About   Help   FAQ
Mouse SNPs
Query Results -- Summary
Genome Coordinate Discrepancy
The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details).
 Symbol
Name
ID
Jag1
jagged 1
MGI:1095416

195 matching SNPs displayed


Legend
 Results are sorted by chromosome/coordinate value. Chromosome transitions are marked by blank rows.
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27231405
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136905204fJag1 : Locus-Region1SNPG G G       GA                   A        G    G A/G
rs27231404
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136905206fJag1 : Locus-Region1SNPA AAAA   C  A A       A                 C A    A A/C
rs27231403
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136905474fJag1 : Locus-Region1SNPG GGGG   G  GGG       G          G      G A    G A/G
rs27231402
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136905708fJag1 : Locus-Region1SNPG GGGG   A  GAG       G          A      A G    G A/G
rs27231401
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136906109fJag1 : Locus-Region1SNPG GGGG   C  GCG       G          C      C G    G C/G
rs27231400
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136906128fJag1 : Locus-Region1SNPT TTTT   C  TCT       T                 C T    T C/T
rs27231399
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136906281fJag1 : Locus-Region1SNPT TTTT   G  TGT       T          G      G T    T G/T
rs27231398
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136906832fJag1 : Locus-Region1SNPC AAAA   C  ACC       A          C      C A    A A/C
rs27231397
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136906857fJag1 : Locus-Region2SNPGGAAAAA  G AAGG       A          G      G G    A A/G
rs27231396
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136906962fJag1 : Locus-Region1SNPC CCCC   C  CCC       C          C      C T    C C/T
rs27231395
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136907805fJag1 : mRNA-UTR1SNPC TTTT   C TTCC       T          C      C C    T C/T
rs27231394
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136908985fJag1 : Coding-Synonymous1SNPG CCCC   G  CGG       C          G      G G    C C/G
rs27231393
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136909102fJag1 : Coding-Synonymous1SNP  GGGG   G   GG                  G        A    G A/G
rs27231392
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136909137fJag1 : Coding-Synonymous1SNPG TTTT   G TTGG       T          G      G G    T G/T
rs27231391
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136909148fJag1 : Coding-NonSynonymous1SNP  TTTT   T ATTT                  T        T    T A/T
rs27231390
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136909198fJag1 : Coding-Synonymous1SNPC CCCC   T  CTC       C          T      T C    C C/T
rs27231389
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136909253fJag1 : Intron1SNPA GGGG   A GGAA       G          A      A G    G A/G
rs27231388
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136909443fJag1 : Intron1SNPT CCCC   T CCTT       C          T      T T    C C/T
rs27231387
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136909588fJag1 : Intron1SNPC CCCC   T CCTC       C          T      T C    C C/T
rs27231386
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136909634fJag1 : Intron1SNPC CCCC   T CC C       C          C      C T    C C/T
rs27231385
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136909928fJag1 : Intron1SNPA AAAA   A  A A       A                   C    A A/C
rs27231384
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136909935fJag1 : Intron1SNPC CCCC   T CCTC       C                 T C    C C/T
rs27231383
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136909999fJag1 : Intron1SNPC CCCC   A  CAC       C          A      A      C A/C
rs27231382
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136910202fJag1 : Intron2SNPCCTTTTT  C TTCC       T          C      C C    T C/T
rs27231381
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136910225fJag1 : Intron1SNPT TTTT   C  TCT       T                 C T    T C/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27231380
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136910242fJag1 : Intron2SNPCCTTTTT  C TTCC       T          C      C      T C/T
rs27231379
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136910395fJag1 : Coding-Synonymous1SNPG GGGG   G  GGG       G          G      G A    G A/G
rs27231378
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136910456fJag1 : Intron2SNP AGGGGG  A GGAA       G                 A A    G A/G
rs27231377
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136910516fJag1 : Intron1SNPG GGGG   T GGTG       G          T      T T    G G/T
rs13476796
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136910769fJag1 : Coding-Synonymous3SNPTTCCCCCCCCCCCCTCCTCCCCCCCCCCTCTCCCCTCCCTCCCTCCCCCC/T
rs27231376
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136910894fJag1 : Intron1SNPA AAAA   G  AGA       A                 G A    A A/G
rs27231375
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136910915fJag1 : Intron1SNPG GGGG   A  GAG       G          A      A G    G A/G
rs27231374
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136911106fJag1 : Intron1SNPC CCCC   C CCCC       C          C      C T    C C/T
rs27231373
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136911328fJag1 : Intron2SNPAACCCCC  C CCCA       C          C      C A    C A/C
rs27231372
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136911375fJag1 : Intron1SNPG GGGG   G  GGG       G          G      G C    G C/G
rs27231371
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136911386fJag1 : Intron1SNPG AAAA   G  AGG       A          G      G G    G A/G
rs27231370
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136911407fJag1 : Intron1SNPG GGGG   G GGGG       G          G      G A    G A/G
