About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Nr2e3
nuclear receptor subfamily 2, group E, member 3
MGI:1346317

172 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs16804683
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59940832fGm20275 : Intron
Nr2e3 : 1939 bp downstream of
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  GGGGGGG G   AGAGGG GG  GAGG G  A/G
rs16804684
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59940848fGm20275 : Intron
Nr2e3 : 1923 bp downstream of
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  GGGGGGA G   AGAGGG GG  GAGG G  A/G
rs16804685
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59940851fGm20275 : Intron
Nr2e3 : 1920 bp downstream of
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  GGGGGGA G   AGAGGG GG  GAGG G  A/G
rs37498528
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59941009fGm20275 : Noncoding-Transcript-Variant
Nr2e3 : 1762 bp downstream of
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  TTT T C TT T      T          TTC/T
rs38273740
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59941046fGm20275 : Noncoding-Transcript-Variant
Nr2e3 : 1725 bp downstream of
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  CCC C A  CAC      C           CA/C
rs38275938
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59941207fNr2e3 : 1564 bp downstream of
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  AAA A G AAAA      A  A       AAA/G
rs37123690
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59941296fNr2e3 : 1475 bp downstream of
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  CCC C C CCTC      C  C       CCC/T
rs38794702
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59941297fNr2e3 : 1474 bp downstream of
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  GGG G A GGGG      G  G       GGA/G
rs16804686
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59941471fNr2e3 : 1300 bp downstream of
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
2SNP  CCCCCCC CCTCTCTCCCCCC  CTCC C CC/T
rs16804687
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59941480fNr2e3 : 1291 bp downstream of
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  TTTTTTC T   CTCTTT TT  TCTT C  C/T
rs16804688
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59941483fNr2e3 : 1288 bp downstream of
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  CCCCCCC C   TCCCCC CC  CTCC C  C/T
rs16804689
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59941513fNr2e3 : 1258 bp downstream of
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  TTTTTTT T   TTATTT TT  TTTT T  A/T
rs16804690
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59941542fNr2e3 : 1229 bp downstream of
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
6Mixed  AAAAAAA A   -AAAAA AA  A-AA A  -/A/C/G
rs16804696
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59941575fNr2e3 : 1196 bp downstream of
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
2SNP  GGGGGGG GGTGTGTGGG GG  GTGG GGGG/T
rs16804697
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59941696fNr2e3 : 1075 bp downstream of
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  CCCCCCC C   CCCCCC CC  CCCC A  A/C
rs16804698
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59941753fNr2e3 : 1018 bp downstream of
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  CCCCCCC C   CCACCC CC  CCCC C  A/C
rs16804699
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59941775fNr2e3 : 996 bp downstream of
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
2SNP  TTTTTTC TTCTCTCTTTCTT  TCTT CTTC/T
rs36540135
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59941942fNr2e3 : 829 bp downstream of
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  GGG G G GGAG      G           GA/G
rs16804700
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59942063fNr2e3 : 708 bp downstream of
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  CCCCCCC C   CCCCCC CC  CCC  A  A/C
rs16804701
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59942067fNr2e3 : 704 bp downstream of
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  AAAAAAA A   AATAAA AA  AAAA A  A/T
rs16804702
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59942088fNr2e3 : 683 bp downstream of
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  GGGGGGG G   GGTGGG GG  GGGG G  G/T
rs16804703
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59942095fNr2e3 : 676 bp downstream of
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
2SNPT TTTTTTT TTCTCTCTTTTTTT TCTTTTTTC/T
rs16804704
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59942184fNr2e3 : 587 bp downstream of
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  AAAAAAA A   AATAAA AA  AAAA A  A/T
rs16804705
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59942215fNr2e3 : 556 bp downstream of
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
2SNPT TTTTTTC TTCTCTCTTTTTTT TCTTTTTTC/T
rs16804706
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59942399fNr2e3 : Locus-Region
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  TTTT TG T   TTTTTT TT  TTTT T  G/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs16804707
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59942418fNr2e3 : Locus-Region
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  GGGG GG G   AGGGGG GG  GAGG G  A/G
rs16804708
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59942423fNr2e3 : Locus-Region
