About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
Genome Coordinate Discrepancy
The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details).
 Symbol
Name
ID
Efnb1
ephrin B1
MGI:102708

31 matching SNPs displayed


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs29084303
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:96329885fEfnb1 : Locus-Region1SNPG GGGG G GGGGGGGGTG/T
rs31843313
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:96329899fEfnb1 : Locus-Region1SNPA AAAA G AAAAAAAAAA/G
rs31843312
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:96330215fEfnb1 : Locus-Region1SNPC CCCC T CCCCCCCCCC/T
rs29084302
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:96330443fEfnb1 : Locus-Region1SNPA AAAA A AAGAAAAGAA/G
rs31843311
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:96332859fEfnb1 : Intron1SNPA  A A   A G  AAG A/G
rs29084301
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:96333443fEfnb1 : Intron2SNPTCCC CTC T CC TTC C/T
rs29084300
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:96333555fEfnb1 : Intron2SNPAGGGGGAA A AG  A  A/G
rs31843310
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:96333681fEfnb1 : Intron1SNP   A A G A GA AAG A/G
rs31069334
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:96333830fEfnb1 : Intron1SNP GG   A  A        A/G
rs29084299
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:96334466fEfnb1 : Intron1SNPG  GGG G G CG GGC C/G
rs31843309
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:96334938fEfnb1 : Intron1SNP   T T G T TT  T  G/T
rs31407472
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:96335642fEfnb1 : Intron1SNP TT   C  C        C/T
rs29084298
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:96335922fEfnb1 : Intron1SNPT  TTT C T CT TT  C/T
rs29084297
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:96336049fEfnb1 : Intron1SNP   T T   T C   T  C/T
rs31185361
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:96336191fEfnb1 : Intron1SNP  G   A  A        A/G
rs29084296
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:96337274fEfnb1 : Intron2SNP GGG G G A GG GAG A/G
rs31843308
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:96338210fEfnb1 : Intron1SNPC  C C G C CC CCC C/G
rs29084295
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:96338435fEfnb1 : Intron1SNPT  C C C T CC TTC C/T
rs29084294
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:96338734fEfnb1 : Intron1SNPA  AAA G A GA AAG A/G
rs29084143
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:96339210fEfnb1 : Intron1SNPC  CCC C C TC CCT C/T
rs29084142
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:96339885fEfnb1 : Intron1SNPA  GGG G A GG AAG A/G
rs29084141
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:96340237fEfnb1 : Intron1SNPC  T T   C CT CCC C/T
rs31843307
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:96340534fEfnb1 : Intron1SNPC  CCC A C CC CCC A/C
rs29084140
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:96341041fEfnb1 : Intron1SNPG  G G G G AG GG  A/G
rs29084139
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:96341367fEfnb1 : Intron1SNPG  GGG G G AG GGG A/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs6169286
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:96341630fEfnb1 : Intron1SNP      A G         A/G
rs29084138
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:96341890fEfnb1 : Coding-Synonymous1SNPC  CCC T C TC CCT C/T
rs29084137
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:96342258fEfnb1 : Intron1SNPG GGGG G GGAG GGAGA/G
rs29084136
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:96342563fEfnb1 : Coding-Synonymous1SNPC CCCC A CCCCCCCCCA/C
rs29084135
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:96343789fEfnb1 : mRNA-UTR2SNPT CCCC C TTCCTTTCTC/T
rs29084134
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
ChrX:96344630fEfnb1 : Locus-Region1SNPG GGGG G GGAGGGGAGA/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
05/08/2013
MGI 5.13
The Jackson Laboratory