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Genome
Coordinate Discrepancy The genome coordinates for mouse SNPs are derived from a different NCBI build of the mouse genome than are the genome coordinates for MGI genes. (see details). |
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Symbol Name ID |
Ptch2 patched homolog 2 MGI:1095405 |
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) |  | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | Allele Summary (all strains) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs32952202 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116766996 | f | Ptch2 : Locus-Region | 1 | SNP | T | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27483522 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116767207 | f | Ptch2 : Locus-Region | 1 | SNP | A | A | A | A | A | T | A | A | T | A | A | A | A | T | A | A/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27483521 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116767224 | f | Ptch2 : Locus-Region | 1 | SNP | T | T | T | T | T | A | T | T | A | T | T | T | T | A | T | A/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31792495 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116767291 | f | Ptch2 : Locus-Region | 1 | SNP | A | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27483520 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116767733 | f | Ptch2 : Locus-Region | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | G | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27483519 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116767946 | f | Ptch2 : Locus-Region | 1 | SNP | C | C | C | C | C | T | C | C | T | C | C | C | C | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27483518 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116768054 | f | Ptch2 : Locus-Region | 1 | SNP | C | C | C | C | C | T | C | C | T | C | C | C | C | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32114458 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116768577 | f | Ptch2 : Locus-Region | 1 | SNP | A | T | A | A/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27483517 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116768654 | f | Ptch2 : Locus-Region | 2 | SNP | G | T | G | G | G | T | G | G | T | G | G | G | T | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27483516 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116768674 | f | Ptch2 : Locus-Region | 1 | SNP | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32060821 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116768972 | f | Ptch2 : Coding-Synonymous | 1 | SNP | A | C | A/C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27483515 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116769075 | f | Ptch2 : Intron | 2 | SNP | C | C | T | C | T | T | C | T | T | C | C | T | C | C | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27483514 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116769095 | f | Ptch2 : Intron | 2 | SNP | T | T | A | T | A | A | A | A | A | A | T | A | T | T | A | A | A/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27483513 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116769248 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | T | G | T | G | G | T | G | G | T | T | G | T | T | T | G | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27483512 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116769395 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | T | A | A | A | A | A | A | A | A | A | A/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27483511 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116769441 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | T | C | C | T | C | C | C | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27483510 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116769702 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | C | T | T | C | T | T | T | T | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27483509 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116769788 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27483508 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116769857 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | C | T | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27483507 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116769873 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27483506 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116770096 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | C | T | T | C | T | T | T | T | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32966628 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116770137 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | G | T | T | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32931616 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116770417 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | T | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32096478 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116770571 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | C | G | C | G | C/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27483505 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116770842 | f | Ptch2 : Intron | 2 | SNP | T | T | C | T | C | C | T | C | C | T | T | C | T | T | T | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) | | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | Allele Summary (all strains) |
| rs27483504 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116770966 | f | Ptch2 : Intron | 2 | SNP | C | C | T | C | T | T | T | T | T | T | C | T | C | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27483503 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116771257 | f | Ptch2 : Intron | 2 | SNP | A | G | A | G | G | A | G | G | G | G | A | G | A | A | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27483502 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116771266 | f | Ptch2 : Intron | 2 | SNP | A | C | A | A | A | A | A | C | A | A | A | A | A | A | A | C | A/C | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32143152 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116771476 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | A | G | A | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32240753 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116772034 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | T | A | A/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32981617 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116772229 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32568187 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116772319 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | T | G | G/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32360619 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116772385 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | A | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27483501 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116772629 | f | Ptch2 : Intron | 2 | SNP | G | A | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | G | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32669352 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116772743 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | A | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27483500 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116772752 | f | Ptch2 : Intron | 2 | SNP | G | A | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27483499 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116773682 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | T | A | A | T | A | A | A | A | A | A/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27483498 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116773736 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C | G | C/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27483497 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116773802 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | C | T | C | C | C | T | C | T | C | C | C | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27483496 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116773836 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27483495 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116773886 | f | Ptch2 : Intron | 2 | SNP | C | G | C | C | C | C | G | C | C | C | C | C | G | C/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27483494 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116773935 | f | Ptch2 : Intron | 2 | SNP | T | C | T | T | T | T | C | C | T | C | T | T | T | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27483493 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116774134 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | T | C | C | T | C | C | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32059485 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116774338 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs31835118 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116774343 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | T | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33007204 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116774344 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | G | T | G | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32856689 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116774350 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | A | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27483492 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116774399 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | T | G | G | T | G | G | G | G | G | G/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27483491 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116774468 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | G | A | G | G | G | G | G | G | A | G | A | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27483490 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116774507 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | A | G | G | A | G | G | G | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) | | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | Allele Summary (all strains) |
