About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
 Symbol
Name
ID
Dpagt1
dolichyl-phosphate (UDP-N-acetylglucosamine) acetylglucosaminephosphotransferase 1 (GlcNAc-1-P transferase)
MGI:1196396

108 matching SNPs displayed
Full result set is also available in a tab-delimited format.


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs32609971
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44325329fDpagt1 : Locus-Region1SNPG  A    G  A         A    GGAA/G
rs32609973
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44325376fDpagt1 : Locus-Region1SNP  CC    T  C C      CC      CC/T
rs48866152
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44325421fDpagt1 : Locus-Region1SNP  C       C                  C
rs52521401
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44325528fDpagt1 : Locus-Region1SNP  A                          A
rs230452521
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44325590fDpagt1 : Locus-Region1SNP               T      C      C/T
rs47764899
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44325697rDpagt1 : Locus-Region1SNP  T       T                  T
rs32610605
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44325801fDpagt1 : Locus-Region2SNPCCTT    T TTCT      TT    CCTC/T
rs32610607
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44325816fDpagt1 : Locus-Region1SNPG GG    T  GGG       G    GGGG/T
rs254172296
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44325921fDpagt1 : Locus-Region1SNP               A      G      A/G
rs49540411
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44325948fDpagt1 : Locus-Region1SNP GA       A                  A/G
rs46902572
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44325952fDpagt1 : Locus-Region1SNP AC       C                  A/C
rs47915430
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44325995fDpagt1 : Locus-Region1SNP G        A                  A/G
rs32604814
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44326015fDpagt1 : Locus-Region1SNPG  A    A  A         A     GAA/G
rs32604816
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44326046fDpagt1 : Locus-Region1SNPC CC    T  CCC      CC    CCCC/T
rs32604818
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44326065fDpagt1 : Locus-Region2SNPTTAA    A AA         A    TTAA/T
rs32604820
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44326101fDpagt1 : Locus-Region2SNPTTGG    T GG        GG     TGG/T
rs49271407
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44326162fDpagt1 : Locus-Region1SNP CA       A                  A/C
rs46981386
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44326175fDpagt1 : Locus-Region1SNP CT       T                  C/T
rs32604821
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44326195fDpagt1 : Locus-Region2SNPCCGG    G GG         G     CGC/G
rs32604823
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44326328fDpagt1 : Locus-Region3SNPGGAA    G AA   G     AA   GGAA/G
rs32605765
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44326378fDpagt1 : Locus-Region2SNPCCAA    A  A         A     CAA/C
rs32605767
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44326485fDpagt1 : Locus-Region1SNPG  G    A  G         G     GGA/G
rs32605769
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44326511fDpagt1 : Locus-Region1SNP  GG    C  G G       G      GC/G
rs32605770
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44326642fDpagt1 : Locus-Region1SNPC CC    T  C         C    CCCC/T
rs32605772
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44326661fDpagt1 : Locus-Region1SNPG GG    T  G G       G    GGGG/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs32606414
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44326690fDpagt1 : Locus-Region1SNPA  A    G  A         A     AAA/G
rs32606416
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44326713fDpagt1 : Locus-Region1SNPC  T    T  TC        T    CCTC/T
rs29980176
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44326739fDpagt1 : Locus-Region2SNPCCAA   AC  A A       A    CCAA/C
rs32606419
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44326869fDpagt1 : mRNA-UTR1SNP   G    G  G         G     AGA/G
rs30180326
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44326936fDpagt1 : mRNA-UTR1SNP AT                          A/T
rs32606420
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44327110fDpagt1 : Coding-Synonymous1SNPC  C    T  C         C     CCC/T
rs30078014
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44327254fDpagt1 : Intron2SNPGGA    A       G      A      A/G
rs265626513
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44327324fDpagt1 : Intron1SNP               C      A      A/C
rs6235634
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44327428fDpagt1 : Intron3SNPAAG    G AG                  A/G
rs32606422
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44327483fDpagt1 : Intron1SNPG  G    A  G G       G     GGA/G
rs32607264
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44327773fDpagt1 : Intron1SNPA  A    G  A         A     AAA/G
rs222218051
