About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Naga
N-acetyl galactosaminidase, alpha
MGI:1261422

87 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs234284504
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82327810fcmy2 : within coordinates of
Naga : 1722 bp downstream of
1SNP             C  T    C/T
rs49819462
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82328295fcmy2 : within coordinates of
Naga : 1237 bp downstream of
1SNP A                   A
rs251804940
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82328421fcmy2 : within coordinates of
Naga : 1111 bp downstream of
1SNP             C  A    A/C
rs49731531
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82328434fcmy2 : within coordinates of
Naga : 1098 bp downstream of
2SNP CC          A  C    A/C
rs51513067
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82328550fcmy2 : within coordinates of
Naga : 982 bp downstream of
2SNP CC          T  C    C/T
rs31681283
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82328957fcmy2 : within coordinates of
Naga : 575 bp downstream of
1SNPG GGGG G GGAG GG  GGGA/G
rs31927306
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82329119fcmy2 : within coordinates of
Naga : Locus-Region
3SNP  A   T      T  A    A/T
rs222393993
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82330199fcmy2 : within coordinates of
Naga : Coding-Synonymous
1SNP             A  G    A/G
rs33858958
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82330370fcmy2 : within coordinates of
Naga : Intron
2SNP CC   T  T           C/T
rs242270188
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82330413fcmy2 : within coordinates of
Naga : Intron
1SNP             G  A    A/G
rs264672366
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82330626fcmy2 : within coordinates of
Naga : Intron
1SNP             C  T    C/T
rs229526814
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82330879fcmy2 : within coordinates of
Naga : Intron
1SNP             A  G    A/G
rs242380242
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82331021fcmy2 : within coordinates of
Naga : Intron
1SNP             A  C    A/C
rs31681815
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82331239fcmy2 : within coordinates of
Naga : Intron
1SNP  CCCC     T  C   CT C/T
rs31681816
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82331316fcmy2 : within coordinates of
Naga : Intron
1SNPG GGGG G GGAG GG  GAGA/G
rs260166776
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82331437fcmy2 : within coordinates of
Naga : Intron
1SNP             C  T    C/T
rs31681818
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82331572fcmy2 : within coordinates of
Naga : Intron
1SNPC CCCC C CCT  CC  CTCC/T
rs31681820
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82331610fcmy2 : within coordinates of
Naga : Intron
1SNPA AAAA   AAG  AA  AG A/G
rs227615329
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82331943fcmy2 : within coordinates of
Naga : Intron
1SNP             T  C    C/T
rs31681822
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82332003fcmy2 : within coordinates of
Naga : Intron
1SNPA AAAA G AAG  AA  AGAA/G
rs31682614
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82332077fcmy2 : within coordinates of
Naga : Intron
1SNPG GGGG G GGTG GG  GTGG/T
rs31682616
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82332107fcmy2 : within coordinates of
Naga : Intron
1SNPT TTTT T TTC  TT  TCTC/T
rs31682618
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82332137fcmy2 : within coordinates of
Naga : Intron
1SNPG GGGG   GGAG GG  GAGA/G
rs31818786
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82332283fcmy2 : within coordinates of
Naga : Intron
2SNPTTT      C           C/T
rs32425181
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82333016fcmy2 : within coordinates of
Naga : Intron
2SNP AA   C  C           A/C
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs256643856
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82333181fcmy2 : within coordinates of
Naga : Intron
1SNP             A  C    A/C
rs32446475
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82333341fcmy2 : within coordinates of
Naga : Intron
2SNP AA      G           A/G
rs31682620
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82333438fcmy2 : within coordinates of
Naga : Intron
1SNPG GGGG   G A  GG  GA A/G
rs31682622
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82333564fcmy2 : within coordinates of
Naga : Intron
1SNPT TTTT A T T      TT A/T
rs262250560
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82333942fcmy2 : within coordinates of
Naga : Intron
1SNP             A  G    A/G
rs229022454
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82333947fcmy2 : within coordinates of
Naga : Intron
1SNP             A  G    A/G
rs31683374
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82334108fcmy2 : within coordinates of
