About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
Genome Coordinate Discrepancy
The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details).
 Symbol
Name
ID
Tnfrsf9
tumor necrosis factor receptor superfamily, member 9
MGI:1101059

101 matching SNPs displayed


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs32775268
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150292405fTnfrsf9 : Locus-Region1SNPA T   T    T                                  A/T
rs31881696
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150292530fTnfrsf9 : Locus-Region1SNPGGA   A    A                                  A/G
rs31891161
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150293138fTnfrsf9 : Locus-Region1SNP TC   C    C                                  C/T
rs31929384
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150293976fTnfrsf9 : Locus-Region1SNPAAG   G    G                                  A/G
rs32177341
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150294007fTnfrsf9 : Locus-Region1SNPCCA   A                                       A/C
rs32622494
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150294137fTnfrsf9 : Locus-Region1SNPG A   A    A                                  A/G
rs32079795
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150294244fTnfrsf9 : Locus-Region1SNPGGA   A    A                                  A/G
rs32720469
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150294695fTnfrsf9 : Intron1SNPA AAAA   G AAGA      A          A     A A   A A/G
rs32720472
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150294781fTnfrsf9 : Intron1SNPC CCCC   T CCTC      C          C     C C   C C/T
rs32721255
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150294948fTnfrsf9 : Intron1SNPC GGGG   C GGCG      G          G     G C   G C/G
rs31853064
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150295037fTnfrsf9 : Intron1SNP AG   G    G                                  A/G
rs32060376
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150295213fTnfrsf9 : Intron1SNP GT   T    G                                  G/T
rs32101275
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150295361fTnfrsf9 : Intron2SNPGGAGAG   G AAGG      A          A     A G   G A/G
rs32721259
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150295382fTnfrsf9 : Intron1SNPG GGGG   G GGAG      G          G     G A   G A/G
rs32709368
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150295553fTnfrsf9 : Intron1SNP GT        T                                  G/T
rs32721262
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150296554fTnfrsf9 : Intron1SNPT TTTT   T TTCT      T          T     T C   T C/T
rs32722185
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150296555fTnfrsf9 : Intron1SNPG GTG    T GG T      G          G     G     T G/T
rs32722188
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150296651fTnfrsf9 : Intron1SNPG GAGA   A GGGA      G          G     G G   A A/G
rs32475666
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150296871fTnfrsf9 : Intron1SNP GT   T                                       G/T
rs31922985
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150297388fTnfrsf9 : Intron1SNP TC   C    C                                  C/T
rs32071429
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150297401fTnfrsf9 : Intron2SNPAAGAGAG  G GGGA      G          G     G G   A A/G
rs32722193
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150297477fTnfrsf9 : Intron1SNPC CCCC   T CCCC      C          C     C C   C C/T
rs32723025
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150297680fTnfrsf9 : Intron1SNPT TTTT   C TT T      T          T     T     T C/T
rs32723028
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150297734fTnfrsf9 : Intron1SNPA AAAA   G AAAA      A          A     A A   A A/G
rs32723031
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150297750fTnfrsf9 : Intron1SNPT TTTT   T TTCT      T          T     T C   T C/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs32723784
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150298204fTnfrsf9 : Intron1SNPC CCCC   C CCTC      C          C     C T   C C/T
rs32723787
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150298475fTnfrsf9 : Intron1SNPG GGGG   A GGGG      G          G     G G   G A/G
rs32723790
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150298539fTnfrsf9 : Intron1SNPC  CCC   C CCCC      C          C     C T   C C/T
rs32723793
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150298710fTnfrsf9 : Intron1SNPA AAAA   C AACA      A          A     A C   A A/C
rs32717404
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150298767fTnfrsf9 : Intron1SNPT TTTT   C TTCT      T          T     T C   T C/T
rs32717407
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150298811fTnfrsf9 : Intron1SNPC CCCC   T CCCC      C          C     C C   C C/T
rs32717410
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150298882fTnfrsf9 : Intron1SNPA AAAA   G AAAA      A          A     A A   A A/G
rs32717412
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150298936fTnfrsf9 : Intron1SNPG GGGG   G GGAG      G          G     G A   G A/G
rs32717413
