About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Slc26a4
solute carrier family 26, member 4
MGI:1346029

145 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29150467
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31517927fSlc26a4 : 1900 bp downstream of2SNPCCGGGGGCGG G GG  G GC/G
rs29191442
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31518063fSlc26a4 : 1764 bp downstream of1SNP GA   A A           A/G
rs29213833
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31518105fSlc26a4 : 1722 bp downstream of1SNP AC   C C           A/C
rs29162766
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31518106fSlc26a4 : 1721 bp downstream of1SNP GA   A A           A/G
rs36748109
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31518229fSlc26a4 : 1598 bp downstream of2SNPTTCCCC TCCTC CC  C CC/T
rs36309343
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31518242fSlc26a4 : 1585 bp downstream of1SNPA TTTT ATTAT TT  T TA/T
rs38411017
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31518425fSlc26a4 : 1402 bp downstream of1SNPG GGGG GG AG GG  GGGA/G
rs39711955
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31518465fSlc26a4 : 1362 bp downstream of1SNPA TTTT ATTAT TT  TATA/T
rs36818936
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31518702fSlc26a4 : 1125 bp downstream of1SNPC CCCC GC CC CC  CCCC/G
rs108306331
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31518761fSlc26a4 : 1066 bp downstream of1SNP AC                 A/C
rs38269717
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31518829fSlc26a4 : 998 bp downstream of2SNPAAGGGG GG GG GG  GGGA/G
rs50715160
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31518840fSlc26a4 : 987 bp downstream of1SNP GT                 G/T
rs37253558
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31518881fSlc26a4 : 946 bp downstream of2SNPTTCCCC CC CC CC  CCCC/T
rs45960554
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31519025fSlc26a4 : 802 bp downstream of1SNP CT                 C/T
rs49840873
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31519041fSlc26a4 : 786 bp downstream of1SNP TA                 A/T
rs49985122
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31519064fSlc26a4 : 763 bp downstream of1SNP GC                 C/G
rs45684957
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31519132fSlc26a4 : 695 bp downstream of1SNP TG                 G/T
rs45810853
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31519199fSlc26a4 : 628 bp downstream of1SNP TC                 C/T
rs37616669
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31519221fSlc26a4 : 606 bp downstream of2SNPGGAAAA GA  A AA  A AA/G
rs47397675
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31519274fSlc26a4 : 553 bp downstream of1SNP AT                 A/T
rs47091230
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31519285fSlc26a4 : 542 bp downstream of1SNP GA                 A/G
rs51897116
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31519291fSlc26a4 : 536 bp downstream of1SNP TC                 C/T
rs46180434
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31519341fSlc26a4 : Locus-Region1SNP TC                 C/T
rs45684948
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31519355fSlc26a4 : Locus-Region1SNP GA                 A/G
rs51072594
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31519370fSlc26a4 : Locus-Region1SNP CA     A           A/C
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs45720262
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31519420fSlc26a4 : Locus-Region1SNP AG     G           A/G
rs49429108
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31519553fSlc26a4 : Locus-Region1SNP CT     T           C/T
rs51612529
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31519561fSlc26a4 : Locus-Region1SNP TC     C           C/T
rs29167668
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31520057fSlc26a4 : mRNA-UTR3SNPTTCCCCCTC TC CC  CTCC/T
rs38914774
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31520500fSlc26a4 : Intron1SNPC CCCC TC CC CC  CCCC/T
rs36406497
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31520566fSlc26a4 : Intron1SNPA AAAA TAATA AA  AAAA/T
rs39698043
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31520747fSlc26a4 : Intron1SNPC CCCC ACCAC CC  CACA/C
rs36295232
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31520825fSlc26a4 : Intron1SNPT CCCC CC CC CC  CCCC/T
rs37890820
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31521113fSlc26a4 : Intron1SNPT TTTT CT CT TT  TCTC/T
rs36698957
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31521126fSlc26a4 : Intron1SNPC TTTT CT  T TT  T TC/T
rs37504724
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31521203fSlc26a4 : Intron1SNPC CCCC ACCAC CC  CACA/C
rs29145154
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31521266fSlc26a4 : Intron3SNPCCAAAAACAA A AA  A AA/C
rs37036442
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31521282fSlc26a4 : Intron1SNPA AAAA TA TA AA  ATAA/T
rs36365987
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31521465fSlc26a4 : Intron1SNPG GGGG AG AG GG  GAGA/G
rs29193357
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31521493fSlc26a4 : Intron2SNP CT   T T           C/T
rs29183152
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31521582fSlc26a4 : Intron3SNPGGT TTTTT  T TT  T TG/T
rs36841041
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31521649fSlc26a4 : Intron1SNPA AAAA GA GA AA  AGAA/G
rs37672791
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31522264fSlc26a4 : Intron1SNPC CCCC TCCTC CC  CTCC/T
rs36982362
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31522464fSlc26a4 : Coding-NonSynonymous1SNPT TTTT CT CT TT  TCTC/T
rs29137911
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31522675fSlc26a4 : Intron3SNPAATTTTTTT TT TT  TTTA/T
rs36664066
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31522760fSlc26a4 : Intron1SNPA AAAA GA GA AA  AGAA/G
rs29180331