rs27231369
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136911418fJag1 : Intron2SNPGGCCCCC  G CCGG       C          G      G G    C C/G
rs27231368
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136911432fJag1 : Intron2SNPAAGGGGG  A GGAA       G          A      A G    G A/G
rs27231367
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136911565fJag1 : Intron1SNPG GGGG   C  GCG       G          C      C C    G C/G
rs27231366
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136911797fJag1 : Intron1SNPC CCCC   T  CTC       C          T      T T    C C/T
rs27231365
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136911862fJag1 : Intron2SNPCCTTTTT  C TTCC       T          C      C T    C C/T
rs27231364
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136912333fJag1 : Intron1SNPT TTTT   T  TTT       T          T      T T    C C/T
rs33736763
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136912703fJag1 : Intron1SNPTTG   G                                          G/T
rs29557240
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136912704fJag1 : Intron1SNPAAC   C                                          A/C
rs27231363
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136912791fJag1 : Intron1SNPC CCCC      C C       C                   A    C A/C
rs27231362
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136912798fJag1 : Intron1SNPT TTTT   C  T T       T                 C T    T C/T
rs27231361
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136913335fJag1 : Intron1SNPG GGGG   A GGAG       G          A      A A    G A/G
rs27231360
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136913489fJag1 : Intron2SNPGGAAAAA  A AAAG       A          A      A A    G A/G
rs27231359
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136913540fJag1 : Intron2SNPC TTTTT  C TTCC       T          C      C C    C C/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27231358
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136913636fJag1 : Intron1SNPC CCCC   T CCTC       C          T      T T    C C/T
rs27231357
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136913674fJag1 : Intron1SNPA AAAA   G AAGA       A          G      G G    A A/G
rs27231356
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136913808fJag1 : Intron1SNPG GGGG   C  GCG       G                   C    G C/G
rs27231355
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136914181fJag1 : Coding-Synonymous1SNPC CCCC   C CCCC       C          C      C T    C C/T
rs27231354
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136914484fJag1 : Intron1SNPC AAAA   C  ACC       A          C      C C    A A/C
rs27231353
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136914612fJag1 : Intron2SNPA CCCCC  A CCAA       C                 A A      A/C
rs27231352
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136914637fJag1 : Intron2SNPG CCCCC  G CCGG       C                 G G    G C/G
rs27231351
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136915094fJag1 : Intron1SNPT CCCC   C  CCT       C          C      C C    C C/T
rs27231350
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136915104fJag1 : Intron1SNPG GGGG   G  GGG       G          G      G G    A A/G
rs27231349
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136915125fJag1 : Intron1SNPC CCCC   C  CCC       C          C      C T    T C/T
rs27231348
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136915170fJag1 : Intron1SNPG TTTT   G  TGG       T          G      G G    G G/T
rs27231347
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136915310fJag1 : Intron1SNPA AAAA   G  AGA       A          G      G A    A A/G
rs27231346
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136915796fJag1 : Intron1SNPG GGGG   C  GCG       G          C      C G    G C/G
rs33344229
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136916029fJag1 : Intron1SNP A         C                                     A/C
rs29723428
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136916044fJag1 : Intron1SNP C         T                                     C/T
rs27231345
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136916355fJag1 : Intron1SNPT TTTT   C  TCT       T          C      C C    C C/T
rs27231344
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136916914fJag1 : Intron1SNPC CCCC   C CCCC       C          C      C T    C C/T
rs27231343
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136917044fJag1 : Intron1SNPG GGGG   A GGAG       G          A      A A    G A/G
rs27231342
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136917253fJag1 : Coding-Synonymous1SNPG GGGG   A  GAG       G          A      A G    G A/G
rs27231341
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136917298fJag1 : Coding-Synonymous1SNPG GGGG   A GGGG       G          G      G G    G A/G
rs27231340
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136917396fJag1 : Intron1SNPC CCCC     CC C       C                 G C    C C/G
rs27231339
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136917457fJag1 : Intron1SNPT TTTT   C  TCT       T          C      C C    C C/T
rs27231338
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136917494fJag1 : Intron1SNPG CCCC   C CCCG       C          C      C C    C C/G
rs27231337
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136917510fJag1 : Intron1SNPA AAAA   A  AAA       A          A      A C    A A/C
rs27231336
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136917771fJag1 : Intron1SNPG GGG    A GGAG       G          A      A G    G A/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27231335
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136917773fJag1 : Intron1SNPG GGGG   G GGGG       G          G      G A    A A/G
rs27231334
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136917784fJag1 : Intron1SNPC CCCC   C CCCC       C          C      C C    T C/T
