About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
Genome Coordinate Discrepancy
The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details).
 Symbol
Name
ID
Gsta4
glutathione S-transferase, alpha 4
MGI:1309515

224 matching SNPs displayed


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs30526392
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78038374fGsta4 : Locus-Region1SNPGGT    G T                  G/T
rs30527951
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78038454fGsta4 : Locus-Region2SNPGGCCC CGGCC C      CC    GGCC/G
rs33778567
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78038497fGsta4 : Locus-Region1SNPCCT    C T                  C/T
rs50212573
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78038631fGsta4 : Locus-Region1SNPG GGG   GGGGG       G    GTGG/T
rs30033354
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78038816fGsta4 : Locus-Region1SNPGGT    G T                  G/T
rs30072591
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78038820fGsta4 : Locus-Region1SNPGGC    G C                  C/G
rs48401594
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78038851fGsta4 : Locus-Region1SNP  GGG G GGGAG      GG    A GA/G
rs50549503
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78039241fGsta4 : Locus-Region1SNPA GGG   AGGAG       G    AAGA/G
rs8261588
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78039368fGsta4 : Locus-Region1SNP  GGGGGCCG   G CCGC    GC   C/G
rs16784227
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78039414fGsta4 : Locus-Region1SNP  GGGGGTTG   GGGTGT  GTGT   G/T
rs8261589
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78039424fGsta4 : Locus-Region2SNP  GGGGGGGG   GGAGGG  GGGG   A/G
rs47187085
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78039464fGsta4 : Locus-Region1SNPC T     CTTC             CTTC/T
rs8261590
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78039478fGsta4 : Locus-Region2SNP  AAAAAGGA   AAAGAG  AGAG   A/G
rs8261591
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78039511fGsta4 : Locus-Region2SNP  CCCCCCCC   CCTCCC  CCCC   C/T
rs8261592
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78039533fGsta4 : Locus-Region2SNP  TTTTTTAT   TTTTTT  TTTT   A/T
rs8261593
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78039535fGsta4 : Locus-Region3SNPT CCCCCTTCCTCCCCTCT  CTCTTCCC/T
rs16784233
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78039588fGsta4 : Locus-Region1IN-DEL  CCCCCCCC   CCCCC-  CCCC   -/C
rs16784234
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78039593fGsta4 : Locus-Region1IN-DEL                  C    --   -/C
rs8261594
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78039636fGsta4 : Locus-Region2SNP  AAAAAGAA   AAA     AG     A/G
rs29886917
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78039638fGsta4 : Locus-Region1SNPGGA    G A                  A/G
rs8261581
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78039722fGsta4 : Locus-Region1SNP  G   G G    G AG G    GG   A/G
rs8261582
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78039763fGsta4 : Locus-Region2SNPTTCC  CTCC   C CTCT    CC   C/T
rs8261583
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78039787fGsta4 : Locus-Region2SNPC CCC C TCCCCC TCCC C  CCCCCC/T
rs8261584
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78039798fGsta4 : Locus-Region1SNP  TT  T T    T ATTT    TT   A/T
rs8261585
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78039801fGsta4 : Locus-Region1SNP  AA  A A    A CAAA    AA   A/C
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs8261586
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78039836fGsta4 : mRNA-UTR1IN-DEL  TT  T T    T T- -    T-   -/T
rs8261587
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78039838fGsta4 : mRNA-UTR1IN-DEL  G   G G    G G- -    G-   -/G
rs29689095
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78039854fGsta4 : mRNA-UTR1SNPCCA    C A                  A/C
rs16795511
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78039955fGsta4 : Intron2SNP  CCC C TCCC CC C C  CC  CC C/T
rs51610726
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78040070fGsta4 : Intron1SNPG A A   G  GA            GG A/G
rs46006204
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78040077fGsta4 : Intron1SNPT CCC   TCCCC            CCTC/T
rs50633556
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78040451fGsta4 : Intron1SNPG GGG G GGGAG       G    AAGA/G
rs51206733
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78040603fGsta4 : Intron1SNPA GGG   GGGAG            AAGA/G
rs48126985
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78040734fGsta4 : Intron1SNPC  TT   C TCT            CCTC/T
rs52112123
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78040855fGsta4 : Intron1SNPG AAA   A AGA       A    G  A/G