| rs27483489 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116774576 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27483488 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116774606 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | C | T | T | T | T | T | T | T | T | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32322074 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116774845 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | C | T | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27483487 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116775119 | f | Ptch2 : Intron | 2 | SNP | C | T | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27483486 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116775170 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | C | T | T | C | T | T | T | T | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27483485 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116775240 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27483484 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116775330 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27483483 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116775633 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27483482 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116775717 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | G | C | G | G | G | G | C | G | G | G | G | G | G | G | C | C/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27483481 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116775795 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27483480 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116775827 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | A | G | A | A | A | G | G | A | A | A | A | A | A | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27483479 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116775927 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | A | G | A | A | A | G | G | A | A | A | A | A | A | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27483478 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116775968 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | A | G | A | A | A | A | G | A | A | A | A | A | A | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27483477 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116775983 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | T | G | T | T | T | T | G | T | T | T | T | T | T | G | G/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27483476 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116776256 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | A | G | A | G | G | G | G | G | G | A | G | A | A | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27483475 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116776353 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | G | A | A | G | A | A | A | A | A | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27483474 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116776364 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | A | G | G | A | G | G | G | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27483473 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116776600 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | T | C | T | T | T | C | T | C | T | T | T | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27483472 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116776801 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | A | G | G | A | G | G | G | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27483471 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116776846 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | T | C | T | C | C | C | C | C | C | T | C | T | T | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27483470 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116776955 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | C | T | T | C | T | T | T | T | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27483469 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116777099 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | C | T | T | C | T | T | T | T | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27483468 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116777104 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | G | A | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27531253 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116777122 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | C | T | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27531252 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116777137 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | A | G | A | A | G | A | A | A | A | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) | | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | Allele Summary (all strains) |
| rs27531251 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116777152 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | C | T | C | T | T | T | T | C | C | T | C | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27531250 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116777154 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | C | T | T | C | T | T | T | T | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27531249 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116777181 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | T | A | T | A | A | A | A | A | A | T | A | T | T | A | A/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27531248 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116777197 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | A | T | A | T | A | T | T | A | A | T | A | A | T | A/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27531247 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116777317 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | C | T | C | T | T | T | T | T | T | C | T | C | C | T | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27531246 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116777339 | f | Ptch2 : Coding-Synonymous | 1 | SNP | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27531245 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116777495 | f | Ptch2 : Coding-Synonymous | 1 | SNP | T | T | T | T | T | G | T | T | G | T | T | T | T | G | T | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27531244 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116777738 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | C | T | T | C | T | T | T | T | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27531243 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116777819 | f | Ptch2 : Intron | 2 | SNP | G | G | C | G | C | C | G | G | C | C | G | G | C | G | G | G | C | C/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32075294 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116777961 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | A | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27531242 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116778038 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | C | T | T | C | T | T | T | T | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27531241 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116778269 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27531240 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116778301 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | A | G | G | A | G | G | G | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27531239 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116778307 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | G | A | G | A | A | A | A | G | A | G | G | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27531238 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116778340 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | A | A | C | C | C | A | A | A | A | A | C | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27531237 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116778364 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | C | C | T | T | T | T | C | C | T | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27531236 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116778394 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | G | A | G | A | A | G | A | A | G | G | A | G | G | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27531235 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116778470 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | G | G | C | C | C | G | C | G | G | C | C/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27531234 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116778564 | f | Ptch2 : Coding-Synonymous | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27531233 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116778630 | f | Ptch2 : Coding-Synonymous | 1 | SNP | A | A | A | A | A | A | A | G | A | A | A | A | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27531232 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116779821 