About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
Genome Coordinate Discrepancy
The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details).
 Symbol
Name
ID
Pin1
protein (peptidyl-prolyl cis/trans isomerase) NIMA-interacting 1
MGI:1346036

103 matching SNPs displayed


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs30353337
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20455320fPin1 : Locus-Region1SNPTTA       A               A/T
rs47076032
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20456003fPin1 : Locus-Region1SNPG GGG G   GG G      G  GAGA/G
rs47165449
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20456013fPin1 : Locus-Region1SNP  CCC C   C         A  A AA/C
rs6202199
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20456689fPin1 : Intron3SNP  TTTTTTGGT   TCTTT  TT   C/G/T
rs16794337
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20456800rPin1 : Intron1SNP  TT TTTT T   TCT T   T   C/T
rs6203340
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20456886fPin1 : Intron1SNP       G C                C/G
rs29696848
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20457435fPin1 : Intron1SNP GA                       A/G
rs33666481
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20457479fPin1 : Intron1SNP CA                       A/C
rs30130902
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20457480fPin1 : Intron1SNP CG                       C/G
rs33708189
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20457935fPin1 : Intron1SNP GA                       A/G
rs29593067
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20457960fPin1 : Intron1SNP TC                       C/T
rs29691537
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20458187fPin1 : Intron1SNP AG       G               A/G
rs51388459
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20458605fPin1 : Intron1SNPT TTT T A TTTT      T  TTTA/T
rs47399650
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20458667fPin1 : Intron1SNPG GGG G A GGGG     GG  GGGA/G
rs47967750
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20458697fPin1 : Intron1SNPA AAA A G AAGA      A  AGAA/G
rs30293423
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20458757fPin1 : Intron2SNPAAGGG GGA GAAG     GA  AAAA/G
rs30238294
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20459146fPin1 : Intron2SNPGGAAA AAG AGGA      G  GGGA/G
rs30039564
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20459334fPin1 : Intron1SNP TC    C  C               C/T
rs8266438
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20459642fPin1 : Intron1IN-DEL    -         -G--   -    -/G
rs8266439
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20459651fPin1 : Intron1SNP    C         CTCC   C    C/T
rs8266440
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20459786fPin1 : Intron1SNP    T         TAT    T    A/T
rs8266441
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20459813fPin1 : Coding-Synonymous1SNP    G         GAG    G    A/G
rs16797493
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20459862fPin1 : Coding-NonSynonymous1SNP    G         GAG         A/G
rs8266443
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20460078rPin1 : Intron1SNP  CCCCCC  C   TCT C  CT   C/T
rs8266442
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20460156rPin1 : Intron1SNP  CCCCCCA C   CCC C  CC   A/C
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs30428116
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20460299fPin1 : Intron1SNP GA    A  A               A/G
rs29884423
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20460674fPin1 : Intron1SNP TG    G  G               G/T
rs29646113
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20460721fPin1 : Intron1SNP TC    C  C               C/T
rs45830184
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20461067fPin1 : Intron1SNPA AAA A G AAAA     AA  AAAA/G
rs29699155
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20461214fPin1 : Intron1SNP AG                       A/G
rs33718527
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20461883fPin1 : Intron1SNPGGA    A  A               A/G
rs46265126
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20461968fPin1 : Intron1SNPC CCC C G CCGC     GC  C CC/G
rs49672263
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20462287fPin1 : Intron1SNPC CCC C C CCCT     CC  TCTC/T
rs47519971