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150300395fTnfrsf9 : Intron
Tnfrsf9 : Locus-Region
1SNPT TTTT   C TTCT      T          T     T C   T C/T
rs32718246
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150300450fTnfrsf9 : Locus-Region
Tnfrsf9 : Intron
1SNPC CCCC   T CCTC      C          C     C T   C C/T
rs32718248
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150300796fTnfrsf9 : Locus-Region
Tnfrsf9 : Intron
1SNPT TTTT   T TTCT      T          T     T C   T C/T
rs32718250
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150300935fTnfrsf9 : Locus-Region
Tnfrsf9 : Intron
1SNPG GAGA   G GGGA      G          G     G G   G A/G
rs32718253
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150301712fTnfrsf9 : Intron
Tnfrsf9 : Locus-Region
1SNPA AAAA   A AACA      A          A     A C   A A/C
rs3701215
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150301861fTnfrsf9 : Intron
Tnfrsf9 : Locus-Region
3SNPA TATAT  T TTTA      T          T     T T   A A/T
rs32719148
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150301975fTnfrsf9 : Intron
Tnfrsf9 : Locus-Region
1SNPC CCCC   A CCCC      C          C     C C   C A/C
rs32719151
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150302084fTnfrsf9 : Intron
Tnfrsf9 : Locus-Region
1SNPC CCCC   C CCTC      C          C     C T   C C/T
rs32719964
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150302170fTnfrsf9 : mRNA-UTR
Tnfrsf9 : Intron
1SNPA CCCC   C CCCC      C          C     C C   C A/C
rs32719967
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150302191fTnfrsf9 : Intron
Tnfrsf9 : mRNA-UTR
1SNPA AAAA   C AACA      A          A     A C   A A/C
rs32719970
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150302327fTnfrsf9 : Intron1SNPA AAAA   G AAGA      A          A     A G   A A/G
rs32719973
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150302583fTnfrsf9 : Intron1SNPT TTTT   C TTTT      T          T     T T   T C/T
rs32346348
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150302817fTnfrsf9 : Intron1SNPAAT   T    T                                  A/T
rs32720756
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150303162fTnfrsf9 : Intron1SNPC CTCT   C CCCT      C          C     C C   T C/T
rs32720759
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150303886fTnfrsf9 : Intron1SNPG GAGA   A GGAA      G          G     G A   A A/G
rs32720762
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150304025fTnfrsf9 : Coding-NonSynonymous1SNPT TCTC   C TTCC      T          T     T C   C C/T
rs32721555
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150304586fTnfrsf9 : Intron1SNPT TTTT   C TTTT      T          T     T T   T C/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs32721558
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150304682fTnfrsf9 : Intron1SNPC CCCC   G CCGC      C          C     C G   C C/G
rs32721561
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150304791fTnfrsf9 : Intron1SNPA AAAA   G AAGA      A          A     A G   A A/G
rs32722204
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150304896fTnfrsf9 : Coding-Synonymous1SNPC CCCC   T CCCC      C          C     C C   C C/T
rs32722206
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150305769fTnfrsf9 : Intron1SNPA AAAA   G AAGA      A          A     A G   A A/G
rs32722209
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150305814fTnfrsf9 : Intron1SNPT TTTT   C TTCT      T          T     T     T C/T
rs32722211
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150305859fTnfrsf9 : Intron1SNPG GGGG   G GGAG      G          G     G A   G A/G
rs32723114
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150305909fTnfrsf9 : Intron1SNPT TCTC   C TTCC      T          T       C   C C/T
rs32723116
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150306357fTnfrsf9 : Intron1SNPA AAAA   A CCAA      C          A     C A   A A/C
rs32723118
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150306460fTnfrsf9 : Coding-Synonymous1SNPG GGGG   G GGAG      G          G     G A   G A/G
rs32723121
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150306546fTnfrsf9 : Coding-NonSynonymous2SNPTTCCCCC  C CCCC      C          C     C C   C C/T
rs32723123
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150306772fTnfrsf9 : Intron1SNPT TTTT   T TTCT      T          T     T C   T C/T
rs32724135
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150307056fTnfrsf9 : Intron1SNPA AAAA   G AAGA      A          A     A G   A A/G
rs32724137
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150307192fTnfrsf9 : Coding-NonSynonymous1SNPG GGGG   G GGGG      G          G     G A   G A/G
rs32724139
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150307824fTnfrsf9 : Intron2SNPC TCTC   C TTCC      T          T     T C   C C/T
rs32719135
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150307947fTnfrsf9 : Intron1SNPT TTTT   T TTCT      T          T     T C   T C/T
rs32719138
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150308068fTnfrsf9 : Intron1SNPA GAGA   A AAA       A          G       A   A A/G
rs32719141
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150308105fTnfrsf9 : Intron1SNPT TTTT   C TTCT      T          T     T C   T C/T
