About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Pin1
protein (peptidyl-prolyl cis/trans isomerase) NIMA-interacting 1
MGI:1346036

117 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs51183820
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20650361fPin1 : Locus-Region1SNP  G                     A    A/G
rs47517687
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20650597fPin1 : Locus-Region1SNP TT                     C    C/T
rs47200571
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20650651fPin1 : Locus-Region1SNP  T       T             A    A/T
rs45784521
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20650728fPin1 : Locus-Region1SNP GG       G             T    G/T
rs30353337
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20650876fPin1 : Locus-Region2SNPTTA       A             A    A/T
rs50136453
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20650895fPin1 : Locus-Region1SNP  A       A             C    A/C
rs47076032
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20651559fPin1 : Locus-Region1SNPG GGG G   GG G       G    GAGA/G
rs47165449
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20651569fPin1 : Locus-Region1SNP  CCC C   C          A    A AA/C
rs6202199
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20652245fPin1 : Intron3SNP  TTTTTTGGT   T CTTT   T T   C/G/T
rs16794337
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20652356rPin1 : Intron1SNP  TT TTTT T   T CT T     T   C/T
rs6203340
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20652442fPin1 : Intron1SNP       G C                   C/G
rs29696848
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20653024fPin1 : Intron1SNP GA                          A/G
rs33666481
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20653035fPin1 : Intron2SNP CA       A                  A/C
rs30130902
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20653036fPin1 : Intron2SNP CG       G                  C/G
rs33708189
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20653491fPin1 : Intron3SNP GA            G      G      A/G
rs29593067
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20653520fPin1 : Intron1SNP TC                          C/T
rs29691537
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20653743fPin1 : Intron1SNP AG       G                  A/G
rs51388459
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20654161fPin1 : Intron1SNPT TTT T A TTTT       T    TTTA/T
rs47399650
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20654223fPin1 : Intron1SNPG GGG G A GGGG      GG    GGGA/G
rs47967750
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20654253fPin1 : Intron1SNPA AAA A G AAGA       A    AGAA/G
rs30293423
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20654313fPin1 : Intron3SNPAAGGG GGA GAAG      GA    AAAA/G
rs30238294
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20654702fPin1 : Intron3SNPGGAAA AAG AGGA       G    GGGA/G
rs30039564
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20654890fPin1 : Intron2SNP TC    C  C                  C/T
rs8266438
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20655198fPin1 : Intron1IN-DEL    -         - G--    -     -/G
rs8266439
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20655207fPin1 : Intron1SNP    C         C TCC    C     C/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs8266440
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20655342fPin1 : Intron1SNP    T         T AT     T     A/T
rs8266441
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20655369fPin1 : Coding-Synonymous1SNP    G         G AG     G     A/G
rs16797493
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20655418fPin1 : Coding-NonSynonymous1SNP    G         G AG           A/G
rs8266443
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20655634rPin1 : Intron1SNP  CCCCCC  C   T CT C   C T   C/T
rs8266442
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20655712rPin1 : Intron1SNP  CCCCCCA C   C CC C   C C   A/C
rs30428116
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20655864fPin1 : Intron2SNP GA    A  A                  A/G
rs29884423
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20656230fPin1 : Intron2SNP TG    G  G                  G/T
rs29646113
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20656277fPin1 : Intron2SNP TC    C  C                  C/T
rs108753059
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20656428fPin1 : Intron1SNP A        G                  A/G
rs45830184
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20656623fPin1 : Intron1SNPA AAA A G AAAA      AA    AAAA/G
rs238267337
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20656723fPin1 : Intron1SNP               G      G      G
rs50241358
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20656741fPin1 : Intron2SNP AG            A      A      A/G
rs29699155
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20656770fPin1 : Intron2SNP AG                          A/G
rs33718527