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20462297fPin1 : Intron1SNPT TTT T C TTCT     TT  TCTC/T
rs48495871
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20462528fPin1 : Intron1SNPA AAA A G AAGA     AA  AGAA/G
rs50723939
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20462650fPin1 : Intron1SNPG GGG G C GGCG     GG  GCGC/G
rs50092704
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20462669fPin1 : Intron1SNPC CCC C A CC C     CC  CACA/C
rs49141387
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20463903fPin1 : Intron1SNPG GGG G A GGAG     GG  GAGA/G
rs29633542
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20464042fPin1 : Intron1SNPAAG    G  G               A/G
rs47741390
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20464568fPin1 : Intron1SNPG GGG G G GGAG     GG  GAGA/G
rs46729260
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20464654fPin1 : Intron1SNPC TTT T C TCCT      C  CCCC/T
rs47568098
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20464769fPin1 : Intron1SNPA AAA A C AACA      A  ACAA/C
rs49525527
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20464889fPin1 : Intron1SNPC GGG G G GCGG     GC  CGCC/G
rs51073094
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20464936fPin1 : Intron1SNPA AAA A C A AA     AA  AAAA/C
rs49559641
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20464969fPin1 : Intron1SNPA AAA A G AAGA     AA  AGAA/G
rs47860499
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20464976fPin1 : Intron1SNPT TTT T   TT T     TT  TCTC/T
rs50453442
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20465013fPin1 : Intron1SNPT TTT T C TT T      T  TCTC/T
rs51084948
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20465146fPin1 : Intron1SNPT TTT T T TTGT      T  TTTG/T
rs51938955
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20465317fPin1 : Intron1SNPA AAA A G AA A     AA  AGAA/G
rs46567429
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20465335fPin1 : Intron1SNPT TTT T C TTCT     TT  TCTC/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs51399893
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20465431fPin1 : Intron1SNPT TTT T G TTGT     TT  TGTG/T
rs33679025
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20465481fPin1 : Intron1SNP GT    T  T               G/T
rs50346991
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20465717fPin1 : Intron1SNPG GGG G G GGAG      G  GGGA/G
rs48528914
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20465725fPin1 : Intron1SNPT TTT T C TT T     TT  TTTC/T
rs49528292
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20465756fPin1 : Intron1SNPG GGG G A GGAG     GG  GAGA/G
rs48836319
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20465785fPin1 : Intron1SNPA AAA A G AAGA      A  AGAA/G
rs30037977
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20465971fPin1 : Intron1SNP TC    C  C               C/T
rs30288097
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20465973fPin1 : Intron1SNP CT    T  T               C/T
rs30377572
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20466027fPin1 : Intron2SNPAACCC CCA CA A     CA   AAA/C
rs51416807
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20466089fPin1 : Intron1SNPG GGG G A GGAG     GG  GAGA/G
rs33671265
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20466126fPin1 : Intron1SNP TA    A  A               A/T
rs30234407
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20466134fPin1 : Intron2SNPTTCCC CCC CTTT     CT  TTTC/T
rs46403436
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20466278fPin1 : Intron1SNPG GGG G G GAGG      A  AGAA/G
rs8266449
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20466335rPin1 : Intron2SNP      C   C   CG C   C    C/G
rs8266448
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20466436rPin1 : Intron3SNPA AAAAAAC AACAACAAAAAAAACAA/C
rs8266447
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20466487rPin1 : Intron2SNPC AAAAAAC ACCACCCAAACAC  CA/C
rs8266446
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20466498rPin1 : Intron3SNPTTCCCCCCC CTCCTCTCCCTCTTCTC/T
rs8266445
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20466526rPin1 : Intron1SNP  AAAAAA  A   ACAAA  AA   A/C
rs48289327
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20466707fPin1 : Intron1SNPG GGG G G GGAG     GG  GAGA/G
rs8266444