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31522855fSlc26a4 : Intron3SNPAATTTT ATTAT TT  TATA/T
rs29176884
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31522977fSlc26a4 : Intron3SNPAACCCC CC CC CC  CCCA/C
rs29138781
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31523143fSlc26a4 : Intron3SNPCCTTTT CTTCT TT  TCTC/T
rs33846225
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31523223fSlc26a4 : Intron2SNP AG   G G           A/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29144843
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31523541fSlc26a4 : Intron2SNP TC   C C           C/T
rs33847055
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31523648fSlc26a4 : Intron2SNP CT   T T           C/T
rs29152375
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31524940fSlc26a4 : Intron1SNPGGG   A A           A/G
rs29172914
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31525903fSlc26a4 : Intron2SNPAAG   G G           A/G
rs29165000
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31525907fSlc26a4 : Intron2SNPGGA   A A           A/G
rs29185934
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31526235fSlc26a4 : Intron2SNPCCG   G G       G   C/G
rs29130376
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31526540fSlc26a4 : Intron2SNPGGA   A A           A/G
rs29193561
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31526833fSlc26a4 : Intron1SNPC T   T T           C/T
rs29157745
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31528053fSlc26a4 : Intron1SNPA C   C C           A/C
rs29126464
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31528399fSlc26a4 : Intron1SNP GA   A A           A/G
rs29143553
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31528514fSlc26a4 : Intron1SNP AG   G G           A/G
rs29178184
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31529120fSlc26a4 : Intron2SNPGGA   A A           A/G
rs246306296
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31530942fSlc26a4 : Intron1SNP            G  G    G
rs262895565
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31531592fSlc26a4 : Intron1SNP            A  A    A
rs39033292
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31533596fSlc26a4 : Intron1SNPG GGGG AGGAG GG  GAGA/G
rs36702242
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31533632fSlc26a4 : Intron1SNPA AAAA TAATA AA  ATAA/T
rs29198074
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31533711fSlc26a4 : Intron3SNPGGGGGGAGAAGA GA  AGGA/G
rs50638217
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31533870fSlc26a4 : Intron1SNP GG     A           A/G
rs29206188
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31533879fSlc26a4 : Intron2SNPTTG   G G           G/T
rs37716496
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31534231fSlc26a4 : Intron1SNPA AAAA AAAAA AA  AGAA/G
rs37739045
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31534353fSlc26a4 : Intron1SNPT TTTT CTTCT TT  TCTC/T
rs37076972
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31534453fSlc26a4 : Intron1SNPC CCCC CCCCC CC  CTCC/T
rs37643120
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31534643fSlc26a4 : Intron1SNPT TTTT TTTTT TT  TCTC/T
rs37434110
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31534771fSlc26a4 : Intron1SNPT TTTT TTTTT TT  TGTG/T
rs38086661
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31534844fSlc26a4 : Intron1SNPA AAAA AAA A AA  AGAA/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs38680928
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31534871fSlc26a4 : Intron1SNPT TTTT TTTTT TT  TCTC/T
rs36461115
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31534895fSlc26a4 : Intron1SNPT TTTT TTTTT TT  TCTC/T
rs29197289
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31535178fSlc26a4 : Intron3SNPGGTTTTTGTTGT TT  TGTG/T
rs29216734
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31535538fSlc26a4 : Intron3SNPCCCCCC CTTCT CT  TCCC/T
rs29134240
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31535563fSlc26a4 : Intron2SNPCCTTTT CCCCC TC  CCTC/T
rs37031596
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31535783fSlc26a4 : Intron1SNPT TTTT TTTTT TT  TCTC/T
rs37181502
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31535913fSlc26a4 : Coding-NonSynonymous1SNPC CCCC CCCCC CC  CTCC/T
rs36450562
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31535993fSlc26a4 : Intron1SNPG GGGG GGGGG GG  GAGA/G
rs37864845
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31536107fSlc26a4 : Intron1SNPC CCCC CCCCC CC  CGCC/G
rs36554957
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31536202fSlc26a4 : Intron1SNPC AAAA CAACA AA  ACAA/C
rs36299078
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31536270fSlc26a4 : Intron1SNPG GGGG AGGAG GG  GGGA/G
rs47692761
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31537475fSlc26a4 : Intron1SNP C      C           C
rs29196935
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31537802fSlc26a4 : Intron3SNP AA A G      A   G  A/G
rs33846738
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31537973fSlc26a4 : Intron2SNP CA   A A           A/C
rs29211108
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31538238fSlc26a4 : Intron2SNP AG   G G           A/G
rs29152485
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31538260fSlc26a4 : Intron2SNP AG   G G           A/G
rs50619152
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31538417fSlc26a4 : Intron1SNP AC                 A/C
rs29143874
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31538929fSlc26a4 : Intron2SNP CG   G         C   C/G
rs29159440
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31539198fSlc26a4 : Coding-Synonymous1SNP AG   G G           A/G
rs29141370
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31539347fSlc26a4 : Intron1SNP AG   G G           A/G
rs29142883
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31539413fSlc26a4 : Intron1SNP GA   A A           A/G
rs29170216