rs27231333
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136917925fJag1 : Intron1SNPC CCCC   A CCAC       C          A      A C    C A/C
rs27231332
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136918069fJag1 : Intron1SNPT TTTT   C  TCT       T          C      C T    T C/T
rs27231331
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136918224fJag1 : Intron1SNPA GGG       G A       G          A      A        A/G
rs27231330
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136918582fJag1 : Intron1SNP  AAAA   C  ACC       A          A      A A      A/C
rs32822501
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136918587fJag1 : Intron1SNPGGA   A    A                                     A/G
rs27231329
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136918850fJag1 : Intron1SNPC CCCC   C CCCC       C          C      C T    C C/T
rs27231328
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136918866fJag1 : Intron1SNPC CCCC   C  CCC       C          C      C C    T C/T
rs27231327
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136919174fJag1 : Intron1SNP  GGGG   A GGAG       G          A      A G    G A/G
rs27231326
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136919285fJag1 : Intron1SNPC TTTT   C TTCC       T          C      C C    T C/T
rs27231325
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136919345fJag1 : Intron1SNPA GGGG   G GGGA       G          G      G      A A/G
rs27231324
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136919539fJag1 : Intron1SNPG AAA    A AAAG                         A      G A/G
rs27231323
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136919746fJag1 : Intron2SNPAAGGGGG  G GGGA       G          G      G      G A/G
rs27231322
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136919770fJag1 : Intron1SNPC TTTT   C TT         T                 C        C/T
rs33311662
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136919783fJag1 : Intron1SNPGGA   A    A                                     A/G
rs27231321
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136919872fJag1 : Intron2SNPTTAAAAA  T AATT       A          T      T      T A/T
rs32935508
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136920471fJag1 : Intron1SNP AG   G    G                                     A/G
rs27231320
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136920639fJag1 : Intron1SNPT TTTT   C TTCT       T          C      C      T C/T
rs27231319
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136920795fJag1 : Intron1SNPG GGGG   A GGAG       G                 A      G A/G
rs27231318
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136920821fJag1 : Intron1SNPT TTTT   G TTGT       T                 G      T G/T
rs27231317
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136920914fJag1 : Intron1SNPC CCCC   A CCAC       C          A      A      C A/C
rs27231316
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136921202fJag1 : Coding-Synonymous1SNPC CCCC   T CCTC       C          T      T      C C/T
rs27231315
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136921361fJag1 : Intron1SNPA AAAA   G AAGA       A                 G      A A/G
rs27231314
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136921517fJag1 : Intron1SNPG GGGG   A GGAG       G                        G A/G
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27231313
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136921547fJag1 : Intron2SNPGGAAAAA  G AAGG       A                          A/G
rs27231312
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136922229fJag1 : Intron1SNPG GGGG   A GGAG       G          A      A      G A/G
rs27231311
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136922381fJag1 : Intron1SNPC CCC    C CCCC                                T C/T
rs27231310
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136922571fJag1 : Intron1SNPG GGGG     GG         G                 T      G G/T
rs27231309
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136922921fJag1 : Intron2SNPCCTTT T  C TTCC       T                        T C/T
rs27231308
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136923155fJag1 : Intron1SNPA AAAA   A AAAA       A          A      A      T A/T
rs27231307
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136923487fJag1 : Intron1SNPT CCCC   C CCCT       C                 C      C C/T
rs27231306
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136923577fJag1 : Intron1SNPT TTTT   A TTAT       T          A      A      T A/T
rs27231305
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136923788fJag1 : Intron1SNPC TTTT   C TTCC       T                 C      C C/T
rs27231304
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136923995fJag1 : Intron1SNPA AAAA   C AACA       A                 C      C A/C
rs27231303
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136924319fJag1 : Intron2SNPTTAAAAA  C AAC        A                          A/C/T
rs27231302
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136924433fJag1 : Intron1SNPC CCCC   G CC C       C                 G      C C/G
rs27231301
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136924550fJag1 : Intron1SNPG GGGG   C GGCG       G                        G C/G
rs27231300
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136924568fJag1 : Intron2SNPGGAAAAA  G AAGG       A          G      G      A A/G
rs27231299
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136924666fJag1 : Intron2SNPAACCCCC  A CCAA       C                        C A/C
rs27231298
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136924682fJag1 : Intron2SNPGGTTTTT  G TTGG       T          G      G      T G/T
rs27231297
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136924848fJag1 : Intron2SNPAAGGGGG  A GGAA       G                        A A/G
