About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Sema4a
sema domain, immunoglobulin domain (Ig), transmembrane domain (TM) and short cytoplasmic domain, (semaphorin) 4A
MGI:107560

47 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs108536120
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:88434029rhsh : within coordinates of
Sema4a : 1930 bp downstream of
1SNP CC      C          C
rs32886327
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:88434663fhsh : within coordinates of
Sema4a : 1296 bp downstream of
1SNPT T TT C T TT TT  TCC/T
rs30406480
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:88434997fhsh : within coordinates of
Sema4a : 962 bp downstream of
3SNPTTATT TA T AA  A AAAA/T
rs32886332
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:88435027fhsh : within coordinates of
Sema4a : 932 bp downstream of
1SNPA AAAA A AATA AA AAAA/T
rs32887034
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:88435244fhsh : within coordinates of
Sema4a : 715 bp downstream of
1SNPA AAAA G AAGA AA AGAA/G
rs32887036
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:88435324fhsh : within coordinates of
Sema4a : 635 bp downstream of
1SNPA AAAA A AAAA  A ACAA/C
rs32887039
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:88435353fhsh : within coordinates of
Sema4a : 606 bp downstream of
1SNPC  CC    C CC    CTCC/T
rs32887041
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:88435779fhsh : within coordinates of
Sema4a : Locus-Region
1SNPC CCCC T CCCC CC CC C/T
rs32887043
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:88435827fhsh : within coordinates of
Sema4a : Locus-Region
1SNPG GGGG G GGAG G  GAGA/G
rs32887846
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:88435894fhsh : within coordinates of
Sema4a : Locus-Region
1SNPC CCCC   CCCC CC CT C/T
rs32887848
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:88436225fhsh : within coordinates of
Sema4a : mRNA-UTR
1SNPG GGGG G G AG  G GGGA/G
rs32887851
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:88436358fhsh : within coordinates of
Sema4a : mRNA-UTR
1SNPC CCCC C CCCC CC CTCC/T
rs32888744
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:88436451fhsh : within coordinates of
Sema4a : mRNA-UTR
1SNPT TTTT T T CT TT TCTC/T
rs13467770
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:88436972rhsh : within coordinates of
Sema4a : Coding-Synonymous
1SNPT TTTT C TTCT TT TCTC/T
rs13467768
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:88437133rhsh : within coordinates of
Sema4a : Coding-NonSynonymous
1SNPG GGGG A GGAG GG GA A/G
rs32888751
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:88437160fhsh : within coordinates of
Sema4a : Coding-NonSynonymous
1SNPC CCCC T CCCC CC CCTC/T
rs32888753
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:88437462fhsh : within coordinates of
Sema4a : Intron
1SNPC CCC  C CCTC CC CTCC/T
rs32889675
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:88437591fhsh : within coordinates of
Sema4a : Intron
1SNPC CCCC T CCCC CC CCCC/T
rs32889678
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:88437663fhsh : within coordinates of
Sema4a : Intron
1SNPC CCCC T CC C CC CCCC/T
rs32889681
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:88438423fhsh : within coordinates of
Sema4a : Intron
1SNPC CCCC T CCCC CC CCTC/T
rs32890494
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:88438518fhsh : within coordinates of
Sema4a : Coding-Synonymous
1SNPA AAAA G AAAA  A AGGA/G
rs32890497
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:88438557fhsh : within coordinates of
Sema4a : Coding-Synonymous
1SNPC CCCC T CCTC    CCTC/T
rs32890499
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:88438609fhsh : within coordinates of
Sema4a : Intron
1SNPC CCCC C CCCC CC CTCC/T
rs32890502
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:88439082fhsh : within coordinates of
Sema4a : Intron
1SNPG GGGG G GGGG GG GTGG/T
rs32891384
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:88439431fhsh : within coordinates of
Sema4a : Intron
1SNPC CCCC C CCAC CC CCCA/C
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs32891387
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:88439788fhsh : within coordinates of
Sema4a : Intron
1SNPG GGGG A GGAG GG GG A/G
rs32891389
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:88440551fhsh : within coordinates of
Sema4a : Intron
1SNPA AAAA C AACA AA ACCA/C
rs32891392
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:88440695fhsh : within coordinates of
Sema4a : Intron
1SNPT TTT  C T CT TT TC C/T
rs32892165
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:88441268fhsh : within coordinates of
Sema4a : Intron
1SNPA AAAA G AAGA AA AGGA/G
rs32892168
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:88441416fhsh : within coordinates of
Sema4a : Intron
1SNPT TTTT C TTTT TT TCCC/T
rs30007832
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:88441897fhsh : within coordinates of
Sema4a : Intron
3SNP TC   T  C   C  C   C/T
rs32892171
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:88441923fhsh : within coordinates of
Sema4a : Intron
1SNPA AAAA A AAGA AA AAAA/G
rs32892694
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:88442199fhsh : within coordinates of
Sema4a : Intron
1SNPC CCCC T CCCC CC CT C/T
rs32892697
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:88442546fhsh : within coordinates of
Sema4a : Intron
1SNPG GGGG G GGGG GG GAGA/G
rs32892699
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:88443001fhsh : within coordinates of
Sema4a : Intron
1SNPG GGGG G GGGG GG GAGA/G
rs32886296
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:88447867fhsh : within coordinates of
Sema4a : Intron
1SNPT TTTT G TTTT TT TGGG/T
rs32886298
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:88447903fhsh : within coordinates of
Sema4a : Intron
1SNPC CCCC A CC C CC CACA/C
rs6306365
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:88448312fhsh : within coordinates of
Sema4a : Intron
1SNP      A G           A/G
rs49951003
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:88449188fhsh : within coordinates of
Sema4a : Intron
1SNP GG      G          G
rs32886301
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:88449320fhsh : within coordinates of
Sema4a : Intron
1SNPT TTTT C TT T  T TC C/T
rs32887044
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:88450384fhsh : within coordinates of
Sema4a : Intron
1SNPT T TT C TT T    TCCC/T
rs32887047
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:88450526fhsh : within coordinates of
Sema4a : Coding-Synonymous
1SNPA AAAA G AAGA AA AAGA/G
rs32887049
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:88450818fhsh : within coordinates of
Sema4a : Intron
1SNPG GGGG A GG G GG GG A/G
rs32887052
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:88451911fhsh : within coordinates of
Sema4a : Intron
1SNPA AAA  A AAAA AA AGAA/G
rs32887885
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:88453159fhsh : within coordinates of
Sema4a : Intron
1SNPA AAAA A AA A  A  C A/C
rs32887888
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:88454200fhsh : within coordinates of
Sema4a : Intron
1SNPC C CC C CC C    CTCC/T
rs31521233
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr3:88456261fhsh : within coordinates of
Sema4a : Intron
Sema4a : Locus-Region
2SNP TA   T  T          A/T

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
07/15/2014
MGI 5.18
The Jackson Laboratory