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44327830fDpagt1 : Intron1SNP               A      T      A/T
rs247311903
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44327853fDpagt1 : Intron1SNP               A      G      A/G
rs261716880
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44327867fDpagt1 : Intron1SNP               G      A      A/G
rs29739098
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44328138fDpagt1 : Coding-Synonymous3SNPGGCC   CC  C C G     CC    GCC/G
rs246936981
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44328177fDpagt1 : Intron1SNP               C      T      C/T
rs46964415
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44328393fDpagt1 : Intron1SNP T                           T
rs48108103
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44328556fDpagt1 : Intron1SNP A                           A
rs29942814
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44328933fDpagt1 : Intron4SNPCCCT   TC CT T C     TT    CTC/T
rs226989518
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44329121fDpagt1 : Coding-Synonymous1SNP               T      C      C/T
rs32607268
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44329191fDpagt1 : Intron1SNPG  A    G AA         A     GAA/G
rs30037089
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44329221fDpagt1 : Intron3SNP GG            G      A      A/G
rs32607270
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44329250fDpagt1 : Intron1SNPA  A    G AAAA       A    AAAA/G
rs30088820
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44329409fDpagt1 : Intron2SNP TC                          C/T
rs214296697
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44329469fDpagt1 : Intron1SNP               A      C      A/C
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs30220436
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44329474fDpagt1 : Intron3SNP TG            T      G      G/T
rs51283150
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44329559fDpagt1 : Intron2SNP AG            A      G      A/G
rs33756022
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44329872fDpagt1 : Intron2SNP AG    G  G                  A/G
rs47428184
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44329896fDpagt1 : Intron1SNP TA       A                  A/T
rs29978954
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44329953fDpagt1 : Intron2SNP GC    C  C                  C/G
rs30331584
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44329981fDpagt1 : Intron2SNP CT    T  T                  C/T
rs32607272
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44330103fDpagt1 : Intron1SNPG  G    A GG         G     GGA/G
rs52274461
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44330575fDpagt1 : Intron2SNP TC            T      C      C/T
rs52328952
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44330637fDpagt1 : Intron1SNP GA                          A/G
rs52225119
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44330671fDpagt1 : Intron1SNP TC                          C/T
rs52094817
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44330673fDpagt1 : Intron1SNP GA                          A/G
rs51767214
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44330704fDpagt1 : Intron1SNP AG                          A/G
rs48544842
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44330778fDpagt1 : Intron1SNP CT                          C/T
rs49717959
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44330802fDpagt1 : Intron1SNP AT                          A/T
rs51435998
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44330870fDpagt1 : Intron1SNP CT                          C/T
rs49401584
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44330965fDpagt1 : Intron1SNP AG                          A/G
rs32608144
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44331054fDpagt1 : Intron1SNPG AAA A G AAGA      AA    AGAA/G
rs32608146
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44331074fDpagt1 : Intron1SNPC CCC C T CCCC      CC    CCCC/T
rs32608148
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44331298fDpagt1 : Intron1SNPT TTT T G TTTT      TT    TTTG/T
rs29589049
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44331504fDpagt1 : Intron3SNP CC    G  C    C      G      C/G
rs29595520
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44331557fDpagt1 : Intron2SNP TA    A  A                  A/T
rs30279984
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44331560fDpagt1 : Intron2SNP TC    C  C                  C/T
rs49652008
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44331611fDpagt1 : Intron1SNP TG       G                  G/T
rs30486029
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44331662fDpagt1 : Intron2SNP AG    G  G                  A/G
rs50310383
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44331690fDpagt1 : Intron1SNP GT       T                  G/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs33671270
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44331764fDpagt1 : Intron2SNP GC       C                  C/G
rs32608150
