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Genome
Coordinate Discrepancy The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details). |
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Symbol Name ID |
Bcat2 branched chain aminotransferase 2, mitochondrial MGI:1276534 |
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) |  | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | Allele Summary (all strains) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs45958569 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52823751 | f | Bcat2 : Locus-Region | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | A | T | T | T | A/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31333563 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52823957 | f | Bcat2 : Locus-Region | 1 | SNP | G | T | G/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs49775363 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52824057 | f | Bcat2 : Locus-Region | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | A | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs45705679 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52824068 | f | Bcat2 : Locus-Region | 1 | SNP | C | T | T | T | C | C | T | C | T | T | C | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs51668173 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52824120 | f | Bcat2 : Locus-Region | 1 | SNP | T | T | T | C | T | T | T | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs46832188 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52824208 | f | Bcat2 : Locus-Region | 1 | SNP | G | A | A | A | G | G | G | A | G | A | A | G | G | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs49891010 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52824365 | f | Bcat2 : Locus-Region | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | A | A | T | A | A | A | A/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs47708605 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52824622 | f | Bcat2 : Locus-Region | 1 | SNP | A | G | G | G | A | A | A | G | A | G | G | G | A | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs51854097 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52825404 | f | Bcat2 : Locus-Region | 1 | SNP | A | G | G | G | A | A | A | G | A | G | G | G | A | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs6178739 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52825558 | f | Bcat2 : Locus-Region | 1 | SNP | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs6178786 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52825586 | f | Bcat2 : Locus-Region | 1 | SNP | G | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs6180754 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52825902 | f | Bcat2 : Intron | 1 | SNP | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs3686164 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52825994 | f | Bcat2 : Intron | 1 | SNP | A | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs50864751 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52826377 | f | Bcat2 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | G | T | T | T | T | G/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs46049051 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52826753 | f | Bcat2 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | A | G | G | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs49028028 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52826804 | f | Bcat2 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | T | A | A | A | T | A | A/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31995031 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52827805 | f | Bcat2 : Intron | 1 | SNP | T | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31947321 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52827895 | f | Bcat2 : Intron | 1 | SNP | A | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32068275 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52828604 | f | Bcat2 : Intron | 1 | SNP | T | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31239938 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52828845 | f | Bcat2 : Intron | 1 | SNP | T | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31666869 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52828956 | f | Bcat2 : Intron | 1 | SNP | T | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32357481 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52830007 | f | Bcat2 : Intron | 1 | SNP | T | G | G/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32291624 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52830478 | f | Bcat2 : Intron | 1 | SNP | G | T | G/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32506860 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52830539 | f | Bcat2 : Intron | 2 | SNP | A | A | A | G | A | G | A | A | A | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31863305 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52830766 | f | Bcat2 : Intron | 1 | SNP | T | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) | | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | Allele Summary (all strains) |
| rs50579397 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52830894 | f | Bcat2 : Intron | 1 | SNP | A | G | A | G | G | G | G | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31995360 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52831042 | f | Bcat2 : Intron | 1 | SNP | C | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs51895880 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52831250 | f | Bcat2 : Coding-NonSynonymous | 1 | SNP | T | T | T | A | T | T | T | T | A/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs49190861 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52831410 | f | Bcat2 : Intron | 1 | SNP | C | A | A | A | C | C | A | C | A | A | A | C | C | A | A/C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs48000334 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52831740 | f | Bcat2 : Intron | 1 | SNP | C | T | T | T | C | C | C | T | C | T | T | T | C | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31247998 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52834176 | f | Bcat2 : Intron | 1 | SNP | T | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31747207 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52834191 | f | Bcat2 : Intron | 1 | SNP | A | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32453202 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52834227 | f | Bcat2 : Intron | 1 | SNP | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31883661 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52834578 | f | Bcat2 : Intron | 1 | SNP | C | T | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31056736 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52836407 | f | Bcat2 : Intron | 1 | SNP | G | A | A | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31107285 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52836543 | f | Bcat2 : Intron | 1 | SNP | T | G | G | T | G/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31695644 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52836612 | f | Bcat2 : Intron | 1 | SNP | C | T | T | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32398238 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52836745 | f | Bcat2 : Intron | 1 | SNP | A | G | G | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32513657 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52836969 | f | Bcat2 : Intron | 1 | SNP | A | T | A | A/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31433472 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52837211 | f | Bcat2 : Intron | 1 | SNP | T | A | A/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32264676 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52837212 | f | Bcat2 : Intron | 1 | SNP | T | A | A/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32364179 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52837659 | f | Bcat2 : Intron | 1 | SNP | G | T | T | G | G/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32142692 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52837707 | f | Bcat2 : Intron | 1 | SNP | C | A | A | C | A/C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32136180 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52837715 | f | Bcat2 : Intron | 1 | SNP | C | T | T | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32055817 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52837748 | f | Bcat2 : Intron | 1 | SNP | T | C | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31613333 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52837762 | f | Bcat2 : Intron | 1 | SNP | A | C | C | A | A/C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31551155 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52839118 | f | Bcat2 : Intron | 1 | SNP | T | A | A | T | A/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31102698 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52839394 | f | Bcat2 : Intron | 1 | SNP | C | G | G | C | C/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs46492528 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52840073 | f | Bcat2 : Intron | 1 | SNP | T | C | C | C | T | T | T | C | T | C | C | C | T | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31984951 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52840413 | f | Bcat2 : Intron | 2 | SNP | A | A | G | G | G | A | G | A | A | G | A | G | G | G | A | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) | | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | Allele Summary (all strains) |
| rs50982778 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52840666 | f | Bcat2 : Intron | 1 | SNP | C | G | G | G | C | C | C | G | C | G | G | C | C | C/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs49736218 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52840965 | f | Bcat2 : Intron | 1 | SNP | C | G | G | C | C | G | C | G | G | G | C | C | C | C/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs47735161 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52841273 | f | Bcat2 : Intron | 1 | SNP | C | T | T | T | C | C | C | T | C | T | T | T | C | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs46687763 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52841319 | f | Bcat2 : Intron | 1 | SNP | A | T | T | T | A | A | A | T | A | T | T | T | A | A | T | A/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs51162531 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52841428 | f | Bcat2 : Intron | 1 | SNP | T | C | C | C | T | T | T | C | T | C | C | C | T | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs50759050 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52841459 | f | Bcat2 : Intron | 1 | SNP | G | T | T | T | G | T | G | T | T | G | G | T | G/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs49137008 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52841550 | f | Bcat2 : Intron | 1 | SNP | C | G | G | G | C | C | C | G | C | G | G | G | C | C | C/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs46823455 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52841695 | f | Bcat2 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | G | G | T | G | T | T | G | G | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs49487216 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52842305 | f | Bcat2 : Intron | 1 | SNP | C | A | A | A | C | C | C | A | C | A | A | A | C | C | A | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32480950 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52842979 | f | Bcat2 : Intron | 1 | SNP | T | C | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31932615 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52843207 | f | Bcat2 : Intron | 1 | SNP | T | C | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31692537 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52843281 | f | Bcat2 : Intron | 1 | SNP | G | A | A | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31214945 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52843409 | f | Bcat2 : Intron | 1 | SNP | T | C | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32128667 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52843457 | f | Bcat2 : Intron | 1 | SNP | G | C | C | G | C/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13479226 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52843651 | f | Bcat2 : Coding-Synonymous | 2 | SNP | C | C | T | T | T | C | T | T | T | C | T | C | T | C | T | T | T | T | C | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | C | T | C | C | T | T | T | T | C | C | T | C | C | T | T | T | T | T | T | C/T | |
| rs31128430 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52843907 | f | Bcat2 : Intron | 1 | SNP | C | G | C | C/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32007958 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52843916 | f | Bcat2 : Intron | 1 | SNP | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31567771 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52843917 | f | Bcat2 : Intron | 1 | SNP | A | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs46548070 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52844355 | f | Bcat2 : Intron | 1 | SNP | G | A | A | A | G | G | A | G | A | A | A | G | G | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs47317592 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52844395 | f | Bcat2 : Intron | 1 | SNP | G | C | C | C | G | G | G | C | G | C | C | G | G | G | C | C/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs50055321 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52844472 | f | Bcat2 : Intron | 1 | SNP | T | G | G | G | T | T | T | G | T | G | G | G | T | T | G | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs46469299 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52844579 | f | Bcat2 : Intron | 1 | SNP | G | A | A | A | G | G | G | A | G | A | A | G | G | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs47579281 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52844591 | f | Bcat2 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | T | T | T | A | T | A | A | A | T | T | A | A/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs51973659 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52844663 | f | Bcat2 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs49322717 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52844779 | f | Bcat2 : mRNA-UTR | 1 | SNP | C | C | C | A | A | A | C | C | C | C | A | C | A/C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) | | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | Allele Summary (all strains) |
| rs48499159 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52844792 | f | Bcat2 : mRNA-UTR | 1 | SNP | G | C | C | C | G | G | G | C | G | C | C | C | G | G | C | C/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs46796355 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52844997 | f | Bcat2 : mRNA-UTR | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs50431049 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52845089 | f | Bcat2 : Locus-Region | 1 | SNP | A | A | A | G | G | G | A | G | A | A | G | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31319025 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52845134 | f | Bcat2 : Locus-Region | 1 | SNP | T | C | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs51032402 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52845204 | f | Bcat2 : Locus-Region | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31864307 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52845364 | f | Bcat2 : Locus-Region | 1 | SNP | C | T | T | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32256614 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr7:52845483 | f | Bcat2 : Locus-Region | 2 | SNP | A | A | C | C | C | A | C | A | A | C | A | C | C | C | A | A | C | A/C |
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc |
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last database update 05/08/2013 MGI 5.13 |
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