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Genome
Coordinate Discrepancy The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details). |
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Symbol Name ID |
Gdap1 ganglioside-induced differentiation-associated-protein 1 MGI:1338002 |
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) |  | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | Allele Summary (all strains) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs31806552 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:17134143 | f | Gdap1 : Locus-Region | 1 | SNP | C | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32677637 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:17134472 | f | Gdap1 : Locus-Region | 1 | SNP | C | A | C | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32161943 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:17142280 | f | Gdap1 : Intron | 1 | SNP | T | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13475744 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:17146318 | f | Gdap1 : Intron | 2 | SNP | G | G | A | G | A | A | A | G | A | G | G | A | A | G | A | A | G | A | A | A | A | G | G | A | A | G | A | G | A | A | A | G | A | A | G | G | G | G | A | A | G | G | A | A | G | G | A/G | |
| rs6383966 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:17147229 | f | Gdap1 : Intron | 1 | SNP | G | T | G/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs6383968 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:17147231 | f | Gdap1 : Intron | 1 | SNP | A | T | A/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs6384452 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:17147267 | f | Gdap1 : Intron | 1 | SNP | A | C | A/C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs6385039 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:17147361 | f | Gdap1 : Intron | 1 | SNP | A | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs6385663 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:17147505 | f | Gdap1 : Intron | 1 | SNP | G | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs6386748 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:17147708 | f | Gdap1 : Intron | 1 | SNP | G | T | G/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32162906 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:17150387 | f | Gdap1 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | T | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32162909 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:17150572 | f | Gdap1 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | G | A | A | G | A | A | A | A | A | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32162912 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:17150804 | f | Gdap1 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | A | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32163715 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:17150824 | f | Gdap1 : Intron | 1 | SNP | G | G | C | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | C/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32163718 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:17151100 | f | Gdap1 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | G | C | C/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32163721 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:17151107 | f | Gdap1 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | A | T | T | A | T | T | T | T | T | T | A/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32164574 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:17151135 | f | Gdap1 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32164577 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:17151193 | f | Gdap1 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32164580 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:17151276 | f | Gdap1 : Coding-Synonymous | 1 | SNP | T | T | T | T | T | C | T | T | C | T | T | T | T | T | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32164583 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:17151335 | f | Gdap1 : Coding-Synonymous | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32165316 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:17151649 | f | Gdap1 : mRNA-UTR | 1 | SNP | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | T | T | T | T | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs6197532 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:17151662 | f | Gdap1 : mRNA-UTR | 2 | SNP | T | T | T | T | T | T | G | G | T | T | G | T | T | T | T | T | T | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs6197637 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:17151747 | f | Gdap1 : mRNA-UTR | 1 | SNP | T | G | G/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs6198038 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:17151747 | f | Gdap1 : mRNA-UTR | 1 | SNP | C | G | C/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs6198040 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:17151747 | f | Gdap1 : mRNA-UTR | 1 | SNP | G | C | C/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) | | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | Allele Summary (all strains) |
| rs6199072 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:17151957 | f | Gdap1 : mRNA-UTR | 2 | SNP | T | T | T | T | T | T | C | C | T | T | C | T | T | T | T | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32165322 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:17152046 | f | Gdap1 : mRNA-UTR | 1 | SNP | T | T | C | T | T | C | T | T | C | T | T | T | T | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32166595 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:17152082 | f | Gdap1 : mRNA-UTR | 1 | SNP | C | C | C | C | C | T | C | C | T | C | C | C | C | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32166598 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:17152238 | f | Gdap1 : mRNA-UTR | 1 | SNP | G | G | G | G | G | A | G | G | A | G | G | G | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32166601 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:17152290 | f | Gdap1 : mRNA-UTR | 1 | SNP | T | T | T | T | T | G | T | T | G | T | T | T | T | G | T | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32167474 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:17152345 | f | Gdap1 : mRNA-UTR | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32167477 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:17152497 | f | Gdap1 : mRNA-UTR | 1 | SNP | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32167480 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:17152767 | f | Gdap1 : mRNA-UTR | 1 | SNP | G | G | G | G | G | A | G | G | A | G | G | G | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32159256 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:17152958 | f | Gdap1 : mRNA-UTR | 1 | SNP | G | G | G | G | G | A | G | G | A | G | G | G | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32159259 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:17153045 | f | Gdap1 : mRNA-UTR | 1 | SNP | C | C | C | C | C | T | C | C | T | C | C | C | C | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32159262 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:17153227 | f | Gdap1 : mRNA-UTR | 1 | SNP | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | A | A | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32160475 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:17153274 | f | Gdap1 : mRNA-UTR | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | A | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32160478 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:17153340 | f | Gdap1 : mRNA-UTR | 1 | SNP | T | T | T | T | T | C | T | T | C | T | T | T | T | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32160481 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:17153477 | f | Gdap1 : mRNA-UTR | 1 | SNP | G | G | G | G | G | A | G | G | A | G | G | G | A | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32161364 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:17153519 | f | Gdap1 : mRNA-UTR | 1 | SNP | A | A | A | A | A | T | A | A | T | A | A | A | A | T | A | A/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32161367 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:17153634 | f | Gdap1 : mRNA-UTR | 1 | SNP | G | G | G | G | G | T | G | G | T | G | G | G | G | T | G | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32161370 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:17153847 | f | Gdap1 : mRNA-UTR | 1 | SNP | T | T | A | T | T | A | T | T | A | T | T | T | T | A | T | A/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32161373 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:17153878 | f | Gdap1 : mRNA-UTR | 1 | SNP | C | C | C | C | C | T | C | C | T | C | C | C | C | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32162256 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:17153956 | f | Gdap1 : mRNA-UTR | 1 | SNP | G | G | G | G | G | A | G | G | A | G | G | G | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32162259 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:17154058 | f | Gdap1 : mRNA-UTR | 1 | SNP | T | T | T | T | T | C | T | T | C | T | T | T | T | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32162262 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:17154435 | f | Gdap1 : Locus-Region | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32163165 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:17154518 | f | Gdap1 : Locus-Region | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32163168 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:17154564 | f | Gdap1 : Locus-Region | 1 | SNP | A | A | A | A | A | G | A | A | G | A | A | A | A | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32163171 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr1:17154704 | f | Gdap1 : Locus-Region | 1 | SNP | C | C | C | C | C | T | C | C | T | C | C | C | C | T | C | C/T |
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc |
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last database update 05/08/2013 MGI 5.13 |
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