About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Apoa1
apolipoprotein A-I
MGI:88049

77 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs30481421
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46226633fApoa1 : Locus-Region2SNPTTCCC CCTCCTC      CT   CTCC/T
rs32673411
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46227854fApoa1 : Locus-Region1SNPG GGG G GGGAG      GG   GGGA/G
rs52437132
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46227991fApoa1 : Locus-Region1SNP CT      T                 C/T
rs52248391
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46227997fApoa1 : Locus-Region1SNP AG      G                 A/G
rs52315347
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46228018fApoa1 : Locus-Region1SNP CA      A                 A/C
rs32673413
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46228092fApoa1 : Locus-Region2SNPCCGGG G GGGCG      GC   GGGC/G
rs8254876
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46228102fApoa1 : Locus-Region1SNP             T CTT         C/T
rs8254877
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46228140fApoa1 : Locus-Region1SNP  TT  TT T   T CCTT   TT   C/T
rs8254878
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46228142fApoa1 : Locus-Region1SNP  T   TT T   T TCTT   TT   C/T
rs8254879
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46228143fApoa1 : Locus-Region1SNP  G   GG G   G GAGG   GG   A/G
rs8254880
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46228181fApoa1 : Locus-Region1IN-DEL  --  -T       TT T   T    -/T
rs8254881
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46228186fApoa1 : Locus-Region1IN-DEL  TT  T-       T- -        -/T
rs8254882
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46228197fApoa1 : Locus-Region1SNP  TT  TT T   T CTTT   TT   C/T
rs8254883
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46228247fApoa1 : Locus-Region1SNP  TT  TT T   T CTTT   TT   C/T
rs8254884
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46228280fApoa1 : Locus-Region2SNP TCC  CC C   C CTCC   CC   C/T
rs8254885
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46228289fApoa1 : Locus-Region1IN-DEL  A-  A  A   A AAAA   AA   -/A
rs32674275
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46228436fApoa1 : Locus-Region1SNPG GGG G AGGGG      GG   GGGA/G
rs8254889
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46228476rApoa1 : Locus-Region1SNP  GGGGGGGG   G AGGG   GG   A/G
rs8254888
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46228627rApoa1 : Locus-Region1SNP  CCCCCCCC   C TCCC   CC   C/T
rs3725511
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46228745fApoa1 : Intron5SNPCCCTCCCTCCCCCTTCCCTTCCCTTCTC/T
rs8254887
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46228759rApoa1 : Intron1SNP  C CCCCCC   C TCCC   CC   C/T
rs8254886
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46228764rApoa1 : Intron1SNP  G GGGGGG   G AGGG   GG   A/G
rs32674278
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46228826fApoa1 : Intron1SNPC CCC C TCCCC      CC   CCCC/T
rs32674280
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46229050fApoa1 : Intron1SNPG GGG G AGGGG      GG   GGGA/G
rs8239758
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46229415fApoa1 : Intron1SNP  G  GG AG            G    A/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs8239759
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46229424fApoa1 : Intron1SNP  T  TT AT        T        A/T
rs8239760
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46229431fApoa1 : Intron1SNP  G  GG AG        G   G    A/G
rs8254890
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46229589fApoa1 : Intron1SNP  GGG GGGG     AG G   G    A/G
rs8254891
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46229616fApoa1 : Intron4SNPGGCCCCCCCCCGCC GGCCCG CCCGCC/G
rs8254892
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46229684fApoa1 : Intron8Mixed  AAAAAAAA   A -AAA   AA   -/A/C/G/T
rs8254900
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46229759fApoa1 : Intron4SNPAAGGGGGGGGGAGG GAGGGA GGGAGA/G
rs13462139
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46230352fApoa1 : Coding-NonSynonymous4SNPAAACA ACAAAAA C    CAA  CACA/C
rs13462138
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46230356fApoa1 : Coding-NonSynonymous3SNP TC    T C    T      C     C/T
rs8254901
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46230536fApoa1 : Locus-Region1SNP  GGGGGGGG   G AGGG   GG   A/G
rs8254902
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46230558fApoa1 : Locus-Region1SNP  CCCCCCCC   C TCCC   CC   C/T
rs8254903
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46230576fApoa1 : Locus-Region1SNP  CCCCCCCC   C ACCC   CC   A/C
rs8254904
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46230706fApoa1 : Locus-Region1SNP  AAAAAAAA   A GGAA   AA   A/G
rs8254905
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46230730fApoa1 : Locus-Region2SNPG AAAAAAGAAGAA GGAAAG AAAGAA/G
rs16802576
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46230742fApoa1 : Locus-Region1SNP   AAAAAAA   A TAAA   AA   A/T
rs8254906
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46230828fApoa1 : Locus-Region1SNP     CCC C     G C         C/G