rs48828853
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78041092fGsta4 : Intron1SNPG AAA A G AGA            GGAA/G
rs51250633
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78041158fGsta4 : Intron1SNP  CCC   CCCTC       C    TTCC/T
rs45948003
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78041318fGsta4 : Intron1SNPG GG  G GGGTG       G    TTGG/T
rs30469814
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78041581fGsta4 : Intron1SNP  T    C T                  C/T
rs29878855
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78041793fGsta4 : Intron1SNPTTA    T A                  A/T
rs30283626
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78041794fGsta4 : Intron1SNPAAG    A G                  A/G
rs29926821
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78041818fGsta4 : Intron1SNPGGT    G T                  G/T
rs29594888
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78042021fGsta4 : Intron1SNPAAG    A G                  A/G
rs52354600
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78042161fGsta4 : Intron1SNPT TTT   TTT T            GGTG/T
rs49659805
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78042225fGsta4 : Intron1SNPG GGG G AGG G       G    AAGA/G
rs50360849
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78042244fGsta4 : Intron1SNPA AAA A GAAGA       A    GGAA/G
rs51965548
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78042323fGsta4 : Intron1SNPC CCC C TCCCC       C    CCCC/T
rs46831052
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78042364fGsta4 : Intron1SNPG GGG G AGG G      GG    AAGA/G
rs50492281
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78042412fGsta4 : Intron1SNPT TTT T CTT T       T      TC/T
rs30078294
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78042729fGsta4 : Intron1SNP GA    G                    A/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs33660412
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78042836fGsta4 : Intron1SNP TC    T                    C/T
rs30522307
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78042847fGsta4 : Intron1SNP TC    T                    C/T
rs29694248
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78042851fGsta4 : Intron1SNP CT    C                    C/T
rs33757022
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78042996fGsta4 : Intron1SNP CT    C                    C/T
rs51153663
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78043230fGsta4 : Intron1SNPT TTT T GTTGT       T    GGTG/T
rs48584206
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78043348fGsta4 : Intron1SNP  AAA A GAAGA       A    GGAA/G
rs29931606
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78043504fGsta4 : Intron1SNP TC    T C                  C/T
rs47665463
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78043546fGsta4 : Intron1SNPG GGG G AGGAG       G    AAGA/G
rs33673750
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78044587fGsta4 : Intron1SNPAAG    A G                  A/G
rs29980737
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78045281fGsta4 : Intron1SNPGGA    G                    A/G
rs8261597
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78045726rGsta4 : Intron1IN-DEL  CCCCCCCC   C -CCC    C    -/C
rs8261596
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78045884rGsta4 : Intron1SNP  GGGGGGGG   G TGGG    G    G/T
rs8261595
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78045912rGsta4 : Intron1SNP  TTTTTT T   T GTTT    T    G/T
rs50960269
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78045961fGsta4 : Intron1SNPC CCC C TCC C       C    T CC/T
rs6217039
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78046017fGsta4 : Intron4SNPG AAAAAGAA   AAGGAG  AGA    A/G
rs8261602
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78046022rGsta4 : Intron1SNP   CCCCCCC   C TCCC    C    C/T
rs8261601
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78046032rGsta4 : Intron1SNP  AAAAAAAA   A CAAA    A    A/C
rs8261600
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78046088rGsta4 : mRNA-UTR1SNP  CCCCCCCC   C GCCC    C    C/G
rs8261599
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78046138rGsta4 : Coding-Synonymous1SNP   TTTTTTT   T CTTT    T    C/T
rs8261598
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78046236rGsta4 : Intron1SNP   GGG  GG   G AG G    G    A/G
rs8261603
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78046255fGsta4 : Intron1SNP  CCCCCCT    C CCTC    C    C/T
rs8261604
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78046314fGsta4 : Intron1SNP  CCCCCCCC   C TCCC    C    C/T
rs8261605
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78046344fGsta4 : Intron3SNPTTCCCCCTCCCCCC CTCTTC  CCCCCC/T
