About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Hdac6
histone deacetylase 6
MGI:1333752

110 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs33380043
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7928304fEras : Intron
Hdac6 : 1816 bp downstream of
1SNPC CCC CACA     CC CA A/C
rs33381366
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7928442fEras : Intron
Hdac6 : 1678 bp downstream of
1SNPT TTT TCTC     TT TC C/T
rs222698639
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7929927fEras : Locus-Region
Hdac6 : Locus-Region
1SNP           A     G   A/G
rs49661252
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7929988fEras : Locus-Region
Hdac6 : Locus-Region
1SNP        T            T
rs45648723
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7930070fEras : Locus-Region
Hdac6 : Locus-Region
2SNP T      T  A     T   A/T
rs33381368
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7930266fEras : Locus-Region
Hdac6 : mRNA-UTR
1SNPA AAA   A      AA AG A/G
rs33381371
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7930610fHdac6 : Intron1SNPA   A AGAG      A AG A/G
rs261535465
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7930972fHdac6 : Intron1SNP           T     C   C/T
rs33382234
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7931452fHdac6 : Intron1SNPG GGG GGG G    GG GC C/G
rs33382237
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7931492fHdac6 : Coding-NonSynonymous2SNPT T T TCTC C   TTT C C/T
rs33377294
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7931528fHdac6 : Coding-NonSynonymous1SNPT TTT TATA     TT TA A/T
rs33377297
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7931574fHdac6 : Coding-Synonymous1SNPC CCC CCCTC    CC CT C/T
rs33377299
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7931588fHdac6 : Coding-NonSynonymous1SNPT T T T T       T TA A/T
rs33377301
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7931616fHdac6 : Coding-Synonymous1SNPA   A   AT      A  T A/T
rs33377303
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7931809fHdac6 : Coding-NonSynonymous1SNPC CCC CTCT     CC CT C/T
rs33378306
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7931838fHdac6 : Coding-Synonymous1SNPG GGG GGGAG    GG GA A/G
rs33378308
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7931865fHdac6 : Coding-Synonymous1SNPT TTT TTTCT    TT TC C/T
rs33378311
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7931979fHdac6 : Intron1SNPG GGG GGGA     GG GA A/G
rs33378313
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7932268fHdac6 : Intron1SNP   C   T C      C  C C/T
rs33379286
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7932449fHdac6 : Intron1SNPG G    A G      G GGGA/G
rs33379289
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7932665fHdac6 : Intron1SNPA AA   GAAA     A AAAA/G
rs33379291
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7932939fHdac6 : Intron1SNP   C   A C      C  CCA/C
rs33380164
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7933020fHdac6 : Intron1SNPA AA   TAAA     A AAAA/T
rs33380166
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7933022fHdac6 : Intron1SNPA AA   A CA     A ACAA/C
rs33380167
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7933235fHdac6 : Intron1SNPG GGG  GGTG     G  TGG/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs33380170
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7933373fHdac6 : Intron1SNPG GGG  GGCG     G  C C/G
rs225604363
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7934035fHdac6 : Intron1SNP           T     C   C/T
rs259303407
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7934247fHdac6 : Coding-Synonymous1SNP           C     T   C/T
rs33380172
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7934339fHdac6 : Intron1SNPG      G A      G  A A/G
rs33381224
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7935192fHdac6 : Intron1SNPC      C A      C  A A/C
rs33381227
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7935225fHdac6 : Intron1SNPG      A A      G  A A/G
rs33381230
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7935340fHdac6 : Intron1SNPG G    C GG     G  G C/G
rs33381232
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7935563fHdac6 : Intron1SNPG GG   AGAG     G  A A/G
rs33382065
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7935655fHdac6 : Intron1SNP   A   GAG      A  GAA/G
rs33382067
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7935684fHdac6 : Intron1SNP       TCC         C C/T
rs33382068
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7935708fHdac6 : Intron1SNP   A   GAG      A  GAA/G
rs33382071
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7935764fHdac6 : Intron1SNPA AA   GAGA     A  GAA/G
rs33383004
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7936258fHdac6 : Coding-Synonymous1SNPA AA   AAGA     A  GAA/G
rs33383007
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7936579fHdac6 : Intron1SNP       CCT      C  C C/T
rs33383010
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7936638fHdac6 : Intron1SNPC CC   CC C     C  ACA/C
rs33383013
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7936798fHdac6 : Intron1SNPC CC   C TC     C  T C/T
rs227678090
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7936855fHdac6 : Intron1SNP           T     G   G/T
rs247469439
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7936863fHdac6 : Intron1SNP           T     C   C/T
rs33383786
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7937136fHdac6 : Intron1SNPT      T CT     T  CTC/T
rs33383789
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7937163fHdac6 : Intron1SNPC  C   C TC     C  TCC/T
rs33383792
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7937289fHdac6 : Intron2SNPA  A   A G G    AA G A/G
rs33384595
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7937310fHdac6 : Coding-Synonymous1SNP       T C      C  C C/T
rs33384596
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7937677fHdac6 : Coding-Synonymous1SNPG GG   G AG     G  A A/G
rs33381436
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7937689fHdac6 : Coding-Synonymous1SNPC  C   C C         T C/T
rs33381439
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7937854fHdac6 : Coding-Synonymous2SNPG G    G A A    GG A A/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs33381442
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7938080fHdac6 : Intron2SNPA A    G GAG    AA GAA/G
rs211775796
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7938123fHdac6 : Intron1SNP           T     C   C/T
rs236840960
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7938130fHdac6 : Intron1SNP           C     T   C/T
rs252641559
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7938146fHdac6 : Intron1SNP           T     G   G/T