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  AAAA AA A   GAAAAA AA  AGAA A  A/G
rs46184443
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59942625fNr2e3 : Locus-Region
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
2SNP  A            G        A        A/G
rs16804709
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59942629fNr2e3 : Locus-Region
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
2Mixed  ------- -   --?--- --  ---- -  -/C/T
rs16804711
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59942641fNr2e3 : Locus-Region
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  TTTTTTT T   TTGTTT TT  TTTT T  G/T
rs16804712
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59942688fNr2e3 : Locus-Region
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  CCCCCCC C   CCTCCC CC  CCCC C  C/T
rs16804713
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59942723fNr2e3 : Locus-Region
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  AAAAAAA A   AACAAA AA  AAAA A  A/C
rs16804714
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59942825fNr2e3 : mRNA-UTR
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  TTTTTTT T   TTCTTT TT  TTTT T  C/T
rs16804715
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59942975fNr2e3 : mRNA-UTR
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  AAAAAAA A   AACAAA AA  AAAA A  A/C
rs16804716
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59943023fNr2e3 : mRNA-UTR
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  TTTTTTT T   TTCTTT TT  TTTT T  C/T
rs16804717
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59943075fNr2e3 : mRNA-UTR
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  GGGGGGG G   GGAGGG GG  GGGG G  A/G
rs16804718
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59943369fNr2e3 : mRNA-UTR
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  GGGGGGA G   AGAGGG GG  GAGG G  A/G
rs16804736
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59943405rNr2e3 : Coding-NonSynonymous
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP       AT     AATA        A      A/T
rs16804719
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59943550fNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
2SNP  AAAAAAA A   AAGAAA AA  AAAA A  A/G
rs16804720
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59943584fNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
6Mixed  -- ---- -   --G--- --  ---- -  -/A/G
rs16804726
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59943631fNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
2SNP  AAAAAAA A   AACAAA AA  AAAA A  A/C
rs16804727
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59943646fNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
2SNP  GGGGGGG G   GGTGGG GG  GGGG G  G/T
rs6228894
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59943671fNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
4SNPG GGGGGGAAGGAGAGAGGGGGGG GAGGGGGGA/G
rs16804729
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59943694fNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  GG GGGG G   GGG GG GA  GGGG G  A/G
rs16804732
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59943724rNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1IN-DEL  CCCCCCC C   CC-CCC CC  CCCC C  -/C
rs16804731
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59943725rNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1IN-DEL  TTTTTTT T   TT-TTT TT  TTTT T  -/T
rs16804730
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59943727fNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1IN-DEL  AA AAAA A   AA- AA AA  AAAA A  -/A
rs6229478
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59943784fNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP       G A                       A/G
rs6229504
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59943796fNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP       G A                       A/G
rs6230091
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59943898fNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
2SNP  G GGGGAAG   AGAGGG GG  GAGG G  A/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs6230093
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59943900fNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
2SNP  TTTTTTCCT   CTTTTT TT  TCTT T  C/T
rs6230117
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59943906fNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
2SNP  GGGGGGAAG    GAGGG GG  GAGG G  A/G
rs6243693
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59944117fNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
2SNPT TTT TTCCTTCT      T  T     T  TC/T
rs6244218
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59944162fNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
2SNPC CCC CCTTCCTC      C  C     C CCC/T
rs37055706
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59944193fNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNPT TTT T T TTTT      C  T     T TTC/T
rs38346150
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59944250fNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNPG GGG G A GGAG      G  G     G GGA/G
rs39296066
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59944437fNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNPC CCC C T CCTC      C  C     C CCC/T
rs36274703
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59944932fNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNPG GGG G G GGGG      A  G     G GGA/G
