About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Taf1
TAF1 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor
MGI:1336878

121 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs48337212
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101531891fStol : within coordinates of
Taf1 : Locus-Region
1SNP        A          A
rs29080530
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101532462fStol : within coordinates of
Taf1 : Locus-Region
1SNPA AAAA  A TA AA ATAA/T
rs29080529
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101532636fStol : within coordinates of
Taf1 : Locus-Region
1SNPG GGGG  GGCG GG GCGC/G
rs29080528
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101533129fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNP  GGGG  GGTG GG GTTG/T
rs29080527
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101533257fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPT TTTT  TTTT TC TTTC/T
rs31828817
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101534238fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPG GGGG GGGAG GG GAGA/G
rs29080526
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101535278fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPC CCCC TCC C CC CTCC/T
rs29080525
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101535429fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPG GGGG GGGAG GG GAGA/G
rs29080524
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101536795fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPG GGGG AGGGG GG GGGA/G
rs29080032
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101539065fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPT TTTT CTTCT TT TCCC/T
rs29080031
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101539246fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPG GGGG GGGGG GG GGAA/G
rs31828816
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101539829fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPG GGGG CGGGG  G GGGC/G
rs29080030
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101540067fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPG GGGG GGGTG GG GTGG/T
rs29080029
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101540414fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPC CCCC CCCTC CC CTCC/T
rs29080028
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101540659fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPC CCCC CCCCC CC CTCC/T
rs29080027
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101541169fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPC CCCC TCCTC CC CTTC/T
rs29080026
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101542570fStol : within coordinates of
Taf1 : Coding-NonSynonymous
1SNPG GGGG GGGAG GG GAGA/G
rs29080025
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101543277fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPA AAAA AAAGA AA AGAA/G
rs29080024
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101543317fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPT TTTT TTTCT TT TCTC/T
rs29079583
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101543922fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPG GGGG GGGAG GG GAGA/G
rs29079582
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101543962fStol : within coordinates of
Taf1 : Coding-Synonymous
1SNPT TTTT TTTGT TT TGTG/T
rs29079581
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101544246fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPG GGGG GGGCG GG GCGC/G
rs31828815
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101544311fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPT TTT  CTT T  T T TC/T
rs249877988
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101544451fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNP            C  T   C/T
rs31828814
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101545195fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPA AAAA GAAAA AA AAAA/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29079580
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101546289fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPG GGGG GGGAG GG GAGA/G
rs29079579
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101546377fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPT TTTT CTT T TT TCCC/T
rs29079578
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101546893fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPT TTTT TTTCT TT TCTC/T
rs29079577
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101547286fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPT TTTT TTTCT TT TCTC/T
rs31828193
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101547564fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPA AAAA CAAAA AA AAAA/C
rs29079576
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101548066fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPC CCCC GCCGC CC CGGC/G
rs29079575
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101548512fStol : within coordinates of
Taf1 : Coding-Synonymous
1SNPG GGGG GGGGG GG GGTG/T
rs219235849
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101552101fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNP            T  C   C/T
rs29079303
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101552150fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPC CCCC CCCTC  C CTCC/T
rs31828192
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101552466fStol : within coordinates of
Taf1 : Coding-NonSynonymous
1SNPG GGGG GGGGG GG GAGA/G
rs31828191
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101552619fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPT TTTT CTTTT TT TTTC/T
rs29079302
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101553419fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPA AAAA AAATA AA ATAA/T
rs31828190
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101553504fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPA AAAA AA GA AA AGAA/G
rs29079301
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101554450fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPC CCCC CCCCC CC CCTC/T
rs31828189
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101556874fStol : within coordinates of
Taf1 : Coding-Synonymous
1SNPA AAAA AAAAA AA ACAA/C
rs29079300
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101557000fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPT TTTT TTTAT TT TATA/T
rs29079299
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101557252fStol : within coordinates of
Taf1 : Coding-Synonymous
1SNPG GGGG GGGAG GG GAGA/G
rs31828188
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101557436fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPC CCCC CCCGC CC CGCC/G
rs29079298
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101558977fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPC CCCC CCCCC CC CCTC/T
rs52220985
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101559344fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNP CA     A          A/C
rs29079297
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101559889fStol : within coordinates of
Taf1 : Coding-Synonymous
1SNPG GGGG GGGAG GG GAAA/G
rs29079296
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101559974fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPA AAAA GAAGA AA AGGA/G
rs29079295
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101560004fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPC CCCC GCCGC CC CGCC/G
rs29079294
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101560159fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPG GGGG GGGGG GG GGAA/G
rs29083881
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101560190fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPG GGGG GGGAG GG GAGA/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29083880
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101560996fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPC CCCC CCCCC CC CCTC/T
rs29083879
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101561035fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPC CCCC CCCTC CC CTCC/T
rs29083878
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101562925fStol : within coordinates of
Taf1 : Coding-Synonymous
1SNPA AAAA AAAGA AA AGAA/G
rs29083877
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101563956fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPC CCCC TCCTC CC CTTC/T
rs29083876
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101564236fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPG GGGG GGGAG GG GAGA/G
rs108002777
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101565052rStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNP AG     A          A/G
rs29083875
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101566401fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPC CCCC  CCTC CC CTCC/T
rs29083874
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101567369fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPG GGGG  GGAG GG GAAA/G
rs29083763
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101567571fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPT TTTT  TTCT TT T TC/T
rs31828187
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101568614fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPC CCCC  CCCC CC CTCC/T
rs29083762