Naga : Intron
1SNPA AAAA   A G  AA  AGAA/G
rs31683376
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82334906fcmy2 : within coordinates of
Naga : Coding-Synonymous
1SNPG GGGG G GGCG GG  GGGC/G
rs31683378
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82335206fcmy2 : within coordinates of
Naga : Intron
1SNPA AAAA   AATA AA  ATAA/T
rs31683380
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82335268fcmy2 : within coordinates of
Naga : Intron
1SNPT TTTT   TTCT TT  TCTC/T
rs31683381
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82335303fcmy2 : within coordinates of
Naga : Intron
1SNPC CCCC C CCAC CC  CACA/C
rs248806603
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82335707fcmy2 : within coordinates of
Naga : Intron
1SNP             A  C    A/C
rs31683383
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82335774fcmy2 : within coordinates of
Naga : Intron
2SNPT TTTT   T C TTTC TCTC/T
rs6317066
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82336049fcmy2 : within coordinates of
Naga : Intron
2SNPG GGGGG AGGA  GG  GAGA/G
rs31684406
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82336102fcmy2 : within coordinates of
Naga : Intron
3SNPTTT T C  CC       T  C/T
rs6317143
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82336104fcmy2 : within coordinates of
Naga : Intron
1SNP      T C            C/T
rs6219744
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82336176fcmy2 : within coordinates of
Naga : Intron
1SNP      C T            C/T
rs6220203
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82336215fcmy2 : within coordinates of
Naga : Intron
1SNP      G A            A/G
rs31684408
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82336654fcmy2 : within coordinates of
Naga : Intron
1SNPA AAAA G A G      AG A/G
rs31684410
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82336700fcmy2 : within coordinates of
Naga : Intron
1SNPC C CC T C         CTC/T
rs234245484
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82337298fcmy2 : within coordinates of
Naga : Intron
1SNP             A  T    A/T
rs32314205
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82337306fcmy2 : within coordinates of
Naga : Intron
2SNP  T   A  A           A/T
rs245974447
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82337464fcmy2 : within coordinates of
Naga : Coding-Synonymous
1SNP             A  C    A/C
rs31987127
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82337571fcmy2 : within coordinates of
Naga : Intron
1SNP  C   A  A           A/C
rs215197497
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82337601fcmy2 : within coordinates of
Naga : Intron
1SNP             C  T    C/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs232014922
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82337691fcmy2 : within coordinates of
Naga : Intron
1SNP             G  A    A/G
rs261973093
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82337706fcmy2 : within coordinates of
Naga : Intron
1SNP             C  A    A/C
rs222700709
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82337728fcmy2 : within coordinates of
Naga : Intron
1SNP             G  A    A/G
rs237413435
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82337862fcmy2 : within coordinates of
Naga : Intron
1SNP             C  A    A/C
rs255531774
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82337894fcmy2 : within coordinates of
Naga : Intron
1SNP             G  A    A/G
rs31684412
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82338298fcmy2 : within coordinates of
Naga : mRNA-UTR
1SNPC CC     C T      C  C/T
rs50896064
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82338364fcmy2 : within coordinates of
Naga : Intron
1SNP G       A           A/G
rs223541419
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82338461fcmy2 : within coordinates of
Naga : Intron
1SNP             T  C    C/T
rs242097824
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82338549fcmy2 : within coordinates of
Naga : Intron
1SNP             C  G    C/G
rs31685194
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82338677fcmy2 : within coordinates of
Naga : Intron
2SNPG GGGG G GTGGGGGT GGGG/T
rs221428497
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82338705fcmy2 : within coordinates of
Naga : Intron
1SNP             T  C    C/T
rs244454591
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82338963fcmy2 : within coordinates of
Fam109b : within coordinates of
Naga : Locus-Region
Smdt1 : within coordinates of
1SNP             C  A    A/C
rs32425759
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82338999fcmy2 : within coordinates of
Fam109b : within coordinates of
Naga : Locus-Region
Smdt1 : within coordinates of
2SNP TT   C  C       C   C/T
rs31685196
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82339114fcmy2 : within coordinates of
Fam109b : within coordinates of
Naga : Locus-Region