rs8261606
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78046379fGsta4 : Intron1SNP  AAAAAAAA   A GAAA    AA   A/G
rs8261607
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78046453fGsta4 : Intron1SNP  CCCCCCCC   C TCCC    CC   C/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs8261608
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78046504fGsta4 : Intron3SNPTTCCCCCTCCCCCC CTCTTC  CCCCCC/T
rs8261609
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78046510fGsta4 : Intron1SNP  TTTTTTTT   T CTTT    TT   C/T
rs8261610
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78046514fGsta4 : Intron1SNP  CCCCCCCC   C TCCC    CC   C/T
rs8261611
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78046562fGsta4 : Intron1SNP  AAAAAAAA   A GAAA    AA   A/G
rs50951132
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78046596fGsta4 : Intron1SNPT TTT T ATTTT      TT    TTTA/T
rs8261612
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78046652fGsta4 : Intron1SNP  TTTTTTTT     CTTT     T   C/T
rs8261613
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78046805fGsta4 : Intron2SNP  AAAAAAAA    AGAAA  AA A   A/G
rs8261614
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78046821fGsta4 : Intron2SNP  GGGGGGAG    GAGGG   G A   A/G
rs49259222
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78047116fGsta4 : Intron1SNPC CCC C CCCCC      CC    CCTC/T
rs8261615
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78047302fGsta4 : Coding-Synonymous1SNP  GGGGGGGG   G AGGG    GG   A/G
rs8261616
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78047423fGsta4 : Intron2SNPG GGGGGGGGG GG GGGGGG  GAAGGA/G
rs8261617
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78047435fGsta4 : Intron8Mixed  --------   - A---    --   -/A/C/G/T
rs8261625
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78047436fGsta4 : Intron3MixedCCT??-?CCT   - CC-CC   -- T -/C/T
rs8261626
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78047445fGsta4 : Intron1SNP  AAAAAAAA   A GAAA    AA   A/G
rs8261627
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78047507fGsta4 : Intron2SNPT TTTTTTCTTTTT CTTTTT  TTTTTC/T
rs33628475
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78047548fGsta4 : Intron2SNPTTCCC CTTCC C       C    TTCC/T
rs8261628
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78047590fGsta4 : Intron3SNPGGAAAAAGGAAG A GGAGGA  AGGAAA/G
rs30035123
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78047979fGsta4 : Intron1SNP  T    C T                  C/T
rs30434858
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78048002fGsta4 : Intron1SNP  A    G A                  A/G
rs29743314
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78048005fGsta4 : Intron1SNP  T    A T                  A/T
rs33695870
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78048058fGsta4 : Intron1SNP  G    C G                  C/G
rs30090409
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78048196fGsta4 : Intron1SNP  C    T C                  C/T
rs33770785
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78048312fGsta4 : Intron1SNP  A    G A                  A/G
rs29592139
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78048406fGsta4 : Intron1SNP  G    A                    A/G
rs47022446
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78049602fGsta4 : Intron1SNPG AAA A AAAAA      GA    AAAA/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs48795031
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78049616fGsta4 : Intron1SNPC CCC C TCCC       CC    CCCC/T
rs51846942
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78049733fGsta4 : Intron1SNPA TTT T ATTTT      AT    TTTA/T
rs45778504
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78049765fGsta4 : Intron1SNPT CCC C CCCCC      TC    CCCC/T
rs45887319
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78049909fGsta4 : Intron1SNPA GGG G  GGGG      AG    GGGA/G
rs51620591
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78050017fGsta4 : Intron1SNPG AAA A GAAGA      GG    GGAA/G
rs49333654
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78050024fGsta4 : Intron1SNPC C     ACCC       CC    CC A/C
rs49832126
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78050065fGsta4 : Intron1SNPC CCC C CCCTC      CC    TTCC/T
rs47721035
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78050087fGsta4 : Intron1SNPC CCC C CCCAC      CC    AACA/C
rs46370948
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78050088fGsta4 : Intron1SNPG GGG G GGGGG      GG    GGAA/G
rs49223101
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78050114fGsta4 : Intron1SNPA AAA A CAAAA      AA    AAAA/C
rs47677420
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78050157fGsta4 : Intron1SNPG GGG G AGGAG      GG    AAGA/G
