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Genome
Coordinate Discrepancy The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details). |
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Symbol Name ID |
Tlr4 toll-like receptor 4 MGI:96824 |
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) |  | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | Allele Summary (all strains) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs27883180 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66487020 | f | Tlr4 : Locus-Region | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27883179 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66487329 | f | Tlr4 : Locus-Region | 1 | SNP | A | A | A | A | A | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13498452 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66487337 | f | Tlr4 : Locus-Region | 3 | SNP | A | A | G | A | G | G | A | A | G | A | A | G | A | A | G | G | A | A | A | A | G | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27883178 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66487429 | f | Tlr4 : Locus-Region | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | T | A | A/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27883177 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66487439 | f | Tlr4 : Locus-Region | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13489044 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66487474 | f | Tlr4 : Locus-Region | 2 | SNP | A | G | A | G | G | A | A | G | A | A | G | G | A | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27883176 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66487517 | f | Tlr4 : Locus-Region | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | A | C | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13489045 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66487544 | f | Tlr4 : Locus-Region | 2 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | A | T | T | A | T | T | T | T | T | T | T | T | A/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13498453 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66487566 | f | Tlr4 : Locus-Region | 2 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | C | A | A | C | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13489046 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66488146 | f | Tlr4 : Locus-Region | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13498454 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66488639 | f | Tlr4 : Locus-Region | 2 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | C | G | G | C | G | G | G | G | G | G | G | C | G | C/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13489047 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66488704 | f | Tlr4 : Locus-Region | 2 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | C | A | A | C | A | A | A | A | A | A | A | A | C | A | A/C | |||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13489048 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66488855 | f | Tlr4 : mRNA-UTR | 2 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A | G | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13498455 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66488931 | f | Tlr4 : Coding-Synonymous | 2 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | G | A | A | A | A | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13489049 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66489019 | f | Tlr4 : Intron | 2 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A | G | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31881478 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66489130 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | G | A | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13498456 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66489270 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | A | C | C | A | C | C | C | C | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13489050 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66489842 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | G | C | C | C | C | C/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27883175 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66489934 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32156836 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66489960 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | G | A | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13498457 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66489986 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | A | T | T | T | T | A/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13502541 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66490142 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27883174 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66490282 | f | Tlr4 : Intron | 2 | SNP | G | A | G | G | G | G | G | G | A | G | A | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13489051 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66490292 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13498458 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66490318 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | T | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) | | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | Allele Summary (all strains) |
| rs13489052 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66490333 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | A | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13498459 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66490384 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | C | T | T | C | T | T | T | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13489053 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66490450 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | A | C | C | A | C | C | C | C | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13489054 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66490564 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | A | T | A | T | T | A | A | A | A | T | A | A | A | A/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13498460 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66490576 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | C | T | C | T | T | C | C | C | C | T | C | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13489055 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66490657 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13498461 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66490726 | f | Tlr4 : Intron | 2 | SNP | T | C | T | C | C | T | T | T | T | T | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32621858 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66490868 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | C | T | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32183719 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66490954 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | A | G | A | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33023271 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66490994 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | T | C | T | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13489056 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66491102 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32583757 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66491258 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | C | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13502660 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66491896 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | A | C | C | C | C | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13489057 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66491945 | f | Tlr4 : Intron | 2 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A | G | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13489058 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66492082 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | T | C | T | C | C | T | T | T | T | T | T | C | T | T | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13498462 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66492100 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | T | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13489059 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66492186 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13498463 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66492482 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13489060 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66492501 | f | Tlr4 : Intron | 2 | SNP | G | G | C | G | C | C | G | G | G | G | G | G | G | G | G | C | G | G | G | G | G | G | G | C/G | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13489061 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66492617 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | G | T | T | T | T | T | T | T | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13498464 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66492624 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32776501 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66492804 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | A | T | T | A/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13489062 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66492811 | f | Tlr4 : Intron | 2 | SNP | T | C | T | T | T | C | T | T | T | T | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32797904 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66492900 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | C | A | C | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13498465 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66492996 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | C | G | G | G | G | G | G | C/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) | | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | Allele Summary (all strains) |
