About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Apc2
adenomatosis polyposis coli 2
MGI:1346052

66 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs50241155
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80294108fApc2 : 1869 bp upstream of
Gm30682 : within coordinates of
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
Rps15 : mRNA-UTR
1SNP  CC     T C CC       C                   C      C/T
rs49226282
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80294948fApc2 : 1029 bp upstream of
Gm30682 : within coordinates of
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
1SNPG GGGG   A GGAG       G          G      G A    G A/G
rs51426605
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80295137fApc2 : 840 bp upstream of
Gm30682 : within coordinates of
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
1SNPT TTTT   T TTTT       T          T      T A    T A/T
rs46420399
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80295162fApc2 : 815 bp upstream of
Gm30682 : within coordinates of
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
1SNP GG        G                          T          G/T
rs50584311
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80295288fApc2 : 689 bp upstream of
Gm30682 : within coordinates of
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
1SNP CC        C                          A          A/C
rs47512582
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80295289fApc2 : 688 bp upstream of
Gm30682 : within coordinates of
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
1SNP TT        T                          A          A/T
rs48813583
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80295314fApc2 : 663 bp upstream of
Gm30682 : within coordinates of
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
1SNPC CCCC   A CCCC       C          C      C C    C A/C
rs52517150
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80296334fApc2 : within coordinates of
Gm30682 : within coordinates of
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
1SNPA AAAA   G AAGA       A          A      A G    A A/G
rs51951115
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80296652fApc2 : within coordinates of
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
1SNPT TTTT   T TTCT       T          T      T C    T C/T
rs48987457
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80297435fApc2 : within coordinates of
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
1SNPC CCCC   G CCGC       C          C      C G    G C/G
rs48941289
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80297640fApc2 : within coordinates of
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
1SNPT TTTT   T TTGT       T          T      T G    T G/T
rs47795127
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80297774fApc2 : within coordinates of
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
1SNPG GGGG   G GGAG       G          G      G A    G A/G
rs49544194
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80298128fApc2 : within coordinates of
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
1SNPG GGGG   A GGGG       G          G      G G    G A/G
rs52487474
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80298256fApc2 : within coordinates of
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
1SNPG GGGG     GGAG       G          G      G      A A/G
rs47318231
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80298974fApc2 : within coordinates of
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
1SNPG GGGG   G GGGG       G          G      G T    G G/T
rs46155110
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80299109fApc2 : within coordinates of
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
1SNPG GGGG     GGGG       G          G      G G    A A/G
rs49521431
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80299733fApc2 : within coordinates of
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
1SNPC CCCC   C CCAC       C          C      C A    C A/C
rs47569367
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80299785fApc2 : within coordinates of
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
1SNPA AAAA   A AAGA       A          A      A G    A A/G
rs47210544
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80300957fApc2 : Locus-Region
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
1SNPG GGGG   G GGAG       G          G      G A    G A/G
rs47531163
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80301089fApc2 : Locus-Region
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
1SNPG GGGG   G GGAG       G          G      G A    G A/G
rs46420510
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80301581fApc2 : Locus-Region
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
1SNPA AAAA   G AAGA       A          A      A G    A A/G
rs48018953
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80301680fApc2 : Locus-Region
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
1SNPG GGGG   G GGCG       G          G      G C    G C/G
rs49279060
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80303559fApc2 : Intron
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
1SNPC CCCC   C CCTC       C          C      C T    C C/T
rs51152171
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80303588fApc2 : Intron
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
1SNPT TTTT   C TTCT       T          T      T C    T C/T
rs51487318
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80303611fApc2 : Intron
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
1SNPC CCCC   C CCAC       C          C      C A    C A/C
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs48643981
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80304659fApc2 : Intron
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
1SNPC CCCC   A CCCC       C          C      C C    C A/C
rs47529464
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80304792fApc2 : Coding-Synonymous
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
1SNPG GGGG   A GGAG       G          G      G A    G A/G
rs47565708
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80305084fApc2 : Intron
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
1SNPG GGGG   G GGAG       G          G      G A    G A/G
rs45815721
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80305558fApc2 : Coding-Synonymous
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
1SNPA AAAA   G AAGA       A          A      A G    G A/G
rs48363789
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80305717fApc2 : Intron
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
1SNPG GGGG   T GGGG       G          G      G G    G G/T
rs45638711
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80306049fApc2 : Intron
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
1SNPG GGGG   G GGAG       G          G      G A    G A/G
rs48352588
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80306063fApc2 : Intron
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
1SNPG GGGG   A GGGG       G          G      G G    G A/G
rs50488804
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80306097fApc2 : Intron