rs30136198
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78050427fGsta4 : Intron1SNPTTC    T C                  C/T
rs29787117
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78050429fGsta4 : Intron1SNPCCG    C G                  C/G
rs29783218
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78050510fGsta4 : Intron2SNPAACCC  ACCC        AC      CA/C
rs29992805
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78050520fGsta4 : Intron1SNPTTC    T C                  C/T
rs46109426
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78050558fGsta4 : Intron1SNPT TTT T ATTTT      TT    TTTA/T
rs50108096
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78050604fGsta4 : Intron1SNPC CCC C CCCAC      CC    AACA/C
rs3664448
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78050718fGsta4 : Intron3SNPGGCCC CGCCCCC      GC    CCCC/G
rs3665645
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78050895fGsta4 : Intron2SNP AG   GA G                  A/G
rs3665679
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78050896fGsta4 : Intron2SNP CT   TC T                  C/T
rs3665696
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78050956fGsta4 : Intron2SNP CT   TC T                  C/T
rs52388605
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78050977fGsta4 : Intron1SNPG GGG G TGGGG      GG    GGGG/T
rs50622144
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78051000fGsta4 : Intron1SNPA AAA A AAAGA      AA    GGAA/G
rs47897629
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78051088fGsta4 : Intron1SNPC CCC C CCCGC      CC    GGCC/G
rs3681548
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78051209fGsta4 : Intron2SNPT CCC CTTCC C      TC      CC/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs46255763
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78051246fGsta4 : Intron1SNPA AAA A AAAGA      AA    GGAA/G
rs8261629
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78052040fGsta4 : Coding-Synonymous2SNPT TTTTTTCTTTTT TTTTTT  TTTTTC/T
rs8261630
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78052179fGsta4 : Intron2SNPA AAAAAAAAAGAA AAAAAA  AGGGAA/G
rs8261631
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78052184fGsta4 : Intron1Mixed   TT  T T     CTTT    -T   -/C/T
rs8261641
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78052285fGsta4 : Intron2SNPA AAAAAAAAAGAA GAAAAA  AGGGAA/G
rs8261642
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78052374fGsta4 : Intron2SNPG AAAAAGGAAGAA GGAGGA  AGGGAA/G
rs8261643
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78052467fGsta4 : Intron2SNPA AAAAAAGAAAAA AAAAAA  AAAAAA/G
rs8261632
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78052709fGsta4 : Intron1SNP  TTTTTTTT   T ATTT    TT   A/T
rs8261633
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78052799fGsta4 : Intron2SNPG GGGGGGAGGGGG GGGGGG  GGGGGA/G
rs8261634
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78052818fGsta4 : Intron1IN-DEL  GGGGGGGG   G GGGG     -   -/G
rs8261635
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78052827fGsta4 : Intron1SNP  GGGGGGAG   G GGGG    GG   A/G
rs8261645
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78053114rGsta4 : Intron3MixedG AAA-AGAAAA A AGAGGA    A A-/A/G
rs8261644
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78053127rGsta4 : Intron4SNPC TTTTTCCTT  TTCCTCCTTCT C TC/T
rs8261646
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78053368fGsta4 : Intron1SNP  CCCCCCCC   C TC C    CC   C/T
rs8261647
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78053438fGsta4 : Intron1SNP  CCCCCCCC   C TCCC    CC   C/T
rs8261648
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78053462fGsta4 : Intron1SNP  TTTTTCCT   T CC       C   C/T
rs8261636
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78053575fGsta4 : Intron1SNP  TTTTTTAT   T TTTT    TT   A/T
rs8261637
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78053577fGsta4 : Intron1SNP  CCCCCCTC   C CCCC    CC   C/T
rs49909315
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78053602fGsta4 : Intron1SNPG GGG G  GGGG      GG    GGAA/G
rs8261638
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78053608fGsta4 : Intron2SNPG GGGGGGAGGGGG GGGGGG  GGGG A/G
rs8261639
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78053764fGsta4 : Coding-Synonymous2SNPT TTTTT ATTTTT TTTTTT  TTTTTA/T
rs8261640
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78053811fGsta4 : Coding-NonSynonymous2SNP  AAAAAAAA   A CAAA    AA   A/C
rs8261651
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78053875fGsta4 : Intron1SNP  TTTTTCTT   T TCTC    TT   C/T
rs8261652
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78053876fGsta4 : Intron2SNPA GGGGGAGG   G GAGAAA  GGAG A/G