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101569708fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPG GGGG  GGTG GG GTGG/T
rs29083761
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101570640fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPC CCCC  CCCC CC CCGC/G
rs29083760
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101570805fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPT TTTT  TTCT TT TCCC/T
rs29083759
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101571893fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPC CCCC CCCTC CC CTCC/T
rs29083758
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101571990fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPC CCCC CCCCC CC CCTC/T
rs29083757
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101572799fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPT TTTT TTTAT TT TATA/T
rs31828186
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101573031fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPC CCCC CCCTC CC CTCC/T
rs238272657
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101573710fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNP            T  A   A/T
rs29083756
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101573923fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNP  AA    AA      A GA/G
rs31828185
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101574424fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPG GGGG AGGAG GG GAAA/G
rs29083755
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101575933fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPA AAAA AAAAA AA AATA/T
rs29083754
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101576136fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPT TTTT GTTGT TT TGGG/T
rs31828184
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101576175fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPG GGGG GGGGG GG GTGG/T
rs31827313
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101576231fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPG GGGG GGGGG GG GCGC/G
rs29083343
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101576298fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPC CCCC CCCCC CC CCTC/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29083342
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101576332fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPA AAAA AAAAA AA AACA/C
rs29083341
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101578087fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPT TTTT TTTCT TT TCTC/T
rs29083340
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101578988fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPC CCCC CCCCC  C CCTC/T
rs29083339
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101581478fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPC CCCC CC TC CC CTCC/T
rs29083338
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101581802fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPT TTTT ATTAT TT TAAA/T
rs31827312
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101581897fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPC CCCC TCCCC CC CCCC/T
rs29083337
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101582293fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNP  AAAA GA GA AA AGGA/G
rs29083336
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101588231fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPA AAAA GAAGA AA AGGA/G
rs31827311
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101588696fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
2SNPG GCGG CGGCGGGGCGC C/G
rs29083335
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101590392fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPG GGGG GGGGG GG GGAA/G
rs29083334
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101590882fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPA AAAA GAAGA AA AGGA/G
rs29082773
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101591531fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPC CCCC CCCTC CC CTTC/T
rs29082772
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101591953fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPG GGGG GGGAG GG GAGA/G
rs29082771
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101593282fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPA AAAA GAAGA AA A GA/G
rs29082770
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101594127fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPG GGGG AGGGG GG GGGA/G
rs29082769
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101594217fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPG GGGG GGGGG GG GGTG/T
rs31246297
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101594776fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNP  T   T T          T
rs29082768
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101594787fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPG GGGG GGGAG GG GAGA/G
rs29082767
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101594971fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPG GGGG GGGAG GG GGGA/G
rs29082766
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101595214fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPG GGGG AGGAG GG GAAA/G
rs29082765
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101595431fStol : within coordinates of
Taf1 : Coding-Synonymous
1SNPC CCCC CCCTC CC CTCC/T
rs31827310
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101595524fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNP  AA A AAATA  A ATAA/T
rs31827309
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101595640fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPG GGGG AGGGG GG GGGA/G
rs31827308
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101595696fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPA AAAA GAAGA AA AGGA/G
rs29082764
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101595793fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPA AAAA  A GA  A AGGA/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29082203
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101596684fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPA AAAA AAAAA AA AAGA/G
rs29082202
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101596698fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPG GGGG GGGAG GG GAGA/G
rs31827307
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101596741fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPA AAAA GAAAA AA AAAA/G
rs29082201
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101597475fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPC CCCC CCCCC CC CCTC/T
rs31827306
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101597632fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPC CCCC TCC C CC C CC/T
rs31827305
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101597668fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPG GGGG CGG G GG G GC/G
rs31827304
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101598075fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPT TTTT CTTTT TT TTTC/T
rs29082200
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101598089fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPA AAAA AAATA AA ATAA/T
rs29082199
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101598919fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPC CCCC CCCTC CC CTCC/T
rs29082198
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101599285fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPG GGGG GGGGG GG GGAA/G
rs31834498
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101599299fStol : within coordinates of
Taf1 : Intron
1SNPC CCCC GCCCC  C CCCC/G
rs29082197
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101599783fStol : within coordinates of
Taf1 : mRNA-UTR
1SNPC CCCC TCCCC CC CCCC/T
rs29082196
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101600247fStol : within coordinates of
Taf1 : mRNA-UTR
1SNPT TTTT TTTTT TT TTCC/T
rs29082195
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101600290fStol : within coordinates of
Taf1 : mRNA-UTR
1SNPA AAAA AAAGA AA AGAA/G
rs29082194
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101601743fStol : within coordinates of
Taf1 : mRNA-UTR
1SNPA AAAA AAA A AA A GA/G
rs29081683
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101601987fStol : within coordinates of
Taf1 : Locus-Region
1SNPA AAAA AAAGA AA AGAA/G
rs29081682
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101602240fStol : within coordinates of
Taf1 : Locus-Region
1SNPG GGGG CGGCG GG GCCC/G
rs29081681
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101602491fStol : within coordinates of
Taf1 : 1457 bp downstream of
1SNPG GGGG GGGGG GG GGAA/G
rs29081680
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101602508fStol : within coordinates of
Taf1 : 1474 bp downstream of
1SNPG GGGG GGGGA GG GGGA/G
rs29081679
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101602854fStol : within coordinates of
Taf1 : 1820 bp downstream of
1SNPA AAAA AAAGA AA AGAA/G
rs29081678
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:101602897fStol : within coordinates of
Taf1 : 1863 bp downstream of
1SNPC CCCC CCCGC CC CGCC/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
10/21/2014
MGI 5.20
The Jackson Laboratory