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20657439fPin1 : Intron2SNPGGA    A  A                  A/G
rs46265126
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20657524fPin1 : Intron1SNPC CCC C G CCGC      GC    C CC/G
rs49672263
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20657843fPin1 : Intron2SNPC CCC C C CCCT T    CCT   TCTC/T
rs47519971
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20657853fPin1 : Intron1SNPT TTT T C TTCT      TT    TCTC/T
rs48495871
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20658084fPin1 : Intron1SNPA AAA A G AAGA      AA    AGAA/G
rs50723939
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20658206fPin1 : Intron1SNPG GGG G C GGCG      GG    GCGC/G
rs50092704
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20658225fPin1 : Intron1SNPC CCC C A CC C      CC    CACA/C
rs49141387
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20659459fPin1 : Intron1SNPG GGG G A GGAG      GG    GAGA/G
rs29633542
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20659598fPin1 : Intron3SNPAAG    G  G    A      A      A/G
rs47741390
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20660124fPin1 : Intron1SNPG GGG G G GGAG      GG    GAGA/G
rs46729260
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20660210fPin1 : Intron2SNPCCTTT T C TCCT       C    CCCC/T
rs47568098
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20660325fPin1 : Intron1SNPA AAA A C AACA       A    ACAA/C
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs49525527
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20660445fPin1 : Intron2SNPCCGGG G G GCGG      GC    CGCC/G
rs51073094
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20660492fPin1 : Intron1SNPA AAA A C A AA      AA    AAAA/C
rs49559641
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20660525fPin1 : Intron1SNPA AAA A G AAGA      AA    AGAA/G
rs47860499
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20660532fPin1 : Intron1SNPT TTT T   TT T      TT    TCTC/T
rs50453442
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20660569fPin1 : Intron1SNPT TTT T C TT T       T    TCTC/T
rs51084948
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20660702fPin1 : Intron1SNPT TTT T T TTGT       T    TTTG/T
rs51938955
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20660873fPin1 : Intron1SNPA AAA A G AA A      AA    AGAA/G
rs46567429
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20660891fPin1 : Intron1SNPT TTT T C TTCT      TT    TCTC/T
rs51399893
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20660987fPin1 : Intron1SNPT TTT T G TTGT      TT    TGTG/T
rs33679025
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20661037fPin1 : Intron2SNP GT    T  T                  G/T
rs50346991
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20661273fPin1 : Intron1SNPG GGG G G GGAG       G    GGGA/G
rs48528914
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20661281fPin1 : Intron1SNPT TTT T C TT T      TT    TTTC/T
rs49528292
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20661312fPin1 : Intron1SNPG GGG G A GGAG      GG    GAGA/G
rs48836319
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20661341fPin1 : Intron1SNPA AAA A G AAGA       A    AGAA/G
rs30037977
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20661527fPin1 : Intron3SNP TC    C  C    T      T      C/T
rs30288097
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20661529fPin1 : Intron3SNP CT    T  T    C      C      C/T
rs30377572
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20661583fPin1 : Intron4SNPAACCC CCA CA A A    CAA    AAA/C
rs51416807
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20661645fPin1 : Intron1SNPG GGG G A GGAG      GG    GAGA/G
rs33671265
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20661682fPin1 : Intron2SNP TA    A  A                  A/T
rs30234407
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20661690fPin1 : Intron4SNPTTCCC CCC CTTT T    CTT   TTTC/T
rs46403436
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20661834fPin1 : Intron1SNPG GGG G G GAGG       A    AGAA/G
rs8266449
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20661891rPin1 : Intron2SNP      C   C   C G C    C     C/G
rs8266448
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20661992rPin1 : Intron3SNPA AAAAAAC AACAA CAAAAA A AACAA/C
rs8266447
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20662043rPin1 : Intron2SNPC AAAAAAC ACCAC CCAAAC A C  CA/C
rs8266446
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20662054rPin1 : Intron3SNPTTCCCCCCC CTCCT CTCCCT C TTCTC/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs8266445
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20662082rPin1 : Intron1SNP  AAAAAA  A   A CAAA   A A   A/C
rs48289327
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20662263fPin1 : Intron1SNPG GGG G G GGAG      GG    GAGA/G
rs8266444
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20662284rPin1 : Intron1IN-DEL  A  AAA  A   A -AAA   A A   -/A
rs8266470
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20662423rPin1 : Intron2SNP   CC CC  C   C T C      C   C/T