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44332192fDpagt1 : Intron1SNPT TTT T C TT T      TT    T TC/T
rs32608152
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44332881fDpagt1 : Coding-Synonymous
H2afx : Locus-Region
1SNPG GGG G A GGGG      GG    GGGA/G
rs32608944
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44332931fDpagt1 : Coding-NonSynonymous
H2afx : Locus-Region
1SNPT TTT T C TTCT      TT    TCTC/T
rs32608946
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44333020fDpagt1 : Intron
H2afx : Locus-Region
1SNPG GGG G   GGCG      GG    GCGC/G
rs32608947
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44333116fDpagt1 : Coding-Synonymous
H2afx : Locus-Region
1SNPT TTT T T TTCT      TT    TCTC/T
rs30176960
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44333175fDpagt1 : mRNA-UTR
H2afx : Locus-Region
4SNPA GAG GAG GAGG G    AAA G AGAA/G
rs48815466
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44333237fDpagt1 : mRNA-UTR
H2afx : Locus-Region
1SNP  A       A             G    A/G
rs32608950
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44333263fDpagt1 : mRNA-UTR
H2afx : Locus-Region
2SNP  AAA A   AAGA      AA  G AGAA/G
rs32608952
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44333264fDpagt1 : mRNA-UTR
H2afx : Locus-Region
1SNP  TTT T C TTTT      TT    T TC/T
rs32609814
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44333544fDpagt1 : mRNA-UTR
H2afx : Locus-Region
2SNPT TTT T C TTCT      TT  C TCTC/T
rs32609816
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44333644fDpagt1 : Intron
H2afx : Locus-Region
2SNPT TTT T   TTAT      TT  A T TA/T
rs32609818
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44333663fDpagt1 : Intron
H2afx : Locus-Region
2SNPA AAA A C AACA      AA  C ACAA/C
rs32609820
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44333719fDpagt1 : Intron
H2afx : Locus-Region
2SNP  AAA A G AAGA      AA  G AGAA/G
rs32609822
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44333755fDpagt1 : Intron
H2afx : Locus-Region
1SNPG GGG G G GGCG      GG    GGGC/G
rs32610354
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44333768fDpagt1 : Intron
H2afx : Locus-Region
1SNPC CCC C C CCTC      CC    CTCC/T
rs32610356
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44333809fDpagt1 : Intron
H2afx : Locus-Region
1SNPG GGG G G GGGG      GG    GAGA/G
rs48295621
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44334091fDpagt1 : Intron
H2afx : Locus-Region
1SNP  T       T                  T
rs32610358
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44334252fDpagt1 : 652 bp downstream of
H2afx : Locus-Region
1SNPC CCC C C CCTC      CC    CCCC/T
rs32610360
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44334310fDpagt1 : 710 bp downstream of
H2afx : Locus-Region
1SNPC CCC C C CCTC      CC    C CC/T
rs32610362
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44334348fDpagt1 : 748 bp downstream of
H2afx : Locus-Region
1SNPA AAA A G AAGA      AA    AGAA/G
rs32610954
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44334378fDpagt1 : 778 bp downstream of
H2afx : Locus-Region
1SNPG GGG G G GGTG      GG    GGGG/T
rs8254818
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44334471fDpagt1 : 871 bp downstream of
H2afx : Locus-Region
2SNPG GGGGGGG GGCGG C GGGG G GGCGC/G
rs217241417
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44334482fDpagt1 : 882 bp downstream of
H2afx : Locus-Region
1SNP               T      C      C/T
rs8254819
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44334486fDpagt1 : 886 bp downstream of
H2afx : Locus-Region
1SNP  C CCCCC C   C T CC   C C   C/T
SNP ID
(dbSNP Build 137)
Map Position
(GRCm38)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs8254820
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44334597fDpagt1 : 997 bp downstream of
H2afx : Locus-Region
1SNP  A AAAAA A   A G AA   A A   A/G
rs8254821
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44334610fDpagt1 : 1010 bp downstream of
H2afx : Locus-Region
1SNP  T TTTTT T   T ATTT   T T   A/T
rs8254822
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44334680fDpagt1 : 1080 bp downstream of
H2afx : Locus-Region
1SNP  G GGGGG G   G CCGG   G G   C/G
rs13463799
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44334722fDpagt1 : 1122 bp downstream of
H2afx : mRNA-UTR
1SNPG GGG G G GGTG      GG    GTGG/T
rs233624686
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44334724fDpagt1 : 1124 bp downstream of
H2afx : mRNA-UTR
1SNP               T      C      C/T
rs13463798
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44334761fDpagt1 : 1161 bp downstream of
H2afx : mRNA-UTR
2SNPT TTT T C TTCT C    TTT   TCTC/T
rs32610959
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44334951fDpagt1 : 1351 bp downstream of
H2afx : Coding-Synonymous
1SNPC CCC C T CCCC      CC    CCCC/T
rs3023211
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr9:44335568fDpagt1 : 1968 bp downstream of
H2afx : mRNA-UTR
2SNPC TCT TCC TCCT      CC    CCCC/T

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
07/01/2014
MGI 5.18
The Jackson Laboratory