rs36317125
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59945598fNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNPC CCC C C CCCC      A  C     C CCA/C
rs36311019
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59945608fNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNPA AAA A G AAGA      A  A     A AAA/G
rs36524541
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59945718fNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNPG GGG G A GGAG      G  G     G GGA/G
rs37788739
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59945748fNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNPA AAA A G AAGA      A  A     A AAA/G
rs36364734
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59945795fNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNPC CCC C A CCAC      C  C     C CCA/C
rs36467981
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59945978fNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNPT TTT T C TTCT      T  T     T TTC/T
rs36328728
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59946052fNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNPC CCC C T CCTC      C  C     C CCC/T
rs36668665
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59946077fNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNPT TTT T G TTTT      T  T     T TTG/T
rs39042009
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59946094fNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNPT TTT T C TTTT      T  T     T TTC/T
rs36843732
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59946164fNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNPG GGG G T GGTG      G  G     G GGG/T
rs38451000
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59946204fNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNPC CCC C T CCTC      C  C     C CCC/T
rs36546366
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59946298fNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNPC CCC C G CCGC      C  C     C CCC/G
rs37538543
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59946429fNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNPT TTT T T TTTT      T        A TTA/T
rs38262064
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59946503fNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNPG GGG G G GGGG      G  T     T GGG/T
rs16804614
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59946534rNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  AAAAAAA A   AAGAAA AA  AAAA A  A/G
rs16804613
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59946630rNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  GGGGGGG G   GGAGGG GG  GGGG G  A/G
rs16804612
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59946662rNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  CCCCCCC C   CCTCCC CC  CCCC C  C/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs16804611
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59946742rNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  AAAAAAA A   AAGAAA AA  AAAA A  A/G
rs16804610
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59946745rNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  CCCCCCT C   CCCCCC CC  CCCC C  C/T
rs16804609
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59946776rNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  TTTTTTT T   TTCTTT TT  TTTT T  C/T
rs16804608
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59946806rNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  TTTTTTT T   TTCTTT TT  TTTT T  C/T
rs16804607
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59946809rNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  AAAAAAA A   AAGAAA AA  AAAA A  A/G
rs16804606
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59946840rNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  GGGGGGG G   GGAGGG GG  GGGG G  A/G
rs16804605
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59947039rNr2e3 : Coding-Synonymous
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  CCCCCCC C   CCTCCC CC  CCCC C  C/T
rs36526974
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59947097fNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNPG GGG G G GGAG      G  G     G GGA/G
rs16804627
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59947131rNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  AAA AAC A   CACAAA AA  ACAA A  A/C
rs16804626
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59947141rNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  GGG GGA G   AGGGGG GG  GAGG G  A/G
rs16804625
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59947190rNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  GGG GGG G   GGAGGG GG  GGGG G  A/G
rs16804624
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59947224rNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  CCC CCC C   CCTCCC CC  CCCC C  C/T
rs16804623
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59947232rNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  TTTTTTT T   TTGTTT TT  TTTT T  G/T
rs16804622
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59947256rNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  GGGGGGG G   GGAGGG GG  GGGG G  A/G
rs16804621
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59947257rNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  TTTTTTT T   TTCTTT TT  TTTT T  C/T
rs16804620
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59947449rNr2e3 : Coding-Synonymous