Smdt1 : within coordinates of
1SNPG GGGG G GGAG GG  GAGA/G
rs31584249
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82339192fcmy2 : within coordinates of
Fam109b : Locus-Region
Naga : Locus-Region
Smdt1 : within coordinates of
2SNP AA   G  G           A/G
rs265144583
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82339349fcmy2 : within coordinates of
Fam109b : Locus-Region
Naga : Locus-Region
Smdt1 : within coordinates of
1SNP             G  A    A/G
rs228388374
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82339374fcmy2 : within coordinates of
Fam109b : Locus-Region
Naga : Locus-Region
Smdt1 : within coordinates of
1SNP             C  G    C/G
rs31685198
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82339461fcmy2 : within coordinates of
Fam109b : Locus-Region
Naga : Locus-Region
Smdt1 : within coordinates of
1SNPG GGGG G GGAG GG  GAGA/G
rs252214368
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82339465fcmy2 : within coordinates of
Fam109b : Locus-Region
Naga : Locus-Region
Smdt1 : within coordinates of
1SNP             A  G    A/G
rs259504169
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82339482fcmy2 : within coordinates of
Fam109b : Locus-Region
Naga : Locus-Region
Smdt1 : within coordinates of
1SNP             C  A    A/C
rs31685199
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82339527fcmy2 : within coordinates of
Fam109b : Locus-Region
Naga : Locus-Region
Smdt1 : within coordinates of
1SNPC CCCC C CCGC CC  CGCC/G
rs31685201
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82339549fcmy2 : within coordinates of
Fam109b : Locus-Region
Naga : Locus-Region
Smdt1 : within coordinates of
2SNPT  TTT   TCCTT TC TCTC/T
rs245725908
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82339619fcmy2 : within coordinates of
Fam109b : Locus-Region
Naga : Locus-Region
Smdt1 : within coordinates of
1SNP             T  C    C/T
rs31685203
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82339645fcmy2 : within coordinates of
Fam109b : Locus-Region
Naga : Locus-Region
Smdt1 : within coordinates of
2SNPT TTTT T TCTTTTTC TTTC/T
rs238979648
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82339799fcmy2 : within coordinates of
Fam109b : Locus-Region
Naga : Locus-Region
Smdt1 : within coordinates of
1SNP             C  A    A/C
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs250546129
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82339863fcmy2 : within coordinates of
Fam109b : Locus-Region
Naga : Locus-Region
Smdt1 : within coordinates of
1SNP             T  C    C/T
rs213125637
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82340028fcmy2 : within coordinates of
Fam109b : Locus-Region
Naga : Locus-Region
Smdt1 : within coordinates of
1SNP             G  A    A/G
rs235568090
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82340141fcmy2 : within coordinates of
Fam109b : Locus-Region
Naga : Locus-Region
Smdt1 : within coordinates of
1SNP             C  T    C/T
rs249766347
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82340227fcmy2 : within coordinates of
Fam109b : Locus-Region
Naga : Locus-Region
Smdt1 : within coordinates of
1SNP             T  C    C/T
rs223657667
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82340257fcmy2 : within coordinates of
Fam109b : Locus-Region
Naga : Locus-Region
Smdt1 : within coordinates of
1SNP             C  T    C/T
rs31686154
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82340323fcmy2 : within coordinates of
Fam109b : Locus-Region
Naga : Locus-Region
Smdt1 : within coordinates of
2SNPT  TTT   TC TT TC T TC/T
rs253719438
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82340349fcmy2 : within coordinates of
Fam109b : Locus-Region
Naga : Locus-Region
Smdt1 : within coordinates of
1SNP             C  T    C/T
rs31686155
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82340410fcmy2 : within coordinates of
Fam109b : Locus-Region
Naga : Locus-Region
Smdt1 : within coordinates of
2SNPC  CCC   CAC C CA CCCA/C
rs31686157
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82340577fcmy2 : within coordinates of
Fam109b : Locus-Region
Naga : Locus-Region
Smdt1 : within coordinates of
1SNPA AAAA G GGG  AA  AGGA/G
rs31686158
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82340679fcmy2 : within coordinates of
Fam109b : Locus-Region
Naga : Locus-Region
Smdt1 : within coordinates of
2SNPA AAAA   ACA AAAC AAAA/C
rs31686159
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82340718fcmy2 : within coordinates of
Fam109b : Locus-Region
Naga : Locus-Region
Smdt1 : within coordinates of
2SNPG  GGG   GAG G GA GGGA/G
rs31686161
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr15:82340788fcmy2 : within coordinates of
Fam109b : Locus-Region
Naga : Locus-Region
Smdt1 : within coordinates of
4SNPCCCCCCA  AC CA  C C AA/C

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
04/08/2014
MGI 5.17
The Jackson Laboratory