| rs13489063 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66493094 | f | Tlr4 : Intron | 2 | SNP | G | G | A | G | A | A | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | A | G | G | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13498466 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66493156 | f | Tlr4 : Intron | 3 | SNP | T | T | C | T | C | C | T | T | C | T | T | T | T | C | T | C | T | T | T | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13489064 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66493272 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | C | G | G | G | G | G | G | C/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13489065 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66493591 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13498467 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66493718 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | T | A | A | A | A | A | A | A | A/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13489066 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66493786 | f | Tlr4 : Intron | 2 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | A | C | C | A | C | C | A | C | C | C | C | C | C | C | C | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32092185 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66493916 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | C | T | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32398623 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66494160 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | A | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32995968 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66494222 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | A | C | C | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32822058 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66494273 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | A | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13498468 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66494548 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13489067 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66494644 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13489068 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66494680 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13498469 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66494736 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13489069 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66494853 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | A | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13498470 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66495043 | f | Tlr4 : Coding-NonSynonymous | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13489070 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66495077 | f | Tlr4 : Coding-Synonymous | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13498471 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66495120 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13489071 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66495228 | f | Tlr4 : Intron | 2 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | A | C | C | A | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13489072 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66495306 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | G | A | A | G | A | A | A | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13498472 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66495408 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | C | A | C | A | A | A | A | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13489073 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66495599 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13498473 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66495800 | f | Tlr4 : Intron | 2 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | C | T | T | C | T | T | C | T | T | T | T | T | T | T | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13489074 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66495861 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | T | A | A | A | A | A | A/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13489075 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66496158 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | G | A | A | G | A | A | A | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) | | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | Allele Summary (all strains) |
| rs13498474 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66496180 | f | Tlr4 : Intron | 3 | SNP | C | C | T | C | T | T | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32785901 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66496507 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | A | T | A | A | A/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32271837 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66496645 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | A | T | A | A | A/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13489076 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66496854 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | C | T | T | C | T | T | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13489077 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66496899 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | A | T | T | T | T | T | T | A/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27883173 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66496903 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13489078 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66496929 | f | Tlr4 : Intron | 2 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13489079 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66497022 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | A | T | T | T | T | A/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32500627 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66497693 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | A | C | A | A | A/C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32621396 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66498196 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | A | A | C | A | A | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13489080 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66499006 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | C | T | T | C | T | T | T | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13489081 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66499044 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | T | G | G | G | G | G | G | G | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13489082 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66499104 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13489083 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66499260 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27883172 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66499478 | f | Tlr4 : Intron | 2 | SNP | A | A | G | A | G | A | A | A | A | A | A | G | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13489084 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66499544 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | A | G | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13489085 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66499572 | f | Tlr4 : Intron | 2 | SNP | C | C | T | C | T | T | C | C | C | C | C | C | T | C | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13489086 