rs27231296
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136925183fJag1 : Intron1SNPC GGGG   G GGGC       G          G      G      G C/G
rs27231295
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136925426fJag1 : Intron1SNPC AAAA   C AACC       A          C      C      C A/C
rs27231294
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136925594fJag1 : Intron1SNPC CCCC   C CCCC       C          C      C      T C/T
rs27231293
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136925664fJag1 : Intron1SNPC CCCC   T CCTC       C                 T      T C/T
rs27231292
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136925685fJag1 : Intron1SNPT TTTT   C TTCT       T                 C      T C/T
rs27231291
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136925937fJag1 : Intron1SNPG GGGG   A GGAG       G                 A      G A/G
rs27231290
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136925983fJag1 : Intron1SNPA AAAA   T AATA       A          T      T      T A/T
rs27231289
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136926237fJag1 : Intron1SNPC T T       TCC                                  C/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27231288
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136926391fJag1 : Intron1SNPC CCCC   A CCAC       C          A             C A/C
rs27231287
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136926397fJag1 : Intron1SNPG GGGG   G GGGG                         C        C/G
rs33375419
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136926640fJag1 : Intron1SNPAAG   G    G                                     A/G
rs27231286
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136926742fJag1 : Intron1SNPC CCCC   T CCTC       C                 T      C C/T
rs27231285
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136927304fJag1 : Intron1SNPC CCCC   C CCCC       C          C      C      A A/C
rs27231284
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136927721fJag1 : Intron1SNPT TTTT   C TTCT       T          C      C      T C/T
rs33618934
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136928004fJag1 : Intron1SNP AT   T    T                                     A/T
rs27231283
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136928109fJag1 : Intron1SNPA AAAA   A AAAA       A          A      A      T A/T
rs27231282
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136928319fJag1 : Intron1SNPC CCCC   A CCAC       C          A      A      C A/C
rs27231281
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136928377fJag1 : Intron1SNPC CCCC   T CCTC       C                 T      C C/T
rs27231280
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136929165fJag1 : Intron1SNPT TTTT   C  TCT                  C      C      T C/T
rs27231279
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136929614fJag1 : Intron1SNPT        C   CT                  C      C C    T C/T
rs27231278
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136929648fJag1 : Intron1SNPA        G   GA                  G      G G    A A/G
rs27231277
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136929924fJag1 : Intron1SNPT        C   CT                         C T    T C/T
rs33253508
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136930015fJag1 : Intron1SNP TG   G    G                                     G/T
rs29539238
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136930202fJag1 : Intron1SNP TA   A    A                                     A/T
rs27231276
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136930540fJag1 : Intron2SNPCCA      A A AC                  A      A A    C A/C
rs27231275
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136930655fJag1 : Intron1SNPG        T   TG                  T      T G    G G/T
rs27231274
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136930705fJag1 : Intron1SNPC        G   GC                  G      G G    C C/G
rs27231273
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136930733fJag1 : Intron1SNPG        A   AG                  A      A G    G A/G
rs27231272
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136931033fJag1 : Intron1SNPG        A   AG                  A      A G    G A/G
rs27231271
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136931301fJag1 : Intron1SNPT             T                  C      C      T C/T
rs27231270
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136931302fJag1 : Intron1SNPA        G   GA                           G    A A/G
rs27231269
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136931477fJag1 : Intron1SNPA        A   GA                  A      A A    A A/G
rs27231268
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136931513fJag1 : Intron1SNPG        T   TG                  T      T T    G G/T
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27231267
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136931613fJag1 : Intron1SNP         G   GG                  G        G    T G/T
rs27231266
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136931664fJag1 : Intron1SNPG        A   AG                  A      A A    G A/G
rs27231265
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136931705fJag1 : Intron1SNPT        T   TT                  G      G T    T G/T
rs27231264
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136931720fJag1 : Intron1SNPC        T   TC                  T      T T    C C/T
rs27231263
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136931832fJag1 : Intron1SNPT        A   AT                  A      A A    T A/T
rs27231262
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136931961fJag1 : Intron1SNPG        G   AG                  A      A A    G A/G
rs27231261
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136932132fJag1 : Intron1SNPG        T   TG                  T      T T    T G/T