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  CCCCCCC C   CCTCCC CC  CCCC C  C/T
rs16804619
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59947458rNr2e3 : Coding-Synonymous
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
2SNPT TTTTTTC TTCTCTCTTTTTTT TCTTTTTTC/T
rs16804618
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59947600rNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  CC CCCT C   CCCCCC CC  CCCC C  C/T
rs16804617
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59947609rNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1IN-DEL  TTTTTTT T   TT-TTT TT  TTTT T  -/T
rs16804616
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59947630rNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  CC CCCC C   CCTCCC CC  CCCC C  C/T
rs16804615
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59947657rNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  TT TTTT T   TTCTTT T   TTTT T  C/T
rs16804628
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59947784fNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  GGGGGGG G   GGAGGG GG  GGGG G  A/G
rs16804629
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59947838fNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  GGGGGGG G   GGAGGG GG  GGGG G  A/G
rs16804630
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59947846fNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  TTTTTTT T   TTCTTT TT  TTTT T  C/T
rs16804631
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59947858fNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  TTTTTTT T   TTATTT TT  TTTT T  A/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs16804632
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59947936fNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  CCCCCCC C   CCACCC CC  CCCC C  A/C
rs16804633
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59947961fNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1IN-DEL   --G  G G   G GG G GG  GG-G    -/G
rs16804634
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59947966fNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1IN-DEL   GG   - -   - G- - --  --G-    -/G
rs16804635
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59948023fNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  CCCCCCC C   CCTCCC CC  CCCC C  C/T
rs16804636
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59948081fNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
2SNPA AAAAAAG AAGAGAGAAAAAAA AGAAAAAAA/G
rs16804637
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59948134fNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  CCCCCCC C   TCCCCC CC  CTCC C  C/T
rs16804638
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59948429fNr2e3 : Coding-Synonymous
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  CCCCCCC C   CCACCC CC  CCCC C  A/C
rs16804639
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59948543fNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  TTTTTTT T   TTCTTT TT  TTTT T  C/T
rs16804640
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59948568fNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1IN-DEL  G-G G-G G   G-G-GG GG  GGG  G  -/G
rs16804641
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59949019fNr2e3 : Coding-Synonymous
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  GGGGGGG G   GGAGGG GG  GGGG G  A/G
rs16804642
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59949142fNr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  GGGGGGG G   GGAGGG GG  GGGG G  A/G
rs16804643
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59949198fNr2e3 : Coding-Synonymous
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
2SNPT TTTTTTG TTGTGTGTTTTTTT TGTTTTTTG/T
rs16804644
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59949368fGm7616 : Locus-Region
Nr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  CCCCCCC C   CCTCCC CC  CCCC C  C/T
rs16804645
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59949377fGm7616 : Locus-Region
Nr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1IN-DEL  CCCCCCC C   -CCCCC CC  C-CC C  -/C
rs16804646
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59949412fGm7616 : Locus-Region
Nr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
2SNPT TTTTTTC TTTTTTCTTTCTTT TTTTTCTTC/T
rs16804647
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59949589fGm7616 : Locus-Region
Nr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
2SNPC CCCCCCC CCCCCCCCCCTCCC CCCCCTCCC/T
rs16804648
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59949626fGm7616 : Locus-Region
Nr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  GGGGGGG G   GGAGGG GG  GGGG G  A/G
rs16804649
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59949632fGm7616 : Locus-Region
Nr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
2SNPC CCCCCCG CCCCCCGCCCCCCC CCCCCCCCC/G
rs16804650
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59949690fGm7616 : Locus-Region
Nr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  TTTTTTT T   TTCTTT TT  TTTT T  C/T
rs39340884
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59949746fGm7616 : Locus-Region
Nr2e3 : Intron
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNPT TTT T T TTCT      T  T     T TTC/T
rs16804651
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59949840fGm7616 : Locus-Region
Nr2e3 : Coding-Synonymous
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  CCCCCCC C   CCTCCC CC  CCCC C  C/T