rs8261653
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78053941fGsta4 : Intron1SNP  GGGGGGGG   G CGGG    GG   C/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs8261654
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78053951fGsta4 : Intron1SNP  TTTTTCTT   T CCTC    TC   C/T
rs8261655
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78053954fGsta4 : Intron1SNP  CCCCCACC   C CACA    CA   A/C
rs8261656
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78053961fGsta4 : Intron1SNP  GGGGGAGG   G GAGA    GG   A/G
rs8261657
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78053974fGsta4 : Intron1SNP  GGGGGGGG   G AGGG    GG   A/G
rs8261658
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78053984fGsta4 : Intron1SNP  TTTTTTTT   T ATTT     T   A/T
rs8261659
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78054070fGsta4 : Intron1SNP  CCCCCCCC   C CCCC    CT   C/T
rs8261660
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78054071fGsta4 : Intron1SNP  CCCCCCCC   C CCCC    CT   C/T
rs8261661
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78054081fGsta4 : Intron3SNPT CCCCCTCCCC CCTTCTTCCTCCCC C/T
rs8261662
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78054129fGsta4 : Intron2SNP  A AA GAA   A  G G  AG A   A/G
rs8261649
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78054165fGsta4 : Intron1SNP  GGGGGGGG   G AGGG    GG   A/G
rs51104527
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78054181fGsta4 : Intron1SNPA GGG   GGG        A     G  A/G
rs30223932
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78054858fGsta4 : Intron2SNPAAGGG GAAGG        A     A GA/G
rs48927052
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78055077fGsta4 : Intron1SNPT TTT T CTTT       TT    TTTC/T
rs29979232
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78055090fGsta4 : Intron1SNPCCA    C A                  A/C
rs29742386
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78055096fGsta4 : Intron1SNPTTC    T C                  C/T
rs8261691
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78055196fGsta4 : Intron1SNP  GGGGGGAG   G AGGG    GA   A/G
rs8261692
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78055284fGsta4 : Intron1SNP  GGGGGGGG   G TGGG    GG   G/T
rs16784237
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78055315fGsta4 : Intron1IN-DEL  AAAAAAAA   AA-AAA  AAAA   -/A
rs16784238
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78055321fGsta4 : Intron1SNP  TTTTTTCT   TTTTTT  TTTC   C/T
rs16784239
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78055325fGsta4 : Intron1SNP  TTTTTTCT   TTCTTT  TTTC   C/T
rs16784240
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78055354fGsta4 : Intron2SNPG GGGGGGAGGAGGGAGGGGGGGGAAAGA/G
rs8261693
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78055397fGsta4 : Intron2SNP  CCCCCCCC   CCTCCC  CCCC   C/T
rs8261694
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78055441fGsta4 : Intron3SNPA AAAAAACAACAAACAAAAAAAACCCCA/C
rs50273582
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78055762fGsta4 : Intron1SNPC CCC C TCCCC      CC    CCCC/T
rs8261663
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78055781fGsta4 : Intron1SNP  C  C CCC   C GCCC         C/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs8261664
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78055790fGsta4 : Intron1SNP  T TTTTTT   T GTTT    T    G/T
rs8261665
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78055796fGsta4 : Intron2SNPC CCCCCCTCCTCC CCCCCC  C T  C/T
rs8261666
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78055811fGsta4 : Intron1SNP  TT TTTCT   T CTTT    T    C/T
rs8261667
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78055821fGsta4 : Intron2SNPG GGGGGGCGGCGG GGGGGG  G C GC/G
rs8261668
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78055887fGsta4 : Intron1SNP  AAAAAAGA   A GAAA    AG   A/G
rs8261669
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78055888fGsta4 : Intron1SNP  CCCCCCAC   C ACCC    CA   A/C
rs8261670
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78055892fGsta4 : Intron1SNP  TTTTTTCT   T CTTT    TC   C/T
rs8261671
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78055906fGsta4 : Intron1SNP  TTTTTTTT   T CTTT    TT   C/T
rs8261672
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78055934fGsta4 : Intron1SNP  AAAAAAGA   A AAAA    AG   A/G
rs8261673
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78055948fGsta4 : Intron1SNP  GGGGGGGG   G AGGG    GG   A/G
rs8261674
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78055959fGsta4 : Intron2SNPG GGGGGGAGGAGG GGGGGG  GAAA A/G
rs8261675
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78055961fGsta4 : Intron1SNP  AAAAAAAA   A CAAA    AA   A/C
rs8261676