rs32719143
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150308130fTnfrsf9 : Intron1SNPT TTTT   T TTCT      T          T     T C   T C/T
rs32719876
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150308348fTnfrsf9 : Intron1SNPC CCCC   C CCTC      C          C     C T   C C/T
rs32719879
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150308387fTnfrsf9 : Intron1SNPT TCTC   C TTCC      T          T     T C   C C/T
rs32719881
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150308505fTnfrsf9 : Coding-NonSynonymous1SNPC CGCC     CC        C          C     C     G C/G
rs32720694
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150308672fTnfrsf9 : Intron1SNPC CTCT   C CCCT      C          C     C C   T C/T
rs32720697
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150308726fTnfrsf9 : Intron1SNPC CCCC   T CCTC      C          C     C T   C C/T
rs32281395
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150309220fTnfrsf9 : Intron1SNPCCC   C    T                                  C/T
rs32720700
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150309473fTnfrsf9 : Intron1SNPG GTGT   G GGGT      G          G     G G   T G/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs32720703
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150309489fTnfrsf9 : Intron1SNPC CCCC   C CCCC      C          C     C T   C C/T
rs13478050
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150309624fTnfrsf9 : Intron
Tnfrsf9 : Coding-NonSynonymous
3SNPCCTCTCTTTCCCCCCCCTCCCCCTTTCCTCCCTCCCCCCCCTTCCCC/T
rs31937083
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150310827fTnfrsf9 : Intron1SNPTTC   C                                       C/T
rs32721518
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150311292fTnfrsf9 : Intron1SNPG GAGA     GG A      G          G     G       A/G
rs32721520
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150312474fTnfrsf9 : Intron1SNPC TCTT     CC        C          T     C       C/T
rs32721523
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150313636fTnfrsf9 : Intron1SNPT TGT      TT        T          T     T       G/T
rs31747234
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150314640fTnfrsf9 : Intron1SNPA A   A    C                                  A/C
rs32722356
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150314752fTnfrsf9 : Intron1SNPA AGAG     AA G      A          A     A       A/G
rs32722359
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150315250fTnfrsf9 : Intron1SNPC CTCT     CC T      C          C     C       C/T
rs32722362
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150315449fTnfrsf9 : Intron1SNPT TCTC     TT C      T          T     T       C/T
rs32626312
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150315566fTnfrsf9 : Intron1SNP TC        T                                  C/T
rs32723035
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150315615fTnfrsf9 : Intron1SNPT TCTT     TT        T          T     T       C/T
rs32723037
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150315650fTnfrsf9 : Intron1SNPA CCAA   C AA A      A          A     A C   C A/C
rs32723039
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150315850fTnfrsf9 : Intron1SNPG GG G     GG A      G          G       A     A/G
rs32723042
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150315982fTnfrsf9 : Intron1SNPT TCTC     TT C      T          T     T       C/T
rs32724014
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150316397fTnfrsf9 : Intron1SNPA AGA      AA        A          A     A       A/G
rs32724017
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150316422fTnfrsf9 : Intron1SNPC CTCT     CC T      C          C     C       C/T
rs32724020
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150316566fTnfrsf9 : Intron1SNPA AGAA     AA        A          A     A       A/G
rs32724022
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150316755fTnfrsf9 : Intron1SNPG GCG      GG        G          G     G       C/G
rs32724835
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150316791fTnfrsf9 : Intron1SNPT TCTC     TT C      T          T     T       C/T
rs32724838
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150316859fTnfrsf9 : Intron1SNPG GCGC     GG C      G          G     G       C/G
rs32724840
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150317349fTnfrsf9 : Intron1SNPT TCTT     TT        T          T     T       C/T
rs32724842
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150317807fTnfrsf9 : Intron1SNPT TATA     TT A      T          T     T       A/T
rs32725715
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150318463fTnfrsf9 : Intron1SNPG GAG      GG A      G          G     G       A/G
rs32725718
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150319004fTnfrsf9 : mRNA-UTR1SNPG GAGA     GG A      G          G     G       A/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs32130063
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr4:150319124fTnfrsf9 : mRNA-UTR2SNPAACCCCC    CC C      C          C     C       A/C

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
05/08/2013
MGI 5.13
The Jackson Laboratory