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20466728rPin1 : Intron1IN-DEL  A  AAA  A   A-AAA  AA   -/A
rs8266470
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20466867rPin1 : Intron2SNP   CC CC  C   CT C    C   C/T
rs51783040
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20466968fPin1 : Intron1SNPG GGG G G GGAG      G  GAGA/G
rs46683642
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20466989fPin1 : Intron1SNPG GGG G A GGGG     GG  GGGA/G
rs8266468
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20467098rPin1 : Intron1IN-DEL  A  A- A      AAAA  AA   -/A
rs8266469
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20467098rPin1 : Intron1IN-DEL  -  -A -      A---  --   -/A
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs8266467
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20467274rPin1 : Intron2SNPT TTTTTTC TTCTTCT TTTTTTCTC/T
rs8266466
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20467303rPin1 : Intron1SNP  GGGGGGG G   GT GG  GG   G/T
rs8266465
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20467420rPin1 : Intron1SNP   A  AA  A   AG          A/G
rs8266456
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20467500rPin1 : Intron2SNP  TTTTTTT     TCTTT  TT   C/T
rs8266455
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20467534rPin1 : Intron1SNP  TTTTTTT T   TCTTT  TT   C/T
rs8266454
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20467540rPin1 : Intron1SNP  TTTTTTT T   TCTTT  TT   C/T
rs8266453
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20467566rPin1 : Intron1SNP  CCCCCCC C   CTCCC  CC   C/T
rs8266452
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20467587rPin1 : Intron1IN-DEL  CCCCCCC C   C-CCC  CC   -/C
rs8266451
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20467677rPin1 : Coding-Synonymous1SNP  AAAAAAG A   AAAAA  AA   A/G
rs8266450
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20467778rPin1 : mRNA-UTR1SNP  GGGGGGG G   GAGGG  GG   A/G
rs8266464
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20468089rPin1 : mRNA-UTR2SNP   CC CC  C   CT C   CC   C/T
rs51441403
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20468090fPin1 : mRNA-UTR1SNPT TTT T C TTTT     TT  TTTC/T
rs8266463
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20468174rPin1 : mRNA-UTR2IN-DEL  CCCCCCC C   C-CCC  CC   -/C
rs8266462
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20468219rPin1 : mRNA-UTR2SNP   AAAAAA A   ACAA   AA   A/C
rs8266461
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20468226rPin1 : mRNA-UTR3SNPA AAAAAAG AAGAAGAAAAAAAAGAA/G
rs8266460
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20468233rPin1 : mRNA-UTR2SNP  TTTTTTC T   TTTTT  TT   C/T
rs16794338
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20468374rPin1 : mRNA-UTR4Mixed TGGGGGGG G   T-TGG  GT   -/G/T
rs8266459
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20468429rPin1 : mRNA-UTR1SNP  TTTTTTT T   TCT T  TT   C/T
rs8266458
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20468431rPin1 : mRNA-UTR1SNP  TTTTTTT T   TCT T  TT   C/T
rs8266457
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20468447rPin1 : mRNA-UTR1SNP  AAAAAAA A   AGAAA  AA   A/G
rs48875082
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20469104fPin1 : mRNA-UTR1SNPG GGG G G GGAG     GG  GGGA/G
rs49297500
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20469994fPin1 : mRNA-UTR1SNPA AAA A G AAAA      A  AAAA/G
rs48867930
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20470170fOlfm2 : Locus-Region
Pin1 : mRNA-UTR
1SNPC CCC C   CCAC     CC  CACA/C
rs50447920
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20470242fOlfm2 : Locus-Region
Pin1 : mRNA-UTR
1SNPA AAA A A AATA      A  ATAA/T
rs46667082
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20470356fOlfm2 : Locus-Region
Pin1 : mRNA-UTR
1SNPG GGG G A GGAG     GG  GAGA/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs49534550
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20470466fOlfm2 : Locus-Region
Pin1 : mRNA-UTR
1SNPA AAA A C AACA     AA  ACAA/C
rs51252422
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20470610fOlfm2 : Locus-Region
Pin1 : mRNA-UTR
1SNPA AAA A G AAGA     AA  AGAA/G
rs48416668
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:20470710fOlfm2 : Locus-Region
Pin1 : mRNA-UTR
1SNPG GGG G A GGGG     GG  GGGA/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
06/05/2013
MGI 5.13
The Jackson Laboratory