rs27231260
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136932442fJag1 : Intron1SNPC        T   CC                  C      C C    C C/T
rs27231259
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136932489fJag1 : Intron1SNPG        A   AG                  A      A A    A A/G
rs29505014
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136932503fJag1 : Intron1SNP CT   T                                          C/T
rs32997822
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136932547fJag1 : Intron1SNP AG                                              A/G
rs27231258
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136932707fJag1 : Intron1SNP         A   AA                  A      A A    C A/C
rs27231257
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136932742fJag1 : Intron1SNPG        A   AG                  A      A A    A A/G
rs27231256
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136932808fJag1 : Intron1SNPG        C   CG                  C      C C    C C/G
rs27231255
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136932815fJag1 : Intron1SNP         T   T                   T      T T    C C/T
rs27231254
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136932907fJag1 : Intron1SNPT        T   TT                  T      T T    C C/T
rs27231253
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136932945fJag1 : Intron1SNPA        G   GA                  G      G G    G A/G
rs27231252
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136933495fJag1 : Intron1SNPA        G   GA                  G      G G    A A/G
rs27231251
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136933575fJag1 : Intron1SNPG        A   GG                  G      G G    G A/G
rs27231250
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136933619fJag1 : Intron1SNPC        C   CC                  C      C C    T C/T
rs27231249
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136934252fJag1 : Intron1SNPG        G   GG                  A      A G    G A/G
rs27231248
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136935055fJag1 : Intron1SNPG        A   AG                         A A    G A/G
rs27231247
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136935646fJag1 : Intron1SNPC        G   GC                  G        G    C C/G
rs27231246
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136935994fJag1 : Intron1SNPC        C   CC                  C      C A    C A/C
rs27231245
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136936215fJag1 : Intron1SNPC        C   CC                  C      C C    A A/C
SNP ID
(dbSNP Build 128)
Map Position
(NCBI Build 37)
Gene : dbSNP Function ClassAssays
(ss)
Variation
Type
Allele
Summary
(all strains)
rs27231244
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136936453fJag1 : Intron1SNPA        G   GA                         G G    A A/G
rs27231243
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136936471fJag1 : Intron1SNPG        A   AG                  A        A    G A/G
rs27231242
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136936893fJag1 : Intron1SNPA        A   CA                  C      C C    A A/C
rs27231241
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136937022fJag1 : Intron1SNPG        A   GG                  G      G G    G A/G
rs27231240
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136937033fJag1 : Intron1SNPT        C   CT                  C      C C    C C/T
rs27231239
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136937051fJag1 : Intron1SNPG        A   GG                  G      G G    G A/G
rs27231238
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136937104fJag1 : Intron1SNPG        C   GG                  G      G G    G C/G
rs27231237
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136937267fJag1 : Intron1SNPC        T   CC                  C      C C    C C/T
rs29909015
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136937276fJag1 : Intron1SNP CT   T    T                                     C/T
rs33419641
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136937277fJag1 : Intron1SNP AG   G    G                                     A/G
rs27231236
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136937553fJag1 : Intron1SNPC        G   GC                  G      G G    C C/G
rs27231235
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136937646fJag1 : Intron1SNPG        G   CG                         C G    G C/G
rs27231234
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136937811fJag1 : Intron1SNPC        A   AC                  A      A A    C A/C
rs27231233
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136937916fJag1 : Intron1SNPA        A   GA                  G      G G    A A/G
rs27231232
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136938248fJag1 : Intron1SNPC        T    C                  T      T T    C C/T
rs27231231
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136938288fJag1 : Intron1SNPC        T   TC                  T      T T    C C/T
rs27231230
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136938336fJag1 : Intron1SNPT        C   CT                  C      C C    T C/T
rs27231229
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136938374fJag1 : Intron1SNPC        A   CC                  C      C C    C A/C
rs27231228
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136938484fJag1 : Intron1SNPT        C    T                           C    T C/T
rs27231227
MPD | dbSNP | MGI SNP Detail
Chr2:136939388fJag1 : Intron1SNPC        C   CC                  C      C C    G C/G

Contributing Projects:
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc
Citing These Resources
Funding Information
Warranty Disclaimer & Copyright Notice
Send questions and comments to User Support.
last database update
05/08/2013
MGI 5.13
The Jackson Laboratory