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
1SNPA AAAA   C AACA       A          A      A C    A A/C
rs52019454
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80306603fApc2 : Intron
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
1SNPC CCCC   C CCCC       C          C      C C    T C/T
rs46372752
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80306604fApc2 : Intron
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
1SNPG GGGG   A GGGG       G          G      G G    G A/G
rs46659509
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80306973fApc2 : Intron
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
1SNPC CCCC   T CCCC       C          C      C C    C C/T
rs46527802
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80307184fApc2 : Coding-Synonymous
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
1SNPG GGGG   G GGAG       G          G      G A    G A/G
rs48335249
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80307564fApc2 : Coding-Synonymous
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
1SNPC CCCC   T CCCC       C          C      C C    C C/T
rs46464380
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80310339fApc2 : Intron
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
1SNPA AAAA     AAGA       A          A      A      A A/G
rs48503314
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80310439fApc2 : Intron
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
1SNP  GG G   G G AG       G          G      G A    G A/G
rs49139853
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80312351fApc2 : Coding-NonSynonymous
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
1SNPG GGGG   G GGTG       G          G      G T    G G/T
rs48626468
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80312419fApc2 : Coding-Synonymous
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
1SNPT TTTT     T CT       T                 T C    T C/T
rs46503426
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80313119fApc2 : Coding-NonSynonymous
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
1SNPC CCCC   C CCTC       C          C      C T    C C/T
rs45653316
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80313379fApc2 : Coding-NonSynonymous
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
1SNPG GGGG   G GGGG       G          G      G G    C C/G
rs49629759
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80313583fApc2 : Coding-Synonymous
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
1SNPC CCCC   C CCCC       C          C      C C    T C/T
rs50203024
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80313615fApc2 : Coding-NonSynonymous
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
1SNPG GGGG   G GGGG       G          G      G G    A A/G
rs50835571
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80313632fApc2 : Coding-NonSynonymous
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
1SNPC CCCC   C CCCC       C          C      C C    A A/C
rs49871071
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80314054fApc2 : Coding-Synonymous
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
1SNPG GGGG   G GGGG       G          G      G G    T G/T
rs51453976
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80314204fApc2 : Coding-Synonymous
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
1SNPA AAAA   A AAGA       A          A      A G    A A/G
rs45859915
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80314423fApc2 : Coding-Synonymous
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
1SNPT TTTT   C TTCT       T          T      T C    T C/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs13480662
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80315322fApc2 : Coding-NonSynonymous
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
3SNPTTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG GGGGGGG/T
rs49324701
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80315368fApc2 : Coding-Synonymous
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
1SNP  GGGG   G G AG       G          G      G A    G A/G
rs48544406
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80315436fApc2 : Coding-NonSynonymous
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
1SNPG GGGG   G GGAG       G          G      G A    G A/G
rs50451872
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80316173fApc2 : mRNA-UTR
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
1SNPT TTTT     TTCT       T          T      T C    C C/T
rs45989612
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80316180fApc2 : mRNA-UTR
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
1SNPT TTTT   C TTTT       T          T      T T    T C/T
rs46159133
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80316218fApc2 : mRNA-UTR
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
1SNPG GGGG   G GGAG       G          G      G A    G A/G
rs45692353
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80316314fApc2 : mRNA-UTR
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
1SNPC CCCC   C CCTC       C          C      C T    C C/T
rs51087976
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80316856fApc2 : mRNA-UTR
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
1SNPG GGGG   G GGAG       G          G      G A    G A/G
rs45849268
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80316935fApc2 : mRNA-UTR
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
1SNPG GGGG   A G GG       G          G      G G    G A/G
rs48494067
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80317016fApc2 : mRNA-UTR
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
1SNPG GGGG   G GGGG       G          G      G A    G A/G
rs51936984
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80317110fApc2 : mRNA-UTR
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
1SNPC CCCC   T CCTC       C          C      C T    T C/T
rs50781685
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80317877f2310011J03Rik : Locus-Region
Apc2 : mRNA-UTR
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
1SNPT TTTT     TTCT       T          T      T C    T C/T
rs51227789
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80318020f2310011J03Rik : Locus-Region
Apc2 : mRNA-UTR
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
1SNPT TTTT   T TTCT       T          T      T C    T C/T
rs50572528
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80318323f2310011J03Rik : mRNA-UTR
Apc2 : Locus-Region
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
1SNPC CCCC   C CCCC       C          C      C C    T C/T
rs47608761
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80318575f2310011J03Rik : mRNA-UTR
Apc2 : Locus-Region
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
1SNPC CCCC   C CCTC       C          C      C T    C C/T
rs50241691
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr10:80319257f2310011J03Rik : mRNA-UTR
Apc2 : 994 bp downstream of
Gn : within coordinates of
jams1 : within coordinates of
1SNPG GGGG   G G AG                         G A    G A/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
08/25/2015
MGI 6.0
The Jackson Laboratory