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66499672 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | A | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13489087 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66499782 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | T | G | G | G | G | G | G | G/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27883171 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66499785 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | G | A | A | A | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13489088 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66499791 | f | Tlr4 : Intron | 3 | SNP | T | T | A | T | A | A | T | T | T | T | T | T | A | T | A | T | T | A | A | A/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27883170 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66499830 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13489089 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66500004 | f | Tlr4 : Intron | 2 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A | G | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27883169 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66500069 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13489090 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66500131 | f | Tlr4 : Intron | 2 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | T | G | G | T | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G/T | |||||||||||||||||||||||||||||||
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) | | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | Allele Summary (all strains) |
| rs13477751 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66500224 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C/T | ||||||
| rs27883168 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66500255 | f | Tlr4 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | C | G | C/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27883167 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66500317 | f | Tlr4 : Coding-Synonymous | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27883166 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66500483 | f | Tlr4 : Coding-NonSynonymous | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13489091 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66500516 | f | Tlr4 : Coding-NonSynonymous | 2 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | C | T | T | C | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13489092 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66500632 | f | Tlr4 : Coding-NonSynonymous | 2 | SNP | G | G | A | G | A | A | G | A | G | G | A | G | G | A | A | G | G | G | G | A | A | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13498475 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66500761 | f | Tlr4 : Coding-NonSynonymous | 1 | SNP | A | T | A | A | A | A | A | A | A | A/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13489093 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66500765 | f | Tlr4 : Coding-NonSynonymous | 2 | SNP | G | G | A | G | A | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13489094 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66501115 | f | Tlr4 : Coding-Synonymous | 2 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A | G | A | A | G | A | A | A | A | A | A | G | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27883165 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66501253 | f | Tlr4 : Coding-Synonymous | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13498476 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66501394 | f | Tlr4 : Coding-Synonymous | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13489095 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66501730 | f | Tlr4 : Coding-Synonymous | 2 | SNP | C | C | T | C | T | T | C | C | T | C | C | T | C | C | T | C | T | C | C | T | T | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13498477 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66501763 | f | Tlr4 : Coding-Synonymous | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27883164 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66501784 | f | Tlr4 : Coding-NonSynonymous | 2 | SNP | A | A | C | A | C | A | A | C | A | A | C | A | A | A | C | C | C | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13489096 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66501818 | f | Tlr4 : Coding-NonSynonymous | 2 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A | G | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27883163 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66502075 | f | Tlr4 : Coding-Synonymous | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs3023006 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66502140 | f | Tlr4 : Coding-NonSynonymous | 3 | SNP | C | C | C | C | C | C | A | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13498478 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66502162 | f | Tlr4 : Coding-Synonymous | 3 | SNP | C | C | T | C | T | C | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | T | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||
| rs4224524 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66502202 | f | Tlr4 : Coding-NonSynonymous | 1 | SNP | G | G | G | G | T | G | G | G | G/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13489097 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66502287 | f | Tlr4 : Coding-NonSynonymous | 3 | SNP | G | G | A | G | A | A | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | A | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27883162 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66502426 | f | Tlr4 : Coding-Synonymous | 1 | SNP | A | A | A | A | A | G | A | A | G | A | A | A | A | A | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27883161 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66502438 | f | Tlr4 : Coding-Synonymous | 1 | SNP | T | T | T | T | T | C | T | T | C | T | T | T | T | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27883160 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66502498 | f | Tlr4 : Coding-Synonymous | 1 | SNP | G | G | G | G | G | A | G | G | A | G | G | G | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27883159 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66502595 | f | Tlr4 : mRNA-UTR | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | A | C | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27883158 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66502683 | f | Tlr4 : mRNA-UTR | 1 | SNP | G | G | G | G | G | A | G | G | A | G | G | G | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) | | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | Allele Summary (all strains) |
| rs13498479 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66502700 | f | Tlr4 : mRNA-UTR | 3 | SNP | C | C | A | C | A | A | C | C | C | C | C | C | C | C | C | A | C | C | C | C | A | C | A | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27883157 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66502737 | f | Tlr4 : mRNA-UTR | 1 | SNP | T | T | T | T | T | A | T | T | T | T | T | T | T | T | A/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27883156 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66502784 | f | Tlr4 : mRNA-UTR | 2 | SNP | A | A | G | A | G | A | A | A | A | A | A | A | A | A | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27883155 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66502794 | f | Tlr4 : mRNA-UTR | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | T | G | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13489098 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66502839 | f | Tlr4 : mRNA-UTR | 2 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | C | T | T | C | T | T | C | T | T | T | T | T | T | T | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27883154 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66502874 | f | Tlr4 : mRNA-UTR | 1 | SNP | C | C | C | C | C | A | C | C | A | C | C | C | C | A | C | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13489099 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66502921 | f | Tlr4 : mRNA-UTR | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13498480 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66503770 | f | Tlr4 : mRNA-UTR | 2 | SNP | A | A | G | A | G | G | A | A | G | A | A | G | G | A | A | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13489100 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66503815 | f | Tlr4 : mRNA-UTR | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13498481 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:66504300 | f | Tlr4 : Locus-Region | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | A | T | T | T | T | A/T |
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc |
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