rs16804652
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59949852fGm7616 : Locus-Region
Nr2e3 : Coding-Synonymous
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  AAAAAAA A   AAGAAA AA  AAAA A  A/G
rs16783339
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59950016fGm7616 : Locus-Region
Nr2e3 : mRNA-UTR
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
2SNP  GGGGGGG G   GGCGGG GG  GGGG G  C/G
rs16783340
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59950039fGm7616 : Locus-Region
Nr2e3 : mRNA-UTR
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
2SNP  TTTTTTT T   TTCTTT TT  TTTT T  C/T
rs16783341
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59950042fGm7616 : Locus-Region
Nr2e3 : mRNA-UTR
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
3SNPC CCCCCCC CCTCTCCCCCCCCC CTCCCCCCC/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs16783342
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59950053fGm7616 : Locus-Region
Nr2e3 : mRNA-UTR
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
2SNP  TTTTTTT T   GTTTTT TT  TGTT T  G/T
rs16804653
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59950081fGm7616 : Locus-Region
Nr2e3 : Locus-Region
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  CCCCCCC C   CCTCCC CC  CCCC C  C/T
rs16804654
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59950153fGm7616 : Locus-Region
Nr2e3 : Locus-Region
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  AAAAAAA A   GAGAAA AA  AGAA A  A/G
rs16804655
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59950230fGm7616 : Locus-Region
Nr2e3 : Locus-Region
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  GGGGGGG G   GGAGGG GG  GGGG G  A/G
rs16804656
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59950233fGm7616 : Locus-Region
Nr2e3 : Locus-Region
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  GGGGGGG G   GGCGGG GG  GGGG G  C/G
rs16804657
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59950255fGm7616 : Locus-Region
Nr2e3 : Locus-Region
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  CCCCCCC C   CCTCCC CC  CCCC C  C/T
rs16804658
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59950256fGm7616 : Locus-Region
Nr2e3 : Locus-Region
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  TTTTTTT T   TTATTT TT  TTTT T  A/T
rs16804659
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59950310fGm7616 : Locus-Region
Nr2e3 : Locus-Region
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
2SNPA AAAAAAA AAGAGAGAAAAAAA AGAAAAAAA/G
rs16804660
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59950336fGm7616 : Locus-Region
Nr2e3 : Locus-Region
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  GGGGGGG G   AGGGGG GG  GAGG G  A/G
rs16804661
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59950343fGm7616 : Locus-Region
Nr2e3 : Locus-Region
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  AAAAAAA A   AAGAAA AA  AAAA A  A/G
rs37256869
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59950392fGm7616 : Locus-Region
Nr2e3 : Locus-Region
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNPC CCC C C CCGC      C  C     C CCC/G
rs16804662
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59950401fGm7616 : Locus-Region
Nr2e3 : Locus-Region
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  TTTTTTT T   TTCTTT TT  TTTT T  C/T
rs16804663
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59950449fGm7616 : Locus-Region
Nr2e3 : Locus-Region
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
2SNPG GGGGGGG GGGGGGGGGGTGGG GGGGGTGGG/T
rs16804664
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59950481fGm7616 : Locus-Region
Nr2e3 : Locus-Region
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  TTTTTTT T   CTCTTT TT  TCTT T  C/T
rs16804665
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59950484fGm7616 : Locus-Region
Nr2e3 : Locus-Region
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  TTTTTTT T   CTCTTT TT  TCTT T  C/T
rs16804666
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59950507fGm7616 : Locus-Region
Nr2e3 : Locus-Region
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  CC CCCC C   TCTCCC CC  CTCC C  C/T
rs16804667
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59950511fGm7616 : Locus-Region
Nr2e3 : Locus-Region
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  TT TTTT T   CTCTTT TT  TC T T  C/T
rs36869022
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59950686fGm7616 : Locus-Region
Nr2e3 : Locus-Region
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNPA AAA A G AAGA      A  A     A AAA/G
rs39205511
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59950736fGm7616 : Locus-Region
Nr2e3 : Locus-Region
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNPA AAA A A AAGA      A  A     A AAA/G
rs36442390
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59951012fGm7616 : Locus-Region
Nr2e3 : Locus-Region
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNPA AAA A A AAGA      A  A     A AAA/G
rs37619061
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59951024fGm7616 : Locus-Region
Nr2e3 : Locus-Region
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNPC CCC C C CCTC      C  C     C CCC/T
rs36513221
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59951208fGm7616 : Locus-Region
Nr2e3 : Locus-Region
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNPG GGG G G GGAG      G  G     G  GA/G
rs39726362