rs33382395
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7938557fHdac6 : Intron1SNPA  A   G AA     A  A A/G
rs33382398
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7938590fHdac6 : Intron1SNPG GG   G CG     G  C C/G
rs33382400
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7938673fHdac6 : Intron2SNPA AA   G GAG    AA G A/G
rs33382403
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7939107fHdac6 : Intron1SNP       T C      C  C C/T
rs33383355
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7939763fHdac6 : Coding-Synonymous1SNPC  C   C A      C  A A/C
rs33383358
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7939841fHdac6 : Intron1SNPC CC   C TC     C  T C/T
rs232749279
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7939842fHdac6 : Intron1SNP           A     G   A/G
rs33383360
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7940143fHdac6 : Intron1SNPG GG   A G      G  G A/G
rs33383362
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7940442fHdac6 : Intron1SNP       C A      A  A A/C
rs45736551
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7940529fHdac6 : Intron1SNP  C                  C
rs251821407
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7940700fHdac6 : Intron1SNP           A     G   A/G
rs222355334
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7940727fHdac6 : Intron1SNP           A     T   A/T
rs244371723
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7941226fHdac6 : Intron1SNP           C     G   C/G
rs261016989
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7941286fHdac6 : Intron1SNP           T     C   C/T
rs33384345
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7941692fHdac6 : Intron2SNPT TT   TTCTC    TTCCTC/T
rs33384348
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7941732fHdac6 : Intron2SNPA AA   A G G    AAGGAA/G
rs261566757
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7941822fHdac6 : Intron1SNP           G     T   G/T
rs33384350
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7941962fHdac6 : Intron1SNPA A    A TA     A  T A/T
rs227688021
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7941967fHdac6 : Intron1SNP           G     A   A/G
rs33384353
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7942295fHdac6 : Intron1SNPC CC   A C      C CCCA/C
rs241531723
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7942350fHdac6 : Intron1SNP           C     T   C/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs33385286
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7942588fHdac6 : Intron1SNPA AA   AACA     A ACAA/C
rs33385289
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7942745fHdac6 : Intron1SNPC      C TC     C CT C/T
rs262494788
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7942859fHdac6 : Intron1SNP           T     C   C/T
rs33385292
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7942920fHdac6 : Intron1SNPT TTT TTTAT    TT TATA/T
rs33386155
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7943555fHdac6 : Intron1SNPC CCC CTCTC    CC CTCC/T
rs33386157
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7943598fHdac6 : Intron1SNPA AAA ACACA    AA ACAA/C
rs33386160
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7943798fHdac6 : Intron1SNPC CCC CCCCC    CC ACCA/C
rs33386163
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7944027fHdac6 : Intron1SNPC CCC CCCTC    CC CTCC/T
rs33386956
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7944260fHdac6 : Intron1SNPC CCC CCCTC    CC CTCC/T
rs231477518
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7944682fHdac6 : Intron1SNP           A     C   A/C
rs33386959
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7944830fHdac6 : Intron1SNPC CCC CTCTC    CC CTCC/T
rs251340069
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7944911fHdac6 : Intron1SNP           A     G   A/G
rs33386961
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7944964fHdac6 : Intron1SNPG GGG GAGAG    GG GAGA/G
rs211908251
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7945157fHdac6 : Intron1SNP           C     T   C/T
rs223991737
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7945323fHdac6 : Intron1SNP           T     C   C/T
rs246365218
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7945327fHdac6 : Intron1SNP           T     C   C/T
rs33387844
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7946191fHdac6 : Intron1SNPC CCC CCCTC    CC CTCC/T
rs33387847
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7946340fHdac6 : Intron1SNPG GGG GGGTG    GG GTGG/T
rs33387850
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7946439fHdac6 : Intron1SNPA AAA AGAGA    AA AGAA/G
rs33387853
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7946464fHdac6 : Intron1SNPC CCC CCCCC    CC CTCC/T
rs33388646
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7946893fHdac6 : Intron1SNPT TTT TCTCT    TT TCTC/T
rs8251145
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7946986rHdac6 : Coding-Synonymous1SNP       CT   C        C/T
rs8251144
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7947017rHdac6 : Coding-Synonymous1SNP   GAG GG   G G      A/G
rs8251143
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7947021rHdac6 : Coding-NonSynonymous1SNP    AGGGG   GG       A/G
rs8251142
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7947023rHdac6 : Coding-Synonymous1SNP   G        T        G/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs8251141
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7947032rHdac6 : Splice-Site1SNP    A  G    G        A/G
rs8251140
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7947077rHdac6 : Intron1SNP    CG GG   GGG      C/G
rs33388648
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7947738fHdac6 : mRNA-UTR1SNPG GGG GAGAG    GG GAGA/G
rs217317091
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7947757fHdac6 : mRNA-UTR1SNP           A     C   A/C
rs33388651
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7947991fHdac6 : Locus-Region1SNPC CCC CCCGC    CC CGCC/G
rs33388653
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7948023fHdac6 : Locus-Region1SNPC CCC CCCCC    CC T CC/T
rs33373975
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7948294fHdac6 : Locus-Region1SNPC CCC CTCCC    CC CCCC/T
rs33373977
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7948364fHdac6 : Locus-Region1SNPA AAA AGAGA    AA AGAA/G
rs33373980
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7948883fHdac6 : Locus-Region1SNPA AAA AGAGA    AA AGAA/G
rs33373983
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:7949223fHdac6 : Locus-Region1SNPC CCC C C C    CC CACA/C

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
12/09/2014
MGI 5.20
The Jackson Laboratory