rs51783040
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20662524fPin1 : Intron1SNPG GGG G G GGAG       G    GAGA/G
rs46683642
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20662545fPin1 : Intron1SNPG GGG G A GGGG      GG    GGGA/G
rs8266469
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20662653rPin1 : Intron1IN-DEL  -  -A -       A---   - -   -/A
rs8266468
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20662654rPin1 : Intron1IN-DEL  A  A- A       AAAA   A A   -/A
rs8266467
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20662830rPin1 : Intron2SNPT TTTTTTC TTCTT CT TTT T TTCTC/T
rs8266466
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20662859rPin1 : Intron1SNP  GGGGGGG G   G T GG   G G   G/T
rs8266465
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20662976rPin1 : Intron1SNP   A  AA  A   A G            A/G
rs8266456
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20663056rPin1 : Intron2SNP  TTTTTTT     T CTTT   T T   C/T
rs8266455
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20663090rPin1 : Intron1SNP  TTTTTTT T   T CTTT   T T   C/T
rs8266454
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20663096rPin1 : Intron1SNP  TTTTTTT T   T CTTT   T T   C/T
rs8266453
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20663122rPin1 : Intron1SNP  CCCCCCC C   C TCCC   C C   C/T
rs8266452
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20663143rPin1 : Intron1IN-DEL  CCCCCCC C   C -CCC   C C   -/C
rs8266451
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20663233rPin1 : Coding-Synonymous1SNP  AAAAAAG A   A AAAA   A A   A/G
rs8266450
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20663334rPin1 : mRNA-UTR1SNP  GGGGGGG G   G AGGG   G G   A/G
rs8266464
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20663645rPin1 : mRNA-UTR2SNP   CC CC  C   C T C    C C   C/T
rs51441403
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20663646fPin1 : mRNA-UTR1SNPT TTT T C TTTT      TT    TTTC/T
rs8266463
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20663730rPin1 : mRNA-UTR2IN-DEL  CCCCCCC C   C -CCC   C C   -/C
rs8266462
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20663775rPin1 : mRNA-UTR2SNP   AAAAAA A   A CAA    A A   A/C
rs8266461
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20663782rPin1 : mRNA-UTR3SNPA AAAAAAG AAGAA GAAAAA A AAGAA/G
rs8266460
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20663789rPin1 : mRNA-UTR2SNP  TTTTTTC T   T TTTT   T T   C/T
rs46374342
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20663930fPin1 : mRNA-UTR1SNP A                      C    A/C
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs16794338
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20663934rPin1 : mRNA-UTR4Mixed TGGGGGGG G   T -TGG   G T   -/G/T
rs8266459
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20663985rPin1 : mRNA-UTR1SNP  TTTTTTT T   T CT T   T T   C/T
rs8266458
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20663987rPin1 : mRNA-UTR1SNP  TTTTTTT T   T CT T   T T   C/T
rs8266457
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20664003rPin1 : mRNA-UTR1SNP  AAAAAAA A   A GAAA   A A   A/G
rs48875082
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20664660fPin1 : mRNA-UTR1SNPG GGG G G GGAG      GG    GGGA/G
rs49297500
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20665550fPin1 : mRNA-UTR1SNPA AAA A G AAAA       A    AAAA/G
rs48867930
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20665726fPin1 : mRNA-UTR2SNPC CCC C   CCAC      CC  A CACA/C
rs50447920
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20665798fPin1 : mRNA-UTR2SNPA AAA A A AATA       A  T ATAA/T
rs46667082
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20665912fPin1 : mRNA-UTR2SNPG GGG G A GGAG      GG  A GAGA/G
rs49534550
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20666022fPin1 : mRNA-UTR2SNPA AAA A C AACA      AA  C ACAA/C
rs51252422
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20666166fPin1 : mRNA-UTR2SNPA AAA A G AAGA      AA  G AGAA/G
rs48416668
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20666266fPin1 : mRNA-UTR1SNPG GGG G A GGGG      GG    GGGA/G
rs48617779
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20667009fPin1 : Locus-Region1SNP AG                          A/G
rs48698079
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20667602fOlfm2 : Locus-Region
Pin1 : 1018 bp downstream of
1SNP  GGG G A G GG       G    GGGA/G
rs51475281
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20667603fOlfm2 : Locus-Region
Pin1 : 1019 bp downstream of
2SNPT CCC C   CTCC       T    TCTC/T
rs48164182
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20667616fOlfm2 : Locus-Region
Pin1 : 1032 bp downstream of
1SNPC CCC C T CCCC      CC    CCCC/T
rs47846848
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20668206fOlfm2 : Coding-Synonymous
Pin1 : 1622 bp downstream of
1SNPG GGG G A GGGG      GG    GGGA/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
08/18/2015
MGI 6.0
The Jackson Laboratory