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59951371fGm7616 : mRNA-UTR
Nr2e3 : Locus-Region
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNPA AAA A G AAGA      G  A     A AAA/G
rs39146847
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59951411fGm7616 : Coding-NonSynonymous
Nr2e3 : Locus-Region
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNPT TTT T T TTTT      A  T     T TTA/T
rs6277693
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59951464fGm7616 : Coding-NonSynonymous
Nr2e3 : Locus-Region
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
2SNPG GGG GGGCGGCG      G  G     G GGC/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs6278130
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59951511fGm7616 : Coding-Synonymous
Nr2e3 : Locus-Region
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP       G A                       A/G
rs6278205
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59951564fGm7616 : Intron
Nr2e3 : Locus-Region
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP       A G                       A/G
rs36891924
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59951616fGm7616 : Intron
Nr2e3 : Locus-Region
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNPA AAA A A AAGA      A  A     A AAA/G
rs38164031
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59951690fGm7616 : Intron
Nr2e3 : Locus-Region
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNPG GGG G T GGTG      G  G     G GGG/T
rs36616555
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59951730fGm7616 : Intron
Nr2e3 : Locus-Region
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNPG GGG G A GGAG      G  G     G GGA/G
rs37849426
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59951894fGm7616 : Intron
Nr2e3 : Locus-Region
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNPG GGG G A GGGG      G  G     G GGA/G
rs39471426
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59952145fGm7616 : Intron
Nr2e3 : within coordinates of
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNPC CCC C C CCCC      T  C     C CCC/T
rs36821903
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59952477fGm7616 : Intron
Nr2e3 : within coordinates of
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNPC CCC C C CCTC      C  C     C CCC/T
rs36394879
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59952570fGm7616 : Intron
Nr2e3 : within coordinates of
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNPC CCC C T CCTC      C  C     C  CC/T
rs37292790
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59952601fGm7616 : Intron
Nr2e3 : within coordinates of
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNPG GGG G G GGAG      G  G     G GGA/G
rs37626920
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59952709fGm7616 : Intron
Nr2e3 : within coordinates of
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNP  T T T C TTC       C        T TTC/T
rs36521009
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59952741fGm7616 : Intron
Nr2e3 : within coordinates of
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNPA AAA A G AAGA      G  A     A AAA/G
rs37469711
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59953134fGm7616 : Intron
Nr2e3 : within coordinates of
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNPT TTT T A TTAT      A  T     T TTA/T
rs38281342
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59953827fGm7616 : Intron
Nr2e3 : within coordinates of
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNPT TTT T C TT T      C  T     T TTC/T
rs37585917
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59957299fGm7616 : Intron
Nr2e3 : within coordinates of
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNPT TTT T C TT T      C  T     T TTC/T
rs36658818
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59957799fGm7616 : Intron
Gm15507 : within coordinates of
Nr2e3 : within coordinates of
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNPT TTT T G TT T      T  T     T TTG/T
rs30466700
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59958632fGm7616 : Intron
Gm15507 : within coordinates of
Nr2e3 : within coordinates of
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
3SNPCCT    T  T    C        T        C/T
rs38395509
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59959501fGm7616 : Locus-Region
Gm15507 : within coordinates of
Nr2e3 : within coordinates of
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNPG GGG G T GG G      G  G     G GGG/T
rs37368061
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59960587fGm15507 : within coordinates of
Nr2e3 : within coordinates of
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNPA AAA A G AA A      A  A     A AAA/G
rs37514194
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59960643fGm15507 : within coordinates of
Nr2e3 : within coordinates of
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNPA AAA A G AA A      A  A     A AAA/G
rs36444002
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59961397fGm15507 : within coordinates of
Nr2e3 : 738 bp upstream of
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNPG GGG G C GG G      C  G     G GGC/G
rs38894546
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:59962197fNr2e3 : 1538 bp upstream of
repro28 : within coordinates of
repro36 : within coordinates of
1SNPA  AA A G  A A               A AAA/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
04/08/2014
MGI 5.17
The Jackson Laboratory