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78055974fGsta4 : Intron1SNP  CCCCCCCC   C ACCC    CC   A/C
rs8261677
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78056110fGsta4 : Intron2SNPT TTTTTTCTTCTT TT TTT  T CC C/T
rs8261695
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78056144fGsta4 : Intron1SNP  G GGGGGG   G AGGG         A/G
rs8261696
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78056200fGsta4 : Intron1SNP  G GGGGGG   G CGGG     G   C/G
rs8261697
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78056225fGsta4 : Intron1SNP  GGGGGGGG   G CGGG         C/G
rs8261698
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78056256fGsta4 : Intron1SNP  CCCCCCCC   C TCCC         C/T
rs16800208
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78056354fGsta4 : Intron1SNP  A AAAAAA   AACA A  AA     A/C
rs8261699
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78056413fGsta4 : Intron2SNP  G   GGG     GAGG     GG   A/G
rs8261700
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78056705fGsta4 : Intron1SNP  TTTTTTT    T TTGT    G    G/T
rs16800209
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78056705fGsta4 : Intron1SNP  TTTTTTT    TTTTGT  TTG    G/T
rs8261701
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78056717fGsta4 : Intron1SNP  GGG    G       T     T    G/T
rs8261702
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78056717fGsta4 : Intron1SNP  TTTTT  T   T   T     A    A/T
rs16800210
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78056717fGsta4 : Intron1SNP  GGG    G       T     T    G/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs16800211
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78056717fGsta4 : Intron1SNP  TTTTT  T   TT  T   T A    A/T
rs8261678
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78056750fGsta4 : Intron1SNP  GGGGGAGG   G GAGA    G    A/G
rs8261679
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78056760fGsta4 : Intron1SNP  GGGGGGAG   G AGGG    G    A/G
rs8261680
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78056784fGsta4 : Intron2SNPC CCCCCCACCCCC CCCCCC  CCCC A/C
rs8261681
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78056844fGsta4 : Intron3SNPGGAAAAAGGAAGAA GGAGGA  AGGG A/G
rs8261682
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78056950fGsta4 : Coding-Synonymous1SNP  CCCCCCCC   C TCCC    CC   C/T
rs8261683
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78056999fGsta4 : mRNA-UTR1IN-DEL  --T---T-   - -- -    --   -/T
rs8261684
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78057012fGsta4 : mRNA-UTR2SNPA AAAAAAGAAGAA GAAAAA  AGGGAA/G
rs8261685
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78057034fGsta4 : mRNA-UTR2SNPA AAAAAAGAAAAA GAAAAA  AAAAAA/G
rs8261686
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78057149fGsta4 : mRNA-UTR1SNP  GGGGGGGG   G AGGG    GG   A/G
rs8261687
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78057237fGsta4 : Locus-Region3SNPGGCCCCCGCC CCC CGCGG   CCCCCC/G
rs50580923
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78057301fGsta4 : Locus-Region1SNPA AAA A GAAAA      AA    AA A/G
rs8261688
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78057350fGsta4 : Locus-Region1SNP   AAAAAAA   A CAAA    AA   A/C
rs8261689
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78057352fGsta4 : Locus-Region1SNP   TTTTTGT   T TTTT    TT   G/T
rs8261690
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78057365fGsta4 : Locus-Region1SNP   GGGGGCG   G GGGG         C/G
rs8236792
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78057374fGsta4 : Locus-Region3SNP  GGGGGGAG   GGGGGG  GGGG   A/G
rs8261703
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78057409fGsta4 : Locus-Region1SNP  GGGGGGGG   G AGGG    G    A/G
rs8261704
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78057487fGsta4 : Locus-Region2SNPA AAAAAATAAAAA TAAAAA  AAAA A/T
rs8261705
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78057493fGsta4 : Locus-Region1SNP  CCCCCCCC   C GCCC    C    C/G
rs8261706
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78057559fGsta4 : Locus-Region1SNP  GGGGGGGG   G AGGG    GG   A/G
rs8261707
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78057568fGsta4 : Locus-Region1SNP  AAAAAAGA   A AAAA    AG   A/G
rs8261708
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78057571fGsta4 : Locus-Region1SNP  TTTTTTAT   T TTTT    TA   A/T
rs8261709
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78057598fGsta4 : Locus-Region1IN-DEL  TTTT-T T   T  TTT    T-   -/T
rs8261710
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:78057599fGsta4 : Locus-Region1IN-DEL  ----T-T-   -  ---    -T   -/T

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
05/08/2013
MGI 5.13
The Jackson Laboratory