rs8254907
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46230914fApoa1 : Locus-Region1SNP     AAAAA     C AA   A    A/C
rs8254908
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46230921fApoa1 : Locus-Region2SNPC TTTTTTTTTCTT C TTTC T TCTC/T
rs8254909
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46230949fApoa1 : Locus-Region1SNP     GGGCG   G G GG   G    C/G
rs8254910
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46230961fApoa1 : Locus-Region1IN-DEL  C  CCCCC   C - CC   C    -/C
rs8254911
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46230962fApoa1 : Locus-Region1IN-DEL  AA AAAAA   A - AA   A    -/A
rs8254912
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46231009fApoa1 : 543 bp downstream of4SNPG GA GGAGG GGAAG G AGGG AGAA/G
rs8254913
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46231032fApoa1 : 566 bp downstream of1IN-DEL   A AAA A   A - AA   A    -/A
rs8254914
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46231033fApoa1 : 567 bp downstream of1IN-DEL   A AAA A   A - AA   A    -/A
rs8254915
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46231034fApoa1 : 568 bp downstream of1IN-DEL   C CCC C     - CC   C    -/C
rs8254916
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46231035fApoa1 : 569 bp downstream of1IN-DEL   A AAA A     - AA   A    -/A
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs8254917
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46231045fApoa1 : 579 bp downstream of1SNP   A AAAAA   A G AA   A    A/G
rs30179423
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46231278fApoa1 : 812 bp downstream of3SNP GA    G A    G      A     A/G
rs30163859
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46231303fApoa1 : 837 bp downstream of3SNP GG    A G    A      G     A/G
rs8254926
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46231569rApoa1 : 1103 bp downstream of1SNP  TT TTTAT     AATT   A    A/T
rs8254925
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46231570rApoa1 : 1104 bp downstream of1SNP  CC CCCTC     TTCC   T    C/T
rs8254924
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46231571rApoa1 : 1105 bp downstream of1SNP  GG GGGAG     AAGG   A    A/G
rs8254923
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46231572rApoa1 : 1106 bp downstream of1SNP  CC CCCAC     AACC   A    A/C
rs8254922
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46231574rApoa1 : 1108 bp downstream of1SNP  GG GGGTG     TTGG   T    G/T
rs46458436
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46231601fApoa1 : 1135 bp downstream of2SNP  C      C    T      C     C/T
rs8254921
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46231642rApoa1 : 1176 bp downstream of1SNP  GGGGGGGG     AGGG   GG   A/G
rs8254920
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46231700rApoa1 : 1234 bp downstream of1SNP  CCCCCCCC     TCCC   CC   C/T
rs8254919
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46231705rApoa1 : 1239 bp downstream of1SNP  CCCCCCCC     ACCC   CC   A/C
rs8254918
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46231745rApoa1 : 1279 bp downstream of1SNP  AAAAAAAA     TAAA   AA   A/T
rs30481522
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46231832fApoa1 : 1366 bp downstream of1SNPA        C                 A/C
rs33638305
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46231838fApoa1 : 1372 bp downstream of1SNPC        A                 A/C
rs29890415
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46231857fApoa1 : 1391 bp downstream of2SNPT AAA AAAAATA      AT   ATAA/T
rs8239771
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46231972rApoa1 : 1506 bp downstream of2SNPA AAAAAAGAAAA     AAA A AAAA/G
rs8239770
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46231997rApoa1 : 1531 bp downstream of2SNPG GGGGGGAGGGG     GGG G GGGA/G
rs8239769
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46232061rApoa1 : 1595 bp downstream of2SNPC TTTTTTCTTCT     TTC T TCTC/T
rs8239768
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46232117rApoa1 : 1651 bp downstream of1SNP     TTTG         T   T    G/T
rs32675401
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46232285fApoa1 : 1819 bp downstream of4SNPG GAG GA GG G A    A G  A AA/G
rs32675403
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46232294fApoa1 : 1828 bp downstream of2SNPG TTT T GTTGT      TG   T TG/T
rs30143276
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46232310fApoa1 : 1844 bp downstream of1SNPA T    A T                 A/T
rs32676605
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46232311fApoa1 : 1845 bp downstream of1SNPG  G    G TGT      GG   GGGG/T
rs29692542
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46232331fApoa1 : 1865 bp downstream of1SNPA G    A G                 A/G
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29734906
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46232332fApoa1 : 1866 bp downstream of1SNPT C    T C                 C/T
rs30086290
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:46232334fApoa1 : 1868 bp downstream of3SNPG GA   A G G       AG   AGAA/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
09/16/2014
MGI 5.19
The Jackson Laboratory