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31539577fSlc26a4 : Intron2SNP TC   C C       C   C/T
rs29206407
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31541092fSlc26a4 : Intron2SNP A    T T           A/T
rs29128622
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31541215fSlc26a4 : Intron2SNPCCT   T T           C/T
rs29151927
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31541224fSlc26a4 : Intron2SNPGGA   A A           A/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29159153
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31541601fSlc26a4 : Intron2SNPCCG   G             C/G
rs29207766
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31541847fSlc26a4 : Intron2SNP GA   A             A/G
rs29151537
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31541865fSlc26a4 : Intron3SNP CC C T      C   T  C/T
rs29183490
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31546928fSlc26a4 : Intron3SNPTTGGGGT T    G   T GG/T
rs29216435
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31547590fSlc26a4 : Intron2SNPCCT   C C           C/T
rs29216607
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31548217fSlc26a4 : Intron2SNP GA   G G           A/G
rs29220982
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31548279fSlc26a4 : Intron2SNP AG   A A           A/G
rs29491727
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31548363fSlc26a4 : Intron2SNPGGA   G G           A/G
rs29178487
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31548389fSlc26a4 : Intron2SNPGGA   A A           A/G
rs51168667
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31548441fSlc26a4 : Intron1SNP CA     C           A/C
rs48253262
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31548442fSlc26a4 : Intron1SNP AT     A           A/T
rs29217007
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31548463fSlc26a4 : Intron2SNPTTA   T T           A/T
rs29214577
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31550993fSlc26a4 : Intron2SNP  A   G G           A/G
rs29131365
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31551038fSlc26a4 : Intron2SNP  G   A A           A/G
rs29167025
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31551676fSlc26a4 : Intron2SNP CT   T T           C/T
rs29124956
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31551900fSlc26a4 : Intron2SNP CG   G G           C/G
rs29149636
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31552101fSlc26a4 : Intron2SNP GA   G G           A/G
rs29159373
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31553243fSlc26a4 : Intron2SNP TA   T T           A/T
rs29174634
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31554274fSlc26a4 : Intron2SNP  G   A             A/G
rs47636858
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31554777fSlc26a4 : Intron1SNP AG                 A/G
rs29157282
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31557248fSlc26a4 : Intron2SNP GG   T             G/T
rs6213783
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31557695fSlc26a4 : Intron1SNP     TC             C/T
rs52634849
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31557976fSlc26a4 : Intron1SNP  T     C           C/T
rs52620187
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31557980fSlc26a4 : Intron1SNP  T     C           C/T
rs107925341
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31558014fSlc26a4 : Intron1SNP  G     T           G/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs52631287
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31558792fSlc26a4 : Intron1SNP GG                 G
rs52610783
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31558796fSlc26a4 : Intron1SNP GC                 C/G
rs52654518
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31558810fSlc26a4 : Intron1SNP GC                 C/G
rs52643334
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31558818fSlc26a4 : Intron1SNP CG                 C/G
rs52628800
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31558824fSlc26a4 : Intron1SNP GC                 C/G
rs52606512
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31558832fSlc26a4 : Intron1SNP CG                 C/G
rs52719741
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31558838fSlc26a4 : Intron1SNP GC                 C/G
rs29149140
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31559975fSlc26a4 : Locus-Region3SNPCCTTTTCCCCCC TC  CCTC/T
rs29485476
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31560030fSlc26a4 : Locus-Region2SNPTTC   C C           C/T
rs29142525
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31560107fSlc26a4 : Locus-Region2SNP CT   T T           C/T
rs36500960
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31560148fSlc26a4 : Locus-Region1SNP  AAAA GAA A AA  A AA/G
rs29163440
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31560210fSlc26a4 : Locus-Region2SNP  TTTTATAA A TA  A TA/T
rs36559792
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31560265fSlc26a4 : Locus-Region1SNP  AAAA CAACA AA  ACAA/C
rs29207233
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31560504fSlc26a4 : Locus-Region3SNPA CCCCCCCCCC CC  CACA/C
rs38084246
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31560543fSlc26a4 : Locus-Region1SNPG GGGG AGGAG GG  G GA/G
rs37607666
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31560596fSlc26a4 : Locus-Region1SNPA AAAA GAAGA AA  AAAA/G
rs29212639
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31560799fSlc26a4 : Locus-Region2SNPTTC   C C           C/T
rs37235936
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31560934fSlc26a4 : Locus-Region1SNPG GGGG AGGAG GG  GAGA/G
rs29199964
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31561152fSlc26a4 : Locus-Region1SNP  A   G G           A/G
rs37684389
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr12:31561625fSlc26a4 : Locus-Region1SNPA AAAA AAAAA AA  AGAA/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
09/09/2014
MGI 5.19
The Jackson Laboratory