A/G | |
| rs33400301 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28357497 | f | Def6 : Intron | 1 | SNP | T | T | G | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs29540180 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28357724 | f | Def6 : Intron | 1 | SNP | A | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33783875 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28358509 | f | Def6 : Intron | 1 | SNP | G | A | G | A | A | A | A | A | A | G | A | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33783874 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28358530 | f | Def6 : Intron | 1 | SNP | G | A | G | A | A | A | A | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) | | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | Allele Summary (all strains) |
| rs33783123 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28358539 | f | Def6 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | G | A | A | A | A | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33783122 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28358610 | f | Def6 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs6374487 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28359723 | f | Def6 : Intron | 1 | SNP | G | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs6375494 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28359877 | f | Def6 : Intron | 1 | SNP | A | T | A/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs6375601 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28359945 | f | Def6 : Intron | 1 | SNP | G | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33783121 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28360058 | f | Def6 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33783120 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28360448 | f | Def6 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33783119 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28360526 | f | Def6 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33783118 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28361279 | f | Def6 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | A | T | T | T | T | T | T | T | T | T | A/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33783117 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28361543 | f | Def6 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33783116 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28361600 | f | Def6 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33783115 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28361646 | f | Def6 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33783114 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28361891 | f | Def6 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33782443 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28362612 | f | Def6 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | G | A | A | G | A | A | G | A | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33782442 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28362861 | f | Def6 : Coding-Synonymous | 1 | SNP | T | T | T | T | T | G | T | T | G | T | T | G | T | G | T | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33782441 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28362888 | f | Def6 : Coding-Synonymous | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | T | G | G | G/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33782440 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28363508 | f | Def6 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | A | T | T | T | T | T | A | T | A | T | A/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33782439 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28364680 | f | Def6 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | C | A | A | C | A | A | C | A | C | A | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33782438 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28364892 | f | Def6 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | C | A | C | C | A/C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33782437 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28364973 | f | Def6 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33782436 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28365186 | f | Def6 : Coding-Synonymous | 1 | SNP | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | A | G | A | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33782435 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28365302 | f | Def6 : mRNA-UTR | 1 | SNP | T | T | T | T | T | C | T | T | C | T | T | C | T | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33782434 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr17:28365418 | f | Def6 : mRNA-UTR | 1 | SNP | G | G | G | G | G | C | G | G | C | G | G | C | G | G | C/G |
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc |
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last database update 05/08/2013 MGI 5.13 |
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