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | C | T | T | C | T | T | T | T | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27531231 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116779849 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | T | T | T | T | T | C | T | T | C | T | T | T | T | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27531230 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116779895 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | G | G | C | C | G | C | G | G | C | C/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32659322 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116780211 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | A | G | A | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32816331 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116780733 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | A | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| rs27531229 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116780825 | f | Ptch2 : Coding-NonSynonymous | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27531228 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116781059 | f | Ptch2 : Coding-Synonymous | 1 | SNP | C | C | T | T | C | C | T | C | C | T | C | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27531227 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116781068 | f | Ptch2 : Coding-Synonymous | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27531226 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116781577 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | A | A | A | A | G | A | A | G | A | A | A | A | G | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27531225 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116781927 | f | Ptch2 : Coding-Synonymous | 1 | SNP | G | G | G | G | G | A | G | G | A | G | G | G | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs13477933 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116782134 | f | Ptch2 : Coding-Synonymous | 2 | SNP | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C | T | T | C | C | C | C | C | T | C | C | T | C | C | T | C | C | T | T | C | C/T | |
| rs27531224 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116782276 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | A | C | C | C | C | C | C | C | C | C | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27531223 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116782318 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | A | G | A | A | A | G | A | A | G | A | A | A | A | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27531222 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116782528 | f | Ptch2 : Coding-Synonymous | 2 | SNP | C | T | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27531221 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116782964 | f | Ptch2 : Coding-Synonymous | 2 | SNP | A | A | G | A | A | A | A | G | G | A | G | A | A | A | A | G | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27531220 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116783134 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | C | C | G | G | C | G | G | C | G | G | G | G | C/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27531219 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116783283 | f | Ptch2 : Coding-Synonymous | 1 | SNP | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | C | C | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27531218 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116783289 | f | Ptch2 : Coding-Synonymous | 2 | SNP | G | G | A | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27531217 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116783313 | f | Ptch2 : Coding-Synonymous | 1 | SNP | C | C | C | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32925380 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116783500 | f | Ptch2 : Coding-Synonymous | 1 | SNP | C | T | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27531216 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116783587 | f | Ptch2 : Coding-Synonymous | 2 | SNP | T | T | C | T | T | T | T | C | C | T | C | T | T | T | T | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27531215 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116783643 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | G | G | G | G | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32327691 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116783670 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | C | T | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32897324 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116783713 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | C | C | T | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27531214 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116783717 | f | Ptch2 : Intron | 2 | SNP | A | A | G | A | A | A | A | G | G | A | A | A | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32647434 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116783899 | f | Ptch2 : Coding-Synonymous | 1 | SNP | G | G | A | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32184688 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116784039 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | T | A | T | A | A/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27531213 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116784811 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | C | T | C | C | C | T | T | C | T | C | C | C | C | T | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27531212 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116785316 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | C | C | T | C | C | C | C | T | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27531211 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116785920 | f | Ptch2 : Intron | 2 | SNP | G | A | G | G | G | G | A | G | G | G | G | G | G | A | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SNP ID (dbSNP Build 128) | Map Position (NCBI Build 37) | | Gene : dbSNP Function Class | Assays (ss) | Variation Type | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | Allele Summary (all strains) |
| rs31788901 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116785953 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | A | G | A | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32785644 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116785974 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | C | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27531210 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116786248 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | A | A | C | C | A | C | C | A | C | C | C | C | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27531209 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116786256 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | C | T | C | C | T | C | C | C | C | C | C | T | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27531208 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116786258 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | C | C | C | G | G | C | C | G | C | C | C | C | C | C | C/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27531207 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116786329 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | G | G | A | A | G | A | G | G | A | G | G | G | A/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27531206 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116786341 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | C | C | T | T | T | C | T | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27531205 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116786401 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | T | C | T | T | T | C | T | C | T | T | T | T | C | C | C/T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27531204 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116786733 | f | Ptch2 : Coding-Synonymous | 2 | SNP | T | T | C | T | T | T | T | T | C | T | C | T | T | T | T | C | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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| rs33027577 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116786968 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | C | T | C | C/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| rs32186878 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116787040 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs33002651 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116787082 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | C | A | C | A/C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32835711 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116787141 | f | Ptch2 : Intron | 1 | SNP | T | G | T | G/T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32227417 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116787352 | f | Ptch2 : Coding-Synonymous | 1 | SNP | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32091014 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116787457 | f | Ptch2 : Locus-Region | 1 | SNP | G | A | G | A/G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs27531203 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116787500 | f | Ptch2 : Locus-Region | 2 | SNP | G | C | G | G | G | G | G | G | G | G | G | C | C/G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| rs32459718 MPD | dbSNP | MGI SNP Detail | Chr4:116787792 | f | Ptch2 : Locus-Region | 1 | SNP | C | T | C | C/T |
Mouse Genome Database (MGD), Gene Expression Database (GXD), Mouse Tumor Biology (MTB), Gene Ontology (GO), MouseCyc |
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